MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012470	GCA	2	6	619416	619421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_012470	TGCT	2	8	619508	619515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13003	NC_012470	GGCG	2	8	619521	619528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13004	NC_012470	CTTT	2	8	619587	619594	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_012470	TGGG	2	8	619672	619679	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_012470	TAG	2	6	619689	619694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_012470	CTG	2	6	619759	619764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_012470	GCA	2	6	619881	619886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868141
13009	NC_012470	TGA	2	6	619936	619941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868141
13010	NC_012470	GCA	2	6	619952	619957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868141
13011	NC_012470	TCG	2	6	619973	619978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868141
13012	NC_012470	GCT	2	6	620159	620164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868141
13013	NC_012470	GCTG	2	8	620177	620184	0 %	25 %	50 %	25 %	225868141
13014	NC_012470	T	6	6	620187	620192	0 %	100 %	0 %	0 %	225868141
13015	NC_012470	CAAG	2	8	620222	620229	50 %	0 %	25 %	25 %	225868141
13016	NC_012470	GCT	2	6	620253	620258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868141
13017	NC_012470	TGG	2	6	620308	620313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225868141
13018	NC_012470	GGC	2	6	620351	620356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225868141
13019	NC_012470	A	7	7	620390	620396	100 %	0 %	0 %	0 %	225868141
13020	NC_012470	ATG	2	6	620416	620421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868141
13021	NC_012470	GAAT	2	8	620494	620501	50 %	25 %	25 %	0 %	225868141
13022	NC_012470	GCA	2	6	620510	620515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868141
13023	NC_012470	GGAG	2	8	620589	620596	25 %	0 %	75 %	0 %	225868141
13024	NC_012470	TGTC	2	8	620606	620613	0 %	50 %	25 %	25 %	225868141
13025	NC_012470	AGG	2	6	620653	620658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225868142
13026	NC_012470	CTG	2	6	620679	620684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868142
13027	NC_012470	GGT	2	6	620731	620736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225868142
13028	NC_012470	A	7	7	620748	620754	100 %	0 %	0 %	0 %	225868142
13029	NC_012470	GGC	2	6	620756	620761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225868142
13030	NC_012470	CTA	2	6	620777	620782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868142
13031	NC_012470	AGAC	2	8	620824	620831	50 %	0 %	25 %	25 %	225868142
13032	NC_012470	GCT	2	6	620845	620850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868142
13033	NC_012470	CAG	3	9	620885	620893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868142
13034	NC_012470	GCT	2	6	621019	621024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868142
13035	NC_012470	TGA	2	6	621031	621036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868142
13036	NC_012470	TGA	2	6	621057	621062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868142
13037	NC_012470	AGCT	2	8	621081	621088	25 %	25 %	25 %	25 %	225868142
13038	NC_012470	GGC	2	6	621093	621098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225868142
13039	NC_012470	TGAT	2	8	621150	621157	25 %	50 %	25 %	0 %	225868142
13040	NC_012470	CTAGT	2	10	621243	621252	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13041	NC_012470	CTT	2	6	621263	621268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_012470	GTG	2	6	621301	621306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_012470	TGT	2	6	621321	621326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_012470	CAT	2	6	621346	621351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_012470	CTTT	2	8	621392	621399	0 %	75 %	0 %	25 %	225868143
13046	NC_012470	AAG	2	6	621425	621430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868143
13047	NC_012470	AG	4	8	621429	621436	50 %	0 %	50 %	0 %	225868143
13048	NC_012470	TCA	2	6	621457	621462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868143
13049	NC_012470	GTTT	2	8	621476	621483	0 %	75 %	25 %	0 %	225868143
13050	NC_012470	T	6	6	622254	622259	0 %	100 %	0 %	0 %	225868143
13051	NC_012470	T	7	7	622289	622295	0 %	100 %	0 %	0 %	225868143
13052	NC_012470	AAG	2	6	622313	622318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868143
13053	NC_012470	AATT	2	8	622418	622425	50 %	50 %	0 %	0 %	225868143
13054	NC_012470	CGA	2	6	622527	622532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868143
13055	NC_012470	CTC	2	6	622538	622543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868143
13056	NC_012470	AGC	2	6	622593	622598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868143
13057	NC_012470	ATT	2	6	622649	622654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868143
13058	NC_012470	GTAG	2	8	622674	622681	25 %	25 %	50 %	0 %	225868143
13059	NC_012470	T	6	6	622694	622699	0 %	100 %	0 %	0 %	225868143
13060	NC_012470	ATA	2	6	622868	622873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868143
13061	NC_012470	CCG	2	6	622899	622904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225868143
13062	NC_012470	ATG	3	9	622920	622928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868143
13063	NC_012470	GCT	2	6	622941	622946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868143
13064	NC_012470	TCT	2	6	622951	622956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868143
13065	NC_012470	TC	3	6	622976	622981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_012470	TCT	2	6	623015	623020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_012470	T	15	15	623091	623105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_012470	ATT	2	6	623129	623134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_012470	A	6	6	623199	623204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_012470	ATA	2	6	623252	623257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_012470	TCGT	2	8	623323	623330	0 %	50 %	25 %	25 %	225868144
13072	NC_012470	TCA	2	6	623351	623356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868144
13073	NC_012470	CTC	2	6	623371	623376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868144
13074	NC_012470	AAG	2	6	623426	623431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868144
13075	NC_012470	TGT	2	6	623497	623502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868144
13076	NC_012470	ACG	2	6	623824	623829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868144
13077	NC_012470	GAG	2	6	623837	623842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225868144
13078	NC_012470	CGA	2	6	623864	623869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868144
13079	NC_012470	CTT	2	6	623875	623880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868144
13080	NC_012470	GTT	2	6	623888	623893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868144
13081	NC_012470	CGA	2	6	623924	623929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868144
13082	NC_012470	GTC	2	6	624005	624010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868144
13083	NC_012470	TAA	2	6	624032	624037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868144
13084	NC_012470	CAAT	2	8	624054	624061	50 %	25 %	0 %	25 %	225868144
