MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012471	ACA	2	6	545332	545337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869982
11502	NC_012471	TGC	2	6	545348	545353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11503	NC_012471	CAA	2	6	545503	545508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869982
11504	NC_012471	TTA	2	6	545588	545593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869982
11505	NC_012471	TTC	2	6	545740	545745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869982
11506	NC_012471	T	6	6	545755	545760	0 %	100 %	0 %	0 %	225869982
11507	NC_012471	ATG	2	6	545803	545808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869982
11508	NC_012471	TTG	2	6	545845	545850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869982
11509	NC_012471	TTA	2	6	545909	545914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869982
11510	NC_012471	A	6	6	545974	545979	100 %	0 %	0 %	0 %	225869982
11511	NC_012471	CTG	2	6	546061	546066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11512	NC_012471	ATT	2	6	546105	546110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869982
11513	NC_012471	CTG	2	6	546154	546159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11514	NC_012471	ATG	3	9	546172	546180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869982
11515	NC_012471	AGG	2	6	546256	546261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869982
11516	NC_012471	TGT	2	6	546386	546391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869982
11517	NC_012471	AGCT	2	8	546473	546480	25 %	25 %	25 %	25 %	225869982
11518	NC_012471	CAAG	2	8	546520	546527	50 %	0 %	25 %	25 %	225869982
11519	NC_012471	AGA	2	6	546554	546559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869982
11520	NC_012471	TCT	2	6	546562	546567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869982
11521	NC_012471	AAGA	2	8	546576	546583	75 %	0 %	25 %	0 %	225869982
11522	NC_012471	ATA	2	6	546634	546639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869982
11523	NC_012471	TGA	2	6	546643	546648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869982
11524	NC_012471	ATT	3	9	546709	546717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869982
11525	NC_012471	GCT	2	6	546762	546767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11526	NC_012471	AGT	2	6	546794	546799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869982
11527	NC_012471	A	6	6	546834	546839	100 %	0 %	0 %	0 %	225869982
11528	NC_012471	AGCC	2	8	546841	546848	25 %	0 %	25 %	50 %	225869982
11529	NC_012471	CTTAT	2	10	546853	546862	20 %	60 %	0 %	20 %	225869982
11530	NC_012471	TGA	2	6	546866	546871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869982
11531	NC_012471	ATC	2	6	546973	546978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869982
11532	NC_012471	GCTT	2	8	547034	547041	0 %	50 %	25 %	25 %	225869982
11533	NC_012471	GCA	2	6	547114	547119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11534	NC_012471	AGC	2	6	547133	547138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11535	NC_012471	TC	3	6	547167	547172	0 %	50 %	0 %	50 %	225869982
11536	NC_012471	AGG	2	6	547262	547267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869982
11537	NC_012471	AGC	2	6	547324	547329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11538	NC_012471	TCA	2	6	547374	547379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869982
11539	NC_012471	A	6	6	547413	547418	100 %	0 %	0 %	0 %	225869982
11540	NC_012471	AGCA	2	8	547444	547451	50 %	0 %	25 %	25 %	225869982
11541	NC_012471	AGC	2	6	547490	547495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869982
11542	NC_012471	AAG	2	6	547515	547520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869982
11543	NC_012471	AAGC	2	8	547525	547532	50 %	0 %	25 %	25 %	225869982
11544	NC_012471	GAG	2	6	547689	547694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_012471	A	7	7	547706	547712	100 %	0 %	0 %	0 %	225869983
11546	NC_012471	CTT	2	6	547717	547722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869983
11547	NC_012471	CTGG	2	8	547752	547759	0 %	25 %	50 %	25 %	225869983
11548	NC_012471	ATTT	2	8	547770	547777	25 %	75 %	0 %	0 %	225869983
11549	NC_012471	GCC	2	6	547778	547783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869983
11550	NC_012471	TGA	2	6	547792	547797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869983
11551	NC_012471	A	7	7	547878	547884	100 %	0 %	0 %	0 %	225869983
11552	NC_012471	TGA	2	6	548210	548215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869983
11553	NC_012471	TAT	2	6	548316	548321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869983
11554	NC_012471	T	6	6	548449	548454	0 %	100 %	0 %	0 %	225869983
11555	NC_012471	TGA	2	6	548474	548479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869983
11556	NC_012471	CAA	2	6	548503	548508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869983
11557	NC_012471	CTG	2	6	548635	548640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869983
11558	NC_012471	CAGA	2	8	548709	548716	50 %	0 %	25 %	25 %	225869983
11559	NC_012471	ACA	2	6	548727	548732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869983
11560	NC_012471	AG	3	6	548844	548849	50 %	0 %	50 %	0 %	225869983
11561	NC_012471	ACTA	2	8	548853	548860	50 %	25 %	0 %	25 %	225869983
11562	NC_012471	AGA	2	6	548920	548925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869983
11563	NC_012471	ACTGCA	2	12	548931	548942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225869983
11564	NC_012471	TTA	2	6	548972	548977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869983
11565	NC_012471	CAG	2	6	549045	549050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869983
