MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012470	TGA	2	6	240235	240240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867814
5002	NC_012470	ATG	2	6	240264	240269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867814
5003	NC_012470	GAG	2	6	240281	240286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867814
5004	NC_012470	AAT	2	6	240380	240385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867814
5005	NC_012470	TTG	2	6	240399	240404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867814
5006	NC_012470	TTTG	2	8	240412	240419	0 %	75 %	25 %	0 %	225867814
5007	NC_012470	GGT	2	6	240431	240436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867814
5008	NC_012470	GTG	2	6	240467	240472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867814
5009	NC_012470	GCA	2	6	240482	240487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867814
5010	NC_012470	ATC	2	6	240531	240536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867814
5011	NC_012470	CAG	3	9	240582	240590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867814
5012	NC_012470	TCAGAC	2	12	240625	240636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225867814
5013	NC_012470	A	8	8	240672	240679	100 %	0 %	0 %	0 %	225867814
5014	NC_012470	GACA	2	8	240727	240734	50 %	0 %	25 %	25 %	225867814
5015	NC_012470	CCT	2	6	240807	240812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867814
5016	NC_012470	GCA	2	6	240866	240871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867814
5017	NC_012470	GTCT	2	8	240886	240893	0 %	50 %	25 %	25 %	225867814
5018	NC_012470	CT	3	6	240911	240916	0 %	50 %	0 %	50 %	225867814
5019	NC_012470	GATTCC	2	12	240940	240951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225867814
5020	NC_012470	TGG	2	6	240961	240966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867814
5021	NC_012470	TGA	2	6	240975	240980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867814
5022	NC_012470	TCG	2	6	240997	241002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867814
5023	NC_012470	AGAGAC	2	12	241018	241029	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225867814
5024	NC_012470	TGG	2	6	241059	241064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867814
5025	NC_012470	TC	4	8	241124	241131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_012470	ATT	2	6	241189	241194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012470	GCA	2	6	241217	241222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_012470	T	6	6	241254	241259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012470	GAAAG	2	10	241277	241286	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012470	AG	3	6	241285	241290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_012470	GCT	2	6	241367	241372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_012470	CT	3	6	241371	241376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_012470	GTGC	2	8	241468	241475	0 %	25 %	50 %	25 %	225867815
5034	NC_012470	A	6	6	241677	241682	100 %	0 %	0 %	0 %	225867815
5035	NC_012470	GAA	2	6	241720	241725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867815
5036	NC_012470	TAC	2	6	241731	241736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867815
5037	NC_012470	AGC	2	6	241766	241771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867815
5038	NC_012470	TGA	2	6	241809	241814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
5039	NC_012470	TCA	2	6	241878	241883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867815
5040	NC_012470	ATG	2	6	241889	241894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
5041	NC_012470	TGG	2	6	241983	241988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867815
5042	NC_012470	GGT	2	6	241996	242001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867815
5043	NC_012470	GCTG	2	8	242054	242061	0 %	25 %	50 %	25 %	225867815
5044	NC_012470	AGG	2	6	242102	242107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867815
5045	NC_012470	TGC	2	6	242190	242195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867815
5046	NC_012470	TCA	2	6	242230	242235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867815
5047	NC_012470	GAT	2	6	242251	242256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
5048	NC_012470	TCG	2	6	242258	242263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867815
5049	NC_012470	TGA	2	6	242292	242297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
5050	NC_012470	GGC	2	6	242301	242306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225867815
5051	NC_012470	TCA	2	6	242333	242338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867815
5052	NC_012470	TTGG	2	8	242383	242390	0 %	50 %	50 %	0 %	225867815
5053	NC_012470	ACC	2	6	242423	242428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867815
5054	NC_012470	CTT	2	6	242439	242444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867815
5055	NC_012470	GAG	3	9	242458	242466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867815
5056	NC_012470	CAA	2	6	242583	242588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867815
5057	NC_012470	GA	3	6	242669	242674	50 %	0 %	50 %	0 %	225867815
5058	NC_012470	GGC	2	6	242766	242771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225867815
5059	NC_012470	TGA	2	6	242781	242786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
5060	NC_012470	GCT	2	6	242816	242821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867815
5061	NC_012470	AGC	2	6	242861	242866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867815
5062	NC_012470	AGCT	2	8	242939	242946	25 %	25 %	25 %	25 %	225867815
5063	NC_012470	AGG	2	6	242987	242992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867815
5064	NC_012470	ATG	2	6	243041	243046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
5065	NC_012470	TGA	2	6	243054	243059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
5066	NC_012470	A	6	6	243133	243138	100 %	0 %	0 %	0 %	225867815
5067	NC_012470	TTG	2	6	243152	243157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867815
5068	NC_012470	ATCAAA	2	12	243160	243171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225867815
5069	NC_012470	TTGA	2	8	243208	243215	25 %	50 %	25 %	0 %	225867815
5070	NC_012470	CAG	2	6	243316	243321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
5071	NC_012470	TTG	2	6	243387	243392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867816
5072	NC_012470	GCA	2	6	243397	243402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
5073	NC_012470	AGATGT	2	12	243465	243476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867816
5074	NC_012470	T	6	6	243481	243486	0 %	100 %	0 %	0 %	225867816
5075	NC_012470	AGC	2	6	243512	243517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
5076	NC_012470	AGA	2	6	243522	243527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867816
5077	NC_012470	GCA	2	6	243586	243591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
5078	NC_012470	CCT	2	6	243607	243612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867816
5079	NC_012470	AGG	2	6	243681	243686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867816
