MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_012470	ATC	2	6	2081616	2081621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869426
44002	NC_012470	GA	3	6	2081681	2081686	50 %	0 %	50 %	0 %	225869426
44003	NC_012470	AAT	2	6	2081765	2081770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869426
44004	NC_012470	CCA	2	6	2081778	2081783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869426
44005	NC_012470	CAA	2	6	2081839	2081844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869426
44006	NC_012470	CAA	2	6	2081848	2081853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869426
44007	NC_012470	CAT	2	6	2081855	2081860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869426
44008	NC_012470	ATAA	2	8	2081982	2081989	75 %	25 %	0 %	0 %	225869426
44009	NC_012470	TAAA	2	8	2081998	2082005	75 %	25 %	0 %	0 %	225869426
44010	NC_012470	CAAT	2	8	2082139	2082146	50 %	25 %	0 %	25 %	225869426
44011	NC_012470	CT	3	6	2082152	2082157	0 %	50 %	0 %	50 %	225869426
44012	NC_012470	CTACA	2	10	2082256	2082265	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44013	NC_012470	T	7	7	2082336	2082342	0 %	100 %	0 %	0 %	225869427
44014	NC_012470	AAAG	2	8	2082403	2082410	75 %	0 %	25 %	0 %	225869427
44015	NC_012470	ATAA	2	8	2082484	2082491	75 %	25 %	0 %	0 %	225869427
44016	NC_012470	CTC	2	6	2082540	2082545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869427
44017	NC_012470	CTC	2	6	2082553	2082558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869427
44018	NC_012470	AAT	2	6	2082585	2082590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869427
44019	NC_012470	ATA	2	6	2082596	2082601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869427
44020	NC_012470	CCA	2	6	2082623	2082628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869427
44021	NC_012470	CTA	2	6	2082650	2082655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869427
44022	NC_012470	CAT	2	6	2082682	2082687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869427
44023	NC_012470	ACC	2	6	2082716	2082721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869427
44024	NC_012470	TAA	2	6	2082742	2082747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869427
44025	NC_012470	TTGA	2	8	2082751	2082758	25 %	50 %	25 %	0 %	225869427
44026	NC_012470	AAT	2	6	2082793	2082798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869427
44027	NC_012470	CCA	2	6	2082806	2082811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869427
44028	NC_012470	CCA	2	6	2082818	2082823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869427
44029	NC_012470	GCC	2	6	2082838	2082843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869427
44030	NC_012470	ACC	2	6	2082850	2082855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869427
44031	NC_012470	ACT	2	6	2082878	2082883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869427
44032	NC_012470	CAAA	2	8	2082932	2082939	75 %	0 %	0 %	25 %	225869427
44033	NC_012470	AGC	2	6	2083102	2083107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869427
44034	NC_012470	CAAAGG	2	12	2083134	2083145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225869427
44035	NC_012470	AAT	2	6	2083165	2083170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869427
44036	NC_012470	ACA	2	6	2083174	2083179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869427
44037	NC_012470	TTA	2	6	2083199	2083204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869427
44038	NC_012470	CAT	2	6	2083398	2083403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869428
44039	NC_012470	GCCA	2	8	2083566	2083573	25 %	0 %	25 %	50 %	225869428
44040	NC_012470	AAC	2	6	2083574	2083579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869428
44041	NC_012470	ATC	2	6	2083610	2083615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869428
44042	NC_012470	TTTC	2	8	2083645	2083652	0 %	75 %	0 %	25 %	225869428
44043	NC_012470	ACC	2	6	2083678	2083683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869428
44044	NC_012470	CCA	2	6	2083736	2083741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869428
44045	NC_012470	GTC	2	6	2083766	2083771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869428
44046	NC_012470	AAAG	2	8	2083798	2083805	75 %	0 %	25 %	0 %	225869428
44047	NC_012470	TAA	2	6	2083821	2083826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869428
44048	NC_012470	TGG	2	6	2083934	2083939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869428
44049	NC_012470	CAC	2	6	2083974	2083979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869428
44050	NC_012470	AAGC	2	8	2084101	2084108	50 %	0 %	25 %	25 %	225869428
44051	NC_012470	T	7	7	2084112	2084118	0 %	100 %	0 %	0 %	225869428
44052	NC_012470	CTC	2	6	2084121	2084126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869428
44053	NC_012470	GTT	2	6	2084159	2084164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869428
44054	NC_012470	T	7	7	2084163	2084169	0 %	100 %	0 %	0 %	225869428
44055	NC_012470	ATG	2	6	2084174	2084179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869428
44056	NC_012470	TGAAGC	2	12	2084187	2084198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869429
44057	NC_012470	AGCA	2	8	2084303	2084310	50 %	0 %	25 %	25 %	225869429
44058	NC_012470	ACC	2	6	2084342	2084347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869429
44059	NC_012470	TGG	2	6	2084351	2084356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869429
44060	NC_012470	AAG	2	6	2084382	2084387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869429
44061	NC_012470	CCT	2	6	2084404	2084409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869429
44062	NC_012470	CCA	2	6	2084478	2084483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869429
