MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_012471	TCT	2	6	1878714	1878719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871159
40002	NC_012471	ACC	2	6	1878726	1878731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871159
40003	NC_012471	CTT	2	6	1878732	1878737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871159
40004	NC_012471	CTC	2	6	1878792	1878797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871159
40005	NC_012471	TGG	2	6	1878798	1878803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225871159
40006	NC_012471	CTG	2	6	1878830	1878835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871159
40007	NC_012471	TCT	2	6	1878838	1878843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871159
40008	NC_012471	GTC	2	6	1878883	1878888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871159
40009	NC_012471	GCT	2	6	1878901	1878906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871159
40010	NC_012471	CTT	2	6	1878941	1878946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871159
40011	NC_012471	AGCTG	2	10	1878967	1878976	20 %	20 %	40 %	20 %	225871159
40012	NC_012471	TTC	2	6	1878977	1878982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871159
40013	NC_012471	AGC	2	6	1878984	1878989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871159
40014	NC_012471	CTT	3	9	1879022	1879030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871159
40015	NC_012471	TTTCT	2	10	1879031	1879040	0 %	80 %	0 %	20 %	225871159
40016	NC_012471	TCTTT	2	10	1879073	1879082	0 %	80 %	0 %	20 %	225871159
40017	NC_012471	T	6	6	1879088	1879093	0 %	100 %	0 %	0 %	225871159
40018	NC_012471	GCT	2	6	1879094	1879099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871159
40019	NC_012471	TCA	2	6	1879111	1879116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871159
40020	NC_012471	TCC	2	6	1879140	1879145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40021	NC_012471	CCA	2	6	1879282	1879287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871160
40022	NC_012471	AG	3	6	1879415	1879420	50 %	0 %	50 %	0 %	225871160
40023	NC_012471	TA	3	6	1879476	1879481	50 %	50 %	0 %	0 %	225871160
40024	NC_012471	GCT	2	6	1879642	1879647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871160
40025	NC_012471	AAT	2	6	1879689	1879694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871160
40026	NC_012471	CAGT	2	8	1879699	1879706	25 %	25 %	25 %	25 %	225871160
40027	NC_012471	TCC	2	6	1879734	1879739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40028	NC_012471	ACG	2	6	1879743	1879748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40029	NC_012471	ATT	2	6	1879784	1879789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871161
40030	NC_012471	AGTTA	2	10	1879793	1879802	40 %	40 %	20 %	0 %	225871161
40031	NC_012471	CAG	2	6	1879805	1879810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871161
40032	NC_012471	CAG	2	6	1879883	1879888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871161
40033	NC_012471	TCC	2	6	1879947	1879952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871161
40034	NC_012471	AGCAA	2	10	1880049	1880058	60 %	0 %	20 %	20 %	225871161
40035	NC_012471	GT	3	6	1880073	1880078	0 %	50 %	50 %	0 %	225871161
40036	NC_012471	GAT	2	6	1880093	1880098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871161
40037	NC_012471	TTA	2	6	1880103	1880108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871161
40038	NC_012471	AGC	2	6	1880123	1880128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871161
40039	NC_012471	TGA	2	6	1880157	1880162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871161
40040	NC_012471	TCA	2	6	1880169	1880174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871161
40041	NC_012471	ATA	3	9	1880175	1880183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871161
40042	NC_012471	ACG	2	6	1880210	1880215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871161
40043	NC_012471	CAA	2	6	1880248	1880253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871161
40044	NC_012471	AATA	2	8	1880273	1880280	75 %	25 %	0 %	0 %	225871161
40045	NC_012471	CGTG	2	8	1880393	1880400	0 %	25 %	50 %	25 %	225871161
40046	NC_012471	ATC	2	6	1880420	1880425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871161
40047	NC_012471	ATA	2	6	1880441	1880446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871161
40048	NC_012471	TCTT	2	8	1880470	1880477	0 %	75 %	0 %	25 %	225871161
40049	NC_012471	CAT	2	6	1880551	1880556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871161
40050	NC_012471	AAT	2	6	1880569	1880574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871161
40051	NC_012471	ATA	2	6	1880601	1880606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871161
40052	NC_012471	AAG	2	6	1880713	1880718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871161
40053	NC_012471	ACA	2	6	1880746	1880751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871161
40054	NC_012471	TGA	2	6	1880853	1880858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871161
40055	NC_012471	CGCAT	2	10	1880859	1880868	20 %	20 %	20 %	40 %	225871161
