MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_012471	AAG	2	6	1947379	1947384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871215
41502	NC_012471	TAAA	2	8	1947391	1947398	75 %	25 %	0 %	0 %	225871215
41503	NC_012471	CCT	2	6	1947412	1947417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871215
41504	NC_012471	CAA	2	6	1947422	1947427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871215
41505	NC_012471	GCA	2	6	1947449	1947454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871215
41506	NC_012471	GCT	2	6	1947496	1947501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871215
41507	NC_012471	GCT	2	6	1947547	1947552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871215
41508	NC_012471	TGC	2	6	1947555	1947560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871215
41509	NC_012471	TCA	2	6	1947599	1947604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871215
41510	NC_012471	CTC	2	6	1947666	1947671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871215
41511	NC_012471	TAA	2	6	1947716	1947721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871215
41512	NC_012471	TGC	2	6	1947921	1947926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871215
41513	NC_012471	TTG	2	6	1947953	1947958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871215
41514	NC_012471	AAC	2	6	1948154	1948159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871216
41515	NC_012471	CAA	2	6	1948234	1948239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871216
41516	NC_012471	TCA	2	6	1948287	1948292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871216
41517	NC_012471	TAC	2	6	1948340	1948345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41518	NC_012471	GAA	2	6	1948408	1948413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41519	NC_012471	A	7	7	1948462	1948468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41520	NC_012471	T	7	7	1948539	1948545	0 %	100 %	0 %	0 %	225871217
41521	NC_012471	CAA	2	6	1948556	1948561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871217
41522	NC_012471	TTTG	2	8	1948600	1948607	0 %	75 %	25 %	0 %	225871217
41523	NC_012471	GTT	2	6	1948626	1948631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871217
41524	NC_012471	TCC	2	6	1948688	1948693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41525	NC_012471	CAC	2	6	1948723	1948728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41526	NC_012471	T	6	6	1948772	1948777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41527	NC_012471	AGC	2	6	1948801	1948806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41528	NC_012471	CACT	2	8	1948831	1948838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41529	NC_012471	CTC	2	6	1948841	1948846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41530	NC_012471	AAT	2	6	1948872	1948877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41531	NC_012471	CTAT	2	8	1948881	1948888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41532	NC_012471	GCT	2	6	1948904	1948909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41533	NC_012471	ACT	2	6	1948943	1948948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41534	NC_012471	A	6	6	1949017	1949022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41535	NC_012471	CA	3	6	1949038	1949043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41536	NC_012471	TAG	2	6	1949051	1949056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41537	NC_012471	GAG	2	6	1949069	1949074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41538	NC_012471	CTT	2	6	1949077	1949082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41539	NC_012471	A	6	6	1949188	1949193	100 %	0 %	0 %	0 %	225871218
41540	NC_012471	ATA	2	6	1949266	1949271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871218
41541	NC_012471	TCT	2	6	1949297	1949302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871218
41542	NC_012471	CTT	2	6	1949313	1949318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871218
41543	NC_012471	T	7	7	1949317	1949323	0 %	100 %	0 %	0 %	225871218
41544	NC_012471	TCA	2	6	1949335	1949340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871218
41545	NC_012471	TAG	2	6	1949448	1949453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871218
41546	NC_012471	T	6	6	1949476	1949481	0 %	100 %	0 %	0 %	225871218
41547	NC_012471	TCC	2	6	1949508	1949513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41548	NC_012471	AACCA	2	10	1949527	1949536	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41549	NC_012471	TAAAA	2	10	1949558	1949567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41550	NC_012471	GTATT	2	10	1949569	1949578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41551	NC_012471	CTAA	2	8	1949614	1949621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41552	NC_012471	CAA	2	6	1949625	1949630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41553	NC_012471	CAC	2	6	1949665	1949670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41554	NC_012471	TCA	2	6	1949679	1949684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41555	NC_012471	CT	3	6	1949689	1949694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41556	NC_012471	AG	3	6	1949700	1949705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41557	NC_012471	ATAA	2	8	1949773	1949780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41558	NC_012471	GCA	2	6	1949793	1949798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41559	NC_012471	AGCA	2	8	1949828	1949835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41560	NC_012471	AGCAG	2	10	1949927	1949936	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41561	NC_012471	CA	3	6	1949960	1949965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41562	NC_012471	TTC	2	6	1950127	1950132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871219
41563	NC_012471	T	6	6	1950190	1950195	0 %	100 %	0 %	0 %	225871219
41564	NC_012471	ATTAAC	2	12	1950277	1950288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225871219
41565	NC_012471	GCT	2	6	1950311	1950316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871219
41566	NC_012471	TCA	2	6	1950326	1950331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871219
