MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_012471	CCT	2	6	1662319	1662324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870953
35502	NC_012471	CCA	2	6	1662331	1662336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870953
35503	NC_012471	TCA	2	6	1662337	1662342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870953
35504	NC_012471	AGCT	2	8	1662347	1662354	25 %	25 %	25 %	25 %	225870953
35505	NC_012471	CAA	2	6	1662358	1662363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870953
35506	NC_012471	AAC	2	6	1662365	1662370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870953
35507	NC_012471	ATC	2	6	1662372	1662377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870953
35508	NC_012471	TTTGCT	2	12	1662388	1662399	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225870953
35509	NC_012471	TTG	2	6	1662408	1662413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870953
35510	NC_012471	TCA	2	6	1662492	1662497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870953
35511	NC_012471	TGCT	2	8	1662517	1662524	0 %	50 %	25 %	25 %	225870953
35512	NC_012471	ACC	2	6	1662540	1662545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870953
35513	NC_012471	ACAG	2	8	1662576	1662583	50 %	0 %	25 %	25 %	225870953
35514	NC_012471	ATA	2	6	1662654	1662659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870953
35515	NC_012471	AGCC	2	8	1662694	1662701	25 %	0 %	25 %	50 %	225870953
35516	NC_012471	TCAAA	2	10	1662724	1662733	60 %	20 %	0 %	20 %	225870953
35517	NC_012471	AAT	2	6	1662777	1662782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870953
35518	NC_012471	TCA	2	6	1662786	1662791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870953
35519	NC_012471	GAAA	2	8	1662821	1662828	75 %	0 %	25 %	0 %	225870953
35520	NC_012471	GCCAAG	3	18	1662912	1662929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870953
35521	NC_012471	TCA	2	6	1662930	1662935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870953
35522	NC_012471	CAG	2	6	1663120	1663125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870953
35523	NC_012471	TCG	2	6	1663138	1663143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870953
35524	NC_012471	CTC	2	6	1663196	1663201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870953
35525	NC_012471	ATC	2	6	1663202	1663207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870953
35526	NC_012471	GCG	2	6	1663213	1663218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870953
35527	NC_012471	CTC	2	6	1663268	1663273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870953
35528	NC_012471	TCA	3	9	1663296	1663304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870953
35529	NC_012471	A	6	6	1663340	1663345	100 %	0 %	0 %	0 %	225870953
35530	NC_012471	TCT	2	6	1663386	1663391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870953
35531	NC_012471	CTC	2	6	1663451	1663456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870953
35532	NC_012471	CT	3	6	1663463	1663468	0 %	50 %	0 %	50 %	225870953
35533	NC_012471	CTC	2	6	1663478	1663483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870953
35534	NC_012471	CAGC	2	8	1663486	1663493	25 %	0 %	25 %	50 %	225870953
35535	NC_012471	CAA	2	6	1663513	1663518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870953
35536	NC_012471	TGAC	2	8	1663581	1663588	25 %	25 %	25 %	25 %	225870953
35537	NC_012471	CAG	2	6	1663625	1663630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870953
35538	NC_012471	A	6	6	1663638	1663643	100 %	0 %	0 %	0 %	225870953
35539	NC_012471	AATAA	2	10	1663646	1663655	80 %	20 %	0 %	0 %	225870953
35540	NC_012471	AAG	2	6	1663674	1663679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870953
35541	NC_012471	ACC	3	9	1663712	1663720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870953
35542	NC_012471	CAA	2	6	1663780	1663785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870953
35543	NC_012471	TGA	2	6	1663791	1663796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870953
35544	NC_012471	GAT	2	6	1663856	1663861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870953
35545	NC_012471	GAA	2	6	1663901	1663906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870953
35546	NC_012471	A	6	6	1663915	1663920	100 %	0 %	0 %	0 %	225870953
35547	NC_012471	TA	3	6	1663975	1663980	50 %	50 %	0 %	0 %	225870953
35548	NC_012471	AAG	2	6	1664041	1664046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870953
35549	NC_012471	T	7	7	1664112	1664118	0 %	100 %	0 %	0 %	225870953
35550	NC_012471	TTC	2	6	1664128	1664133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870953
35551	NC_012471	TTA	2	6	1664145	1664150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870953
35552	NC_012471	T	6	6	1664156	1664161	0 %	100 %	0 %	0 %	225870953
35553	NC_012471	AATA	2	8	1664193	1664200	75 %	25 %	0 %	0 %	225870953
35554	NC_012471	GCT	2	6	1664207	1664212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35555	NC_012471	AGG	2	6	1664402	1664407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35556	NC_012471	A	6	6	1664432	1664437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35557	NC_012471	TAAAA	2	10	1664488	1664497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35558	NC_012471	A	6	6	1664523	1664528	100 %	0 %	0 %	0 %	225870954
