MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_012471	GGC	2	6	1520696	1520701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32502	NC_012471	ATT	2	6	1520767	1520772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32503	NC_012471	ATT	2	6	1520824	1520829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870829
32504	NC_012471	ATC	2	6	1520846	1520851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870829
32505	NC_012471	TGT	2	6	1520880	1520885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870829
32506	NC_012471	TTC	3	9	1520912	1520920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870829
32507	NC_012471	AC	3	6	1520932	1520937	50 %	0 %	0 %	50 %	225870829
32508	NC_012471	TAG	2	6	1520938	1520943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870829
32509	NC_012471	GT	3	6	1520965	1520970	0 %	50 %	50 %	0 %	225870829
32510	NC_012471	CTT	2	6	1520996	1521001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870829
32511	NC_012471	TGG	2	6	1521014	1521019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870829
32512	NC_012471	TGAA	2	8	1521041	1521048	50 %	25 %	25 %	0 %	225870829
32513	NC_012471	CAA	2	6	1521077	1521082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870829
32514	NC_012471	TAC	2	6	1521110	1521115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870829
32515	NC_012471	CTT	2	6	1521136	1521141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870829
32516	NC_012471	CAA	2	6	1521145	1521150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870829
32517	NC_012471	CCT	2	6	1521199	1521204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870829
32518	NC_012471	TG	3	6	1521247	1521252	0 %	50 %	50 %	0 %	225870829
32519	NC_012471	CTTT	2	8	1521258	1521265	0 %	75 %	0 %	25 %	225870830
32520	NC_012471	CCA	2	6	1521328	1521333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870830
32521	NC_012471	AAC	2	6	1521385	1521390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870830
32522	NC_012471	TCT	2	6	1521425	1521430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870830
32523	NC_012471	TCA	2	6	1521440	1521445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870830
32524	NC_012471	ATA	2	6	1521497	1521502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870830
32525	NC_012471	CTG	2	6	1521911	1521916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870830
32526	NC_012471	TTC	2	6	1521926	1521931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870830
32527	NC_012471	GCT	2	6	1521936	1521941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870830
32528	NC_012471	GCG	2	6	1522004	1522009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32529	NC_012471	GGC	2	6	1522015	1522020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32530	NC_012471	TCC	2	6	1522024	1522029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32531	NC_012471	CCT	2	6	1522076	1522081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32532	NC_012471	ATACA	2	10	1522101	1522110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32533	NC_012471	TCAT	2	8	1522117	1522124	25 %	50 %	0 %	25 %	225870831
32534	NC_012471	GTG	2	6	1522131	1522136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870831
32535	NC_012471	T	6	6	1522166	1522171	0 %	100 %	0 %	0 %	225870831
32536	NC_012471	CTAATT	2	12	1522191	1522202	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225870831
32537	NC_012471	T	6	6	1522201	1522206	0 %	100 %	0 %	0 %	225870831
32538	NC_012471	CAT	2	6	1522224	1522229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870831
32539	NC_012471	AT	3	6	1522262	1522267	50 %	50 %	0 %	0 %	225870831
32540	NC_012471	CTTC	2	8	1522280	1522287	0 %	50 %	0 %	50 %	225870831
32541	NC_012471	T	7	7	1522304	1522310	0 %	100 %	0 %	0 %	225870831
32542	NC_012471	TCA	2	6	1522346	1522351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870831
32543	NC_012471	CTT	2	6	1522395	1522400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870831
32544	NC_012471	T	6	6	1522408	1522413	0 %	100 %	0 %	0 %	225870831
32545	NC_012471	AT	3	6	1522422	1522427	50 %	50 %	0 %	0 %	225870831
32546	NC_012471	TAT	2	6	1522431	1522436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870831
32547	NC_012471	TAA	2	6	1522456	1522461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32548	NC_012471	TCC	2	6	1522510	1522515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32549	NC_012471	ATC	2	6	1522564	1522569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32550	NC_012471	T	6	6	1522585	1522590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32551	NC_012471	ATA	2	6	1522633	1522638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32552	NC_012471	TTC	2	6	1522655	1522660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32553	NC_012471	GGGTA	2	10	1522709	1522718	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32554	NC_012471	TTA	2	6	1522727	1522732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32555	NC_012471	ACT	2	6	1522777	1522782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32556	NC_012471	CCA	2	6	1522854	1522859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32557	NC_012471	CAA	2	6	1522902	1522907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32558	NC_012471	TTGC	2	8	1522930	1522937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32559	NC_012471	TTCT	2	8	1522989	1522996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32560	NC_012471	ATC	2	6	1523038	1523043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32561	NC_012471	CTG	2	6	1523069	1523074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32562	NC_012471	TTC	2	6	1523084	1523089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32563	NC_012471	CGG	2	6	1523099	1523104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32564	NC_012471	GCT	2	6	1523129	1523134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32565	NC_012471	GGC	2	6	1523173	1523178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32566	NC_012471	TCC	2	6	1523182	1523187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32567	NC_012471	CTA	2	6	1523199	1523204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32568	NC_012471	CCT	2	6	1523234	1523239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32569	NC_012471	TTCC	2	8	1523300	1523307	0 %	50 %	0 %	50 %	225870832
