MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_012466	CTT	2	6	2011255	2011260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855632
41003	NC_012466	TC	3	6	2011278	2011283	0 %	50 %	0 %	50 %	225855632
41004	NC_012466	TCA	2	6	2011308	2011313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855632
41005	NC_012466	TTTG	2	8	2011339	2011346	0 %	75 %	25 %	0 %	225855632
41006	NC_012466	TTC	2	6	2011385	2011390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855632
41007	NC_012466	GTTTTT	2	12	2011524	2011535	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	225855633
41008	NC_012466	TA	3	6	2011542	2011547	50 %	50 %	0 %	0 %	225855633
41009	NC_012466	T	6	6	2011562	2011567	0 %	100 %	0 %	0 %	225855633
41010	NC_012466	TTC	2	6	2011665	2011670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41011	NC_012466	CAAG	2	8	2011695	2011702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41012	NC_012466	AGCT	2	8	2011749	2011756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41013	NC_012466	GCT	2	6	2011761	2011766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41014	NC_012466	TCG	2	6	2011844	2011849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855634
41015	NC_012466	TGC	2	6	2011887	2011892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855634
41016	NC_012466	TCG	2	6	2011945	2011950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855634
41017	NC_012466	GCCA	2	8	2011965	2011972	25 %	0 %	25 %	50 %	225855634
41018	NC_012466	CCAAA	2	10	2012045	2012054	60 %	0 %	0 %	40 %	225855634
41019	NC_012466	TTTC	2	8	2012063	2012070	0 %	75 %	0 %	25 %	225855634
41020	NC_012466	TGT	2	6	2012146	2012151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855634
41021	NC_012466	CTTT	2	8	2012155	2012162	0 %	75 %	0 %	25 %	225855634
41022	NC_012466	ATC	2	6	2012163	2012168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855634
41023	NC_012466	CGT	2	6	2012191	2012196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855634
41024	NC_012466	CAG	2	6	2012297	2012302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855634
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41026	NC_012466	CTT	2	6	2012609	2012614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855634
41027	NC_012466	TTA	2	6	2012638	2012643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855634
41028	NC_012466	TGA	2	6	2012740	2012745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855634
41029	NC_012466	ATA	2	6	2012784	2012789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855634
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41033	NC_012466	ATCA	2	8	2013102	2013109	50 %	25 %	0 %	25 %	225855634
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41042	NC_012466	TCC	2	6	2013717	2013722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855635
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41051	NC_012466	CAT	2	6	2014273	2014278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855635
41052	NC_012466	ATCA	2	8	2014361	2014368	50 %	25 %	0 %	25 %	225855635
41053	NC_012466	TTGA	2	8	2014379	2014386	25 %	50 %	25 %	0 %	225855635
41054	NC_012466	TCC	2	6	2014461	2014466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855635
41055	NC_012466	CAG	2	6	2014600	2014605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41056	NC_012466	CTTT	2	8	2014630	2014637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41057	NC_012466	AAATT	2	10	2014654	2014663	60 %	40 %	0 %	0 %	225855636
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41060	NC_012466	TGAA	2	8	2014714	2014721	50 %	25 %	25 %	0 %	225855636
41061	NC_012466	AAGT	2	8	2014738	2014745	50 %	25 %	25 %	0 %	225855636
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41092	NC_012466	GCAC	2	8	2016650	2016657	25 %	0 %	25 %	50 %	225855636
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41100	NC_012466	CCA	2	6	2017212	2017217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855636
41101	NC_012466	ATA	2	6	2017277	2017282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855636
41102	NC_012466	ACA	3	9	2017286	2017294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855636
41103	NC_012466	TAAATT	2	12	2017320	2017331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41104	NC_012466	CAT	2	6	2017432	2017437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855637
41105	NC_012466	ATC	2	6	2017477	2017482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855637
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41107	NC_012466	T	6	6	2017549	2017554	0 %	100 %	0 %	0 %	225855637
41108	NC_012466	TTG	2	6	2017569	2017574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855637
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41115	NC_012466	CTT	2	6	2017869	2017874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855637
41116	NC_012466	TGC	2	6	2017936	2017941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855637
41117	NC_012466	ACT	2	6	2017967	2017972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855637
41118	NC_012466	TCA	2	6	2018018	2018023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855637
41119	NC_012466	CAT	2	6	2018079	2018084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855637
