MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_012470	AGCC	2	8	1609267	1609274	25 %	0 %	25 %	50 %	225869005
34003	NC_012470	TCC	2	6	1609314	1609319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869005
34004	NC_012470	TCA	2	6	1609327	1609332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869005
34005	NC_012470	GTT	2	6	1609418	1609423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869005
34006	NC_012470	TCAA	2	8	1609434	1609441	50 %	25 %	0 %	25 %	225869005
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34008	NC_012470	ACGATC	2	12	1609715	1609726	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225869005
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34011	NC_012470	ATTG	2	8	1609780	1609787	25 %	50 %	25 %	0 %	225869005
34012	NC_012470	AAT	2	6	1609810	1609815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869005
34013	NC_012470	T	6	6	1609836	1609841	0 %	100 %	0 %	0 %	225869005
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34043	NC_012470	TGTCG	2	10	1611617	1611626	0 %	40 %	40 %	20 %	225869006
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34051	NC_012470	T	6	6	1611969	1611974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34052	NC_012470	TTA	2	6	1612031	1612036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34054	NC_012470	TAT	2	6	1612077	1612082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34055	NC_012470	CTC	2	6	1612124	1612129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34056	NC_012470	TTCT	2	8	1612142	1612149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34057	NC_012470	TGC	2	6	1612153	1612158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34113	NC_012470	TACAT	2	10	1614997	1615006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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34242	NC_012470	ACC	2	6	1620746	1620751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869015
34243	NC_012470	CTG	2	6	1620768	1620773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869015
34244	NC_012470	CTTG	2	8	1620837	1620844	0 %	50 %	25 %	25 %	225869015
34245	NC_012470	GCT	2	6	1620896	1620901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869015
34246	NC_012470	CTTA	2	8	1620979	1620986	25 %	50 %	0 %	25 %	225869016
34247	NC_012470	GTC	2	6	1621029	1621034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869016
34248	NC_012470	TTC	2	6	1621070	1621075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869016
34249	NC_012470	ATT	2	6	1621119	1621124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869016
34250	NC_012470	CAG	2	6	1621156	1621161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869016
34251	NC_012470	CAT	2	6	1621195	1621200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869016
34252	NC_012470	ATT	2	6	1621226	1621231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869016
34253	NC_012470	ATT	2	6	1621235	1621240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869016
34254	NC_012470	TTG	2	6	1621259	1621264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869016
34255	NC_012470	TG	3	6	1621303	1621308	0 %	50 %	50 %	0 %	225869016
34256	NC_012470	ATA	2	6	1621405	1621410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869016
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34258	NC_012470	CAT	2	6	1621495	1621500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869016
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34262	NC_012470	TAA	2	6	1621769	1621774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869016
34263	NC_012470	AGT	2	6	1621814	1621819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869016
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34265	NC_012470	CAT	2	6	1621979	1621984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869017
34266	NC_012470	AC	3	6	1621995	1622000	50 %	0 %	0 %	50 %	225869017
34267	NC_012470	ATC	2	6	1622025	1622030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869017
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34270	NC_012470	AAG	2	6	1622234	1622239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869017
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34272	NC_012470	AT	3	6	1622341	1622346	50 %	50 %	0 %	0 %	225869018
34273	NC_012470	CAT	2	6	1622355	1622360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869018
34274	NC_012470	CCT	2	6	1622456	1622461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869018
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34278	NC_012470	CAT	2	6	1622601	1622606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869018
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34293	NC_012470	GGC	2	6	1623103	1623108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34294	NC_012470	GGC	2	6	1623115	1623120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34295	NC_012470	TCC	2	6	1623124	1623129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34296	NC_012470	GCC	2	6	1623175	1623180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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34302	NC_012470	TCT	2	6	1623443	1623448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869019
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34326	NC_012470	CT	4	8	1624354	1624361	0 %	50 %	0 %	50 %	225869020
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34344	NC_012470	TATC	2	8	1624934	1624941	25 %	50 %	0 %	25 %	225869020