40056	NC_012471	TTG	2	6	1880883	1880888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871161
40057	NC_012471	TGCT	2	8	1880969	1880976	0 %	50 %	25 %	25 %	225871161
40058	NC_012471	TG	3	6	1880988	1880993	0 %	50 %	50 %	0 %	225871161
40059	NC_012471	ATA	2	6	1880996	1881001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871161
40060	NC_012471	AGC	2	6	1881045	1881050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871161
40061	NC_012471	GACA	2	8	1881129	1881136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40062	NC_012471	CTTA	2	8	1881152	1881159	25 %	50 %	0 %	25 %	225871162
40063	NC_012471	GAT	2	6	1881209	1881214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871162
40064	NC_012471	TCT	2	6	1881220	1881225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871162
40065	NC_012471	TGA	2	6	1881226	1881231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871162
40066	NC_012471	ATT	2	6	1881264	1881269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871162
40067	NC_012471	T	8	8	1881268	1881275	0 %	100 %	0 %	0 %	225871162
40068	NC_012471	GCT	2	6	1881280	1881285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871162
40069	NC_012471	T	6	6	1881387	1881392	0 %	100 %	0 %	0 %	225871162
40070	NC_012471	AGA	2	6	1881393	1881398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871162
40071	NC_012471	CTTG	2	8	1881420	1881427	0 %	50 %	25 %	25 %	225871162
40072	NC_012471	T	6	6	1881473	1881478	0 %	100 %	0 %	0 %	225871162
40073	NC_012471	TGCTT	2	10	1881490	1881499	0 %	60 %	20 %	20 %	225871162
40074	NC_012471	ATG	2	6	1881549	1881554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871162
40075	NC_012471	GAC	2	6	1881570	1881575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871162
40076	NC_012471	TCT	2	6	1881581	1881586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871162
40077	NC_012471	ATG	2	6	1881607	1881612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871162
40078	NC_012471	TCG	2	6	1881613	1881618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871162
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40080	NC_012471	TCCT	2	8	1881759	1881766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40081	NC_012471	TAT	2	6	1881778	1881783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40082	NC_012471	AAT	2	6	1881790	1881795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40083	NC_012471	GCA	2	6	1881828	1881833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40084	NC_012471	ATG	2	6	1881842	1881847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40085	NC_012471	TCA	2	6	1881856	1881861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40086	NC_012471	GACA	2	8	1881986	1881993	50 %	0 %	25 %	25 %	225871163
40087	NC_012471	TGCT	2	8	1881994	1882001	0 %	50 %	25 %	25 %	225871163
40088	NC_012471	T	6	6	1882066	1882071	0 %	100 %	0 %	0 %	225871163
40089	NC_012471	TCC	2	6	1882116	1882121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871163
40090	NC_012471	CCA	2	6	1882172	1882177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871163
40091	NC_012471	ATCA	2	8	1882181	1882188	50 %	25 %	0 %	25 %	225871163
40092	NC_012471	ACC	2	6	1882226	1882231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871163
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40100	NC_012471	CCT	2	6	1882687	1882692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871163
40101	NC_012471	T	6	6	1882694	1882699	0 %	100 %	0 %	0 %	225871163
40102	NC_012471	T	6	6	1882763	1882768	0 %	100 %	0 %	0 %	225871163
40103	NC_012471	GCA	2	6	1882774	1882779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871163
40104	NC_012471	AGC	2	6	1882818	1882823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871163
40105	NC_012471	AAAGC	2	10	1882848	1882857	60 %	0 %	20 %	20 %	225871163
40106	NC_012471	TTC	2	6	1882860	1882865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871163
40107	NC_012471	ATC	2	6	1882914	1882919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871163
40108	NC_012471	ATAATC	2	12	1882940	1882951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225871163
40109	NC_012471	GAA	2	6	1882986	1882991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871163
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40111	NC_012471	CAG	2	6	1883062	1883067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871163
40112	NC_012471	ATCT	2	8	1883069	1883076	25 %	50 %	0 %	25 %	225871163
40113	NC_012471	ATC	2	6	1883210	1883215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871163
40114	NC_012471	ACC	2	6	1883225	1883230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871163
40115	NC_012471	AG	3	6	1883252	1883257	50 %	0 %	50 %	0 %	225871163
40116	NC_012471	TC	3	6	1883283	1883288	0 %	50 %	0 %	50 %	225871163
40117	NC_012471	TGC	2	6	1883334	1883339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871163
40118	NC_012471	CTC	2	6	1883363	1883368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871163
40119	NC_012471	AGA	2	6	1883381	1883386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871163