44063	NC_012470	CTG	2	6	2084563	2084568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869429
44064	NC_012470	TGA	2	6	2084586	2084591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869429
44065	NC_012470	CTC	2	6	2084606	2084611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869429
44066	NC_012470	ACC	2	6	2084643	2084648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869429
44067	NC_012470	TAT	2	6	2084722	2084727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869429
44068	NC_012470	CAA	2	6	2084749	2084754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869429
44069	NC_012470	ACTT	2	8	2084797	2084804	25 %	50 %	0 %	25 %	225869429
44070	NC_012470	ACA	2	6	2084952	2084957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869429
44071	NC_012470	TCA	2	6	2085084	2085089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869429
44072	NC_012470	CAA	2	6	2085163	2085168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869429
44073	NC_012470	TCG	2	6	2085252	2085257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869429
44074	NC_012470	CGT	2	6	2085473	2085478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869429
44075	NC_012470	GAC	2	6	2085514	2085519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869429
44076	NC_012470	TAGC	2	8	2085649	2085656	25 %	25 %	25 %	25 %	225869429
44077	NC_012470	CTG	2	6	2085668	2085673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869429
44078	NC_012470	CTTC	2	8	2085687	2085694	0 %	50 %	0 %	50 %	225869429
44079	NC_012470	CAG	2	6	2085727	2085732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869429
44080	NC_012470	CATCA	2	10	2085737	2085746	40 %	20 %	0 %	40 %	225869429
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44084	NC_012470	TTC	2	6	2085865	2085870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869429
44085	NC_012470	ATAA	2	8	2085915	2085922	75 %	25 %	0 %	0 %	225869429
44086	NC_012470	TTA	2	6	2086000	2086005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44087	NC_012470	CCCA	2	8	2086027	2086034	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44088	NC_012470	T	6	6	2086125	2086130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44089	NC_012470	TTTCAC	2	12	2086257	2086268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225869430
44090	NC_012470	TGA	2	6	2086275	2086280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869430
44091	NC_012470	TA	3	6	2086426	2086431	50 %	50 %	0 %	0 %	225869430
44092	NC_012470	CTT	2	6	2086443	2086448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869430
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44097	NC_012470	AATC	2	8	2086875	2086882	50 %	25 %	0 %	25 %	225869430
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44099	NC_012470	ACGA	2	8	2087157	2087164	50 %	0 %	25 %	25 %	225869430
44100	NC_012470	TAA	2	6	2087274	2087279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869430
44101	NC_012470	AGC	3	9	2087371	2087379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869430
44102	NC_012470	ATT	2	6	2087425	2087430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44103	NC_012470	TA	3	6	2087449	2087454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44104	NC_012470	TAG	2	6	2087596	2087601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869431
44105	NC_012470	ATA	2	6	2087760	2087765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869431
44106	NC_012470	TAT	2	6	2087792	2087797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869431
44107	NC_012470	ATTC	2	8	2087816	2087823	25 %	50 %	0 %	25 %	225869431
44108	NC_012470	ACA	2	6	2087833	2087838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869431
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44115	NC_012470	TC	3	6	2088123	2088128	0 %	50 %	0 %	50 %	225869431
44116	NC_012470	ATC	2	6	2088142	2088147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869431
44117	NC_012470	GTC	2	6	2088156	2088161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869431
44118	NC_012470	T	6	6	2088198	2088203	0 %	100 %	0 %	0 %	225869431
44119	NC_012470	AAT	2	6	2088204	2088209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869431
44120	NC_012470	ACA	2	6	2088229	2088234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869431
44121	NC_012470	TAA	2	6	2088297	2088302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869431
44122	NC_012470	ACC	2	6	2088332	2088337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44123	NC_012470	T	6	6	2088355	2088360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44124	NC_012470	TAA	2	6	2088389	2088394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44125	NC_012470	ACTTT	2	10	2088410	2088419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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44127	NC_012470	TATGA	2	10	2088430	2088439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44128	NC_012470	GGA	2	6	2088570	2088575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44130	NC_012470	CGT	2	6	2088629	2088634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869432
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44136	NC_012470	A	6	6	2088878	2088883	100 %	0 %	0 %	0 %	225869433
44137	NC_012470	TGT	2	6	2088907	2088912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869433
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44140	NC_012470	GTTTTG	2	12	2088979	2088990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44149	NC_012470	ATC	2	6	2089294	2089299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869434
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44156	NC_012470	A	6	6	2089576	2089581	100 %	0 %	0 %	0 %	225869434
