MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_012471	CGA	2	6	1399836	1399841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870726
30002	NC_012471	TTG	2	6	1399875	1399880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870726
30003	NC_012471	AAT	3	9	1399910	1399918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870726
30004	NC_012471	TCA	2	6	1399956	1399961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870726
30005	NC_012471	TTA	2	6	1400019	1400024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870726
30006	NC_012471	ATTTC	2	10	1400032	1400041	20 %	60 %	0 %	20 %	225870726
30007	NC_012471	ATTCT	2	10	1400070	1400079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30008	NC_012471	TCAA	2	8	1400155	1400162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30009	NC_012471	CCTT	2	8	1400208	1400215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30010	NC_012471	T	6	6	1400254	1400259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30011	NC_012471	TA	3	6	1400268	1400273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30012	NC_012471	T	6	6	1400283	1400288	0 %	100 %	0 %	0 %	225870727
30013	NC_012471	TGG	2	6	1400295	1400300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870727
30014	NC_012471	TCA	2	6	1400389	1400394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870727
30015	NC_012471	GCT	2	6	1400422	1400427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30016	NC_012471	GCT	2	6	1400446	1400451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30017	NC_012471	ATG	2	6	1400458	1400463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870727
30018	NC_012471	ACCA	2	8	1400616	1400623	50 %	0 %	0 %	50 %	225870727
30019	NC_012471	CCG	2	6	1400648	1400653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870727
30020	NC_012471	TGC	2	6	1400687	1400692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30021	NC_012471	CATG	2	8	1400693	1400700	25 %	25 %	25 %	25 %	225870727
30022	NC_012471	CAG	2	6	1400708	1400713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30023	NC_012471	AGC	2	6	1400733	1400738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30024	NC_012471	ATAG	2	8	1400884	1400891	50 %	25 %	25 %	0 %	225870727
30025	NC_012471	CAA	2	6	1400906	1400911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870727
30026	NC_012471	ATT	2	6	1400922	1400927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870727
30027	NC_012471	GTT	2	6	1400946	1400951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870727
30028	NC_012471	CAA	2	6	1400957	1400962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870727
30029	NC_012471	T	6	6	1401014	1401019	0 %	100 %	0 %	0 %	225870727
30030	NC_012471	CCT	2	6	1401035	1401040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870727
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30032	NC_012471	CAA	2	6	1401128	1401133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870727
30033	NC_012471	CAC	2	6	1401134	1401139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870727
30034	NC_012471	ATC	2	6	1401186	1401191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870727
30035	NC_012471	AATC	2	8	1401212	1401219	50 %	25 %	0 %	25 %	225870727
30036	NC_012471	AAT	2	6	1401261	1401266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870727
30037	NC_012471	TTG	2	6	1401349	1401354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870727
30038	NC_012471	AAG	2	6	1401360	1401365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870727
30039	NC_012471	AAC	2	6	1401393	1401398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870727
30040	NC_012471	ATAGT	2	10	1401433	1401442	40 %	40 %	20 %	0 %	225870727
30041	NC_012471	CTG	2	6	1401470	1401475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30042	NC_012471	AGGT	2	8	1401511	1401518	25 %	25 %	50 %	0 %	225870727
30043	NC_012471	TTG	2	6	1401521	1401526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870727
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30049	NC_012471	ATG	2	6	1401649	1401654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870727
30050	NC_012471	TCA	2	6	1401661	1401666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870727
30051	NC_012471	GCA	2	6	1401667	1401672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30052	NC_012471	GCC	2	6	1401736	1401741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870727
30053	NC_012471	GCT	2	6	1401781	1401786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870727
30054	NC_012471	CCTG	2	8	1401859	1401866	0 %	25 %	25 %	50 %	225870727
30055	NC_012471	TCT	2	6	1401895	1401900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870727
30056	NC_012471	AGA	2	6	1401940	1401945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870727
30057	NC_012471	CCT	2	6	1401971	1401976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870727
30058	NC_012471	GAT	2	6	1401990	1401995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870727
30059	NC_012471	CTT	2	6	1402001	1402006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870727
30060	NC_012471	ATA	2	6	1402030	1402035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870727
30061	NC_012471	CT	3	6	1402225	1402230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30062	NC_012471	TCA	2	6	1402255	1402260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870728