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41569	NC_012471	CCAGT	2	10	1950413	1950422	20 %	20 %	20 %	40 %	225871219
41570	NC_012471	AAG	2	6	1950464	1950469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871219
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41572	NC_012471	GAT	2	6	1950529	1950534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871219
41573	NC_012471	TCT	2	6	1950539	1950544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871219
41574	NC_012471	CAC	2	6	1950546	1950551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871219
41575	NC_012471	TACC	2	8	1950558	1950565	25 %	25 %	0 %	50 %	225871219
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41577	NC_012471	AACC	2	8	1950675	1950682	50 %	0 %	0 %	50 %	225871219
41578	NC_012471	TAGC	2	8	1950783	1950790	25 %	25 %	25 %	25 %	225871219
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41582	NC_012471	TGC	2	6	1950934	1950939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871219
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41587	NC_012471	AGC	2	6	1951118	1951123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41588	NC_012471	A	9	9	1951140	1951148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41589	NC_012471	AAC	2	6	1951405	1951410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871220
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41591	NC_012471	AG	3	6	1951573	1951578	50 %	0 %	50 %	0 %	225871220
41592	NC_012471	CAA	2	6	1951677	1951682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871220
41593	NC_012471	GCT	2	6	1951704	1951709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871220
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41596	NC_012471	AGGC	2	8	1951992	1951999	25 %	0 %	50 %	25 %	225871220
41597	NC_012471	AGCT	2	8	1952068	1952075	25 %	25 %	25 %	25 %	225871220
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41600	NC_012471	TTG	2	6	1952114	1952119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871220
41601	NC_012471	GAA	2	6	1952155	1952160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871220
41602	NC_012471	AGCT	2	8	1952166	1952173	25 %	25 %	25 %	25 %	225871220
41603	NC_012471	CAA	2	6	1952191	1952196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871220
41604	NC_012471	A	6	6	1952268	1952273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41605	NC_012471	CTT	2	6	1952314	1952319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41606	NC_012471	AGCC	2	8	1952334	1952341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41607	NC_012471	TCA	2	6	1952498	1952503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41608	NC_012471	TCA	2	6	1952506	1952511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41609	NC_012471	TAA	2	6	1952526	1952531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41610	NC_012471	GCT	2	6	1952542	1952547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41611	NC_012471	CTG	3	9	1952627	1952635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871221
41612	NC_012471	TCT	2	6	1952717	1952722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871221
41613	NC_012471	CTG	2	6	1952783	1952788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871221
41614	NC_012471	CAC	2	6	1952847	1952852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871221
41615	NC_012471	GCT	2	6	1952869	1952874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871221
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41619	NC_012471	GCC	2	6	1953153	1953158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871221
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41621	NC_012471	CCAA	2	8	1953325	1953332	50 %	0 %	0 %	50 %	225871221
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41740	NC_012471	GCA	2	6	1960008	1960013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871226
41741	NC_012471	TTC	2	6	1960036	1960041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871226
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41755	NC_012471	TGCC	2	8	1960517	1960524	0 %	25 %	25 %	50 %	225871227
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41768	NC_012471	CTG	2	6	1961159	1961164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871228
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41772	NC_012471	CTGCT	2	10	1961292	1961301	0 %	40 %	20 %	40 %	225871228
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41852	NC_012471	A	7	7	1964852	1964858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41853	NC_012471	A	6	6	1965073	1965078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41854	NC_012471	CT	3	6	1965097	1965102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41855	NC_012471	GTT	2	6	1965111	1965116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41987	NC_012471	TA	3	6	1973013	1973018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41988	NC_012471	TGT	2	6	1973041	1973046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41989	NC_012471	TC	3	6	1973067	1973072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41990	NC_012471	TCA	2	6	1973214	1973219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41991	NC_012471	CA	3	6	1973218	1973223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41992	NC_012471	TGAA	2	8	1973338	1973345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41993	NC_012471	GCT	2	6	1973348	1973353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41994	NC_012471	TGG	2	6	1973427	1973432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41995	NC_012471	GA	3	6	1973607	1973612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41996	NC_012471	TCC	2	6	1973693	1973698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41997	NC_012471	CTT	2	6	1973889	1973894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41998	NC_012471	CTCCC	2	10	1973924	1973933	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41999	NC_012471	TCC	2	6	1974009	1974014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42000	NC_012471	CGA	2	6	1974022	1974027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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