41120	NC_012466	TCA	2	6	2018201	2018206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855637
41121	NC_012466	TTTC	2	8	2018226	2018233	0 %	75 %	0 %	25 %	225855637
41122	NC_012466	GGTC	2	8	2018319	2018326	0 %	25 %	50 %	25 %	225855637
41123	NC_012466	GTG	2	6	2018329	2018334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855637
41124	NC_012466	AGG	2	6	2018432	2018437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855637
41125	NC_012466	TCT	2	6	2018537	2018542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855637
41126	NC_012466	TTTC	2	8	2018655	2018662	0 %	75 %	0 %	25 %	225855637
41127	NC_012466	ATC	2	6	2018669	2018674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855637
41128	NC_012466	TA	3	6	2018711	2018716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41129	NC_012466	ATAC	2	8	2018733	2018740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41130	NC_012466	ACT	2	6	2018852	2018857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855638
41131	NC_012466	AGCA	2	8	2018889	2018896	50 %	0 %	25 %	25 %	225855638
41132	NC_012466	GGAT	2	8	2018978	2018985	25 %	25 %	50 %	0 %	225855638
41133	NC_012466	T	6	6	2018991	2018996	0 %	100 %	0 %	0 %	225855638
41134	NC_012466	ACT	2	6	2019061	2019066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855638
41135	NC_012466	G	6	6	2019101	2019106	0 %	0 %	100 %	0 %	225855638
41136	NC_012466	TCT	2	6	2019129	2019134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855638
41137	NC_012466	GCTT	2	8	2019150	2019157	0 %	50 %	25 %	25 %	225855638
41138	NC_012466	CCCTCT	2	12	2019265	2019276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855638
41139	NC_012466	GCA	2	6	2019285	2019290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855638
41140	NC_012466	AAG	2	6	2019340	2019345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855638
41141	NC_012466	AAG	2	6	2019424	2019429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855638
41142	NC_012466	AGTA	2	8	2019452	2019459	50 %	25 %	25 %	0 %	225855638
41143	NC_012466	CTT	2	6	2019484	2019489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855638
41144	NC_012466	TC	3	6	2019493	2019498	0 %	50 %	0 %	50 %	225855638
41145	NC_012466	AATC	2	8	2019512	2019519	50 %	25 %	0 %	25 %	225855638
41146	NC_012466	AAG	2	6	2019526	2019531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855638
41147	NC_012466	TCC	2	6	2019577	2019582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855638
41148	NC_012466	CTT	2	6	2019623	2019628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855638
41149	NC_012466	CTCTTC	2	12	2019648	2019659	0 %	50 %	0 %	50 %	225855638
41150	NC_012466	TGA	2	6	2019680	2019685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855638
41151	NC_012466	CAA	2	6	2019749	2019754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855638
41152	NC_012466	CAC	2	6	2019776	2019781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855638
41153	NC_012466	TTCC	2	8	2019864	2019871	0 %	50 %	0 %	50 %	225855638
41154	NC_012466	TGGC	2	8	2019876	2019883	0 %	25 %	50 %	25 %	225855638
41155	NC_012466	ATG	2	6	2019900	2019905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855638
41156	NC_012466	TAT	2	6	2019926	2019931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855638
41157	NC_012466	CAGC	2	8	2020000	2020007	25 %	0 %	25 %	50 %	225855638
41158	NC_012466	GCC	2	6	2020033	2020038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225855638
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41163	NC_012466	TC	3	6	2020276	2020281	0 %	50 %	0 %	50 %	225855638
41164	NC_012466	ACA	2	6	2020437	2020442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855638
41165	NC_012466	CTT	2	6	2020575	2020580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855638
41166	NC_012466	TC	3	6	2020652	2020657	0 %	50 %	0 %	50 %	225855638
41167	NC_012466	CT	3	6	2020732	2020737	0 %	50 %	0 %	50 %	225855638
41168	NC_012466	AGA	2	6	2020766	2020771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855638
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41170	NC_012466	TAA	2	6	2020926	2020931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855638
41171	NC_012466	TTC	2	6	2020960	2020965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41172	NC_012466	T	6	6	2021078	2021083	0 %	100 %	0 %	0 %	225855639
41173	NC_012466	T	6	6	2021246	2021251	0 %	100 %	0 %	0 %	225855639
41174	NC_012466	AAC	2	6	2021271	2021276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855639
41175	NC_012466	T	7	7	2021280	2021286	0 %	100 %	0 %	0 %	225855639
41176	NC_012466	ATC	2	6	2021350	2021355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855639
41177	NC_012466	CTA	2	6	2021375	2021380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855639
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41181	NC_012466	CGG	2	6	2021754	2021759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225855639
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41184	NC_012466	GATCCT	2	12	2021834	2021845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225855639
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41186	NC_012466	A	6	6	2022041	2022046	100 %	0 %	0 %	0 %	225855639
41187	NC_012466	CTG	2	6	2022108	2022113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855639