30063	NC_012471	T	6	6	1402291	1402296	0 %	100 %	0 %	0 %	225870728
30064	NC_012471	CCA	2	6	1402332	1402337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870728
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30067	NC_012471	TGAT	2	8	1402451	1402458	25 %	50 %	25 %	0 %	225870728
30068	NC_012471	CCT	2	6	1402544	1402549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870728
30069	NC_012471	GA	3	6	1402592	1402597	50 %	0 %	50 %	0 %	225870728
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30071	NC_012471	CAT	2	6	1402638	1402643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870728
30072	NC_012471	CAT	2	6	1402698	1402703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870728
30073	NC_012471	TCA	2	6	1402740	1402745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870728
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30100	NC_012471	AT	3	6	1403666	1403671	50 %	50 %	0 %	0 %	225870728
30101	NC_012471	GCT	2	6	1403718	1403723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30103	NC_012471	TGA	2	6	1403751	1403756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30104	NC_012471	CTAAG	2	10	1403766	1403775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30105	NC_012471	TTG	2	6	1403801	1403806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870729
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30115	NC_012471	ACC	2	6	1404344	1404349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870729
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30117	NC_012471	GTT	2	6	1404475	1404480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870729
30118	NC_012471	T	6	6	1404479	1404484	0 %	100 %	0 %	0 %	225870729
30119	NC_012471	ATT	2	6	1404490	1404495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870729
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30121	NC_012471	CAA	2	6	1404543	1404548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870729
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30124	NC_012471	ATT	2	6	1404788	1404793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870729
30125	NC_012471	TCTGGA	2	12	1404906	1404917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225870730
30126	NC_012471	TCA	2	6	1404942	1404947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870730
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30128	NC_012471	TTC	2	6	1404983	1404988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870730
30129	NC_012471	TCA	2	6	1405056	1405061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870730
30130	NC_012471	CTT	2	6	1405066	1405071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870730
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30143	NC_012471	TTACC	2	10	1405567	1405576	20 %	40 %	0 %	40 %	225870730
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30145	NC_012471	GGT	2	6	1405639	1405644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870730
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30148	NC_012471	TGC	2	6	1405694	1405699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870730
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30150	NC_012471	GT	3	6	1405718	1405723	0 %	50 %	50 %	0 %	225870730
30151	NC_012471	ACG	2	6	1405742	1405747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870730
30152	NC_012471	TTA	2	6	1405755	1405760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870730
30153	NC_012471	TGT	2	6	1405812	1405817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870730
30154	NC_012471	TTC	2	6	1405881	1405886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30155	NC_012471	CTTT	2	8	1405910	1405917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30156	NC_012471	T	6	6	1405932	1405937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30157	NC_012471	TA	4	8	1405993	1406000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30158	NC_012471	ATC	2	6	1406070	1406075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30159	NC_012471	TCT	2	6	1406113	1406118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30161	NC_012471	TTGC	2	8	1406152	1406159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30162	NC_012471	TCC	2	6	1406365	1406370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870731
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30165	NC_012471	TGGC	2	8	1406554	1406561	0 %	25 %	50 %	25 %	225870731
30166	NC_012471	CAG	2	6	1406585	1406590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870731
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30187	NC_012471	CTTCT	2	10	1407474	1407483	0 %	60 %	0 %	40 %	225870731
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30199	NC_012471	G	6	6	1408284	1408289	0 %	0 %	100 %	0 %	225870731
30200	NC_012471	TAAGA	2	10	1408312	1408321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30201	NC_012471	TCA	2	6	1408323	1408328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30202	NC_012471	TGA	2	6	1408388	1408393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30203	NC_012471	CTG	2	6	1408400	1408405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30204	NC_012471	CAA	2	6	1408441	1408446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30205	NC_012471	CAC	2	6	1408450	1408455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30206	NC_012471	AAT	2	6	1408509	1408514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30207	NC_012471	CAATAC	2	12	1408534	1408545	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30208	NC_012471	CAG	2	6	1408591	1408596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30209	NC_012471	AGT	2	6	1408625	1408630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30210	NC_012471	T	6	6	1408630	1408635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30211	NC_012471	TAA	2	6	1408641	1408646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30212	NC_012471	TTC	2	6	1408675	1408680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870732
