MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_012471	CAT	2	6	1543139	1543144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33002	NC_012471	GAG	2	6	1543158	1543163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33003	NC_012471	CTG	2	6	1543343	1543348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870854
33004	NC_012471	TGT	2	6	1543351	1543356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870854
33005	NC_012471	GAT	2	6	1543364	1543369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870854
33006	NC_012471	TGCAA	2	10	1543490	1543499	40 %	20 %	20 %	20 %	225870854
33007	NC_012471	GCT	3	9	1543504	1543512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870854
33008	NC_012471	T	6	6	1543539	1543544	0 %	100 %	0 %	0 %	225870854
33009	NC_012471	GCT	2	6	1543572	1543577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870854
33010	NC_012471	GCT	2	6	1543687	1543692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870854
33011	NC_012471	AGGA	2	8	1543789	1543796	50 %	0 %	50 %	0 %	225870854
33012	NC_012471	TCAT	2	8	1543803	1543810	25 %	50 %	0 %	25 %	225870854
33013	NC_012471	GCT	2	6	1543939	1543944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870854
33014	NC_012471	GAC	2	6	1543968	1543973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870855
33015	NC_012471	ATA	2	6	1543994	1543999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870855
33016	NC_012471	TGA	2	6	1544121	1544126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870855
33017	NC_012471	GCT	2	6	1544176	1544181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870855
33018	NC_012471	GCA	2	6	1544246	1544251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870855
33019	NC_012471	AG	3	6	1544322	1544327	50 %	0 %	50 %	0 %	225870855
33020	NC_012471	CTT	2	6	1544333	1544338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870855
33021	NC_012471	A	7	7	1544416	1544422	100 %	0 %	0 %	0 %	225870855
33022	NC_012471	AAT	2	6	1544706	1544711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870855
33023	NC_012471	TAGT	2	8	1544770	1544777	25 %	50 %	25 %	0 %	225870855
33024	NC_012471	AAGCA	2	10	1544802	1544811	60 %	0 %	20 %	20 %	225870856
33025	NC_012471	ATG	2	6	1544819	1544824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870856
33026	NC_012471	CT	3	6	1544866	1544871	0 %	50 %	0 %	50 %	225870856
33027	NC_012471	GTC	2	6	1544912	1544917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870856
33028	NC_012471	AAT	2	6	1544936	1544941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870856
33029	NC_012471	GCA	2	6	1544949	1544954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870856
33030	NC_012471	A	6	6	1545030	1545035	100 %	0 %	0 %	0 %	225870856
33031	NC_012471	GCT	2	6	1545047	1545052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870856
33032	NC_012471	AAT	2	6	1545111	1545116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870856
33033	NC_012471	AGG	2	6	1545192	1545197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870856
33034	NC_012471	A	6	6	1545262	1545267	100 %	0 %	0 %	0 %	225870856
33035	NC_012471	TGA	2	6	1545408	1545413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870856
33036	NC_012471	ATC	2	6	1545428	1545433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870856
33037	NC_012471	CATAC	2	10	1545499	1545508	40 %	20 %	0 %	40 %	225870856
33038	NC_012471	AAT	2	6	1545565	1545570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870856
33039	NC_012471	AGA	2	6	1545591	1545596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870856
33040	NC_012471	A	7	7	1545604	1545610	100 %	0 %	0 %	0 %	225870856
33041	NC_012471	TGA	2	6	1545637	1545642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33042	NC_012471	GAAAG	2	10	1545653	1545662	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33043	NC_012471	CTT	2	6	1545679	1545684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33044	NC_012471	CCTT	2	8	1545687	1545694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33045	NC_012471	CAGC	2	8	1545750	1545757	25 %	0 %	25 %	50 %	225870857
33046	NC_012471	TTAC	2	8	1545773	1545780	25 %	50 %	0 %	25 %	225870857
33047	NC_012471	CAT	2	6	1545828	1545833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870857
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33049	NC_012471	GTT	2	6	1545857	1545862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870857
33050	NC_012471	CTG	2	6	1545888	1545893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870857
33051	NC_012471	T	6	6	1545894	1545899	0 %	100 %	0 %	0 %	225870857
33052	NC_012471	CGG	2	6	1545906	1545911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870857
33053	NC_012471	CTG	2	6	1545918	1545923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870857
