MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012471	GAT	2	6	474045	474050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869920
10002	NC_012471	ATT	2	6	474105	474110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869920
10003	NC_012471	A	6	6	474152	474157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_012471	TCT	2	6	474198	474203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_012471	T	6	6	474264	474269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_012471	A	6	6	474278	474283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_012471	CTA	2	6	474311	474316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_012471	TTG	2	6	474344	474349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_012471	AGC	2	6	474472	474477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869921
10010	NC_012471	GCG	2	6	474568	474573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869921
10011	NC_012471	AGC	2	6	474597	474602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869921
10012	NC_012471	AGCTTT	2	12	474713	474724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225869921
10013	NC_012471	T	6	6	474753	474758	0 %	100 %	0 %	0 %	225869921
10014	NC_012471	CAG	2	6	474852	474857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869921
10015	NC_012471	AGCC	2	8	474858	474865	25 %	0 %	25 %	50 %	225869921
10016	NC_012471	ATG	2	6	474876	474881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869921
10017	NC_012471	ATG	2	6	474923	474928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869921
10018	NC_012471	CAC	2	6	474930	474935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869921
10019	NC_012471	CAG	2	6	474960	474965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869921
10020	NC_012471	TCC	2	6	475007	475012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869921
10021	NC_012471	AGG	2	6	475066	475071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869921
10022	NC_012471	TCA	2	6	475103	475108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869921
10023	NC_012471	AAG	2	6	475163	475168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869921
10024	NC_012471	TCA	2	6	475301	475306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869921
10025	NC_012471	TGA	2	6	475350	475355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869921
10026	NC_012471	AGCT	2	8	475381	475388	25 %	25 %	25 %	25 %	225869921
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10029	NC_012471	TGGC	2	8	475442	475449	0 %	25 %	50 %	25 %	225869921
10030	NC_012471	AGC	2	6	475480	475485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869921
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10032	NC_012471	AC	3	6	475584	475589	50 %	0 %	0 %	50 %	225869921
10033	NC_012471	AGC	2	6	475606	475611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869921
10034	NC_012471	ATAA	2	8	475652	475659	75 %	25 %	0 %	0 %	225869921
10035	NC_012471	AGCT	2	8	475711	475718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10036	NC_012471	T	6	6	475725	475730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_012471	A	6	6	475745	475750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_012471	TCCA	2	8	475789	475796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_012471	CTC	2	6	475856	475861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_012471	CT	3	6	475885	475890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_012471	ACT	2	6	475906	475911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_012471	TAT	2	6	475925	475930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_012471	A	6	6	475934	475939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_012471	CG	3	6	475982	475987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_012471	A	6	6	476048	476053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_012471	CTTT	2	8	476081	476088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10047	NC_012471	TGTC	2	8	476110	476117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_012471	TGA	2	6	476143	476148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_012471	A	6	6	476174	476179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_012471	AAATC	2	10	476195	476204	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10051	NC_012471	CA	3	6	476324	476329	50 %	0 %	0 %	50 %	225869922
10052	NC_012471	GGC	2	6	476343	476348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869922
10053	NC_012471	TTATT	2	10	476381	476390	20 %	80 %	0 %	0 %	225869922
10054	NC_012471	GAT	2	6	476399	476404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869922
10055	NC_012471	TCT	2	6	476512	476517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869922
10056	NC_012471	TGA	2	6	476530	476535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869922
10057	NC_012471	TTTG	2	8	476540	476547	0 %	75 %	25 %	0 %	225869922
10058	NC_012471	AGTG	2	8	476603	476610	25 %	25 %	50 %	0 %	225869922
10059	NC_012471	ATT	2	6	476614	476619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869922
10060	NC_012471	TGG	2	6	476669	476674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869922
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10062	NC_012471	CTG	2	6	476715	476720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869922
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10064	NC_012471	TGA	2	6	476752	476757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869922
10065	NC_012471	CAG	2	6	476760	476765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869922
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10069	NC_012471	TGG	2	6	476929	476934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869922
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10071	NC_012471	TTAT	2	8	476988	476995	25 %	75 %	0 %	0 %	225869922
10072	NC_012471	AAGCTG	2	12	477006	477017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869922
