MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012471	TG	3	6	520015	520020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_012471	AAAG	2	8	520044	520051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_012471	T	8	8	520057	520064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_012471	GAAA	2	8	520120	520127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_012471	A	7	7	520211	520217	100 %	0 %	0 %	0 %	225869962
11006	NC_012471	CTG	2	6	520293	520298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869962
11007	NC_012471	TGC	2	6	520378	520383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869962
11008	NC_012471	TGA	2	6	520384	520389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869962
11009	NC_012471	T	6	6	520390	520395	0 %	100 %	0 %	0 %	225869962
11010	NC_012471	TGGT	2	8	520543	520550	0 %	50 %	50 %	0 %	225869962
11011	NC_012471	TTGCT	2	10	520552	520561	0 %	60 %	20 %	20 %	225869962
11012	NC_012471	TGC	2	6	520585	520590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869962
11013	NC_012471	TAT	2	6	520604	520609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869962
11014	NC_012471	GAA	2	6	520632	520637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869962
11015	NC_012471	TTA	2	6	520657	520662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869962
11016	NC_012471	ATA	2	6	520688	520693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869962
11017	NC_012471	GAAA	2	8	520738	520745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_012471	CTG	2	6	520802	520807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_012471	GCTT	2	8	520847	520854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_012471	CAA	2	6	520868	520873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_012471	TAA	2	6	520886	520891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_012471	TAGGTG	2	12	520929	520940	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_012471	CAG	2	6	520987	520992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_012471	A	6	6	521036	521041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_012471	ATT	2	6	521084	521089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869963
11026	NC_012471	CCTT	2	8	521181	521188	0 %	50 %	0 %	50 %	225869963
11027	NC_012471	TGC	2	6	521215	521220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869963
11028	NC_012471	TCG	2	6	521236	521241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869963
11029	NC_012471	CTG	2	6	521244	521249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869963
11030	NC_012471	GTG	2	6	521303	521308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869963
11031	NC_012471	TTG	2	6	521397	521402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869963
11032	NC_012471	CAG	2	6	521495	521500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869963
11033	NC_012471	CAG	2	6	521529	521534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869963
11034	NC_012471	TTC	2	6	521634	521639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869963
11035	NC_012471	TGC	2	6	521691	521696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869963
11036	NC_012471	AAG	2	6	521721	521726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869963
11037	NC_012471	GTG	2	6	521814	521819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869963
11038	NC_012471	TTG	2	6	521892	521897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869963
11039	NC_012471	TTG	2	6	521924	521929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869963
11040	NC_012471	GAT	2	6	521930	521935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869963
11041	NC_012471	AGC	2	6	521968	521973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869963
11042	NC_012471	TGC	2	6	522032	522037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_012471	AGC	2	6	522039	522044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_012471	TGA	2	6	522092	522097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_012471	TTA	2	6	522151	522156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_012471	GAA	2	6	522214	522219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_012471	GAAA	2	8	522222	522229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_012471	TCT	2	6	522296	522301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_012471	ATG	2	6	522331	522336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11050	NC_012471	AGC	2	6	522404	522409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11051	NC_012471	TTG	2	6	522410	522415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869964
11052	NC_012471	CGT	2	6	522484	522489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11053	NC_012471	CAG	2	6	522520	522525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11054	NC_012471	A	7	7	522559	522565	100 %	0 %	0 %	0 %	225869964
11055	NC_012471	TGA	2	6	522636	522641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11056	NC_012471	AGC	2	6	522723	522728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11057	NC_012471	GAT	2	6	522832	522837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11058	NC_012471	CATT	2	8	522864	522871	25 %	50 %	0 %	25 %	225869964
11059	NC_012471	GAT	2	6	522993	522998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11060	NC_012471	TGA	2	6	523050	523055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11061	NC_012471	TAG	2	6	523082	523087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11062	NC_012471	AGA	2	6	523140	523145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869964
11063	NC_012471	GAA	2	6	523164	523169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869964
11064	NC_012471	CGTG	2	8	523188	523195	0 %	25 %	50 %	25 %	225869964
11065	NC_012471	TTG	2	6	523289	523294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869964
11066	NC_012471	CTAT	2	8	523339	523346	25 %	50 %	0 %	25 %	225869964
11067	NC_012471	AGCT	2	8	523364	523371	25 %	25 %	25 %	25 %	225869964
11068	NC_012471	A	6	6	523475	523480	100 %	0 %	0 %	0 %	225869964
