MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 43253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_012469	AT	3	6	1211375	1211380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25003	NC_012469	TCC	2	6	1211382	1211387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25004	NC_012469	ATT	2	6	1211388	1211393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25005	NC_012469	A	7	7	1211435	1211441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25006	NC_012469	TAT	2	6	1211443	1211448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25007	NC_012469	T	6	6	1211459	1211464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25008	NC_012469	TCA	2	6	1211540	1211545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25009	NC_012469	TCT	2	6	1211594	1211599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25010	NC_012469	TAA	2	6	1211613	1211618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25011	NC_012469	GAAG	2	8	1211633	1211640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25012	NC_012469	ACT	2	6	1211653	1211658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861183
25013	NC_012469	CTC	2	6	1211681	1211686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225861183
25014	NC_012469	TCC	2	6	1211790	1211795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225861183
25015	NC_012469	CTA	2	6	1211797	1211802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861183
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25017	NC_012469	AT	3	6	1211833	1211838	50 %	50 %	0 %	0 %	225861183
25018	NC_012469	AAC	2	6	1211846	1211851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225861183
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25022	NC_012469	ATG	2	6	1212024	1212029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861183
25023	NC_012469	CTGA	2	8	1212050	1212057	25 %	25 %	25 %	25 %	225861183
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25028	NC_012469	GATT	2	8	1212271	1212278	25 %	50 %	25 %	0 %	225861183
25029	NC_012469	TAA	2	6	1212307	1212312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225861183
25030	NC_012469	GAA	2	6	1212410	1212415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225861183
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25032	NC_012469	A	6	6	1212453	1212458	100 %	0 %	0 %	0 %	225861183
25033	NC_012469	T	6	6	1212493	1212498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25034	NC_012469	TAA	2	6	1212589	1212594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25035	NC_012469	GAAT	2	8	1212610	1212617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25036	NC_012469	TCT	2	6	1212665	1212670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861184
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25042	NC_012469	GC	3	6	1213022	1213027	0 %	0 %	50 %	50 %	225861184
25043	NC_012469	GATACC	2	12	1213055	1213066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225861184
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25053	NC_012469	CTGG	2	8	1213578	1213585	0 %	25 %	50 %	25 %	225861185
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25058	NC_012469	TCT	3	9	1213773	1213781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861185
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25103	NC_012469	AGT	2	6	1216574	1216579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861187
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25106	NC_012469	TCAA	2	8	1216771	1216778	50 %	25 %	0 %	25 %	225861187
25107	NC_012469	TGC	2	6	1216812	1216817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225861187
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25112	NC_012469	CCTT	2	8	1217100	1217107	0 %	50 %	0 %	50 %	225861188
25113	NC_012469	T	6	6	1217132	1217137	0 %	100 %	0 %	0 %	225861188
25114	NC_012469	AAC	2	6	1217151	1217156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225861188
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25117	NC_012469	ATG	2	6	1217292	1217297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861188
25118	NC_012469	CTTC	2	8	1217302	1217309	0 %	50 %	0 %	50 %	225861188
25119	NC_012469	TGA	2	6	1217386	1217391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861188
25120	NC_012469	ATC	2	6	1217402	1217407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861188
25121	NC_012469	GTA	2	6	1217441	1217446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861188
25122	NC_012469	ATC	2	6	1217462	1217467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861188
25123	NC_012469	GCA	2	6	1217475	1217480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225861188
25124	NC_012469	CCG	2	6	1217583	1217588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225861188
25125	NC_012469	CAC	2	6	1217590	1217595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225861188
25126	NC_012469	CTTT	2	8	1217611	1217618	0 %	75 %	0 %	25 %	225861188
25127	NC_012469	TCATT	2	10	1217653	1217662	20 %	60 %	0 %	20 %	225861188
25128	NC_012469	ATC	2	6	1217672	1217677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861188
25129	NC_012469	TTATA	2	10	1217856	1217865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25130	NC_012469	TCC	2	6	1217936	1217941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225861189
25131	NC_012469	TAC	2	6	1218078	1218083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25132	NC_012469	CACT	2	8	1218182	1218189	25 %	25 %	0 %	50 %	225861190
25133	NC_012469	ATA	2	6	1218197	1218202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225861190
25134	NC_012469	TCA	2	6	1218350	1218355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861190
25135	NC_012469	AAGA	2	8	1218400	1218407	75 %	0 %	25 %	0 %	225861190