40120	NC_012471	GCT	2	6	1883455	1883460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871163
40121	NC_012471	T	6	6	1883491	1883496	0 %	100 %	0 %	0 %	225871163
40122	NC_012471	TCA	2	6	1883505	1883510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871163
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40124	NC_012471	CCTC	2	8	1883631	1883638	0 %	25 %	0 %	75 %	225871163
40125	NC_012471	CCTA	2	8	1883705	1883712	25 %	25 %	0 %	50 %	225871163
40126	NC_012471	A	6	6	1883741	1883746	100 %	0 %	0 %	0 %	225871163
40127	NC_012471	GTCA	2	8	1883765	1883772	25 %	25 %	25 %	25 %	225871163
40128	NC_012471	A	6	6	1883786	1883791	100 %	0 %	0 %	0 %	225871163
40129	NC_012471	CTTT	2	8	1883835	1883842	0 %	75 %	0 %	25 %	225871163
40130	NC_012471	T	6	6	1883840	1883845	0 %	100 %	0 %	0 %	225871163
40131	NC_012471	AGCT	2	8	1884034	1884041	25 %	25 %	25 %	25 %	225871163
40132	NC_012471	ATC	2	6	1884056	1884061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871163
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40134	NC_012471	AGGC	2	8	1884101	1884108	25 %	0 %	50 %	25 %	225871163
40135	NC_012471	T	6	6	1884127	1884132	0 %	100 %	0 %	0 %	225871163
40136	NC_012471	GCT	2	6	1884133	1884138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871163
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40145	NC_012471	TC	3	6	1884601	1884606	0 %	50 %	0 %	50 %	225871163
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40148	NC_012471	A	7	7	1884723	1884729	100 %	0 %	0 %	0 %	225871163
40149	NC_012471	AGG	2	6	1884739	1884744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871163
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40158	NC_012471	TA	3	6	1885147	1885152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40160	NC_012471	CTTG	2	8	1885235	1885242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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40166	NC_012471	GC	3	6	1885395	1885400	0 %	0 %	50 %	50 %	225871164
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40223	NC_012471	TGC	2	6	1888139	1888144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871166
40224	NC_012471	TGC	2	6	1888173	1888178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871166
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40227	NC_012471	TGA	2	6	1888271	1888276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871166
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40232	NC_012471	A	6	6	1888678	1888683	100 %	0 %	0 %	0 %	225871166
40233	NC_012471	AAT	2	6	1888723	1888728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871166
40234	NC_012471	GCT	2	6	1888750	1888755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871166
40235	NC_012471	TCA	2	6	1888809	1888814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871166
40236	NC_012471	CTT	2	6	1888826	1888831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871167
40237	NC_012471	T	6	6	1888830	1888835	0 %	100 %	0 %	0 %	225871167
40238	NC_012471	CTG	2	6	1888856	1888861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871167
40239	NC_012471	TCA	2	6	1888932	1888937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871167
40240	NC_012471	TCC	2	6	1888950	1888955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871167
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40242	NC_012471	GCG	2	6	1889210	1889215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871167
40243	NC_012471	TCT	2	6	1889232	1889237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871167
40244	NC_012471	CTA	2	6	1889244	1889249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871167
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40247	NC_012471	ACGC	2	8	1889288	1889295	25 %	0 %	25 %	50 %	225871167
40248	NC_012471	CCT	2	6	1889393	1889398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40249	NC_012471	TCA	3	9	1889414	1889422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40250	NC_012471	CAC	2	6	1889423	1889428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40251	NC_012471	CTA	2	6	1889457	1889462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40252	NC_012471	CAGG	2	8	1889469	1889476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40253	NC_012471	TGA	2	6	1889494	1889499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871168
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40255	NC_012471	TTTA	2	8	1889535	1889542	25 %	75 %	0 %	0 %	225871168
40256	NC_012471	CAA	2	6	1889579	1889584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871168
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40259	NC_012471	ATC	2	6	1889812	1889817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871168
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40322	NC_012471	AATT	2	8	1892603	1892610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40323	NC_012471	ATG	2	6	1892612	1892617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40325	NC_012471	CGG	2	6	1892706	1892711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871171
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