MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_012470	T	6	6	2129948	2129953	0 %	100 %	0 %	0 %	225869470
45003	NC_012470	TGTTT	2	10	2130000	2130009	0 %	80 %	20 %	0 %	225869470
45004	NC_012470	T	6	6	2130007	2130012	0 %	100 %	0 %	0 %	225869470
45005	NC_012470	ATA	2	6	2130046	2130051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869470
45006	NC_012470	TTA	2	6	2130057	2130062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45007	NC_012470	TG	3	6	2130068	2130073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45008	NC_012470	ATT	3	9	2130204	2130212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45009	NC_012470	AC	3	6	2130269	2130274	50 %	0 %	0 %	50 %	225869471
45010	NC_012470	TTA	2	6	2130287	2130292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869471
45011	NC_012470	TAT	2	6	2130321	2130326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869471
45012	NC_012470	GTG	3	9	2130332	2130340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869471
45013	NC_012470	T	7	7	2130371	2130377	0 %	100 %	0 %	0 %	225869471
45014	NC_012470	AAG	2	6	2130386	2130391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869471
45015	NC_012470	AAC	2	6	2130392	2130397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869471
45016	NC_012470	AAG	2	6	2130406	2130411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869471
45017	NC_012470	TCA	2	6	2130428	2130433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869471
45018	NC_012470	A	6	6	2130485	2130490	100 %	0 %	0 %	0 %	225869471
45019	NC_012470	A	6	6	2130562	2130567	100 %	0 %	0 %	0 %	225869471
45020	NC_012470	CAAG	2	8	2130576	2130583	50 %	0 %	25 %	25 %	225869471
45021	NC_012470	CTA	2	6	2130587	2130592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869471
45022	NC_012470	AAGC	2	8	2130597	2130604	50 %	0 %	25 %	25 %	225869471
45023	NC_012470	CAA	2	6	2130719	2130724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869472
45024	NC_012470	CAG	2	6	2130729	2130734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869472
45025	NC_012470	AAAC	2	8	2130783	2130790	75 %	0 %	0 %	25 %	225869472
45026	NC_012470	TATT	2	8	2130802	2130809	25 %	75 %	0 %	0 %	225869472
45027	NC_012470	T	6	6	2130808	2130813	0 %	100 %	0 %	0 %	225869472
45028	NC_012470	AAG	2	6	2130823	2130828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869472
45029	NC_012470	TAC	2	6	2130930	2130935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869472
45030	NC_012470	ATG	2	6	2131007	2131012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869472
45031	NC_012470	AGC	2	6	2131149	2131154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869472
45032	NC_012470	TCA	2	6	2131177	2131182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869472
45033	NC_012470	GCAA	2	8	2131286	2131293	50 %	0 %	25 %	25 %	225869472
45034	NC_012470	CAT	2	6	2131295	2131300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869472
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45036	NC_012470	A	6	6	2131432	2131437	100 %	0 %	0 %	0 %	225869472
45037	NC_012470	GAT	2	6	2131460	2131465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869472
45038	NC_012470	T	6	6	2131470	2131475	0 %	100 %	0 %	0 %	225869472
45039	NC_012470	TGA	2	6	2131560	2131565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869472
45040	NC_012470	ATCCT	2	10	2131584	2131593	20 %	40 %	0 %	40 %	225869472
45041	NC_012470	TGAG	2	8	2131611	2131618	25 %	25 %	50 %	0 %	225869472
45042	NC_012470	CAAA	2	8	2131634	2131641	75 %	0 %	0 %	25 %	225869472
45043	NC_012470	A	6	6	2131658	2131663	100 %	0 %	0 %	0 %	225869472
45044	NC_012470	CAA	2	6	2131686	2131691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869472
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45046	NC_012470	TGAT	2	8	2131776	2131783	25 %	50 %	25 %	0 %	225869472
45047	NC_012470	A	6	6	2131798	2131803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45048	NC_012470	CAA	2	6	2131882	2131887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869473
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45050	NC_012470	T	7	7	2131925	2131931	0 %	100 %	0 %	0 %	225869473
45051	NC_012470	ATA	2	6	2131974	2131979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869473
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45054	NC_012470	CAA	2	6	2132071	2132076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869473
45055	NC_012470	ACA	2	6	2132173	2132178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869473
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45059	NC_012470	TCGTC	2	10	2132293	2132302	0 %	40 %	20 %	40 %	225869473
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45069	NC_012470	ATG	2	6	2132744	2132749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45070	NC_012470	TAT	2	6	2132781	2132786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45071	NC_012470	CAT	2	6	2132814	2132819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45072	NC_012470	AGC	2	6	2132865	2132870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45079	NC_012470	GTATC	2	10	2133258	2133267	20 %	40 %	20 %	20 %	225869474
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45087	NC_012470	CAT	2	6	2133636	2133641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869474
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45092	NC_012470	T	6	6	2133774	2133779	0 %	100 %	0 %	0 %	225869474
45093	NC_012470	GAC	2	6	2133903	2133908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869474
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45101	NC_012470	CT	3	6	2134253	2134258	0 %	50 %	0 %	50 %	225869474
