MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_012471	ATTG	2	8	1591082	1591089	25 %	50 %	25 %	0 %	225870893
34003	NC_012471	CTT	2	6	1591099	1591104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870893
34004	NC_012471	GTT	2	6	1591110	1591115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870893
34005	NC_012471	ATC	3	9	1591169	1591177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870893
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34007	NC_012471	ATA	2	6	1591210	1591215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34008	NC_012471	ATC	2	6	1591286	1591291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870894
34009	NC_012471	GAT	2	6	1591364	1591369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870894
34010	NC_012471	GCA	2	6	1591380	1591385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870894
34011	NC_012471	ATA	2	6	1591449	1591454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870894
34012	NC_012471	AAT	2	6	1591470	1591475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870894
34013	NC_012471	CTT	2	6	1591514	1591519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870894
34014	NC_012471	TCC	2	6	1591523	1591528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870894
34015	NC_012471	TTCC	2	8	1591554	1591561	0 %	50 %	0 %	50 %	225870894
34016	NC_012471	CACCAT	2	12	1591585	1591596	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225870894
34017	NC_012471	ATT	2	6	1591715	1591720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870894
34018	NC_012471	TCA	2	6	1591734	1591739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870894
34019	NC_012471	TTGT	2	8	1591766	1591773	0 %	75 %	25 %	0 %	225870894
34020	NC_012471	ATTG	2	8	1591781	1591788	25 %	50 %	25 %	0 %	225870894
34021	NC_012471	TCA	2	6	1591824	1591829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870894
34022	NC_012471	TGA	2	6	1591835	1591840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870894
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34024	NC_012471	ACATCA	2	12	1591878	1591889	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225870894
34025	NC_012471	TGC	2	6	1591895	1591900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870894
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34032	NC_012471	TAT	3	9	1592134	1592142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870894
34033	NC_012471	TGA	2	6	1592183	1592188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870894
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34037	NC_012471	ATGC	2	8	1592275	1592282	25 %	25 %	25 %	25 %	225870894
34038	NC_012471	TAT	2	6	1592320	1592325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870894
34039	NC_012471	TCA	2	6	1592337	1592342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870894
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34044	NC_012471	ATATT	2	10	1592496	1592505	40 %	60 %	0 %	0 %	225870894
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34047	NC_012471	TTG	2	6	1592868	1592873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34048	NC_012471	TCT	2	6	1592900	1592905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34049	NC_012471	T	6	6	1592951	1592956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34050	NC_012471	CTA	2	6	1592993	1592998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34051	NC_012471	TAG	2	6	1593020	1593025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34052	NC_012471	AAATAA	2	12	1593055	1593066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34053	NC_012471	ATT	2	6	1593108	1593113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34054	NC_012471	ATG	2	6	1593207	1593212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34055	NC_012471	ACT	2	6	1593215	1593220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34056	NC_012471	GAAT	2	8	1593223	1593230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_012471	ACAA	2	8	1593266	1593273	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34058	NC_012471	AGCA	2	8	1593314	1593321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34059	NC_012471	TGG	2	6	1593352	1593357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34062	NC_012471	TCT	2	6	1593404	1593409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34063	NC_012471	ACT	2	6	1593435	1593440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34065	NC_012471	TTA	2	6	1593575	1593580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34068	NC_012471	ATTG	2	8	1593682	1593689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34069	NC_012471	TGAA	2	8	1593703	1593710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34070	NC_012471	TTCA	2	8	1593817	1593824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34071	NC_012471	T	6	6	1593830	1593835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34072	NC_012471	TGA	2	6	1593864	1593869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34074	NC_012471	T	7	7	1593937	1593943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34075	NC_012471	GCTT	2	8	1594001	1594008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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34110	NC_012471	AATT	2	8	1595831	1595838	50 %	50 %	0 %	0 %	225870895
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34114	NC_012471	TTTA	2	8	1596100	1596107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34115	NC_012471	TCCTG	2	10	1596123	1596132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34116	NC_012471	ACC	2	6	1596156	1596161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34117	NC_012471	AAGG	2	8	1596183	1596190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34118	NC_012471	ACCA	2	8	1596222	1596229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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34120	NC_012471	AAT	2	6	1596294	1596299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34235	NC_012471	T	6	6	1601857	1601862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34236	NC_012471	T	6	6	1601868	1601873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34237	NC_012471	AGAA	2	8	1601889	1601896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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34359	NC_012471	CAT	2	6	1607786	1607791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870904