34345	NC_012470	GCT	2	6	1625005	1625010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869020
34346	NC_012470	ATC	2	6	1625139	1625144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869021
34347	NC_012470	TC	3	6	1625275	1625280	0 %	50 %	0 %	50 %	225869021
34348	NC_012470	ATT	2	6	1625281	1625286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869021
34349	NC_012470	TCT	2	6	1625296	1625301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869021
34350	NC_012470	GGC	2	6	1625308	1625313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869021
34351	NC_012470	ATC	2	6	1625343	1625348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869021
34352	NC_012470	A	7	7	1625433	1625439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34353	NC_012470	ATT	2	6	1625541	1625546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34354	NC_012470	ATCGCT	2	12	1625553	1625564	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225869022
34355	NC_012470	CTC	2	6	1625598	1625603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869022
34356	NC_012470	TAT	2	6	1625639	1625644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869022
34357	NC_012470	CTT	2	6	1625690	1625695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869022
34358	NC_012470	GGC	2	6	1625707	1625712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869022
34359	NC_012470	CAA	2	6	1625713	1625718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869022
34360	NC_012470	AAT	2	6	1625770	1625775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869022
34361	NC_012470	AAAT	2	8	1625778	1625785	75 %	25 %	0 %	0 %	225869022
34362	NC_012470	TAC	2	6	1625802	1625807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869022
34363	NC_012470	GCT	2	6	1625810	1625815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869022
34364	NC_012470	ACC	2	6	1625823	1625828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869022
34365	NC_012470	ATGT	2	8	1625938	1625945	25 %	50 %	25 %	0 %	225869022
34366	NC_012470	CCA	2	6	1626020	1626025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869023
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34369	NC_012470	AAT	2	6	1626188	1626193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869023
34370	NC_012470	CAAA	2	8	1626304	1626311	75 %	0 %	0 %	25 %	225869023
34371	NC_012470	TTC	2	6	1626347	1626352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869023
34372	NC_012470	TCT	2	6	1626362	1626367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869023
34373	NC_012470	TTA	2	6	1626414	1626419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869023
34374	NC_012470	GGC	2	6	1626602	1626607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869023
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34376	NC_012470	TCC	2	6	1626623	1626628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869023
34377	NC_012470	ACC	2	6	1626710	1626715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869023
34378	NC_012470	GCC	2	6	1626722	1626727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869023
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34380	NC_012470	TGT	2	6	1626806	1626811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869023
34381	NC_012470	GCC	2	6	1626818	1626823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869023
34382	NC_012470	TGG	2	6	1626828	1626833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869023
34383	NC_012470	TGT	2	6	1626919	1626924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869023
34384	NC_012470	CAA	3	9	1626973	1626981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869023
34385	NC_012470	ACC	2	6	1626990	1626995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869023
34386	NC_012470	CTG	2	6	1627012	1627017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869023
34387	NC_012470	GCT	2	6	1627140	1627145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869023
34388	NC_012470	CTG	2	6	1627269	1627274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869023
34389	NC_012470	ATG	2	6	1627359	1627364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869023
34390	NC_012470	ACT	2	6	1627410	1627415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869023
34391	NC_012470	TGAC	2	8	1627425	1627432	25 %	25 %	25 %	25 %	225869023
34392	NC_012470	AGT	2	6	1627438	1627443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869023
34393	NC_012470	GTA	2	6	1627477	1627482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869023
34394	NC_012470	CAG	2	6	1627604	1627609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869023
34395	NC_012470	GGCT	2	8	1627612	1627619	0 %	25 %	50 %	25 %	225869023
34396	NC_012470	TCAT	2	8	1627626	1627633	25 %	50 %	0 %	25 %	225869023
34397	NC_012470	AG	3	6	1627654	1627659	50 %	0 %	50 %	0 %	225869023
34398	NC_012470	CTCA	2	8	1627670	1627677	25 %	25 %	0 %	50 %	225869023
34399	NC_012470	TTG	2	6	1627799	1627804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869023
34400	NC_012470	GGC	2	6	1627805	1627810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869023
34401	NC_012470	CTC	2	6	1627847	1627852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34402	NC_012470	GCA	2	6	1627962	1627967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869024