5080	NC_012470	TGTC	2	8	243735	243742	0 %	50 %	25 %	25 %	225867816
5081	NC_012470	T	6	6	243756	243761	0 %	100 %	0 %	0 %	225867816
5082	NC_012470	AAG	2	6	243805	243810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867816
5083	NC_012470	GCCTT	2	10	243977	243986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5084	NC_012470	CTG	2	6	244266	244271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5085	NC_012470	AG	3	6	244348	244353	50 %	0 %	50 %	0 %	225867817
5086	NC_012470	GCA	2	6	244394	244399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5087	NC_012470	AATT	2	8	244435	244442	50 %	50 %	0 %	0 %	225867817
5088	NC_012470	GCT	2	6	244453	244458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5089	NC_012470	CTA	2	6	244465	244470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
5090	NC_012470	AAG	2	6	244473	244478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
5091	NC_012470	TCAGG	2	10	244534	244543	20 %	20 %	40 %	20 %	225867817
5092	NC_012470	CAT	2	6	244550	244555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
5093	NC_012470	AAT	2	6	244586	244591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867817
5094	NC_012470	GCTTTG	2	12	244641	244652	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225867817
5095	NC_012470	TGG	2	6	244734	244739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867817
5096	NC_012470	ATA	2	6	244755	244760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867817
5097	NC_012470	GCA	2	6	244763	244768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5098	NC_012470	CCA	2	6	244793	244798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867817
5099	NC_012470	GAG	2	6	244802	244807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867817
5100	NC_012470	CCAAGC	2	12	244814	244825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	225867817
5101	NC_012470	AG	3	6	244835	244840	50 %	0 %	50 %	0 %	225867817
5102	NC_012470	CAAG	2	8	244856	244863	50 %	0 %	25 %	25 %	225867817
5103	NC_012470	AGA	2	6	244906	244911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
5104	NC_012470	GAC	2	6	244957	244962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5105	NC_012470	GCC	2	6	244971	244976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225867817
5106	NC_012470	CCT	3	9	245007	245015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867817
5107	NC_012470	AAC	2	6	245111	245116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867817
5108	NC_012470	GCA	2	6	245146	245151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5109	NC_012470	CA	3	6	245223	245228	50 %	0 %	0 %	50 %	225867817
5110	NC_012470	AGA	2	6	245263	245268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
5111	NC_012470	TGAT	2	8	245271	245278	25 %	50 %	25 %	0 %	225867817
5112	NC_012470	CAG	2	6	245280	245285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5113	NC_012470	GC	3	6	245360	245365	0 %	0 %	50 %	50 %	225867817
5114	NC_012470	TGT	2	6	245470	245475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867817
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5116	NC_012470	TGATT	2	10	245515	245524	20 %	60 %	20 %	0 %	225867817
5117	NC_012470	TGA	2	6	245572	245577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
5118	NC_012470	ACA	2	6	245612	245617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867817
5119	NC_012470	CAG	2	6	245666	245671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
5120	NC_012470	CAGC	2	8	245785	245792	25 %	0 %	25 %	50 %	225867817
5121	NC_012470	TGG	2	6	246006	246011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867817
5122	NC_012470	GGA	2	6	246013	246018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867817
5123	NC_012470	TGC	2	6	246241	246246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
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5154	NC_012470	ATG	2	6	247521	247526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
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5226	NC_012470	T	7	7	250564	250570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5227	NC_012470	AGGC	2	8	250622	250629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5230	NC_012470	ATT	2	6	250670	250675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_012470	A	6	6	250677	250682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_012470	AT	12	24	250702	250725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_012470	TAA	2	6	250745	250750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_012470	A	6	6	250760	250765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_012470	TCGT	2	8	250772	250779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5236	NC_012470	AAAT	2	8	250780	250787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_012470	ATCTA	2	10	250793	250802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5238	NC_012470	A	7	7	250802	250808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_012470	A	6	6	250922	250927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_012470	GA	3	6	250935	250940	50 %	0 %	50 %	0 %	225867821
5241	NC_012470	A	6	6	250959	250964	100 %	0 %	0 %	0 %	225867821
5242	NC_012470	CAG	3	9	250978	250986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867821
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5244	NC_012470	CCTGAC	2	12	251006	251017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225867821
5245	NC_012470	CAC	2	6	251069	251074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867821
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5247	NC_012470	TA	3	6	251274	251279	50 %	50 %	0 %	0 %	225867821
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5372	NC_012470	CGT	2	6	255928	255933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867825
5373	NC_012470	GAG	2	6	255991	255996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867825
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5384	NC_012470	A	7	7	256848	256854	100 %	0 %	0 %	0 %	225867825
5385	NC_012470	T	6	6	256924	256929	0 %	100 %	0 %	0 %	225867826
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5488	NC_012470	A	7	7	261834	261840	100 %	0 %	0 %	0 %	225867832
5489	NC_012470	T	6	6	261897	261902	0 %	100 %	0 %	0 %	225867832
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5492	NC_012470	ATT	2	6	261981	261986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867832
5493	NC_012470	GAG	2	6	262062	262067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867832
5494	NC_012470	GAA	2	6	262068	262073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867832
5495	NC_012470	CTG	3	9	262099	262107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867832
5496	NC_012470	CTA	2	6	262141	262146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867832
5497	NC_012470	TGAA	2	8	262153	262160	50 %	25 %	25 %	0 %	225867832
5498	NC_012470	AGC	2	6	262213	262218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867832
5499	NC_012470	GAT	2	6	262341	262346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867832
5500	NC_012470	TAA	2	6	262347	262352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867832

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