34360	NC_012471	AAAGA	2	10	1607793	1607802	80 %	0 %	20 %	0 %	225870904
34361	NC_012471	ATC	2	6	1607815	1607820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34362	NC_012471	GCC	2	6	1607834	1607839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34363	NC_012471	TCA	2	6	1607867	1607872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34364	NC_012471	T	6	6	1607923	1607928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34365	NC_012471	ACC	2	6	1607981	1607986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34366	NC_012471	TCTA	2	8	1607988	1607995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34367	NC_012471	GCG	2	6	1608094	1608099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870905
34368	NC_012471	TCA	2	6	1608111	1608116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870905
34369	NC_012471	AAT	2	6	1608305	1608310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870905
34370	NC_012471	ACCA	2	8	1608377	1608384	50 %	0 %	0 %	50 %	225870905
34371	NC_012471	CG	3	6	1608431	1608436	0 %	0 %	50 %	50 %	225870905
34372	NC_012471	CTTT	2	8	1608578	1608585	0 %	75 %	0 %	25 %	225870906
34373	NC_012471	AGC	2	6	1608588	1608593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870906
34374	NC_012471	T	7	7	1608618	1608624	0 %	100 %	0 %	0 %	225870906
34375	NC_012471	TCT	2	6	1608629	1608634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870906
34376	NC_012471	AGC	2	6	1608687	1608692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870906
34377	NC_012471	TGCTTA	2	12	1608703	1608714	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225870906
34378	NC_012471	CAT	2	6	1608746	1608751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870906
34379	NC_012471	AATCAA	2	12	1608767	1608778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225870906
34380	NC_012471	ATA	2	6	1608891	1608896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870906
34381	NC_012471	T	6	6	1609026	1609031	0 %	100 %	0 %	0 %	225870906
34382	NC_012471	ACG	2	6	1609065	1609070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870906
34383	NC_012471	ACG	2	6	1609188	1609193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870906
34384	NC_012471	GTA	2	6	1609215	1609220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870906
34385	NC_012471	CTG	2	6	1609223	1609228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870906
34386	NC_012471	CTG	2	6	1609269	1609274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870906
34387	NC_012471	GCA	3	9	1609283	1609291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870906
34388	NC_012471	CTTC	2	8	1609318	1609325	0 %	50 %	0 %	50 %	225870906
34389	NC_012471	CTT	2	6	1609352	1609357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870906
34390	NC_012471	TTA	2	6	1609366	1609371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870906
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34393	NC_012471	TAAA	2	8	1609459	1609466	75 %	25 %	0 %	0 %	225870906
34394	NC_012471	AGCC	2	8	1609472	1609479	25 %	0 %	25 %	50 %	225870906
34395	NC_012471	CATT	2	8	1609501	1609508	25 %	50 %	0 %	25 %	225870906
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34427	NC_012471	A	7	7	1611016	1611022	100 %	0 %	0 %	0 %	225870907
34428	NC_012471	CTG	2	6	1611031	1611036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870907
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34443	NC_012471	CCAA	2	8	1611548	1611555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34444	NC_012471	TTA	2	6	1611594	1611599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34450	NC_012471	GAA	2	6	1611902	1611907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870909
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34462	NC_012471	A	6	6	1612361	1612366	100 %	0 %	0 %	0 %	225870909
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34467	NC_012471	TA	3	6	1612572	1612577	50 %	50 %	0 %	0 %	225870909
34468	NC_012471	TAT	2	6	1612599	1612604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870909
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34470	NC_012471	ACA	2	6	1612621	1612626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870909
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34473	NC_012471	CTG	2	6	1612738	1612743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870909
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34477	NC_012471	CAA	2	6	1613619	1613624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870909
34478	NC_012471	ACTC	2	8	1613723	1613730	25 %	25 %	0 %	50 %	225870909
34479	NC_012471	AAT	2	6	1613770	1613775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870909
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34481	NC_012471	A	14	14	1613955	1613968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34482	NC_012471	GAA	3	9	1614037	1614045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34483	NC_012471	GA	3	6	1614078	1614083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34484	NC_012471	GAA	2	6	1614101	1614106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34485	NC_012471	CAT	3	9	1614131	1614139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34487	NC_012471	TAT	2	6	1614186	1614191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34489	NC_012471	T	6	6	1614224	1614229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34490	NC_012471	CAA	2	6	1614244	1614249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34492	NC_012471	GAA	2	6	1614330	1614335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34493	NC_012471	TAA	2	6	1614389	1614394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34497	NC_012471	CT	3	6	1614629	1614634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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34499	NC_012471	AT	5	10	1614700	1614709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34500	NC_012471	A	7	7	1614718	1614724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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