35559	NC_012471	CTA	2	6	1664529	1664534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870954
35560	NC_012471	TTGCT	2	10	1664554	1664563	0 %	60 %	20 %	20 %	225870954
35561	NC_012471	TGA	2	6	1664606	1664611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870954
35562	NC_012471	A	6	6	1664623	1664628	100 %	0 %	0 %	0 %	225870954
35563	NC_012471	AG	3	6	1664634	1664639	50 %	0 %	50 %	0 %	225870954
35564	NC_012471	CAG	2	6	1664650	1664655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870954
35565	NC_012471	A	6	6	1664679	1664684	100 %	0 %	0 %	0 %	225870954
35566	NC_012471	TAAA	2	8	1664719	1664726	75 %	25 %	0 %	0 %	225870954
35567	NC_012471	AC	3	6	1664832	1664837	50 %	0 %	0 %	50 %	225870954
35568	NC_012471	AAGG	2	8	1664841	1664848	50 %	0 %	50 %	0 %	225870954
35569	NC_012471	TAA	2	6	1664882	1664887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870954
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35571	NC_012471	TA	3	6	1665007	1665012	50 %	50 %	0 %	0 %	225870954
35572	NC_012471	TTC	2	6	1665069	1665074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870954
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35574	NC_012471	AAGC	2	8	1665083	1665090	50 %	0 %	25 %	25 %	225870954
35575	NC_012471	CCAAG	2	10	1665095	1665104	40 %	0 %	20 %	40 %	225870954
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35577	NC_012471	CCTAG	2	10	1665165	1665174	20 %	20 %	20 %	40 %	225870954
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35580	NC_012471	ACA	3	9	1665337	1665345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35582	NC_012471	TAAA	2	8	1665415	1665422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35583	NC_012471	ATCAT	2	10	1665438	1665447	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35584	NC_012471	AGC	2	6	1665449	1665454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35585	NC_012471	CAGC	2	8	1665465	1665472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35586	NC_012471	AAG	2	6	1665522	1665527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870955
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35590	NC_012471	ATC	2	6	1665768	1665773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870955
35591	NC_012471	AGG	2	6	1665832	1665837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870955
35592	NC_012471	AGA	2	6	1665856	1665861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870955
35593	NC_012471	AAT	2	6	1665866	1665871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870955
35594	NC_012471	CAAAA	2	10	1665875	1665884	80 %	0 %	0 %	20 %	225870955
35595	NC_012471	A	7	7	1666115	1666121	100 %	0 %	0 %	0 %	225870955
35596	NC_012471	ATA	2	6	1666206	1666211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870955
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35599	NC_012471	TAA	2	6	1666255	1666260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870955
35600	NC_012471	A	6	6	1666272	1666277	100 %	0 %	0 %	0 %	225870955
35601	NC_012471	A	6	6	1666298	1666303	100 %	0 %	0 %	0 %	225870955
35602	NC_012471	GAT	2	6	1666342	1666347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870956
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35604	NC_012471	TCA	2	6	1666434	1666439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870956
35605	NC_012471	TGA	2	6	1666467	1666472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870956
35606	NC_012471	T	6	6	1666496	1666501	0 %	100 %	0 %	0 %	225870956
35607	NC_012471	ATG	2	6	1666521	1666526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870956
35608	NC_012471	T	6	6	1666528	1666533	0 %	100 %	0 %	0 %	225870956
35609	NC_012471	AATC	2	8	1666543	1666550	50 %	25 %	0 %	25 %	225870956
35610	NC_012471	CAA	2	6	1666552	1666557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870956
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35613	NC_012471	ACC	2	6	1666628	1666633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870956
35614	NC_012471	AGC	2	6	1666686	1666691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870956
35615	NC_012471	T	7	7	1666712	1666718	0 %	100 %	0 %	0 %	225870956
35616	NC_012471	ACG	2	6	1666724	1666729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870956
35617	NC_012471	CCTAG	2	10	1666737	1666746	20 %	20 %	20 %	40 %	225870956
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35619	NC_012471	GCT	2	6	1666810	1666815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870956
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35728	NC_012471	A	6	6	1672040	1672045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35732	NC_012471	CTT	2	6	1672124	1672129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35734	NC_012471	GCT	2	6	1672200	1672205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870963
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35980	NC_012471	TA	4	8	1683716	1683723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35982	NC_012471	CTTTT	2	10	1683749	1683758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35983	NC_012471	TCA	2	6	1683806	1683811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35984	NC_012471	ATC	2	6	1683821	1683826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35987	NC_012471	CT	3	6	1683953	1683958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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