MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 43253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_012469	ATGA	2	8	1860173	1860180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38002	NC_012469	TAT	2	6	1860233	1860238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38003	NC_012469	TATT	2	8	1860328	1860335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38004	NC_012469	A	6	6	1860388	1860393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38005	NC_012469	GA	3	6	1860394	1860399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38006	NC_012469	TA	3	6	1860423	1860428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38007	NC_012469	AC	3	6	1860447	1860452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38008	NC_012469	CT	3	6	1860731	1860736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38009	NC_012469	ACG	2	6	1860743	1860748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38010	NC_012469	GGT	2	6	1860780	1860785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38011	NC_012469	TCT	2	6	1860817	1860822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38012	NC_012469	AT	3	6	1861005	1861010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38013	NC_012469	ACT	2	6	1861297	1861302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38014	NC_012469	ATTCA	2	10	1861408	1861417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38015	NC_012469	TATTAG	2	12	1861469	1861480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38016	NC_012469	CACTTC	2	12	1861500	1861511	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38017	NC_012469	ATC	2	6	1861527	1861532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38018	NC_012469	TC	3	6	1861531	1861536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38019	NC_012469	AT	3	6	1861550	1861555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38020	NC_012469	TCCCT	2	10	1861613	1861622	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38021	NC_012469	ACG	2	6	1861755	1861760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38022	NC_012469	CGA	2	6	1861835	1861840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38023	NC_012469	ACC	2	6	1861950	1861955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38024	NC_012469	AGG	2	6	1862086	1862091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38025	NC_012469	GTA	2	6	1862174	1862179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38026	NC_012469	CCTA	2	8	1862226	1862233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38027	NC_012469	TC	3	6	1862346	1862351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38028	NC_012469	GCC	2	6	1862443	1862448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38029	NC_012469	CTC	2	6	1862491	1862496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38030	NC_012469	CAT	2	6	1862534	1862539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38031	NC_012469	AG	3	6	1862553	1862558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38032	NC_012469	TC	3	6	1862669	1862674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38033	NC_012469	CTA	2	6	1862782	1862787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38034	NC_012469	AGAC	2	8	1862857	1862864	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38035	NC_012469	TTAG	2	8	1862882	1862889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38036	NC_012469	TGT	2	6	1862939	1862944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38037	NC_012469	TC	3	6	1862965	1862970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38038	NC_012469	CTC	2	6	1863095	1863100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38039	NC_012469	TCA	2	6	1863112	1863117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38040	NC_012469	CA	3	6	1863116	1863121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38041	NC_012469	TGAA	2	8	1863235	1863242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38042	NC_012469	GCT	2	6	1863245	1863250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38043	NC_012469	ATT	2	6	1863305	1863310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38044	NC_012469	TGG	2	6	1863324	1863329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38045	NC_012469	GA	3	6	1863505	1863510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38046	NC_012469	TCC	2	6	1863591	1863596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38047	NC_012469	CAT	2	6	1863724	1863729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38048	NC_012469	TTG	2	6	1863790	1863795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38049	NC_012469	CTCCC	2	10	1863824	1863833	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
38050	NC_012469	TCC	2	6	1863909	1863914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38053	NC_012469	TTC	2	6	1864024	1864029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38054	NC_012469	TCGC	2	8	1864102	1864109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38055	NC_012469	CTA	2	6	1864112	1864117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38056	NC_012469	TCC	2	6	1864178	1864183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38057	NC_012469	ATC	2	6	1864250	1864255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38058	NC_012469	CTTA	2	8	1864257	1864264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38059	NC_012469	TCG	2	6	1864282	1864287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38060	NC_012469	TCG	2	6	1864301	1864306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38061	NC_012469	TTA	2	6	1864339	1864344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38062	NC_012469	TTA	2	6	1864382	1864387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38063	NC_012469	TAC	2	6	1864389	1864394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38064	NC_012469	TC	3	6	1864466	1864471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38065	NC_012469	CCT	2	6	1864504	1864509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38072	NC_012469	GT	3	6	1864913	1864918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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38077	NC_012469	CACGA	2	10	1865063	1865072	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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38082	NC_012469	TCC	2	6	1865428	1865433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38083	NC_012469	AT	3	6	1865434	1865439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38093	NC_012469	AAGC	2	8	1866060	1866067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38094	NC_012469	TCC	2	6	1866068	1866073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38095	NC_012469	CGC	2	6	1866103	1866108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38098	NC_012469	TGT	2	6	1866217	1866222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38099	NC_012469	TC	3	6	1866279	1866284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38100	NC_012469	T	6	6	1866333	1866338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38101	NC_012469	T	7	7	1866353	1866359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38102	NC_012469	T	7	7	1866364	1866370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38103	NC_012469	CCG	2	6	1866428	1866433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38108	NC_012469	T	8	8	1866546	1866553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38109	NC_012469	TTC	2	6	1866663	1866668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861826
38110	NC_012469	TTTG	2	8	1866683	1866690	0 %	75 %	25 %	0 %	225861826
38111	NC_012469	ATA	2	6	1866723	1866728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225861826
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38115	NC_012469	CTT	2	6	1866779	1866784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861826
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38119	NC_012469	CTT	2	6	1867019	1867024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861826
38120	NC_012469	A	6	6	1867135	1867140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38121	NC_012469	CT	3	6	1867154	1867159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38122	NC_012469	GGTTTA	2	12	1867182	1867193	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225861827
38123	NC_012469	TTA	2	6	1867244	1867249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225861827
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38126	NC_012469	GT	3	6	1867446	1867451	0 %	50 %	50 %	0 %	225861827
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38485	NC_012469	GCA	2	6	1884163	1884168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225861845
38486	NC_012469	CAC	2	6	1884182	1884187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225861845
38487	NC_012469	GAT	2	6	1884195	1884200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861845
38488	NC_012469	AAC	2	6	1884291	1884296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225861845
38489	NC_012469	CGA	2	6	1884304	1884309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225861845
38490	NC_012469	GTT	2	6	1884317	1884322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225861845
38491	NC_012469	GAT	2	6	1884324	1884329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861845
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38496	NC_012469	ATG	2	6	1884566	1884571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861845
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