32570	NC_012471	ATA	2	6	1523314	1523319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870832
32571	NC_012471	CT	3	6	1523391	1523396	0 %	50 %	0 %	50 %	225870832
32572	NC_012471	T	6	6	1523401	1523406	0 %	100 %	0 %	0 %	225870832
32573	NC_012471	TAAA	2	8	1523415	1523422	75 %	25 %	0 %	0 %	225870832
32574	NC_012471	CAT	2	6	1523466	1523471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870832
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32577	NC_012471	GCT	2	6	1523582	1523587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870832
32578	NC_012471	ATA	2	6	1523588	1523593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870832
32579	NC_012471	TCCT	2	8	1523596	1523603	0 %	50 %	0 %	50 %	225870832
32580	NC_012471	TA	3	6	1523605	1523610	50 %	50 %	0 %	0 %	225870832
32581	NC_012471	GTT	2	6	1523705	1523710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870832
32582	NC_012471	TAT	2	6	1523727	1523732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870832
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32584	NC_012471	TTA	2	6	1523759	1523764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870832
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32586	NC_012471	TATTT	2	10	1523827	1523836	20 %	80 %	0 %	0 %	225870832
32587	NC_012471	T	6	6	1523864	1523869	0 %	100 %	0 %	0 %	225870832
32588	NC_012471	ATCA	2	8	1523875	1523882	50 %	25 %	0 %	25 %	225870832
32589	NC_012471	TTC	2	6	1523898	1523903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32590	NC_012471	A	6	6	1523925	1523930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32591	NC_012471	GCTTT	2	10	1524125	1524134	0 %	60 %	20 %	20 %	225870833
32592	NC_012471	TGT	3	9	1524143	1524151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870833
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32595	NC_012471	ATGG	2	8	1524295	1524302	25 %	25 %	50 %	0 %	225870833
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32599	NC_012471	AGGTA	2	10	1524519	1524528	40 %	20 %	40 %	0 %	225870833
32600	NC_012471	AAG	2	6	1524626	1524631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870833
32601	NC_012471	ACG	2	6	1524645	1524650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870833
32602	NC_012471	TCA	2	6	1524677	1524682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870833
32603	NC_012471	T	6	6	1524693	1524698	0 %	100 %	0 %	0 %	225870833
32604	NC_012471	CGA	2	6	1524742	1524747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870833
32605	NC_012471	ATG	2	6	1524762	1524767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870833
32606	NC_012471	TCA	2	6	1524769	1524774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870833
32607	NC_012471	TCT	2	6	1524814	1524819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870833
32608	NC_012471	CTTGA	2	10	1524831	1524840	20 %	40 %	20 %	20 %	225870833
32609	NC_012471	TAA	2	6	1524841	1524846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870833
32610	NC_012471	GAT	2	6	1524915	1524920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32611	NC_012471	TC	3	6	1524963	1524968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32612	NC_012471	T	6	6	1524972	1524977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32613	NC_012471	TCT	2	6	1525082	1525087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870834
32614	NC_012471	TGG	2	6	1525107	1525112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870834
32615	NC_012471	CCTC	2	8	1525113	1525120	0 %	25 %	0 %	75 %	225870834
32616	NC_012471	ATCA	2	8	1525233	1525240	50 %	25 %	0 %	25 %	225870834
32617	NC_012471	TAT	2	6	1525251	1525256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870834
32618	NC_012471	AAT	2	6	1525277	1525282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870834
32619	NC_012471	C	6	6	1525460	1525465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32620	NC_012471	TCAA	2	8	1525545	1525552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32621	NC_012471	CTAT	2	8	1525559	1525566	25 %	50 %	0 %	25 %	225870835
32622	NC_012471	GCA	2	6	1525582	1525587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870835
32623	NC_012471	TGC	2	6	1525596	1525601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870835
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32626	NC_012471	CAT	2	6	1525670	1525675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870835
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32635	NC_012471	CTGA	2	8	1526006	1526013	25 %	25 %	25 %	25 %	225870835
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32682	NC_012471	T	6	6	1528326	1528331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32684	NC_012471	T	7	7	1528358	1528364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32693	NC_012471	GGA	2	6	1528586	1528591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32737	NC_012471	CAA	2	6	1530712	1530717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32741	NC_012471	CAA	2	6	1530853	1530858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32742	NC_012471	AGC	2	6	1530914	1530919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32743	NC_012471	TCC	2	6	1531022	1531027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32744	NC_012471	AGG	2	6	1531032	1531037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32745	NC_012471	AT	3	6	1531194	1531199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32746	NC_012471	AATA	2	8	1531210	1531217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32747	NC_012471	AGTT	2	8	1531280	1531287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32748	NC_012471	T	6	6	1531290	1531295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32749	NC_012471	AGC	2	6	1531314	1531319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32750	NC_012471	TTC	2	6	1531449	1531454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32752	NC_012471	CTAAG	2	10	1531476	1531485	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32753	NC_012471	ACG	2	6	1531491	1531496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870839