33054	NC_012471	TCTT	2	8	1545965	1545972	0 %	75 %	0 %	25 %	225870857
33055	NC_012471	ATA	2	6	1546355	1546360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870857
33056	NC_012471	T	6	6	1546400	1546405	0 %	100 %	0 %	0 %	225870857
33057	NC_012471	CTG	2	6	1546479	1546484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870857
33058	NC_012471	T	7	7	1546563	1546569	0 %	100 %	0 %	0 %	225870857
33059	NC_012471	TGT	2	6	1546608	1546613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33060	NC_012471	TTG	2	6	1546741	1546746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870858
33061	NC_012471	AAG	2	6	1546818	1546823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870858
33062	NC_012471	CTAGGC	2	12	1546847	1546858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225870858
33063	NC_012471	CCA	2	6	1546864	1546869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870858
33064	NC_012471	ACC	2	6	1546974	1546979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870858
33065	NC_012471	CAA	2	6	1547090	1547095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870858
33066	NC_012471	TCC	2	6	1547101	1547106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870858
33067	NC_012471	TAGCT	2	10	1547113	1547122	20 %	40 %	20 %	20 %	225870858
33068	NC_012471	GCT	2	6	1547126	1547131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870858
33069	NC_012471	CAG	2	6	1547169	1547174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870858
33070	NC_012471	GTG	2	6	1547207	1547212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870858
33071	NC_012471	CAG	2	6	1547235	1547240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870858
33072	NC_012471	CAA	2	6	1547246	1547251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870858
33073	NC_012471	TCT	2	6	1547296	1547301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870858
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33078	NC_012471	TGAGA	2	10	1547720	1547729	40 %	20 %	40 %	0 %	225870858
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33080	NC_012471	GCT	2	6	1547807	1547812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870858
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33083	NC_012471	ACT	2	6	1547959	1547964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870858
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33085	NC_012471	AGCA	2	8	1548013	1548020	50 %	0 %	25 %	25 %	225870858
33086	NC_012471	AGC	2	6	1548028	1548033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870858
33087	NC_012471	T	6	6	1548138	1548143	0 %	100 %	0 %	0 %	225870859
33088	NC_012471	ACG	2	6	1548370	1548375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870859
33089	NC_012471	TCACCA	2	12	1548380	1548391	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225870859
33090	NC_012471	TAA	2	6	1548436	1548441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870859
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33098	NC_012471	TAA	2	6	1548748	1548753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870859
33099	NC_012471	GTCA	2	8	1548804	1548811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33100	NC_012471	AC	3	6	1548820	1548825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33101	NC_012471	ATCA	2	8	1548849	1548856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33102	NC_012471	ATTG	2	8	1548917	1548924	25 %	50 %	25 %	0 %	225870860
33103	NC_012471	AAG	2	6	1548926	1548931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870860
33104	NC_012471	GAT	2	6	1548978	1548983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870860
33105	NC_012471	CGT	2	6	1549106	1549111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33106	NC_012471	T	6	6	1549143	1549148	0 %	100 %	0 %	0 %	225870861
33107	NC_012471	CCTC	2	8	1549288	1549295	0 %	25 %	0 %	75 %	225870861
33108	NC_012471	TCCT	2	8	1549345	1549352	0 %	50 %	0 %	50 %	225870861
33109	NC_012471	TAT	2	6	1549372	1549377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870861
33110	NC_012471	T	6	6	1549384	1549389	0 %	100 %	0 %	0 %	225870861
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33114	NC_012471	CTAC	2	8	1549467	1549474	25 %	25 %	0 %	50 %	225870861
33115	NC_012471	CAT	2	6	1549549	1549554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870861
33116	NC_012471	TTG	2	6	1549566	1549571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870861
33117	NC_012471	T	6	6	1549679	1549684	0 %	100 %	0 %	0 %	225870861
33118	NC_012471	CAA	2	6	1549746	1549751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870861
33119	NC_012471	ATG	2	6	1549799	1549804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870861