11069	NC_012471	TGC	2	6	523494	523499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11070	NC_012471	TGA	2	6	523545	523550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11071	NC_012471	GCT	3	9	523597	523605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11072	NC_012471	ATT	2	6	523628	523633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869964
11073	NC_012471	CTTGCT	2	12	523684	523695	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225869964
11074	NC_012471	CTG	2	6	523711	523716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11075	NC_012471	CGT	2	6	523771	523776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11076	NC_012471	TGAT	2	8	523838	523845	25 %	50 %	25 %	0 %	225869964
11077	NC_012471	ATG	2	6	523930	523935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11078	NC_012471	TGT	2	6	523989	523994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869964
11079	NC_012471	CTG	2	6	524057	524062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869964
11080	NC_012471	TGAT	2	8	524117	524124	25 %	50 %	25 %	0 %	225869964
11081	NC_012471	AGCT	2	8	524207	524214	25 %	25 %	25 %	25 %	225869964
11082	NC_012471	TGA	2	6	524241	524246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869964
11083	NC_012471	T	6	6	524248	524253	0 %	100 %	0 %	0 %	225869964
11084	NC_012471	AAT	2	6	524369	524374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869964
11085	NC_012471	GAT	2	6	524427	524432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_012471	TAC	2	6	524527	524532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_012471	AAG	2	6	524641	524646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_012471	CTT	2	6	524658	524663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_012471	AGC	2	6	524682	524687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_012471	GCAG	2	8	524774	524781	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11091	NC_012471	CAT	2	6	524853	524858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_012471	TCA	2	6	524865	524870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_012471	GCT	2	6	524871	524876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_012471	A	7	7	524919	524925	100 %	0 %	0 %	0 %	225869965
11095	NC_012471	A	6	6	524948	524953	100 %	0 %	0 %	0 %	225869965
11096	NC_012471	A	7	7	524955	524961	100 %	0 %	0 %	0 %	225869965
11097	NC_012471	CGC	2	6	525030	525035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869965
11098	NC_012471	TTG	2	6	525067	525072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869965
11099	NC_012471	TGA	2	6	525149	525154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869965
11100	NC_012471	ATT	2	6	525167	525172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869965
11101	NC_012471	ATT	2	6	525273	525278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_012471	TCA	2	6	525317	525322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_012471	ATA	3	9	525340	525348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_012471	AAT	2	6	525458	525463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_012471	AAAG	2	8	525486	525493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_012471	TAATA	2	10	525516	525525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_012471	TAGC	2	8	525572	525579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_012471	GTTTT	2	10	525655	525664	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_012471	AGG	2	6	525682	525687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_012471	CTA	2	6	525724	525729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869966
11111	NC_012471	AAC	2	6	525740	525745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869966
11112	NC_012471	TGG	2	6	525758	525763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869966
11113	NC_012471	TGC	2	6	525765	525770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869966
11114	NC_012471	TTG	3	9	525782	525790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869966
11115	NC_012471	TAC	2	6	525815	525820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869966
11116	NC_012471	ACA	2	6	525826	525831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869966
11117	NC_012471	GTA	2	6	526016	526021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_012471	TAT	2	6	526055	526060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_012471	TTA	2	6	526061	526066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_012471	AT	3	6	526067	526072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_012471	T	7	7	526094	526100	0 %	100 %	0 %	0 %	225869967
11122	NC_012471	AAC	2	6	526110	526115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869967
11123	NC_012471	AGA	2	6	526144	526149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869967
11124	NC_012471	ATC	3	9	526200	526208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869967
11125	NC_012471	TGA	2	6	526258	526263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869967
11126	NC_012471	TGA	2	6	526290	526295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869967
11127	NC_012471	TAA	2	6	526306	526311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869967
11128	NC_012471	T	6	6	526346	526351	0 %	100 %	0 %	0 %	225869967
11129	NC_012471	ACC	2	6	526367	526372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869967
11130	NC_012471	AAG	2	6	526430	526435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869967
11131	NC_012471	CAG	2	6	526440	526445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869967
11132	NC_012471	GAG	2	6	526496	526501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869967
11133	NC_012471	TAT	2	6	526532	526537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869967
11134	NC_012471	ATC	2	6	526562	526567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869967
11135	NC_012471	AAG	2	6	526569	526574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869967
11136	NC_012471	TGG	2	6	526612	526617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869967
11137	NC_012471	CCTT	2	8	526690	526697	0 %	50 %	0 %	50 %	225869967
11138	NC_012471	TCA	2	6	526717	526722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869967
11139	NC_012471	AGG	2	6	526734	526739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869967
