MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012471	TGA	2	6	616695	616700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870041
13002	NC_012471	GAA	2	6	616720	616725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870041
13003	NC_012471	GCT	2	6	616769	616774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870041
13004	NC_012471	GCTGA	2	10	616803	616812	20 %	20 %	40 %	20 %	225870041
13005	NC_012471	CGC	2	6	616914	616919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
13006	NC_012471	CGC	2	6	616941	616946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
13007	NC_012471	CGC	2	6	617157	617162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
13008	NC_012471	CGC	2	6	617184	617189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
13009	NC_012471	ACC	2	6	617347	617352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870041
13010	NC_012471	T	6	6	617353	617358	0 %	100 %	0 %	0 %	225870041
13011	NC_012471	ATGT	2	8	617406	617413	25 %	50 %	25 %	0 %	225870041
13012	NC_012471	GTCC	2	8	617442	617449	0 %	25 %	25 %	50 %	225870041
13013	NC_012471	CTGGAT	2	12	617463	617474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225870041
13014	NC_012471	TTG	2	6	617535	617540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870041
13015	NC_012471	GCT	2	6	617552	617557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870041
13016	NC_012471	T	7	7	617583	617589	0 %	100 %	0 %	0 %	225870041
13017	NC_012471	TC	3	6	617596	617601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13018	NC_012471	TGA	2	6	617605	617610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_012471	GAA	2	6	617642	617647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_012471	T	7	7	617705	617711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_012471	GAG	2	6	617764	617769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_012471	TTGCT	2	10	617770	617779	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13023	NC_012471	TTGT	2	8	617827	617834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_012471	TGT	2	6	617862	617867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_012471	ATG	2	6	617994	617999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870042
13026	NC_012471	TGT	2	6	618011	618016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870042
13027	NC_012471	T	6	6	618018	618023	0 %	100 %	0 %	0 %	225870042
13028	NC_012471	TGG	2	6	618127	618132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870042
13029	NC_012471	TTGCTT	2	12	618145	618156	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225870042
13030	NC_012471	GT	3	6	618193	618198	0 %	50 %	50 %	0 %	225870042
13031	NC_012471	TGGATT	2	12	618199	618210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225870042
13032	NC_012471	TAT	4	12	618230	618241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870042
13033	NC_012471	GCT	2	6	618318	618323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870042
13034	NC_012471	CT	3	6	618326	618331	0 %	50 %	0 %	50 %	225870042
13035	NC_012471	TGA	2	6	618547	618552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870042
13036	NC_012471	AAC	2	6	618554	618559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870042
13037	NC_012471	ATT	2	6	618572	618577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870042
13038	NC_012471	GCT	2	6	618580	618585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870042
13039	NC_012471	AGGG	2	8	618604	618611	25 %	0 %	75 %	0 %	225870042
13040	NC_012471	ATT	2	6	618724	618729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870043
13041	NC_012471	CAA	2	6	618788	618793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870043
13042	NC_012471	CAG	2	6	618880	618885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870043
13043	NC_012471	CAAAA	2	10	618939	618948	80 %	0 %	0 %	20 %	225870043
13044	NC_012471	AG	3	6	618974	618979	50 %	0 %	50 %	0 %	225870043
13045	NC_012471	GCT	2	6	618987	618992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870043
13046	NC_012471	GA	3	6	619008	619013	50 %	0 %	50 %	0 %	225870043
13047	NC_012471	GCT	2	6	619018	619023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870043
13048	NC_012471	GGT	2	6	619045	619050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870043
13049	NC_012471	CAG	3	9	619051	619059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870043
13050	NC_012471	ATTGCG	2	12	619063	619074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225870043
13051	NC_012471	CG	3	6	619073	619078	0 %	0 %	50 %	50 %	225870043
13052	NC_012471	TGC	2	6	619100	619105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870043
13053	NC_012471	TGA	2	6	619110	619115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870043
13054	NC_012471	TGG	2	6	619142	619147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870043
13055	NC_012471	GGT	2	6	619261	619266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870043
13056	NC_012471	AGG	2	6	619313	619318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870043
13057	NC_012471	GCA	2	6	619373	619378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_012471	TGTT	2	8	619413	619420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_012471	TTTG	2	8	619429	619436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_012471	TGGT	2	8	619455	619462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_012471	GCT	2	6	619495	619500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_012471	TTG	2	6	619587	619592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_012471	TGA	2	6	619639	619644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_012471	GCTTT	2	10	619705	619714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13065	NC_012471	T	6	6	619712	619717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_012471	GAT	2	6	619718	619723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_012471	TGT	3	9	619760	619768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_012471	TGG	2	6	619774	619779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_012471	AGG	2	6	619789	619794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_012471	ATA	2	6	619795	619800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870044
13071	NC_012471	T	6	6	619841	619846	0 %	100 %	0 %	0 %	225870044
13072	NC_012471	GAA	2	6	619851	619856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870044
13073	NC_012471	ATG	2	6	619885	619890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870044
13074	NC_012471	CAG	2	6	619936	619941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870044
13075	NC_012471	TGGT	2	8	619990	619997	0 %	50 %	50 %	0 %	225870044
13076	NC_012471	ATT	2	6	620025	620030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870044