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44178	NC_012470	CTA	2	6	2090500	2090505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44179	NC_012470	CAA	2	6	2090568	2090573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44181	NC_012470	A	15	15	2090719	2090733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44182	NC_012470	T	6	6	2090794	2090799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44183	NC_012470	GAA	2	6	2090801	2090806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44184	NC_012470	A	7	7	2090813	2090819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44185	NC_012470	CGA	2	6	2090824	2090829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44186	NC_012470	TCA	2	6	2090879	2090884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869436
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44188	NC_012470	TCA	2	6	2090902	2090907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869436
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44201	NC_012470	A	6	6	2091364	2091369	100 %	0 %	0 %	0 %	225869436
44202	NC_012470	CAA	2	6	2091393	2091398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869436
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44226	NC_012470	TC	3	6	2092697	2092702	0 %	50 %	0 %	50 %	225869436
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44229	NC_012470	T	6	6	2092783	2092788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44230	NC_012470	ATT	2	6	2092878	2092883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44231	NC_012470	ATTT	2	8	2092889	2092896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44232	NC_012470	TAT	2	6	2092928	2092933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44233	NC_012470	TAT	2	6	2092939	2092944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44234	NC_012470	A	6	6	2092949	2092954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44235	NC_012470	TAT	2	6	2092955	2092960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44356	NC_012470	TTG	2	6	2098786	2098791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869442
44357	NC_012470	CTG	2	6	2098819	2098824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869442
44358	NC_012470	TCT	2	6	2098909	2098914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869442
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44363	NC_012470	A	6	6	2099045	2099050	100 %	0 %	0 %	0 %	225869442
44364	NC_012470	AC	3	6	2099110	2099115	50 %	0 %	0 %	50 %	225869442
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44382	NC_012470	TTA	2	6	2100296	2100301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44384	NC_012470	AAT	2	6	2100362	2100367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44385	NC_012470	AT	3	6	2100383	2100388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44386	NC_012470	AT	3	6	2100434	2100439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44387	NC_012470	A	16	16	2100494	2100509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44388	NC_012470	TCT	2	6	2100570	2100575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44392	NC_012470	A	6	6	2100654	2100659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44393	NC_012470	A	6	6	2100681	2100686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44397	NC_012470	AAAAG	2	10	2100821	2100830	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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44421	NC_012470	CTTTT	2	10	2101891	2101900	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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44427	NC_012470	A	6	6	2102036	2102041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44461	NC_012470	CTC	2	6	2103669	2103674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869444
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44465	NC_012470	ATA	2	6	2103807	2103812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44466	NC_012470	TA	3	6	2103811	2103816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44467	NC_012470	TA	4	8	2103824	2103831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44468	NC_012470	AT	3	6	2103868	2103873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44469	NC_012470	TA	5	10	2103882	2103891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44470	NC_012470	AAG	2	6	2103902	2103907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44476	NC_012470	GCT	2	6	2104304	2104309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869446
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44478	NC_012470	AGA	2	6	2104381	2104386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869446
44479	NC_012470	GGC	2	6	2104463	2104468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869446
44480	NC_012470	CAA	2	6	2104524	2104529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869446
44481	NC_012470	AGCTC	2	10	2104542	2104551	20 %	20 %	20 %	40 %	225869446
44482	NC_012470	GCA	2	6	2104583	2104588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869446
44483	NC_012470	TCAA	2	8	2104629	2104636	50 %	25 %	0 %	25 %	225869446
44484	NC_012470	GGA	2	6	2104663	2104668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44485	NC_012470	AGC	2	6	2104707	2104712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869447
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44490	NC_012470	CTA	2	6	2105022	2105027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869447
44491	NC_012470	GAT	2	6	2105036	2105041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869447
44492	NC_012470	CAG	2	6	2105097	2105102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869447
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44500	NC_012470	AACAAT	2	12	2105438	2105449	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225869447

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