MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012471	AG	3	6	639087	639092	50 %	0 %	50 %	0 %	225870064
13502	NC_012471	AGC	2	6	639097	639102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870064
13503	NC_012471	AAT	2	6	639126	639131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870064
13504	NC_012471	AGC	2	6	639137	639142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_012471	GAAG	2	8	639275	639282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_012471	TATGGT	2	12	639287	639298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_012471	T	6	6	639322	639327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_012471	TGC	2	6	639368	639373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_012471	TGTC	2	8	639387	639394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13510	NC_012471	GTT	2	6	639448	639453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_012471	T	6	6	639452	639457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_012471	TAT	2	6	639521	639526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870065
13513	NC_012471	A	6	6	639531	639536	100 %	0 %	0 %	0 %	225870065
13514	NC_012471	TGG	2	6	639568	639573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870065
13515	NC_012471	GAT	2	6	639593	639598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870065
13516	NC_012471	TTA	2	6	639613	639618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870065
13517	NC_012471	CTAG	2	8	639639	639646	25 %	25 %	25 %	25 %	225870065
13518	NC_012471	TGG	2	6	639697	639702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870065
13519	NC_012471	ATT	2	6	639747	639752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870065
13520	NC_012471	TGA	2	6	639907	639912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870065
13521	NC_012471	CAG	2	6	639919	639924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870065
13522	NC_012471	TCTT	2	8	639932	639939	0 %	75 %	0 %	25 %	225870065
13523	NC_012471	AATGCT	2	12	639950	639961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225870065
13524	NC_012471	TGC	2	6	639979	639984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870065
13525	NC_012471	ATGGT	2	10	639985	639994	20 %	40 %	40 %	0 %	225870065
13526	NC_012471	TTAT	2	8	640011	640018	25 %	75 %	0 %	0 %	225870065
13527	NC_012471	CTT	2	6	640025	640030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870065
13528	NC_012471	TAG	2	6	640088	640093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_012471	T	6	6	640119	640124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_012471	T	6	6	640140	640145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_012471	A	6	6	640147	640152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_012471	CGA	2	6	640230	640235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870066
13533	NC_012471	T	6	6	640267	640272	0 %	100 %	0 %	0 %	225870066
13534	NC_012471	GAT	2	6	640306	640311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870066
13535	NC_012471	ATT	2	6	640418	640423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870066
13536	NC_012471	TGGC	2	8	640428	640435	0 %	25 %	50 %	25 %	225870066
13537	NC_012471	ATG	2	6	640457	640462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870066
13538	NC_012471	T	6	6	640478	640483	0 %	100 %	0 %	0 %	225870066
13539	NC_012471	A	6	6	640486	640491	100 %	0 %	0 %	0 %	225870066
13540	NC_012471	AGA	2	6	640615	640620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870066
13541	NC_012471	TGC	2	6	640648	640653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870066
13542	NC_012471	CTC	2	6	640656	640661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870066
13543	NC_012471	TTG	2	6	640698	640703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870066
13544	NC_012471	TGA	2	6	640773	640778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870066
13545	NC_012471	TTG	2	6	640782	640787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870066
13546	NC_012471	CGG	2	6	640830	640835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870066
13547	NC_012471	TTA	2	6	640936	640941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870066
13548	NC_012471	ACG	2	6	641047	641052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_012471	AGG	2	6	641060	641065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_012471	CAT	2	6	641088	641093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870067
13551	NC_012471	A	6	6	641098	641103	100 %	0 %	0 %	0 %	225870067
13552	NC_012471	A	6	6	641105	641110	100 %	0 %	0 %	0 %	225870067
13553	NC_012471	T	7	7	641139	641145	0 %	100 %	0 %	0 %	225870067
13554	NC_012471	T	7	7	641154	641160	0 %	100 %	0 %	0 %	225870067
13555	NC_012471	TTG	2	6	641163	641168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870067
13556	NC_012471	TCA	2	6	641383	641388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870067
13557	NC_012471	GCT	2	6	641393	641398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870067
