MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_012470	GT	3	6	1891644	1891649	0 %	50 %	50 %	0 %	225869254
40002	NC_012470	CAC	2	6	1891651	1891656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869254
40003	NC_012470	ACCA	2	8	1891674	1891681	50 %	0 %	0 %	50 %	225869254
40004	NC_012470	ACG	2	6	1891700	1891705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869254
40005	NC_012470	ACC	2	6	1891742	1891747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869254
40006	NC_012470	ACG	2	6	1891751	1891756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869254
40007	NC_012470	GCAC	2	8	1891758	1891765	25 %	0 %	25 %	50 %	225869254
40008	NC_012470	ATG	2	6	1891779	1891784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869254
40009	NC_012470	CTT	2	6	1891831	1891836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869254
40010	NC_012470	CAT	2	6	1891852	1891857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869254
40011	NC_012470	TGA	2	6	1891865	1891870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869254
40012	NC_012470	ATA	2	6	1891896	1891901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869254
40013	NC_012470	TA	3	6	1891933	1891938	50 %	50 %	0 %	0 %	225869254
40014	NC_012470	CTC	2	6	1892000	1892005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40015	NC_012470	TAT	2	6	1892006	1892011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869255
40016	NC_012470	ACGA	2	8	1892086	1892093	50 %	0 %	25 %	25 %	225869255
40017	NC_012470	T	6	6	1892251	1892256	0 %	100 %	0 %	0 %	225869255
40018	NC_012470	AGC	2	6	1892302	1892307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869255
40019	NC_012470	T	6	6	1892323	1892328	0 %	100 %	0 %	0 %	225869255
40020	NC_012470	TGT	2	6	1892334	1892339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869255
40021	NC_012470	T	7	7	1892435	1892441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40022	NC_012470	CAA	2	6	1892494	1892499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40023	NC_012470	GA	3	6	1892526	1892531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40024	NC_012470	TAATA	2	10	1892553	1892562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40025	NC_012470	AACT	2	8	1892696	1892703	50 %	25 %	0 %	25 %	225869256
40026	NC_012470	TCA	2	6	1892729	1892734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869256
40027	NC_012470	A	6	6	1892752	1892757	100 %	0 %	0 %	0 %	225869256
40028	NC_012470	GA	3	6	1892828	1892833	50 %	0 %	50 %	0 %	225869256
40029	NC_012470	TGT	2	6	1892952	1892957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869256
40030	NC_012470	ACT	2	6	1892970	1892975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869256
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40032	NC_012470	ACT	2	6	1893021	1893026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869256
40033	NC_012470	AAG	2	6	1893086	1893091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869256
40034	NC_012470	CAAA	2	8	1893093	1893100	75 %	0 %	0 %	25 %	225869256
40035	NC_012470	A	6	6	1893116	1893121	100 %	0 %	0 %	0 %	225869256
40036	NC_012470	GAG	2	6	1893122	1893127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869256
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40039	NC_012470	AAGA	2	8	1893189	1893196	75 %	0 %	25 %	0 %	225869256
40040	NC_012470	ACA	2	6	1893249	1893254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869256
40041	NC_012470	TAT	2	6	1893340	1893345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869256
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40043	NC_012470	TCT	2	6	1893511	1893516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869256
40044	NC_012470	TC	3	6	1893608	1893613	0 %	50 %	0 %	50 %	225869256
40045	NC_012470	TGG	2	6	1893663	1893668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869256
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40048	NC_012470	CAT	2	6	1893763	1893768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869256
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40050	NC_012470	CTAAAA	2	12	1893956	1893967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225869256
40051	NC_012470	AAGA	2	8	1893968	1893975	75 %	0 %	25 %	0 %	225869256
40052	NC_012470	CCA	2	6	1893988	1893993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869256
40053	NC_012470	GAA	2	6	1894057	1894062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869256
40054	NC_012470	T	6	6	1894126	1894131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40055	NC_012470	T	6	6	1894182	1894187	0 %	100 %	0 %	0 %	225869257
40056	NC_012470	T	6	6	1894194	1894199	0 %	100 %	0 %	0 %	225869257
40057	NC_012470	TG	3	6	1894261	1894266	0 %	50 %	50 %	0 %	225869257
40058	NC_012470	TCA	2	6	1894270	1894275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869257
40059	NC_012470	TGC	2	6	1894290	1894295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869257
40060	NC_012470	AAG	2	6	1894359	1894364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869257