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32758	NC_012471	ATCT	2	8	1531716	1531723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32759	NC_012471	ATA	2	6	1531732	1531737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32765	NC_012471	A	6	6	1532059	1532064	100 %	0 %	0 %	0 %	225870840
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32782	NC_012471	TC	3	6	1532879	1532884	0 %	50 %	0 %	50 %	225870841
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32795	NC_012471	CAAGT	2	10	1533634	1533643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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32817	NC_012471	A	8	8	1534669	1534676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32818	NC_012471	A	6	6	1534704	1534709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32844	NC_012471	T	6	6	1536078	1536083	0 %	100 %	0 %	0 %	225870843
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32847	NC_012471	ATA	2	6	1536219	1536224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32848	NC_012471	A	9	9	1536238	1536246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32849	NC_012471	AGC	2	6	1536324	1536329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870844
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32853	NC_012471	CTT	2	6	1536482	1536487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870844
32854	NC_012471	CTTT	2	8	1536553	1536560	0 %	75 %	0 %	25 %	225870844
32855	NC_012471	TTA	2	6	1536575	1536580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870844
32856	NC_012471	T	6	6	1536618	1536623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32857	NC_012471	GA	3	6	1536691	1536696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32858	NC_012471	TTA	2	6	1536712	1536717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870845
32859	NC_012471	TTC	2	6	1536718	1536723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870845
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32861	NC_012471	ATC	2	6	1536754	1536759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870845
32862	NC_012471	ATA	3	9	1536773	1536781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870845
32863	NC_012471	AAT	2	6	1536799	1536804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870845
32864	NC_012471	CAT	2	6	1536807	1536812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870845
32865	NC_012471	AGC	2	6	1536832	1536837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870845
32866	NC_012471	TGA	2	6	1536848	1536853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870845
32867	NC_012471	TGA	2	6	1536992	1536997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870845
32868	NC_012471	CCTTT	2	10	1537056	1537065	0 %	60 %	0 %	40 %	225870845
32869	NC_012471	GCT	2	6	1537091	1537096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870845
32870	NC_012471	A	7	7	1537126	1537132	100 %	0 %	0 %	0 %	225870845
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32872	NC_012471	GCA	2	6	1537210	1537215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870846
32873	NC_012471	CAA	2	6	1537301	1537306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870846
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32875	NC_012471	TTG	2	6	1537319	1537324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870846
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32877	NC_012471	T	7	7	1537427	1537433	0 %	100 %	0 %	0 %	225870846
32878	NC_012471	TCA	2	6	1537438	1537443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870846
32879	NC_012471	T	6	6	1537459	1537464	0 %	100 %	0 %	0 %	225870846
32880	NC_012471	A	7	7	1537477	1537483	100 %	0 %	0 %	0 %	225870846
32881	NC_012471	CAA	2	6	1537493	1537498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870846
32882	NC_012471	ATA	2	6	1537572	1537577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870847
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32884	NC_012471	ATA	2	6	1537744	1537749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870847
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32888	NC_012471	GCTG	2	8	1537901	1537908	0 %	25 %	50 %	25 %	225870847
32889	NC_012471	AGCA	2	8	1537965	1537972	50 %	0 %	25 %	25 %	225870847
32890	NC_012471	TAG	2	6	1538023	1538028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870847
32891	NC_012471	GCC	2	6	1538064	1538069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870847
32892	NC_012471	CCA	2	6	1538083	1538088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870847
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32917	NC_012471	TGAG	2	8	1539078	1539085	25 %	25 %	50 %	0 %	225870848
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32925	NC_012471	TCGC	2	8	1539534	1539541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32926	NC_012471	CTTCAT	2	12	1539563	1539574	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225870850
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32932	NC_012471	AAAAT	2	10	1539870	1539879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32933	NC_012471	T	7	7	1539895	1539901	0 %	100 %	0 %	0 %	225870851
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32962	NC_012471	ATCA	2	8	1541458	1541465	50 %	25 %	0 %	25 %	225870852
32963	NC_012471	GTG	2	6	1541526	1541531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870852
32964	NC_012471	CGT	2	6	1541615	1541620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870852
32965	NC_012471	T	7	7	1541637	1541643	0 %	100 %	0 %	0 %	225870852
32966	NC_012471	TAA	2	6	1541658	1541663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870852
32967	NC_012471	CAT	2	6	1541664	1541669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870852
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32973	NC_012471	GCT	2	6	1542164	1542169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870852
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