11566	NC_012471	AAT	2	6	549060	549065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869983
11567	NC_012471	TGTCAG	2	12	549115	549126	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225869983
11568	NC_012471	GAT	2	6	549149	549154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869983
11569	NC_012471	GCCA	2	8	549177	549184	25 %	0 %	25 %	50 %	225869983
11570	NC_012471	AAC	2	6	549197	549202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869983
11571	NC_012471	TTA	2	6	549206	549211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869983
11572	NC_012471	TCC	2	6	549216	549221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869983
11573	NC_012471	GCTG	2	8	549308	549315	0 %	25 %	50 %	25 %	225869983
11574	NC_012471	CAG	2	6	549355	549360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869983
11575	NC_012471	TTTAGC	2	12	549386	549397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11576	NC_012471	TGGC	2	8	549399	549406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11577	NC_012471	GAG	2	6	549494	549499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_012471	GCT	2	6	549502	549507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_012471	ACCAA	2	10	549531	549540	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11580	NC_012471	GCTC	2	8	549542	549549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11581	NC_012471	GAA	2	6	549557	549562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_012471	TTTG	2	8	549591	549598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_012471	TAA	2	6	549651	549656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_012471	AAT	2	6	549665	549670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_012471	TAAT	2	8	549678	549685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_012471	TTATC	2	10	549697	549706	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11587	NC_012471	A	6	6	549710	549715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_012471	TAA	2	6	549843	549848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_012471	A	7	7	549920	549926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_012471	ACT	2	6	550071	550076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_012471	ACA	2	6	550082	550087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_012471	CAA	2	6	550105	550110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_012471	GCAGAA	2	12	550209	550220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11594	NC_012471	GAA	3	9	550236	550244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_012471	AGA	2	6	550270	550275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_012471	AGCA	2	8	550299	550306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11597	NC_012471	CTT	2	6	550329	550334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_012471	TGGT	2	8	550381	550388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_012471	ATG	2	6	550401	550406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_012471	AAACT	2	10	550410	550419	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11601	NC_012471	TAC	2	6	550585	550590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_012471	AAG	2	6	550640	550645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_012471	AAG	2	6	550784	550789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_012471	GAAGA	2	10	550790	550799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_012471	AAG	2	6	550815	550820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_012471	AAG	2	6	550823	550828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_012471	TTC	2	6	550859	550864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_012471	GTT	2	6	550904	550909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_012471	CAA	2	6	550914	550919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_012471	TGT	2	6	550937	550942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_012471	GTT	2	6	550991	550996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_012471	AAG	2	6	551010	551015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_012471	TCA	2	6	551016	551021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_012471	TGG	2	6	551026	551031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_012471	T	7	7	551040	551046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_012471	CTG	2	6	551058	551063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_012471	AGCTT	2	10	551240	551249	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11618	NC_012471	TCC	2	6	551251	551256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11619	NC_012471	TAA	2	6	551257	551262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_012471	AAGG	2	8	551309	551316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_012471	ATG	2	6	551376	551381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869984
11622	NC_012471	AGGC	2	8	551429	551436	25 %	0 %	50 %	25 %	225869984
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11624	NC_012471	CTG	2	6	551573	551578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869984
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11991	NC_012471	ATG	2	6	568781	568786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_012471	TGA	2	6	568917	568922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11994	NC_012471	TCT	2	6	569019	569024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11995	NC_012471	AAG	2	6	569041	569046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11997	NC_012471	TTGA	2	8	569263	569270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11999	NC_012471	AAC	2	6	569426	569431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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