MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_012471	TTTC	2	8	1833542	1833549	0 %	75 %	0 %	25 %	225871106
39003	NC_012471	GCT	2	6	1833574	1833579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871106
39004	NC_012471	AAGC	2	8	1833599	1833606	50 %	0 %	25 %	25 %	225871106
39005	NC_012471	GCT	2	6	1833634	1833639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871106
39006	NC_012471	ACC	2	6	1833651	1833656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871106
39007	NC_012471	GCT	2	6	1833658	1833663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871106
39008	NC_012471	TTTC	2	8	1833800	1833807	0 %	75 %	0 %	25 %	225871106
39009	NC_012471	GCT	2	6	1833832	1833837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871106
39010	NC_012471	GAC	2	6	1833944	1833949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871106
39011	NC_012471	T	6	6	1833999	1834004	0 %	100 %	0 %	0 %	225871106
39012	NC_012471	AAT	2	6	1834063	1834068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39013	NC_012471	CT	3	6	1834097	1834102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39014	NC_012471	AAGGTA	2	12	1834147	1834158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39015	NC_012471	A	7	7	1834204	1834210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39016	NC_012471	ATT	2	6	1834214	1834219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39017	NC_012471	GAA	2	6	1834230	1834235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39018	NC_012471	TTAT	2	8	1834247	1834254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39019	NC_012471	ATCA	2	8	1834269	1834276	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39020	NC_012471	CACT	2	8	1834313	1834320	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39021	NC_012471	TGAT	2	8	1834415	1834422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39022	NC_012471	T	6	6	1834485	1834490	0 %	100 %	0 %	0 %	225871107
39023	NC_012471	TA	3	6	1834492	1834497	50 %	50 %	0 %	0 %	225871107
39024	NC_012471	A	6	6	1834505	1834510	100 %	0 %	0 %	0 %	225871107
39025	NC_012471	TAG	2	6	1834551	1834556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871107
39026	NC_012471	A	6	6	1834569	1834574	100 %	0 %	0 %	0 %	225871107
39027	NC_012471	A	7	7	1834577	1834583	100 %	0 %	0 %	0 %	225871107
39028	NC_012471	AAG	2	6	1834590	1834595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871107
39029	NC_012471	CTT	2	6	1834599	1834604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871107
39030	NC_012471	TA	3	6	1834630	1834635	50 %	50 %	0 %	0 %	225871107
39031	NC_012471	CCT	2	6	1834790	1834795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871108
39032	NC_012471	CTG	2	6	1834818	1834823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871108
39033	NC_012471	TCC	2	6	1834828	1834833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871108
39034	NC_012471	TAT	2	6	1834885	1834890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39035	NC_012471	CCT	2	6	1834891	1834896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39036	NC_012471	CCT	2	6	1834947	1834952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871109
39037	NC_012471	TGC	2	6	1835000	1835005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871109
39038	NC_012471	ATT	2	6	1835051	1835056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871109
39039	NC_012471	T	6	6	1835055	1835060	0 %	100 %	0 %	0 %	225871109
39040	NC_012471	CCT	2	6	1835061	1835066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871109
39041	NC_012471	AGCA	2	8	1835075	1835082	50 %	0 %	25 %	25 %	225871109
39042	NC_012471	ATT	2	6	1835104	1835109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39043	NC_012471	ATTG	2	8	1835112	1835119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39044	NC_012471	TGT	2	6	1835141	1835146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39045	NC_012471	T	7	7	1835180	1835186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39046	NC_012471	TCC	2	6	1835196	1835201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39047	NC_012471	T	7	7	1835241	1835247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39048	NC_012471	AAGC	2	8	1835327	1835334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39049	NC_012471	AAC	2	6	1835349	1835354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39050	NC_012471	A	7	7	1835357	1835363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39051	NC_012471	C	6	6	1835403	1835408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39052	NC_012471	AAG	2	6	1835419	1835424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39053	NC_012471	A	7	7	1835427	1835433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39054	NC_012471	CT	3	6	1835447	1835452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39055	NC_012471	ATCT	2	8	1835467	1835474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39056	NC_012471	CTA	2	6	1835552	1835557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39057	NC_012471	TC	3	6	1835563	1835568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39058	NC_012471	CAG	2	6	1835693	1835698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871110
39059	NC_012471	CAG	2	6	1835738	1835743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871110
39060	NC_012471	CAAT	2	8	1835777	1835784	50 %	25 %	0 %	25 %	225871110
39061	NC_012471	CT	3	6	1835874	1835879	0 %	50 %	0 %	50 %	225871110
39062	NC_012471	CAC	2	6	1835886	1835891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871110
39063	NC_012471	CAG	2	6	1835913	1835918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871110
39064	NC_012471	TCA	2	6	1835990	1835995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871110
39065	NC_012471	TGC	2	6	1836007	1836012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871110
39066	NC_012471	TGGGGC	2	12	1836046	1836057	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	225871110
39067	NC_012471	CAA	2	6	1836110	1836115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871110
39068	NC_012471	GCT	2	6	1836136	1836141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871110
39069	NC_012471	CAA	2	6	1836216	1836221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871110
39070	NC_012471	ATA	2	6	1836340	1836345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871110
39071	NC_012471	TTC	2	6	1836438	1836443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871110
39072	NC_012471	TCTA	2	8	1836478	1836485	25 %	50 %	0 %	25 %	225871111
39073	NC_012471	TCA	2	6	1836512	1836517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871111
39074	NC_012471	ACG	2	6	1836523	1836528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871111
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39076	NC_012471	TCA	2	6	1836563	1836568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871111
