MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43004	NC_012470	TTAATT	2	12	2033827	2033838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869380
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43118	NC_012470	TCC	2	6	2038949	2038954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869382
43119	NC_012470	ATT	2	6	2038964	2038969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869382
43120	NC_012470	A	7	7	2039030	2039036	100 %	0 %	0 %	0 %	225869382
43121	NC_012470	TGGT	2	8	2039055	2039062	0 %	50 %	50 %	0 %	225869382
43122	NC_012470	GGGACA	2	12	2039071	2039082	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	225869382
43123	NC_012470	ACA	2	6	2039129	2039134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869382
43124	NC_012470	CTA	2	6	2039170	2039175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869382
43125	NC_012470	CTG	2	6	2039202	2039207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869382
43126	NC_012470	CAAGGT	2	12	2039239	2039250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869382
43127	NC_012470	GGC	2	6	2039255	2039260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869382
43128	NC_012470	TGC	2	6	2039265	2039270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869382
43129	NC_012470	TGC	2	6	2039274	2039279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869382
43130	NC_012470	AGC	2	6	2039383	2039388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869382
43131	NC_012470	GAG	2	6	2039423	2039428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869382
43132	NC_012470	GA	3	6	2039512	2039517	50 %	0 %	50 %	0 %	225869382
43133	NC_012470	TCA	2	6	2039595	2039600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869382
43134	NC_012470	TTG	2	6	2039728	2039733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869383
43135	NC_012470	GAT	2	6	2039741	2039746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869383
43136	NC_012470	AAC	2	6	2039769	2039774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869383
43137	NC_012470	A	6	6	2039776	2039781	100 %	0 %	0 %	0 %	225869383
43138	NC_012470	TGA	2	6	2039801	2039806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869383
43139	NC_012470	CTGTC	2	10	2039921	2039930	0 %	40 %	20 %	40 %	225869383
43140	NC_012470	TATCA	2	10	2039988	2039997	40 %	40 %	0 %	20 %	225869383
43141	NC_012470	AGG	2	6	2040001	2040006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869383
43142	NC_012470	ACTG	2	8	2040029	2040036	25 %	25 %	25 %	25 %	225869383
43143	NC_012470	GCT	2	6	2040099	2040104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869383
43144	NC_012470	CATG	2	8	2040122	2040129	25 %	25 %	25 %	25 %	225869383
43145	NC_012470	GAG	2	6	2040264	2040269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869383
43146	NC_012470	AAC	2	6	2040309	2040314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869383
43147	NC_012470	ATCA	2	8	2040333	2040340	50 %	25 %	0 %	25 %	225869383
43148	NC_012470	CTT	2	6	2040341	2040346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869383
43149	NC_012470	ACC	2	6	2040406	2040411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869383
43150	NC_012470	CTC	2	6	2040472	2040477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869383
43151	NC_012470	CAG	2	6	2040493	2040498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869383
43152	NC_012470	TGC	2	6	2040500	2040505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869383
43153	NC_012470	TGC	3	9	2040646	2040654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869384
43154	NC_012470	A	6	6	2040737	2040742	100 %	0 %	0 %	0 %	225869384
43155	NC_012470	AAG	2	6	2040795	2040800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869384
43156	NC_012470	AAT	2	6	2040815	2040820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869384
43157	NC_012470	CTT	2	6	2040853	2040858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869384
43158	NC_012470	A	6	6	2040956	2040961	100 %	0 %	0 %	0 %	225869384
43159	NC_012470	CTG	2	6	2040971	2040976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869384
43160	NC_012470	GAC	2	6	2041049	2041054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869384
43161	NC_012470	TGAT	2	8	2041203	2041210	25 %	50 %	25 %	0 %	225869384
43162	NC_012470	TAT	2	6	2041233	2041238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869384
43163	NC_012470	ACA	2	6	2041269	2041274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43164	NC_012470	TTG	2	6	2041313	2041318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43165	NC_012470	AGCT	2	8	2041399	2041406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43166	NC_012470	CT	3	6	2041405	2041410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43167	NC_012470	ATTA	2	8	2041431	2041438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43168	NC_012470	ACC	2	6	2041446	2041451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43169	NC_012470	TGACAT	2	12	2041457	2041468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43170	NC_012470	GTC	2	6	2041534	2041539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869385
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43172	NC_012470	CTA	2	6	2041578	2041583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869385
43173	NC_012470	AGCCTT	2	12	2041599	2041610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225869385
43174	NC_012470	ATT	2	6	2041707	2041712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869385
43175	NC_012470	CAA	2	6	2041787	2041792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869385
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43178	NC_012470	TAG	2	6	2041907	2041912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869385
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43181	NC_012470	GAT	2	6	2042022	2042027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869385
43182	NC_012470	TCG	2	6	2042079	2042084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869385
43183	NC_012470	GAT	2	6	2042141	2042146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869385
43184	NC_012470	CTG	2	6	2042182	2042187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869385
43185	NC_012470	AGG	2	6	2042248	2042253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869385
43186	NC_012470	TGA	2	6	2042363	2042368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869385
43187	NC_012470	TTA	2	6	2042369	2042374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869385
43188	NC_012470	CAG	2	6	2042415	2042420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869385
43189	NC_012470	GCAATT	2	12	2042430	2042441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225869385
