MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012466	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012466	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012466	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012466	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012466	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012466	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012466	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	225853612
8	NC_012466	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	225853612
9	NC_012466	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853612
10	NC_012466	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225853612
11	NC_012466	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853612
12	NC_012466	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
13	NC_012466	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
14	NC_012466	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
15	NC_012466	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225853612
16	NC_012466	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
17	NC_012466	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
18	NC_012466	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225853612
19	NC_012466	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	225853612
20	NC_012466	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	225853612
21	NC_012466	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
22	NC_012466	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
23	NC_012466	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	225853612
24	NC_012466	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
25	NC_012466	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
26	NC_012466	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	225853612
27	NC_012466	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853612
28	NC_012466	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
29	NC_012466	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	225853612
30	NC_012466	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	225853612
31	NC_012466	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225853612
32	NC_012466	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	225853612
33	NC_012466	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	225853612
34	NC_012466	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
35	NC_012466	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012466	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012466	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012466	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012466	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012466	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012466	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012466	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853613
43	NC_012466	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	225853613
44	NC_012466	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
45	NC_012466	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	225853613
46	NC_012466	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	225853613
47	NC_012466	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
48	NC_012466	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
49	NC_012466	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
50	NC_012466	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
51	NC_012466	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	225853613
52	NC_012466	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853613
53	NC_012466	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853613
54	NC_012466	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	225853613
55	NC_012466	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	225853613
56	NC_012466	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	225853613
57	NC_012466	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
58	NC_012466	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
59	NC_012466	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
60	NC_012466	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853613
61	NC_012466	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225853613
62	NC_012466	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853613
63	NC_012466	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	225853613
64	NC_012466	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	225853613
65	NC_012466	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853613
66	NC_012466	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012466	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
68	NC_012466	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	225853614
69	NC_012466	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225853614
70	NC_012466	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
71	NC_012466	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853614
72	NC_012466	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853614
73	NC_012466	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012466	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012466	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
76	NC_012466	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
77	NC_012466	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
78	NC_012466	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853615
79	NC_012466	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	225853615
80	NC_012466	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
81	NC_012466	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853615
82	NC_012466	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
83	NC_012466	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
84	NC_012466	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	225853615
85	NC_012466	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
86	NC_012466	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
87	NC_012466	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
88	NC_012466	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	225853615
89	NC_012466	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	225853615
90	NC_012466	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	225853615
91	NC_012466	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
92	NC_012466	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853615
93	NC_012466	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
94	NC_012466	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
95	NC_012466	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
96	NC_012466	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
97	NC_012466	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	225853615
98	NC_012466	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012466	A	8	8	4341	4348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012466	AAAT	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	225853616
101	NC_012466	AAACA	2	10	4432	4441	80 %	0 %	0 %	20 %	225853616
102	NC_012466	TTGA	2	8	4458	4465	25 %	50 %	25 %	0 %	225853616
103	NC_012466	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853616
104	NC_012466	AC	3	6	4497	4502	50 %	0 %	0 %	50 %	225853616
105	NC_012466	A	6	6	4549	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	225853616
106	NC_012466	ATGA	2	8	4581	4588	50 %	25 %	25 %	0 %	225853616
107	NC_012466	TTA	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
108	NC_012466	GAT	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
109	NC_012466	CAG	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853616
110	NC_012466	TAT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
111	NC_012466	ATTGGA	2	12	4779	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
112	NC_012466	GTT	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853616
113	NC_012466	CAT	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
114	NC_012466	GAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
115	NC_012466	ACT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
116	NC_012466	TTA	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