13558	NC_012471	ATT	3	9	641445	641453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870067
13559	NC_012471	TAA	2	6	641524	641529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870067
13560	NC_012471	AT	3	6	641546	641551	50 %	50 %	0 %	0 %	225870067
13561	NC_012471	CT	3	6	641566	641571	0 %	50 %	0 %	50 %	225870067
13562	NC_012471	GCA	2	6	641639	641644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870067
13563	NC_012471	CAT	2	6	641701	641706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870067
13564	NC_012471	GGA	2	6	641767	641772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870067
13565	NC_012471	TGC	2	6	641782	641787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870067
13566	NC_012471	TAT	2	6	641788	641793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870067
13567	NC_012471	GAA	2	6	641831	641836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870067
13568	NC_012471	GAG	2	6	641909	641914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870067
13569	NC_012471	CAGA	2	8	642077	642084	50 %	0 %	25 %	25 %	225870067
13570	NC_012471	GCT	2	6	642101	642106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870067
13571	NC_012471	CA	3	6	642177	642182	50 %	0 %	0 %	50 %	225870067
13572	NC_012471	TGT	2	6	642250	642255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870067
13573	NC_012471	TTGA	2	8	642314	642321	25 %	50 %	25 %	0 %	225870067
13574	NC_012471	TGG	2	6	642337	642342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870067
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13578	NC_012471	ATA	2	6	642606	642611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870067
13579	NC_012471	GGC	2	6	642698	642703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870067
13580	NC_012471	TAAG	2	8	642771	642778	50 %	25 %	25 %	0 %	225870067
13581	NC_012471	GCT	2	6	642815	642820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870067
13582	NC_012471	ATT	2	6	642833	642838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870067
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13587	NC_012471	CT	3	6	643063	643068	0 %	50 %	0 %	50 %	225870067
13588	NC_012471	AATT	2	8	643175	643182	50 %	50 %	0 %	0 %	225870068
13589	NC_012471	TGA	2	6	643257	643262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870068
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13592	NC_012471	GTT	2	6	643399	643404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870068
13593	NC_012471	A	6	6	643433	643438	100 %	0 %	0 %	0 %	225870068
13594	NC_012471	TGC	2	6	643466	643471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870068
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13597	NC_012471	CTG	2	6	643634	643639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870068
13598	NC_012471	TGA	2	6	643698	643703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870068
13599	NC_012471	CTG	2	6	643711	643716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870068
13600	NC_012471	CT	3	6	643763	643768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13601	NC_012471	AAGG	2	8	643803	643810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_012471	AAGC	2	8	643835	643842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13603	NC_012471	TAA	2	6	643855	643860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_012471	AAAC	2	8	643900	643907	75 %	0 %	0 %	25 %	225870069
13605	NC_012471	TAT	2	6	643916	643921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870069
13606	NC_012471	TGA	2	6	643973	643978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870069
13607	NC_012471	T	6	6	643999	644004	0 %	100 %	0 %	0 %	225870069
13608	NC_012471	TGA	2	6	644087	644092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870069
13609	NC_012471	AGC	2	6	644114	644119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870069
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13617	NC_012471	TTC	2	6	644758	644763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870069
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13619	NC_012471	T	6	6	645004	645009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_012471	AGAA	2	8	645102	645109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_012471	T	6	6	645192	645197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13623	NC_012471	TA	3	6	645233	645238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13993	NC_012471	AAAG	2	8	663495	663502	75 %	0 %	25 %	0 %	225870084
13994	NC_012471	GCT	2	6	663563	663568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870084
13995	NC_012471	A	8	8	663572	663579	100 %	0 %	0 %	0 %	225870084
13996	NC_012471	TGACT	2	10	663596	663605	20 %	40 %	20 %	20 %	225870084
13997	NC_012471	T	6	6	663672	663677	0 %	100 %	0 %	0 %	225870084
13998	NC_012471	GGT	2	6	663689	663694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870084
13999	NC_012471	ATC	2	6	663703	663708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870084
14000	NC_012471	A	7	7	663729	663735	100 %	0 %	0 %	0 %	225870084

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