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11141	NC_012471	GA	3	6	526875	526880	50 %	0 %	50 %	0 %	225869967
11142	NC_012471	ATT	2	6	527012	527017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869967
11143	NC_012471	CTA	2	6	527166	527171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869968
11144	NC_012471	ATC	2	6	527176	527181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869968
11145	NC_012471	TGATAC	2	12	527208	527219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225869968
11146	NC_012471	A	6	6	527225	527230	100 %	0 %	0 %	0 %	225869968
11147	NC_012471	TCA	2	6	527267	527272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869968
11148	NC_012471	TAT	2	6	527281	527286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869968
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11151	NC_012471	CTG	2	6	527438	527443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869968
11152	NC_012471	GCT	2	6	527445	527450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869968
11153	NC_012471	ATG	2	6	527629	527634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869968
11154	NC_012471	A	6	6	527668	527673	100 %	0 %	0 %	0 %	225869968
11155	NC_012471	TTG	2	6	527690	527695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869968
11156	NC_012471	TCC	2	6	527727	527732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869968
11157	NC_012471	GA	3	6	527758	527763	50 %	0 %	50 %	0 %	225869968
11158	NC_012471	CAG	2	6	527815	527820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869968
11159	NC_012471	GCC	2	6	527823	527828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869968
11160	NC_012471	CTC	2	6	527844	527849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869968
11161	NC_012471	TAT	2	6	527901	527906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869968
11162	NC_012471	A	6	6	528073	528078	100 %	0 %	0 %	0 %	225869968
11163	NC_012471	AAG	2	6	528086	528091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869968
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11169	NC_012471	TATCA	2	10	528304	528313	40 %	40 %	0 %	20 %	225869969
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11174	NC_012471	ATGT	2	8	528604	528611	25 %	50 %	25 %	0 %	225869969
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11179	NC_012471	ATT	2	6	528805	528810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869969
11180	NC_012471	GAT	2	6	528811	528816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869969
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11183	NC_012471	A	6	6	529243	529248	100 %	0 %	0 %	0 %	225869969
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11186	NC_012471	CTC	2	6	529316	529321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869969
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11188	NC_012471	ATC	2	6	529409	529414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869969
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11191	NC_012471	TAT	2	6	529586	529591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869970
11192	NC_012471	CTG	2	6	529616	529621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869970
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11194	NC_012471	GTC	2	6	529659	529664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869970
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11200	NC_012471	CTG	2	6	529828	529833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869970
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11202	NC_012471	T	6	6	529962	529967	0 %	100 %	0 %	0 %	225869970
11203	NC_012471	ACTG	2	8	529978	529985	25 %	25 %	25 %	25 %	225869970
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11205	NC_012471	TCAA	2	8	530086	530093	50 %	25 %	0 %	25 %	225869970
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11213	NC_012471	GGCT	2	8	530653	530660	0 %	25 %	50 %	25 %	225869971
11214	NC_012471	CAG	2	6	530662	530667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869971
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11217	NC_012471	CAG	2	6	530714	530719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869971
11218	NC_012471	TTA	2	6	530722	530727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869971
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11220	NC_012471	AGC	2	6	530789	530794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869971
11221	NC_012471	AAT	2	6	530814	530819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_012471	AT	3	6	530818	530823	50 %	50 %	0 %	0 %	225869972
11223	NC_012471	TGT	2	6	530845	530850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869972
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11229	NC_012471	TTACAT	2	12	531427	531438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225869972
11230	NC_012471	TC	3	6	531553	531558	0 %	50 %	0 %	50 %	225869972
11231	NC_012471	TAA	2	6	531559	531564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869972
11232	NC_012471	GTT	2	6	531635	531640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869972
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11235	NC_012471	GTT	2	6	531748	531753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_012471	A	6	6	531775	531780	100 %	0 %	0 %	0 %	225869973
11237	NC_012471	TGA	2	6	531818	531823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869973
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11239	NC_012471	TGA	2	6	531842	531847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869973
11240	NC_012471	GCTTT	2	10	531860	531869	0 %	60 %	20 %	20 %	225869973
11241	NC_012471	CAG	2	6	531887	531892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869973
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11243	NC_012471	GCTAAG	2	12	532024	532035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869973
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11491	NC_012471	ACCATT	2	12	544899	544910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869982
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11493	NC_012471	TAT	2	6	544965	544970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869982
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