41188	NC_012466	CCAT	2	8	2022133	2022140	25 %	25 %	0 %	50 %	225855639
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41190	NC_012466	CATATC	2	12	2022288	2022299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855639
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41192	NC_012466	AAT	2	6	2022374	2022379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855639
41193	NC_012466	TG	3	6	2022381	2022386	0 %	50 %	50 %	0 %	225855639
41194	NC_012466	GTG	2	6	2022414	2022419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855639
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41198	NC_012466	AGCT	2	8	2022597	2022604	25 %	25 %	25 %	25 %	225855639
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41200	NC_012466	TA	3	6	2022651	2022656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41201	NC_012466	CTT	2	6	2022661	2022666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41202	NC_012466	ATA	2	6	2022708	2022713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41203	NC_012466	CAGC	2	8	2022727	2022734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41204	NC_012466	TCCAAC	2	12	2022739	2022750	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41205	NC_012466	ATT	2	6	2022844	2022849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41206	NC_012466	CTT	2	6	2022856	2022861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41207	NC_012466	TG	3	6	2022871	2022876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41208	NC_012466	ATT	2	6	2022922	2022927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41209	NC_012466	TCG	2	6	2022941	2022946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41210	NC_012466	A	6	6	2022955	2022960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41211	NC_012466	ATCT	2	8	2023053	2023060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41212	NC_012466	CA	3	6	2023091	2023096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41213	NC_012466	GAT	2	6	2023132	2023137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41214	NC_012466	T	6	6	2023166	2023171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41215	NC_012466	T	6	6	2023178	2023183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41216	NC_012466	A	7	7	2023184	2023190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41217	NC_012466	TA	3	6	2023226	2023231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41218	NC_012466	TGT	2	6	2023246	2023251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41219	NC_012466	TAA	2	6	2023255	2023260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41220	NC_012466	TAT	2	6	2023290	2023295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41221	NC_012466	ACAT	2	8	2023343	2023350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41222	NC_012466	AGG	2	6	2023390	2023395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41223	NC_012466	TCT	2	6	2023425	2023430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855640
41224	NC_012466	A	6	6	2023448	2023453	100 %	0 %	0 %	0 %	225855640
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41226	NC_012466	CTT	2	6	2023514	2023519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855640
41227	NC_012466	TGA	2	6	2023522	2023527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855640
41228	NC_012466	ATG	2	6	2023560	2023565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855640
41229	NC_012466	AAC	2	6	2023614	2023619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855640
41230	NC_012466	GCT	2	6	2023622	2023627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855640
41231	NC_012466	A	6	6	2023764	2023769	100 %	0 %	0 %	0 %	225855640
41232	NC_012466	CAA	2	6	2023905	2023910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855640
41233	NC_012466	ACC	2	6	2023992	2023997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855640
41234	NC_012466	GAA	2	6	2024036	2024041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855640
41235	NC_012466	TTCT	2	8	2024073	2024080	0 %	75 %	0 %	25 %	225855640
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41475	NC_012466	TTA	2	6	2036129	2036134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855652
41476	NC_012466	AGC	2	6	2036149	2036154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855652
41477	NC_012466	ACT	2	6	2036204	2036209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855652
41478	NC_012466	TCT	2	6	2036213	2036218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855652
41479	NC_012466	CACTC	2	10	2036296	2036305	20 %	20 %	0 %	60 %	225855652
41480	NC_012466	ATT	2	6	2036377	2036382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855652
41481	NC_012466	TAT	2	6	2036409	2036414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855652
41482	NC_012466	TAGA	2	8	2036439	2036446	50 %	25 %	25 %	0 %	225855652
41483	NC_012466	T	7	7	2036502	2036508	0 %	100 %	0 %	0 %	225855652
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41485	NC_012466	GT	4	8	2036546	2036553	0 %	50 %	50 %	0 %	225855652
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41490	NC_012466	GTT	2	6	2036873	2036878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855652
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