40061	NC_012470	GTTG	2	8	1894418	1894425	0 %	50 %	50 %	0 %	225869257
40062	NC_012470	TTC	2	6	1894501	1894506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869257
40063	NC_012470	TTG	2	6	1894518	1894523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869257
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40065	NC_012470	GCT	2	6	1894591	1894596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869257
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40067	NC_012470	GCT	2	6	1894756	1894761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869257
40068	NC_012470	GAA	2	6	1894786	1894791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869257
40069	NC_012470	CAAGGC	2	12	1894797	1894808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869257
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40072	NC_012470	TG	3	6	1894861	1894866	0 %	50 %	50 %	0 %	225869257
40073	NC_012470	GCT	2	6	1894933	1894938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869257
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40102	NC_012470	TAGCGG	2	12	1896161	1896172	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225869257
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40105	NC_012470	AGT	2	6	1896231	1896236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869257
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40117	NC_012470	ACC	3	9	1896903	1896911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869258
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40119	NC_012470	TCA	2	6	1896922	1896927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869258
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40121	NC_012470	TCA	2	6	1897127	1897132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869258
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40228	NC_012470	T	7	7	1902011	1902017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40229	NC_012470	AAT	2	6	1902025	1902030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40230	NC_012470	CAG	2	6	1902060	1902065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40231	NC_012470	AAGAT	2	10	1902085	1902094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40232	NC_012470	CAC	2	6	1902100	1902105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40233	NC_012470	CAG	2	6	1902121	1902126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40234	NC_012470	AGCTAG	2	12	1902249	1902260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869264
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40253	NC_012470	ATCA	2	8	1903168	1903175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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40353	NC_012470	AGC	3	9	1908315	1908323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869270
40354	NC_012470	AGC	2	6	1908342	1908347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869270
40355	NC_012470	AAAT	2	8	1908370	1908377	75 %	25 %	0 %	0 %	225869270
40356	NC_012470	TTG	2	6	1908451	1908456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869270
40357	NC_012470	TGAT	2	8	1908466	1908473	25 %	50 %	25 %	0 %	225869270
40358	NC_012470	TGA	2	6	1908558	1908563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869270
40359	NC_012470	AATAT	2	10	1908597	1908606	60 %	40 %	0 %	0 %	225869270
40360	NC_012470	CGT	2	6	1908650	1908655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869270
40361	NC_012470	GAA	2	6	1908756	1908761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869271
40362	NC_012470	GAC	2	6	1908775	1908780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869271
40363	NC_012470	GCT	2	6	1908796	1908801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869271
40364	NC_012470	AAT	2	6	1908808	1908813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869271
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40366	NC_012470	GCA	2	6	1908858	1908863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869271
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40370	NC_012470	AAT	2	6	1908944	1908949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869271
40371	NC_012470	ATA	2	6	1909004	1909009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869271
40372	NC_012470	ATA	2	6	1909017	1909022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869271
40373	NC_012470	GAAA	2	8	1909050	1909057	75 %	0 %	25 %	0 %	225869271
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40377	NC_012470	TAG	2	6	1909311	1909316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869271
40378	NC_012470	CTTT	2	8	1909366	1909373	0 %	75 %	0 %	25 %	225869271
40379	NC_012470	T	7	7	1909371	1909377	0 %	100 %	0 %	0 %	225869271
40380	NC_012470	GCT	2	6	1909378	1909383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869271
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40382	NC_012470	CGT	2	6	1909461	1909466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869272