34403	NC_012470	GA	3	6	1627975	1627980	50 %	0 %	50 %	0 %	225869024
34404	NC_012470	TGA	2	6	1628021	1628026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869024
34405	NC_012470	AGCT	2	8	1628041	1628048	25 %	25 %	25 %	25 %	225869024
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34408	NC_012470	CCCT	2	8	1628143	1628150	0 %	25 %	0 %	75 %	225869025
34409	NC_012470	TGC	2	6	1628221	1628226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869025
34410	NC_012470	TAA	2	6	1628275	1628280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869025
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34412	NC_012470	CTC	2	6	1628322	1628327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869025
34413	NC_012470	TGA	2	6	1628407	1628412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869025
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34420	NC_012470	CAT	2	6	1628751	1628756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869026
34421	NC_012470	CAGG	2	8	1628769	1628776	25 %	0 %	50 %	25 %	225869026
34422	NC_012470	AAT	2	6	1628832	1628837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869026
34423	NC_012470	CAT	2	6	1628838	1628843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869026
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34426	NC_012470	GGTC	2	8	1628976	1628983	0 %	25 %	50 %	25 %	225869027
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34428	NC_012470	GCT	2	6	1629173	1629178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
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34430	NC_012470	TGC	2	6	1629267	1629272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
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34434	NC_012470	GCT	2	6	1629571	1629576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
34435	NC_012470	GCA	2	6	1629602	1629607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869027
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34442	NC_012470	TAT	2	6	1629815	1629820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869027
34443	NC_012470	AAG	2	6	1629826	1629831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869027
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34446	NC_012470	ATTG	2	8	1630040	1630047	25 %	50 %	25 %	0 %	225869027
34447	NC_012470	GGTT	2	8	1630058	1630065	0 %	50 %	50 %	0 %	225869027
34448	NC_012470	GCCTTA	2	12	1630066	1630077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225869027
34449	NC_012470	TTC	2	6	1630104	1630109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869027
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34451	NC_012470	AAAGC	2	10	1630267	1630276	60 %	0 %	20 %	20 %	225869027
34452	NC_012470	GAAG	2	8	1630280	1630287	50 %	0 %	50 %	0 %	225869027
34453	NC_012470	TGC	2	6	1630369	1630374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
34454	NC_012470	TGTC	2	8	1630419	1630426	0 %	50 %	25 %	25 %	225869027
34455	NC_012470	T	6	6	1630472	1630477	0 %	100 %	0 %	0 %	225869027
34456	NC_012470	GGT	2	6	1630486	1630491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869027
34457	NC_012470	GCT	2	6	1630535	1630540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
34458	NC_012470	TC	3	6	1630588	1630593	0 %	50 %	0 %	50 %	225869027
34459	NC_012470	TGT	2	6	1630662	1630667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869027
34460	NC_012470	GTC	2	6	1630685	1630690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
34461	NC_012470	CTG	2	6	1630790	1630795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
34462	NC_012470	TGA	2	6	1631015	1631020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869027
34463	NC_012470	TCCT	2	8	1631052	1631059	0 %	50 %	0 %	50 %	225869027
34464	NC_012470	CAT	2	6	1631093	1631098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869027
34465	NC_012470	ACC	3	9	1631229	1631237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869027
34466	NC_012470	GAT	2	6	1631273	1631278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869027
34467	NC_012470	TCA	2	6	1631398	1631403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869027
34468	NC_012470	TTCC	2	8	1631451	1631458	0 %	50 %	0 %	50 %	225869027
34469	NC_012470	CTC	2	6	1631478	1631483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869027
34470	NC_012470	CCT	2	6	1631645	1631650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869027
34471	NC_012470	TGAGC	2	10	1631657	1631666	20 %	20 %	40 %	20 %	225869027
34472	NC_012470	CAA	2	6	1631732	1631737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869027
34473	NC_012470	AATG	2	8	1631744	1631751	50 %	25 %	25 %	0 %	225869027
34474	NC_012470	CAA	2	6	1631916	1631921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869027
34475	NC_012470	TTTAG	2	10	1631971	1631980	20 %	60 %	20 %	0 %	225869027
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34477	NC_012470	CAT	2	6	1632050	1632055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869027
34478	NC_012470	CAT	2	6	1632081	1632086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869027
34479	NC_012470	GCT	2	6	1632089	1632094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869027
34480	NC_012470	ATA	2	6	1632183	1632188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869027
34481	NC_012470	TGCCT	2	10	1632211	1632220	0 %	40 %	20 %	40 %	225869027
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