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30216	NC_012471	CAAGC	2	10	1408780	1408789	40 %	0 %	20 %	40 %	225870732
30217	NC_012471	CAAA	2	8	1408824	1408831	75 %	0 %	0 %	25 %	225870732
30218	NC_012471	CTG	2	6	1408881	1408886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870732
30219	NC_012471	AAT	2	6	1408899	1408904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870732
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30222	NC_012471	T	6	6	1409100	1409105	0 %	100 %	0 %	0 %	225870732
30223	NC_012471	GAAA	2	8	1409127	1409134	75 %	0 %	25 %	0 %	225870732
30224	NC_012471	TAA	2	6	1409174	1409179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870732
30225	NC_012471	GGT	2	6	1409191	1409196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870732
30226	NC_012471	CAC	2	6	1409230	1409235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870732
30227	NC_012471	AGC	2	6	1409255	1409260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870732
30228	NC_012471	TCC	2	6	1409299	1409304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870732
30229	NC_012471	AATGCT	2	12	1409431	1409442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225870732
30230	NC_012471	CCT	2	6	1409456	1409461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30231	NC_012471	CTGTAT	2	12	1409543	1409554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225870733
30232	NC_012471	AAC	2	6	1409569	1409574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870733
30233	NC_012471	GAA	2	6	1409577	1409582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870733
30234	NC_012471	CTC	2	6	1409626	1409631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870733
30235	NC_012471	TGT	2	6	1409692	1409697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870733
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30469	NC_012471	TCAG	2	8	1420729	1420736	25 %	25 %	25 %	25 %	225870742
30470	NC_012471	TCA	2	6	1420864	1420869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870742
30471	NC_012471	TGCA	2	8	1420899	1420906	25 %	25 %	25 %	25 %	225870742
30472	NC_012471	A	6	6	1420965	1420970	100 %	0 %	0 %	0 %	225870742
30473	NC_012471	T	6	6	1420997	1421002	0 %	100 %	0 %	0 %	225870742
30474	NC_012471	A	6	6	1421112	1421117	100 %	0 %	0 %	0 %	225870742
30475	NC_012471	TCA	2	6	1421126	1421131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870742
30476	NC_012471	GCA	2	6	1421149	1421154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870743
30477	NC_012471	TCT	2	6	1421205	1421210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870743
30478	NC_012471	CAG	2	6	1421306	1421311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870743
30479	NC_012471	TCAAC	2	10	1421356	1421365	40 %	20 %	0 %	40 %	225870743
30480	NC_012471	TTA	2	6	1421394	1421399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870743
30481	NC_012471	CTC	2	6	1421419	1421424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870743
30482	NC_012471	CAT	2	6	1421461	1421466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870743
30483	NC_012471	TTC	2	6	1421522	1421527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870743
30484	NC_012471	TCATC	2	10	1421542	1421551	20 %	40 %	0 %	40 %	225870743
30485	NC_012471	GCT	2	6	1421625	1421630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870743
30486	NC_012471	TGT	2	6	1421671	1421676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870743
30487	NC_012471	ATC	2	6	1421699	1421704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870743
30488	NC_012471	CTC	2	6	1421714	1421719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870743
30489	NC_012471	AAT	2	6	1421843	1421848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870743
30490	NC_012471	ATA	2	6	1421891	1421896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870743
30491	NC_012471	TCC	2	6	1421972	1421977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870743
30492	NC_012471	AAT	2	6	1421984	1421989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870743
30493	NC_012471	CTC	2	6	1422006	1422011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870743
30494	NC_012471	T	6	6	1422039	1422044	0 %	100 %	0 %	0 %	225870743
30495	NC_012471	CGA	2	6	1422074	1422079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870744
30496	NC_012471	ATG	2	6	1422085	1422090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870744
30497	NC_012471	AGCT	2	8	1422114	1422121	25 %	25 %	25 %	25 %	225870744
30498	NC_012471	GCT	2	6	1422147	1422152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870744
30499	NC_012471	GCG	2	6	1422200	1422205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870744
30500	NC_012471	A	6	6	1422235	1422240	100 %	0 %	0 %	0 %	225870744

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