25136	NC_012469	CTT	2	6	1218430	1218435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861190
25137	NC_012469	ATC	2	6	1218564	1218569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861190
25138	NC_012469	TACC	2	8	1218611	1218618	25 %	25 %	0 %	50 %	225861190
25139	NC_012469	ATC	2	6	1218734	1218739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861191
25140	NC_012469	ATC	2	6	1218745	1218750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861191
25141	NC_012469	TAA	2	6	1218813	1218818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225861191
25142	NC_012469	GGAG	2	8	1218855	1218862	25 %	0 %	75 %	0 %	225861192
25143	NC_012469	GGA	2	6	1218944	1218949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225861192
25144	NC_012469	TC	3	6	1219009	1219014	0 %	50 %	0 %	50 %	225861192
25145	NC_012469	CTT	2	6	1219026	1219031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861192
25146	NC_012469	AT	3	6	1219058	1219063	50 %	50 %	0 %	0 %	225861192
25147	NC_012469	ACCA	2	8	1219123	1219130	50 %	0 %	0 %	50 %	225861192
25148	NC_012469	AC	3	6	1219308	1219313	50 %	0 %	0 %	50 %	225861192
25149	NC_012469	TAAG	2	8	1219462	1219469	50 %	25 %	25 %	0 %	225861192
25150	NC_012469	AAG	2	6	1219540	1219545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225861192
25151	NC_012469	CCA	2	6	1219565	1219570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225861192
25152	NC_012469	CTG	2	6	1219587	1219592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225861192
25153	NC_012469	AAATGC	2	12	1219640	1219651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225861192
25154	NC_012469	CTA	2	6	1219668	1219673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861192
25155	NC_012469	CAT	2	6	1219678	1219683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861192
25156	NC_012469	GTA	2	6	1219735	1219740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861192
25157	NC_012469	TTG	2	6	1219748	1219753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225861192
25158	NC_012469	CAC	2	6	1219872	1219877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225861192
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25160	NC_012469	GTT	2	6	1219979	1219984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225861192
25161	NC_012469	CCA	2	6	1219985	1219990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225861192
25162	NC_012469	CAGC	2	8	1220028	1220035	25 %	0 %	25 %	50 %	225861192
25163	NC_012469	AAT	2	6	1220050	1220055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225861192
25164	NC_012469	A	6	6	1220320	1220325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25165	NC_012469	TCT	2	6	1220351	1220356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25166	NC_012469	CT	3	6	1220409	1220414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25167	NC_012469	CAC	2	6	1220468	1220473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25168	NC_012469	AAT	2	6	1220542	1220547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25169	NC_012469	CCTG	2	8	1220579	1220586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25170	NC_012469	T	6	6	1220597	1220602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25171	NC_012469	CAT	2	6	1220628	1220633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25172	NC_012469	TTA	2	6	1220649	1220654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25173	NC_012469	T	6	6	1220686	1220691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25174	NC_012469	A	6	6	1220695	1220700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25175	NC_012469	TAG	2	6	1220709	1220714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25176	NC_012469	TGTTC	2	10	1220786	1220795	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25177	NC_012469	CCT	2	6	1220856	1220861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25178	NC_012469	TTG	2	6	1220927	1220932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25179	NC_012469	TAC	2	6	1220977	1220982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861193
25180	NC_012469	A	6	6	1221032	1221037	100 %	0 %	0 %	0 %	225861193
25181	NC_012469	CT	3	6	1221064	1221069	0 %	50 %	0 %	50 %	225861193
25182	NC_012469	CTC	2	6	1221081	1221086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225861193
25183	NC_012469	CTG	2	6	1221312	1221317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225861193
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25191	NC_012469	TAT	2	6	1221602	1221607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225861193
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25194	NC_012469	A	6	6	1221746	1221751	100 %	0 %	0 %	0 %	225861193
25195	NC_012469	AGA	2	6	1221775	1221780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225861193
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25197	NC_012469	TGCG	2	8	1221868	1221875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25198	NC_012469	ATT	2	6	1221900	1221905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25199	NC_012469	TGG	2	6	1221914	1221919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25200	NC_012469	A	6	6	1222011	1222016	100 %	0 %	0 %	0 %	225861194
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25205	NC_012469	TCG	2	6	1222267	1222272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225861194
25206	NC_012469	CTT	2	6	1222281	1222286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861194
25207	NC_012469	CCAA	2	8	1222323	1222330	50 %	0 %	0 %	50 %	225861194
25208	NC_012469	T	7	7	1222450	1222456	0 %	100 %	0 %	0 %	225861195
25209	NC_012469	CTT	2	6	1222480	1222485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861195
25210	NC_012469	CAT	2	6	1222554	1222559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861195