117	NC_012466	A	6	6	4995	5000	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
118	NC_012466	CTA	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853617
119	NC_012466	TTGCAA	2	12	5068	5079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225853617
120	NC_012466	AGA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
121	NC_012466	TATC	2	8	5158	5165	25 %	50 %	0 %	25 %	225853617
122	NC_012466	GAT	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
123	NC_012466	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853617
124	NC_012466	A	6	6	5239	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
125	NC_012466	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	225853617
126	NC_012466	GATT	2	8	5326	5333	25 %	50 %	25 %	0 %	225853617
127	NC_012466	GAA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
128	NC_012466	GAG	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
129	NC_012466	T	6	6	5535	5540	0 %	100 %	0 %	0 %	225853617
130	NC_012466	TGA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
131	NC_012466	GAAA	2	8	5591	5598	75 %	0 %	25 %	0 %	225853617
132	NC_012466	GA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	50 %	0 %	225853617
133	NC_012466	AGA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
134	NC_012466	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
135	NC_012466	TGA	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
136	NC_012466	AGA	2	6	5918	5923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
137	NC_012466	A	6	6	5985	5990	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
138	NC_012466	TCAAT	2	10	6059	6068	40 %	40 %	0 %	20 %	225853617
139	NC_012466	TTTTC	2	10	6099	6108	0 %	80 %	0 %	20 %	225853617
140	NC_012466	AGA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
141	NC_012466	A	7	7	6132	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
142	NC_012466	ATT	2	6	6150	6155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
143	NC_012466	GGA	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
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150	NC_012466	TAAAT	2	10	6617	6626	60 %	40 %	0 %	0 %	225853617
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153	NC_012466	TGA	4	12	6743	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
154	NC_012466	TGA	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
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159	NC_012466	TGT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853617
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161	NC_012466	TGA	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
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172	NC_012466	TTA	2	6	7920	7925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
173	NC_012466	AAACG	2	10	7941	7950	60 %	0 %	20 %	20 %	225853617
174	NC_012466	GCTAAC	2	12	7956	7967	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225853617
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181	NC_012466	AAGA	2	8	8373	8380	75 %	0 %	25 %	0 %	225853617
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258	NC_012466	TTTA	2	8	11641	11648	25 %	75 %	0 %	0 %	225853622
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262	NC_012466	TA	3	6	11786	11791	50 %	50 %	0 %	0 %	225853622
263	NC_012466	A	6	6	11793	11798	100 %	0 %	0 %	0 %	225853622
264	NC_012466	A	6	6	11808	11813	100 %	0 %	0 %	0 %	225853622
265	NC_012466	A	6	6	11831	11836	100 %	0 %	0 %	0 %	225853623
266	NC_012466	AGC	2	6	11866	11871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853623
267	NC_012466	A	6	6	11873	11878	100 %	0 %	0 %	0 %	225853623
268	NC_012466	A	6	6	11911	11916	100 %	0 %	0 %	0 %	225853623
269	NC_012466	ATG	2	6	12005	12010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853623
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271	NC_012466	AGT	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853623
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392	NC_012466	TAA	2	6	17107	17112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_012466	GTTAA	2	10	17143	17152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_012466	TAG	2	6	17377	17382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_012466	AGA	2	6	17464	17469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
402	NC_012466	AG	3	6	17492	17497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
403	NC_012466	CGG	2	6	17548	17553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_012466	GGA	2	6	17580	17585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
405	NC_012466	GGGAG	2	10	17661	17670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
406	NC_012466	ACA	2	6	17698	17703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_012466	ATG	2	6	17765	17770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_012466	GGA	2	6	17898	17903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
409	NC_012466	TC	3	6	17984	17989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
410	NC_012466	ACC	2	6	18164	18169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_012466	AAT	2	6	18184	18189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_012466	AGC	2	6	18244	18249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_012466	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
414	NC_012466	TG	3	6	18373	18378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
415	NC_012466	GAG	2	6	18394	18399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
416	NC_012466	GA	3	6	18524	18529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
417	NC_012466	ACA	2	6	18550	18555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_012466	TAG	2	6	18707	18712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_012466	GA	3	6	18820	18825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012466	CT	3	6	18936	18941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
423	NC_012466	GAT	2	6	18954	18959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_012466	CGG	2	6	19045	19050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_012466	GA	3	6	19143	19148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
426	NC_012466	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
427	NC_012466	TAC	2	6	19315	19320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_012466	CCT	2	6	19403	19408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_012466	GGT	2	6	19539	19544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_012466	TCG	2	6	19654	19659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_012466	CGT	2	6	19734	19739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_012466	AGGGA	2	10	19872	19881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
433	NC_012466	TA	3	6	19938	19943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012466	GA	3	6	19958	19963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
435	NC_012466	GAAGTG	2	12	19983	19994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
436	NC_012466	ACTAAT	2	12	20013	20024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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438	NC_012466	GTA	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_012466	ATG	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_012466	T	6	6	20341	20346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_012466	TAA	3	9	20353	20361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_012466	TC	3	6	20454	20459	0 %	50 %	0 %	50 %	225853626
444	NC_012466	GTA	2	6	20477	20482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853626
445	NC_012466	ACC	2	6	20567	20572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853626
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450	NC_012466	TAA	2	6	20886	20891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012466	GAA	2	6	20907	20912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_012466	T	6	6	20999	21004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_012466	TTA	3	9	21054	21062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_012466	GAG	2	6	21110	21115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_012466	A	6	6	22373	22378	100 %	0 %	0 %	0 %	225853631
481	NC_012466	GAA	2	6	22414	22419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853631
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