33120	NC_012471	TATCT	2	10	1549816	1549825	20 %	60 %	0 %	20 %	225870861
33121	NC_012471	ATG	3	9	1549937	1549945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870861
33122	NC_012471	TGA	2	6	1549998	1550003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870861
33123	NC_012471	AT	3	6	1550009	1550014	50 %	50 %	0 %	0 %	225870861
33124	NC_012471	TGA	2	6	1550036	1550041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870861
33125	NC_012471	AT	3	6	1550112	1550117	50 %	50 %	0 %	0 %	225870862
33126	NC_012471	CTTA	2	8	1550132	1550139	25 %	50 %	0 %	25 %	225870862
33127	NC_012471	AAGGT	2	10	1550228	1550237	40 %	20 %	40 %	0 %	225870862
33128	NC_012471	TTGG	2	8	1550278	1550285	0 %	50 %	50 %	0 %	225870862
33129	NC_012471	CGA	2	6	1550315	1550320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870862
33130	NC_012471	GCC	2	6	1550326	1550331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870862
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33132	NC_012471	TAC	2	6	1550391	1550396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870862
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33134	NC_012471	GT	3	6	1550669	1550674	0 %	50 %	50 %	0 %	225870862
33135	NC_012471	AGC	3	9	1550771	1550779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870862
33136	NC_012471	GTTC	2	8	1550931	1550938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33137	NC_012471	AAATG	2	10	1550944	1550953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33138	NC_012471	TTG	2	6	1551010	1551015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33139	NC_012471	CTC	2	6	1551044	1551049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870863
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33144	NC_012471	CTTA	2	8	1551170	1551177	25 %	50 %	0 %	25 %	225870863
33145	NC_012471	CAAT	2	8	1551201	1551208	50 %	25 %	0 %	25 %	225870863
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33150	NC_012471	CCCTC	2	10	1551501	1551510	0 %	20 %	0 %	80 %	225870863
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33155	NC_012471	AATC	2	8	1551806	1551813	50 %	25 %	0 %	25 %	225870863
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33165	NC_012471	TCC	2	6	1552466	1552471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33166	NC_012471	CAT	2	6	1552506	1552511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870864
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33196	NC_012471	GTA	2	6	1553799	1553804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870864
33197	NC_012471	TGC	2	6	1553821	1553826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870864
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33200	NC_012471	A	7	7	1553905	1553911	100 %	0 %	0 %	0 %	225870864
33201	NC_012471	TAA	2	6	1553913	1553918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870864
33202	NC_012471	ACC	2	6	1553975	1553980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870864
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33207	NC_012471	ATC	2	6	1554238	1554243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870864
33208	NC_012471	CAC	2	6	1554300	1554305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870864
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33210	NC_012471	T	6	6	1554437	1554442	0 %	100 %	0 %	0 %	225870865
33211	NC_012471	CAG	2	6	1554503	1554508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870865
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33214	NC_012471	TCA	2	6	1554606	1554611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870865
33215	NC_012471	TCA	2	6	1554807	1554812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870865
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33217	NC_012471	ATC	2	6	1554855	1554860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870865
33218	NC_012471	TGAA	2	8	1554884	1554891	50 %	25 %	25 %	0 %	225870865
33219	NC_012471	TAA	2	6	1554958	1554963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870865
33220	NC_012471	CT	3	6	1554966	1554971	0 %	50 %	0 %	50 %	225870865
33221	NC_012471	AGCA	2	8	1554973	1554980	50 %	0 %	25 %	25 %	225870865
33222	NC_012471	ACC	2	6	1554981	1554986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870865
33223	NC_012471	AATA	2	8	1555001	1555008	75 %	25 %	0 %	0 %	225870865
33224	NC_012471	T	6	6	1555038	1555043	0 %	100 %	0 %	0 %	225870865
33225	NC_012471	TTCTT	2	10	1555090	1555099	0 %	80 %	0 %	20 %	225870865
33226	NC_012471	TGGT	2	8	1555143	1555150	0 %	50 %	50 %	0 %	225870865
33227	NC_012471	TAA	2	6	1555183	1555188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870865