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25212	NC_012469	TGTT	2	8	1222669	1222676	0 %	75 %	25 %	0 %	225861195
25213	NC_012469	ATA	2	6	1222723	1222728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225861195
25214	NC_012469	TTTG	2	8	1222760	1222767	0 %	75 %	25 %	0 %	225861195
25215	NC_012469	TAG	2	6	1222768	1222773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861195
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25218	NC_012469	CTC	2	6	1222944	1222949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225861195
25219	NC_012469	GTT	2	6	1222961	1222966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225861195
25220	NC_012469	ACC	2	6	1222992	1222997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225861195
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25222	NC_012469	CAG	2	6	1223078	1223083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225861195
25223	NC_012469	TTC	2	6	1223136	1223141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861195
25224	NC_012469	TGA	2	6	1223155	1223160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861195
25225	NC_012469	TTAGAG	2	12	1223165	1223176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861195
25226	NC_012469	TTGG	2	8	1223297	1223304	0 %	50 %	50 %	0 %	225861195
25227	NC_012469	CTT	2	6	1223345	1223350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861195
25228	NC_012469	AAGT	2	8	1223365	1223372	50 %	25 %	25 %	0 %	225861195
25229	NC_012469	CTT	2	6	1223384	1223389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861195
25230	NC_012469	TCT	2	6	1223446	1223451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861195
25231	NC_012469	T	6	6	1223499	1223504	0 %	100 %	0 %	0 %	225861195
25232	NC_012469	GCT	2	6	1223536	1223541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225861195
25233	NC_012469	TTG	2	6	1223561	1223566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225861195
25234	NC_012469	TTC	2	6	1223602	1223607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861195
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25236	NC_012469	GGA	2	6	1223684	1223689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225861195
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25347	NC_012469	A	7	7	1229988	1229994	100 %	0 %	0 %	0 %	225861202
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25349	NC_012469	T	6	6	1230028	1230033	0 %	100 %	0 %	0 %	225861202
25350	NC_012469	TGA	2	6	1230149	1230154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861202
25351	NC_012469	TCT	2	6	1230165	1230170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225861202
25352	NC_012469	CTTCT	2	10	1230206	1230215	0 %	60 %	0 %	40 %	225861202
25353	NC_012469	ATG	2	6	1230289	1230294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861202
25354	NC_012469	GTC	2	6	1230349	1230354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225861202
25355	NC_012469	TC	3	6	1230364	1230369	0 %	50 %	0 %	50 %	225861202
25356	NC_012469	TTTTAG	2	12	1230397	1230408	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225861203
25357	NC_012469	CTTT	2	8	1230507	1230514	0 %	75 %	0 %	25 %	225861203
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25369	NC_012469	TCAT	2	8	1231354	1231361	25 %	50 %	0 %	25 %	225861204
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25445	NC_012469	AAAC	2	8	1234967	1234974	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25446	NC_012469	A	7	7	1235023	1235029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25447	NC_012469	TAGAT	2	10	1235047	1235056	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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25455	NC_012469	A	7	7	1235352	1235358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25456	NC_012469	AAAG	2	8	1235364	1235371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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25475	NC_012469	TCA	2	6	1236375	1236380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225861208
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25478	NC_012469	ATG	3	9	1236449	1236457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861208
25479	NC_012469	GTG	2	6	1236557	1236562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225861208
25480	NC_012469	AGC	2	6	1236588	1236593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225861208
25481	NC_012469	ACC	2	6	1236691	1236696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225861208
25482	NC_012469	A	7	7	1236700	1236706	100 %	0 %	0 %	0 %	225861208
25483	NC_012469	CGT	2	6	1236708	1236713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225861208
25484	NC_012469	ATG	2	6	1236716	1236721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225861208
25485	NC_012469	A	6	6	1236743	1236748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25486	NC_012469	GAG	2	6	1236767	1236772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25488	NC_012469	GAG	2	6	1236842	1236847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25489	NC_012469	GAA	2	6	1236848	1236853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25490	NC_012469	GA	3	6	1236896	1236901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25491	NC_012469	ATGA	2	8	1236905	1236912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25492	NC_012469	GTAA	2	8	1236976	1236983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25493	NC_012469	AT	3	6	1237038	1237043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25494	NC_012469	A	6	6	1237175	1237180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25495	NC_012469	CA	3	6	1237186	1237191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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