39077	NC_012471	AGA	2	6	1836601	1836606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871111
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39080	NC_012471	T	6	6	1836938	1836943	0 %	100 %	0 %	0 %	225871112
39081	NC_012471	GCA	2	6	1836980	1836985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871112
39082	NC_012471	GCA	2	6	1836998	1837003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871112
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39087	NC_012471	TC	3	6	1837259	1837264	0 %	50 %	0 %	50 %	225871112
39088	NC_012471	ATC	2	6	1837314	1837319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871112
39089	NC_012471	GCT	2	6	1837344	1837349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871112
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39091	NC_012471	AT	3	6	1837598	1837603	50 %	50 %	0 %	0 %	225871113
39092	NC_012471	CTC	2	6	1837741	1837746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871113
39093	NC_012471	GCT	2	6	1837881	1837886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871113
39094	NC_012471	GCT	2	6	1837895	1837900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871113
39095	NC_012471	T	7	7	1837940	1837946	0 %	100 %	0 %	0 %	225871113
39096	NC_012471	AG	3	6	1837957	1837962	50 %	0 %	50 %	0 %	225871113
39097	NC_012471	TCA	2	6	1838030	1838035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871113
39098	NC_012471	TA	3	6	1838077	1838082	50 %	50 %	0 %	0 %	225871113
39099	NC_012471	GCC	2	6	1838145	1838150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871113
39100	NC_012471	TCA	2	6	1838181	1838186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871113
39101	NC_012471	TGA	2	6	1838285	1838290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871113
39102	NC_012471	T	6	6	1838307	1838312	0 %	100 %	0 %	0 %	225871113
39103	NC_012471	A	6	6	1838319	1838324	100 %	0 %	0 %	0 %	225871113
39104	NC_012471	A	7	7	1838336	1838342	100 %	0 %	0 %	0 %	225871113
39105	NC_012471	T	8	8	1838398	1838405	0 %	100 %	0 %	0 %	225871113
39106	NC_012471	CCT	2	6	1838467	1838472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39107	NC_012471	TG	4	8	1838485	1838492	0 %	50 %	50 %	0 %	225871114
39108	NC_012471	TCAAGA	2	12	1838625	1838636	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225871114
39109	NC_012471	TC	3	6	1838644	1838649	0 %	50 %	0 %	50 %	225871114
39110	NC_012471	GCTT	2	8	1838760	1838767	0 %	50 %	25 %	25 %	225871114
39111	NC_012471	AACTG	2	10	1838798	1838807	40 %	20 %	20 %	20 %	225871114
39112	NC_012471	CCA	2	6	1838821	1838826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871114
39113	NC_012471	TGC	2	6	1838874	1838879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871114
39114	NC_012471	CTT	2	6	1838880	1838885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871114
39115	NC_012471	AGC	3	9	1838898	1838906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871114
39116	NC_012471	TGAC	2	8	1838931	1838938	25 %	25 %	25 %	25 %	225871114
39117	NC_012471	TCT	2	6	1838959	1838964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871114
39118	NC_012471	CT	3	6	1838987	1838992	0 %	50 %	0 %	50 %	225871114
39119	NC_012471	GTT	2	6	1838994	1838999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871114
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39121	NC_012471	TTA	2	6	1839088	1839093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871114
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39131	NC_012471	CAA	2	6	1839478	1839483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871115
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39344	NC_012471	GCT	2	6	1848680	1848685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871124
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39349	NC_012471	TC	3	6	1848800	1848805	0 %	50 %	0 %	50 %	225871124
39350	NC_012471	GCCT	2	8	1848901	1848908	0 %	25 %	25 %	50 %	225871124
39351	NC_012471	TCG	2	6	1848970	1848975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871124
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39355	NC_012471	AGCA	2	8	1849085	1849092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39356	NC_012471	T	6	6	1849137	1849142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39357	NC_012471	TCA	2	6	1849145	1849150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39473	NC_012471	CTC	2	6	1854968	1854973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871130
39474	NC_012471	TCT	2	6	1855043	1855048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871131
39475	NC_012471	AAT	2	6	1855148	1855153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871131
39476	NC_012471	TCA	2	6	1855264	1855269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871131
39477	NC_012471	GCA	2	6	1855273	1855278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871131
39478	NC_012471	ATC	3	9	1855335	1855343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871131
39479	NC_012471	AATGTT	2	12	1855385	1855396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225871131
39480	NC_012471	GTT	2	6	1855482	1855487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871131
39481	NC_012471	CATG	2	8	1855510	1855517	25 %	25 %	25 %	25 %	225871131
39482	NC_012471	CAA	2	6	1855591	1855596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871131
39483	NC_012471	ATTG	2	8	1855607	1855614	25 %	50 %	25 %	0 %	225871131
39484	NC_012471	CCA	2	6	1855809	1855814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871131
39485	NC_012471	ACG	2	6	1855892	1855897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871131
39486	NC_012471	ATA	2	6	1855898	1855903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871131
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39489	NC_012471	TGAT	2	8	1855997	1856004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39490	NC_012471	GAA	2	6	1856034	1856039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39491	NC_012471	CTGA	2	8	1856107	1856114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39492	NC_012471	AGC	2	6	1856182	1856187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871132
39493	NC_012471	AGCC	2	8	1856213	1856220	25 %	0 %	25 %	50 %	225871132
39494	NC_012471	CCAG	2	8	1856303	1856310	25 %	0 %	25 %	50 %	225871132
39495	NC_012471	AGG	2	6	1856315	1856320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871132
39496	NC_012471	CAG	2	6	1856349	1856354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871132
39497	NC_012471	AAT	2	6	1856361	1856366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871132
39498	NC_012471	GGTCTT	2	12	1856437	1856448	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225871132
39499	NC_012471	CAGCA	2	10	1856547	1856556	40 %	0 %	20 %	40 %	225871132
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