43190	NC_012470	GCC	2	6	2042491	2042496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869385
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43192	NC_012470	TTA	2	6	2042586	2042591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43193	NC_012470	GCT	2	6	2042594	2042599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43194	NC_012470	CAT	2	6	2042647	2042652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869386
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43196	NC_012470	CCA	2	6	2042737	2042742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869386
43197	NC_012470	ATC	2	6	2042811	2042816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869386
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43200	NC_012470	AGC	2	6	2042936	2042941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869386
43201	NC_012470	CCT	2	6	2042970	2042975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869386
43202	NC_012470	CT	3	6	2043056	2043061	0 %	50 %	0 %	50 %	225869386
43203	NC_012470	GCT	2	6	2043198	2043203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869386
43204	NC_012470	TTGA	2	8	2043213	2043220	25 %	50 %	25 %	0 %	225869386
43205	NC_012470	CTC	2	6	2043332	2043337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869386
43206	NC_012470	ATA	2	6	2043418	2043423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869386
43207	NC_012470	ATG	2	6	2043432	2043437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869386
43208	NC_012470	TCCTA	2	10	2043440	2043449	20 %	40 %	0 %	40 %	225869387
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43210	NC_012470	GCCA	2	8	2043621	2043628	25 %	0 %	25 %	50 %	225869387
43211	NC_012470	ATC	2	6	2043644	2043649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869387
43212	NC_012470	AGCC	2	8	2043670	2043677	25 %	0 %	25 %	50 %	225869387
43213	NC_012470	ATT	2	6	2043721	2043726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869387
43214	NC_012470	ATCTG	2	10	2043791	2043800	20 %	40 %	20 %	20 %	225869387
43215	NC_012470	TCA	2	6	2043873	2043878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869387
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43217	NC_012470	CTT	2	6	2043980	2043985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869387
43218	NC_012470	TAA	2	6	2043991	2043996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869387
43219	NC_012470	CAA	2	6	2044131	2044136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869387
43220	NC_012470	GA	3	6	2044161	2044166	50 %	0 %	50 %	0 %	225869387
43221	NC_012470	ATA	2	6	2044277	2044282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869387
43222	NC_012470	T	6	6	2044336	2044341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43223	NC_012470	TAAGC	2	10	2044362	2044371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43224	NC_012470	TTGA	2	8	2044492	2044499	25 %	50 %	25 %	0 %	225869388
43225	NC_012470	CCA	2	6	2044655	2044660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869388
43226	NC_012470	TTA	2	6	2044673	2044678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869388
43227	NC_012470	TAT	2	6	2044722	2044727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869388
43228	NC_012470	TCA	2	6	2044758	2044763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869388
43229	NC_012470	CAT	2	6	2044785	2044790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869388
43230	NC_012470	TAA	2	6	2044812	2044817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869388
43231	NC_012470	TTTGC	2	10	2044944	2044953	0 %	60 %	20 %	20 %	225869388
43232	NC_012470	CTG	2	6	2045019	2045024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869388
43233	NC_012470	CTG	2	6	2045040	2045045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869388
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43235	NC_012470	GCT	2	6	2045136	2045141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869388
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43355	NC_012470	ATT	2	6	2050474	2050479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869395
43356	NC_012470	ATC	2	6	2050522	2050527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869395
43357	NC_012470	GCT	2	6	2050572	2050577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869395
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43360	NC_012470	CTG	2	6	2050715	2050720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869395
43361	NC_012470	CAT	2	6	2050788	2050793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869395
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43363	NC_012470	GAG	2	6	2050831	2050836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869395
43364	NC_012470	ATT	2	6	2050856	2050861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869395
43365	NC_012470	TGC	2	6	2050887	2050892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869395
43366	NC_012470	TCAC	2	8	2050950	2050957	25 %	25 %	0 %	50 %	225869395
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43369	NC_012470	ATT	2	6	2051142	2051147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43370	NC_012470	CAT	2	6	2051189	2051194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869396
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43390	NC_012470	ACA	2	6	2052026	2052031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43393	NC_012470	A	6	6	2052091	2052096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43394	NC_012470	TTCA	2	8	2052101	2052108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43395	NC_012470	CAAT	2	8	2052195	2052202	50 %	25 %	0 %	25 %	225869397
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43445	NC_012470	ATAGT	2	10	2053988	2053997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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43452	NC_012470	AG	3	6	2054241	2054246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43453	NC_012470	A	6	6	2054294	2054299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43454	NC_012470	ACC	2	6	2054326	2054331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43464	NC_012470	GGA	2	6	2054922	2054927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869401
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43469	NC_012470	A	7	7	2055115	2055121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43470	NC_012470	AGC	2	6	2055180	2055185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43471	NC_012470	AC	3	6	2055201	2055206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43472	NC_012470	A	6	6	2055242	2055247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43474	NC_012470	AG	3	6	2055321	2055326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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