40383	NC_012470	TGA	2	6	1909481	1909486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869272
40384	NC_012470	GAAA	2	8	1909497	1909504	75 %	0 %	25 %	0 %	225869272
40385	NC_012470	CAAGTC	2	12	1909525	1909536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225869272
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40387	NC_012470	CAAG	2	8	1909677	1909684	50 %	0 %	25 %	25 %	225869272
40388	NC_012470	ATG	2	6	1909767	1909772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869272
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40394	NC_012470	AG	3	6	1910044	1910049	50 %	0 %	50 %	0 %	225869273
40395	NC_012470	AGT	2	6	1910093	1910098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869273
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40398	NC_012470	TAA	2	6	1910150	1910155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869273
40399	NC_012470	AAG	2	6	1910173	1910178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869273
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40433	NC_012470	A	6	6	1911571	1911576	100 %	0 %	0 %	0 %	225869274
40434	NC_012470	TC	4	8	1911593	1911600	0 %	50 %	0 %	50 %	225869274
40435	NC_012470	AAAGG	2	10	1911657	1911666	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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40442	NC_012470	GTC	2	6	1912042	1912047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869275
40443	NC_012470	TTG	3	9	1912049	1912057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869275
40444	NC_012470	CAA	2	6	1912150	1912155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869275
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40448	NC_012470	CAT	2	6	1912320	1912325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869275
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40450	NC_012470	GCT	2	6	1912363	1912368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869275
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40453	NC_012470	ATC	2	6	1912480	1912485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869275
40454	NC_012470	T	7	7	1912536	1912542	0 %	100 %	0 %	0 %	225869275
40455	NC_012470	GCTGA	2	10	1912565	1912574	20 %	20 %	40 %	20 %	225869275
40456	NC_012470	GTT	2	6	1912627	1912632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869275
40457	NC_012470	AGT	2	6	1912759	1912764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869275
40458	NC_012470	T	6	6	1912767	1912772	0 %	100 %	0 %	0 %	225869275
40459	NC_012470	AAT	2	6	1912843	1912848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869275
40460	NC_012470	ATC	2	6	1912873	1912878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869275
40461	NC_012470	CCA	2	6	1912909	1912914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869275
40462	NC_012470	AGC	2	6	1912930	1912935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869275
40463	NC_012470	CCT	2	6	1912953	1912958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869275
40464	NC_012470	TGC	2	6	1912959	1912964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869275
40465	NC_012470	GCT	2	6	1912976	1912981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869275
40466	NC_012470	TTCATT	2	12	1913027	1913038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225869275
40467	NC_012470	ATTA	2	8	1913055	1913062	50 %	50 %	0 %	0 %	225869276
40468	NC_012470	T	6	6	1913063	1913068	0 %	100 %	0 %	0 %	225869276
40469	NC_012470	CAC	2	6	1913133	1913138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869276
40470	NC_012470	CCT	2	6	1913181	1913186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869276
40471	NC_012470	CA	3	6	1913232	1913237	50 %	0 %	0 %	50 %	225869276
40472	NC_012470	GAC	2	6	1913274	1913279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869276
40473	NC_012470	GTC	2	6	1913303	1913308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869276
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40483	NC_012470	CTTG	2	8	1913761	1913768	0 %	50 %	25 %	25 %	225869276
40484	NC_012470	TTA	2	6	1913796	1913801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40485	NC_012470	ACT	2	6	1913874	1913879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40488	NC_012470	GCT	2	6	1913988	1913993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40489	NC_012470	A	9	9	1914013	1914021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40490	NC_012470	ATA	2	6	1914078	1914083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869277
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40496	NC_012470	CTA	2	6	1914276	1914281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40498	NC_012470	ATA	2	6	1914351	1914356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40499	NC_012470	TAAAA	2	10	1914363	1914372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40500	NC_012470	CTTTT	2	10	1914406	1914415	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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