33228	NC_012471	A	6	6	1555223	1555228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33229	NC_012471	TAA	2	6	1555352	1555357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33230	NC_012471	ATC	2	6	1555370	1555375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33231	NC_012471	ATC	2	6	1555538	1555543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870866
33232	NC_012471	C	6	6	1555611	1555616	0 %	0 %	0 %	100 %	225870866
33233	NC_012471	T	6	6	1555777	1555782	0 %	100 %	0 %	0 %	225870866
33234	NC_012471	GGC	2	6	1555816	1555821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870866
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33350	NC_012471	TA	3	6	1560665	1560670	50 %	50 %	0 %	0 %	225870871
33351	NC_012471	AAAAT	2	10	1560685	1560694	80 %	20 %	0 %	0 %	225870871
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33353	NC_012471	ACT	2	6	1560795	1560800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870871
33354	NC_012471	TAT	2	6	1560965	1560970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870871
33355	NC_012471	TGAT	2	8	1560975	1560982	25 %	50 %	25 %	0 %	225870871
33356	NC_012471	GTTC	2	8	1560984	1560991	0 %	50 %	25 %	25 %	225870871
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33401	NC_012471	ATT	3	9	1562672	1562680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33447	NC_012471	TTAT	2	8	1564847	1564854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33450	NC_012471	AT	3	6	1564905	1564910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33451	NC_012471	T	6	6	1564926	1564931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33452	NC_012471	CAG	2	6	1564984	1564989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33454	NC_012471	T	7	7	1565055	1565061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33455	NC_012471	ATC	2	6	1565079	1565084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33466	NC_012471	CTG	2	6	1565768	1565773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
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33470	NC_012471	CTC	2	6	1565855	1565860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870876
33471	NC_012471	TGC	2	6	1565877	1565882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33472	NC_012471	CTG	2	6	1565927	1565932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33473	NC_012471	CTC	2	6	1565984	1565989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870876
33474	NC_012471	TGAA	2	8	1566027	1566034	50 %	25 %	25 %	0 %	225870876
33475	NC_012471	TCTTG	2	10	1566052	1566061	0 %	60 %	20 %	20 %	225870876
33476	NC_012471	CCT	2	6	1566109	1566114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870876
33477	NC_012471	ATC	2	6	1566174	1566179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870876
33478	NC_012471	GCT	2	6	1566201	1566206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33479	NC_012471	CTT	2	6	1566278	1566283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870876
33480	NC_012471	TCA	2	6	1566345	1566350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870876
33481	NC_012471	CCT	2	6	1566367	1566372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870876
33482	NC_012471	ATA	2	6	1566391	1566396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870876
33483	NC_012471	AGC	2	6	1566441	1566446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33484	NC_012471	CAGC	2	8	1566457	1566464	25 %	0 %	25 %	50 %	225870876
33485	NC_012471	GCT	2	6	1566475	1566480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33486	NC_012471	T	6	6	1566496	1566501	0 %	100 %	0 %	0 %	225870876
33487	NC_012471	CTTG	2	8	1566513	1566520	0 %	50 %	25 %	25 %	225870876
33488	NC_012471	CCAG	2	8	1566525	1566532	25 %	0 %	25 %	50 %	225870876
33489	NC_012471	CAG	2	6	1566580	1566585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33490	NC_012471	C	6	6	1566692	1566697	0 %	0 %	0 %	100 %	225870876
33491	NC_012471	CAC	2	6	1566706	1566711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870876
33492	NC_012471	GCT	2	6	1566763	1566768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33493	NC_012471	GCT	2	6	1566904	1566909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33494	NC_012471	TCGC	2	8	1567000	1567007	0 %	25 %	25 %	50 %	225870876
33495	NC_012471	GCT	2	6	1567011	1567016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33496	NC_012471	ATA	2	6	1567032	1567037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870876
33497	NC_012471	ACT	2	6	1567043	1567048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870876
33498	NC_012471	CAG	2	6	1567138	1567143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870876
33499	NC_012471	T	7	7	1567185	1567191	0 %	100 %	0 %	0 %	225870876
33500	NC_012471	CCT	2	6	1567219	1567224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870876

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