13077	NC_012471	ATG	2	6	620074	620079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870044
13078	NC_012471	GAG	2	6	620373	620378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870044
13079	NC_012471	TGA	2	6	620408	620413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870044
13080	NC_012471	AGG	2	6	620422	620427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870044
13081	NC_012471	AAGA	2	8	620433	620440	75 %	0 %	25 %	0 %	225870044
13082	NC_012471	AAG	2	6	620671	620676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870044
13083	NC_012471	AGC	2	6	620681	620686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870044
13084	NC_012471	GCT	2	6	620739	620744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870044
13085	NC_012471	TCTT	2	8	620758	620765	0 %	75 %	0 %	25 %	225870044
13086	NC_012471	TAA	2	6	620771	620776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870044
13087	NC_012471	TGT	2	6	620788	620793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870044
13088	NC_012471	CTA	2	6	620795	620800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870044
13089	NC_012471	ATG	2	6	621066	621071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870044
13090	NC_012471	CTA	2	6	621089	621094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870044
13091	NC_012471	GTCA	2	8	621106	621113	25 %	25 %	25 %	25 %	225870044
13092	NC_012471	GCTAGA	2	12	621176	621187	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225870044
13093	NC_012471	GGA	2	6	621224	621229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870044
13094	NC_012471	ATT	2	6	621334	621339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870044
13095	NC_012471	TGA	2	6	621341	621346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870044
13096	NC_012471	AAAAGG	2	12	621537	621548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_012471	T	6	6	621565	621570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_012471	A	6	6	621584	621589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_012471	ATT	2	6	621615	621620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870045
13100	NC_012471	GCAG	2	8	621647	621654	25 %	0 %	50 %	25 %	225870045
13101	NC_012471	AAG	2	6	621663	621668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870045
13102	NC_012471	AG	3	6	621671	621676	50 %	0 %	50 %	0 %	225870045
13103	NC_012471	TTG	2	6	621709	621714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870045
13104	NC_012471	TAA	2	6	621758	621763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870045
13105	NC_012471	AGC	2	6	621779	621784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870045
13106	NC_012471	GAT	2	6	621867	621872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870045
13107	NC_012471	GTC	2	6	622003	622008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870045
13108	NC_012471	TTG	2	6	622111	622116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870045
13109	NC_012471	GTC	2	6	622201	622206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870045
13110	NC_012471	TTG	2	6	622222	622227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870045
13111	NC_012471	TGT	2	6	622277	622282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870045
13112	NC_012471	GATT	2	8	622318	622325	25 %	50 %	25 %	0 %	225870045
13113	NC_012471	TGA	2	6	622340	622345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870045
13114	NC_012471	GTG	2	6	622384	622389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870045
13115	NC_012471	AGC	2	6	622433	622438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870045
13116	NC_012471	AAG	2	6	622442	622447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870045
13117	NC_012471	TTG	2	6	622476	622481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870046
13118	NC_012471	GTT	3	9	622487	622495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870046
13119	NC_012471	TAG	2	6	622542	622547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870046
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13121	NC_012471	TAT	3	9	622573	622581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870046
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13222	NC_012471	AG	3	6	627280	627285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13223	NC_012471	TTA	2	6	627295	627300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870052
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13233	NC_012471	A	7	7	627827	627833	100 %	0 %	0 %	0 %	225870052
13234	NC_012471	GC	3	6	627850	627855	0 %	0 %	50 %	50 %	225870052
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13238	NC_012471	ATGA	2	8	628042	628049	50 %	25 %	25 %	0 %	225870052
13239	NC_012471	GT	3	6	628100	628105	0 %	50 %	50 %	0 %	225870052
13240	NC_012471	TTA	2	6	628113	628118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870052
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13242	NC_012471	GCAG	2	8	628177	628184	25 %	0 %	50 %	25 %	225870052
13243	NC_012471	GGT	2	6	628243	628248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870052
13244	NC_012471	ATG	2	6	628253	628258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870052
13245	NC_012471	ACT	2	6	628265	628270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870052
13246	NC_012471	TTA	2	6	628297	628302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870052
13247	NC_012471	TGA	2	6	628323	628328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870052
13248	NC_012471	TGA	2	6	628367	628372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870052
13249	NC_012471	AGCTG	2	10	628434	628443	20 %	20 %	40 %	20 %	225870052
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13251	NC_012471	GGT	2	6	628585	628590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870052
13252	NC_012471	TGCT	2	8	628607	628614	0 %	50 %	25 %	25 %	225870052
13253	NC_012471	A	6	6	628633	628638	100 %	0 %	0 %	0 %	225870052
13254	NC_012471	A	7	7	628711	628717	100 %	0 %	0 %	0 %	225870052
13255	NC_012471	TA	3	6	628718	628723	50 %	50 %	0 %	0 %	225870052
13256	NC_012471	TATTT	2	10	628795	628804	20 %	80 %	0 %	0 %	225870052
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13262	NC_012471	GCAA	2	8	629041	629048	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13263	NC_012471	TGAT	3	12	629112	629123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13264	NC_012471	ACTG	2	8	629156	629163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13265	NC_012471	AGG	2	6	629164	629169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13267	NC_012471	TGA	2	6	629214	629219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870053
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13276	NC_012471	TTTA	2	8	629427	629434	25 %	75 %	0 %	0 %	225870053
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