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10082	NC_012471	A	7	7	477379	477385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_012471	T	6	6	477519	477524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_012471	A	7	7	477535	477541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_012471	TAT	2	6	477578	477583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10110	NC_012471	CAT	2	6	478740	478745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869924
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10118	NC_012471	TTAAT	2	10	479033	479042	40 %	60 %	0 %	0 %	225869924
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10123	NC_012471	GAA	2	6	479238	479243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869925
10124	NC_012471	CAT	2	6	479265	479270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869925
10125	NC_012471	CAA	2	6	479297	479302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869925
10126	NC_012471	CAC	2	6	479309	479314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869925
10127	NC_012471	TTCA	2	8	479328	479335	25 %	50 %	0 %	25 %	225869925
10128	NC_012471	CAA	2	6	479387	479392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869925
10129	NC_012471	GAA	3	9	479426	479434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869925
10130	NC_012471	GCA	2	6	479437	479442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869925
10131	NC_012471	AGC	2	6	479481	479486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869925
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10139	NC_012471	AAG	2	6	479827	479832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869925
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10141	NC_012471	TGA	3	9	479938	479946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_012471	ATC	2	6	479961	479966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10143	NC_012471	TATCA	2	10	479972	479981	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10144	NC_012471	GCA	2	6	479984	479989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_012471	TTG	2	6	480010	480015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_012471	GCA	2	6	480156	480161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869926
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10163	NC_012471	AAT	3	9	481022	481030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869926
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10165	NC_012471	TTA	2	6	481058	481063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10166	NC_012471	GAA	3	9	481083	481091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_012471	A	6	6	481214	481219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10169	NC_012471	A	6	6	481281	481286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10170	NC_012471	TCA	2	6	481327	481332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10172	NC_012471	GCA	3	9	481471	481479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10182	NC_012471	GTA	2	6	482044	482049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10185	NC_012471	T	6	6	482194	482199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10186	NC_012471	TGC	2	6	482249	482254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10188	NC_012471	A	6	6	482313	482318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10190	NC_012471	ATA	2	6	482374	482379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10193	NC_012471	T	6	6	482473	482478	0 %	100 %	0 %	0 %	225869927
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10198	NC_012471	CAT	2	6	482622	482627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869927
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10231	NC_012471	T	6	6	483952	483957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_012471	CAG	2	6	484114	484119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10233	NC_012471	ATG	2	6	484126	484131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10234	NC_012471	TGC	2	6	484148	484153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10235	NC_012471	GAC	2	6	484196	484201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10236	NC_012471	GGCT	2	8	484242	484249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10237	NC_012471	T	8	8	484266	484273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_012471	GAAT	2	8	484310	484317	50 %	25 %	25 %	0 %	225869928
10239	NC_012471	AAC	2	6	484400	484405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869928
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10242	NC_012471	GAT	2	6	484554	484559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869928
10243	NC_012471	TGG	3	9	484568	484576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869928
10244	NC_012471	TAA	2	6	484642	484647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869928
10245	NC_012471	AAACAG	2	12	484651	484662	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	225869928
10246	NC_012471	CTT	2	6	484707	484712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869928
10247	NC_012471	GAG	2	6	484713	484718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869928
10248	NC_012471	GGT	2	6	484737	484742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869929
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10255	NC_012471	TCC	2	6	485392	485397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869930
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10257	NC_012471	ACAG	2	8	485418	485425	50 %	0 %	25 %	25 %	225869930
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10282	NC_012471	T	6	6	486649	486654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10308	NC_012471	AGT	2	6	487467	487472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10329	NC_012471	TAGAT	2	10	488805	488814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10330	NC_012471	AGAA	2	8	488818	488825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10331	NC_012471	TAG	2	6	488916	488921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869934
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10362	NC_012471	AGG	2	6	490644	490649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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