45102	NC_012470	CAT	2	6	2134278	2134283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869474
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45108	NC_012470	CTCC	2	8	2134656	2134663	0 %	25 %	0 %	75 %	225869474
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45118	NC_012470	TAA	2	6	2135473	2135478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869475
45119	NC_012470	TGAGTC	2	12	2135483	2135494	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225869475
45120	NC_012470	TAA	2	6	2135509	2135514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869475
45121	NC_012470	CTT	2	6	2135578	2135583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869475
45122	NC_012470	GTAT	2	8	2135624	2135631	25 %	50 %	25 %	0 %	225869475
45123	NC_012470	CAA	2	6	2135677	2135682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869475
45124	NC_012470	TC	3	6	2135713	2135718	0 %	50 %	0 %	50 %	225869475
45125	NC_012470	TAG	2	6	2135728	2135733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869476
45126	NC_012470	GATA	2	8	2135754	2135761	50 %	25 %	25 %	0 %	225869476
45127	NC_012470	TTTC	2	8	2135777	2135784	0 %	75 %	0 %	25 %	225869476
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45131	NC_012470	TAA	2	6	2135871	2135876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869476
45132	NC_012470	CTT	2	6	2135976	2135981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869476
45133	NC_012470	TTTGA	2	10	2136010	2136019	20 %	60 %	20 %	0 %	225869476
45134	NC_012470	CAA	2	6	2136075	2136080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869476
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45136	NC_012470	TAG	2	6	2136126	2136131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869477
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45138	NC_012470	ATC	2	6	2136225	2136230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869477
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45141	NC_012470	CTT	2	6	2136374	2136379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869477
45142	NC_012470	TA	3	6	2136421	2136426	50 %	50 %	0 %	0 %	225869477
45143	NC_012470	CAA	2	6	2136473	2136478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869477
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45145	NC_012470	TAA	2	6	2136551	2136556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45147	NC_012470	TTTC	2	8	2136626	2136633	0 %	75 %	0 %	25 %	225869478
45148	NC_012470	ATC	2	6	2136676	2136681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869478
45149	NC_012470	TAA	2	6	2136720	2136725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869478
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45153	NC_012470	AAAT	2	8	2137006	2137013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45154	NC_012470	TTTAA	2	10	2137037	2137046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45155	NC_012470	TAA	2	6	2137052	2137057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45156	NC_012470	TAT	2	6	2137058	2137063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45157	NC_012470	TTTA	2	8	2137099	2137106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45158	NC_012470	CAA	2	6	2137263	2137268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45159	NC_012470	A	7	7	2137267	2137273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45160	NC_012470	AT	3	6	2137304	2137309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45161	NC_012470	TAC	2	6	2137314	2137319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45162	NC_012470	AAT	2	6	2137352	2137357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869479
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45188	NC_012470	TCT	2	6	2138839	2138844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45189	NC_012470	T	6	6	2138844	2138849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45190	NC_012470	TATCA	2	10	2138884	2138893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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45209	NC_012470	CTTG	2	8	2140256	2140263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45210	NC_012470	CT	3	6	2140288	2140293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45211	NC_012470	GCT	2	6	2140360	2140365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45230	NC_012470	ATG	2	6	2140957	2140962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869481
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45234	NC_012470	ACA	2	6	2141139	2141144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869481
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45239	NC_012470	T	6	6	2141364	2141369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45340	NC_012470	A	7	7	2146250	2146256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45341	NC_012470	T	6	6	2146263	2146268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45342	NC_012470	AAAT	2	8	2146294	2146301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45343	NC_012470	A	6	6	2146324	2146329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45344	NC_012470	TCT	2	6	2146341	2146346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45347	NC_012470	T	7	7	2146430	2146436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45353	NC_012470	TTG	2	6	2146850	2146855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869484
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45357	NC_012470	TAG	2	6	2147033	2147038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869484
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.