13085	NC_012470	AAT	2	6	624102	624107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_012470	TTC	2	6	624124	624129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_012470	TCT	2	6	624172	624177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868145
13088	NC_012470	T	6	6	624181	624186	0 %	100 %	0 %	0 %	225868145
13089	NC_012470	CTT	2	6	624254	624259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868145
13090	NC_012470	TTG	2	6	624357	624362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868145
13091	NC_012470	GCT	2	6	624388	624393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868145
13092	NC_012470	TTC	2	6	624441	624446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868145
13093	NC_012470	AAT	2	6	624573	624578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868145
13094	NC_012470	GTT	2	6	624597	624602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868145
13095	NC_012470	CTTT	2	8	624661	624668	0 %	75 %	0 %	25 %	225868145
13096	NC_012470	CTT	2	6	624708	624713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868145
13097	NC_012470	AACT	2	8	624740	624747	50 %	25 %	0 %	25 %	225868145
13098	NC_012470	TCT	2	6	624802	624807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868145
13099	NC_012470	CTC	2	6	624841	624846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868145
13100	NC_012470	T	6	6	624870	624875	0 %	100 %	0 %	0 %	225868145
13101	NC_012470	T	6	6	624917	624922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_012470	TTTG	2	8	624927	624934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_012470	ATT	2	6	624971	624976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868146
13104	NC_012470	AAG	2	6	624997	625002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868146
13105	NC_012470	AAG	2	6	625011	625016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868146
13106	NC_012470	AG	4	8	625015	625022	50 %	0 %	50 %	0 %	225868146
13107	NC_012470	GTTT	2	8	625062	625069	0 %	75 %	25 %	0 %	225868146
13108	NC_012470	GTT	2	6	625121	625126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868146
13109	NC_012470	GTCC	2	8	625517	625524	0 %	25 %	25 %	50 %	225868146
13110	NC_012470	CAG	2	6	625898	625903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868146
13111	NC_012470	ATT	2	6	626208	626213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868146
13112	NC_012470	GTT	2	6	626214	626219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868146
13113	NC_012470	CTG	2	6	626258	626263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868146
13114	NC_012470	TA	3	6	626265	626270	50 %	50 %	0 %	0 %	225868146
13115	NC_012470	AAT	2	6	626347	626352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868146
13116	NC_012470	GTT	2	6	626356	626361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868146
13117	NC_012470	TA	3	6	626383	626388	50 %	50 %	0 %	0 %	225868146
13118	NC_012470	ATT	2	6	626418	626423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868146
13119	NC_012470	AAT	2	6	626582	626587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868146
13120	NC_012470	T	7	7	626649	626655	0 %	100 %	0 %	0 %	225868146
13121	NC_012470	AAT	2	6	626686	626691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868146
13122	NC_012470	T	6	6	626828	626833	0 %	100 %	0 %	0 %	225868146
13123	NC_012470	CCCA	2	8	626894	626901	25 %	0 %	0 %	75 %	225868146
13124	NC_012470	TCC	2	6	626908	626913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868146
13125	NC_012470	TGA	2	6	626936	626941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868146
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13127	NC_012470	GCT	2	6	626974	626979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868146
13128	NC_012470	TCT	2	6	626984	626989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868146
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13130	NC_012470	CTTT	2	8	627046	627053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13131	NC_012470	ACG	2	6	627073	627078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_012470	T	16	16	627126	627141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_012470	AGG	2	6	627200	627205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13135	NC_012470	TCA	2	6	627300	627305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13136	NC_012470	TAGC	2	8	627313	627320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13137	NC_012470	G	6	6	627386	627391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13138	NC_012470	TGT	2	6	627393	627398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_012470	ATA	2	6	627407	627412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13140	NC_012470	GCT	2	6	627447	627452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13143	NC_012470	TTCG	2	8	627512	627519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13144	NC_012470	T	6	6	627524	627529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13145	NC_012470	ATG	2	6	627576	627581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13150	NC_012470	TGAG	2	8	627778	627785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13151	NC_012470	GGA	2	6	627794	627799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13152	NC_012470	TAC	2	6	627816	627821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868148
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13241	NC_012470	A	6	6	631726	631731	100 %	0 %	0 %	0 %	225868151
13242	NC_012470	CCA	2	6	631776	631781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868151
13243	NC_012470	CTT	2	6	631791	631796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868151
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13246	NC_012470	AGC	2	6	631895	631900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868151
13247	NC_012470	CT	3	6	631966	631971	0 %	50 %	0 %	50 %	225868151
13248	NC_012470	GT	3	6	631983	631988	0 %	50 %	50 %	0 %	225868151
13249	NC_012470	CAT	2	6	632001	632006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868151
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13253	NC_012470	AAG	2	6	632241	632246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_012470	AAG	2	6	632255	632260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868152
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13271	NC_012470	GAAA	2	8	633042	633049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13274	NC_012470	AAG	2	6	633202	633207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868153
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13304	NC_012470	TGG	2	6	634723	634728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13356	NC_012470	A	6	6	637151	637156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13357	NC_012470	TTA	2	6	637163	637168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13364	NC_012470	GTACAA	2	12	637556	637567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225868155
13365	NC_012470	TGA	2	6	637586	637591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868155
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13370	NC_012470	ATC	2	6	637744	637749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868155
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13373	NC_012470	ACC	2	6	637816	637821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868155
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13415	NC_012470	TGA	2	6	639984	639989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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