MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37238	NC_012466	TCAA	2	8	1826764	1826771	50 %	25 %	0 %	25 %	225855452
37239	NC_012466	CTT	2	6	1826783	1826788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855452
37240	NC_012466	GAT	2	6	1826814	1826819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855452
37241	NC_012466	GTT	2	6	1826856	1826861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855452
37242	NC_012466	CGG	2	6	1826875	1826880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225855452
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37244	NC_012466	TGG	2	6	1826946	1826951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855452
37245	NC_012466	ATC	2	6	1826974	1826979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855452
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37249	NC_012466	CAA	2	6	1827152	1827157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855452
37250	NC_012466	AACCAT	2	12	1827161	1827172	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225855452
37251	NC_012466	GTG	2	6	1827227	1827232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855452
37252	NC_012466	ATCA	2	8	1827243	1827250	50 %	25 %	0 %	25 %	225855452
37253	NC_012466	ACG	2	6	1827390	1827395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855452
37254	NC_012466	TCA	2	6	1827511	1827516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855452
37255	NC_012466	ATTG	2	8	1827552	1827559	25 %	50 %	25 %	0 %	225855452
37256	NC_012466	T	6	6	1827567	1827572	0 %	100 %	0 %	0 %	225855452
37257	NC_012466	TTC	2	6	1827660	1827665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37258	NC_012466	TTCTA	2	10	1827669	1827678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37259	NC_012466	CAG	2	6	1827700	1827705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855453
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37264	NC_012466	GCT	2	6	1827777	1827782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855453
37265	NC_012466	CTT	2	6	1827859	1827864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855453
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37269	NC_012466	ATC	2	6	1828175	1828180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855453
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37324	NC_012466	A	7	7	1831444	1831450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37326	NC_012466	AGA	2	6	1831483	1831488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37327	NC_012466	CTG	2	6	1831494	1831499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37328	NC_012466	TAG	2	6	1831590	1831595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37330	NC_012466	A	6	6	1831657	1831662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37331	NC_012466	A	6	6	1831666	1831671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37332	NC_012466	TAA	3	9	1831700	1831708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37333	NC_012466	TCG	2	6	1831760	1831765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37334	NC_012466	T	7	7	1831841	1831847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37335	NC_012466	AATA	2	8	1831859	1831866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37336	NC_012466	A	6	6	1831945	1831950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37337	NC_012466	TCT	3	9	1831994	1832002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855454
37338	NC_012466	TTC	2	6	1832048	1832053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855454
37339	NC_012466	TGTT	2	8	1832078	1832085	0 %	75 %	25 %	0 %	225855454
37340	NC_012466	ATA	2	6	1832146	1832151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855454
37341	NC_012466	TCA	2	6	1832171	1832176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855454
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37343	NC_012466	TGA	2	6	1832258	1832263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855454
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37345	NC_012466	TCA	3	9	1832288	1832296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855454
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37347	NC_012466	ACC	2	6	1832350	1832355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855454
37348	NC_012466	GCCT	2	8	1832497	1832504	0 %	25 %	25 %	50 %	225855454
37349	NC_012466	CAT	2	6	1832553	1832558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855454
37350	NC_012466	AAT	2	6	1832574	1832579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855454
37351	NC_012466	ATC	2	6	1832614	1832619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855454
37352	NC_012466	CCA	2	6	1832628	1832633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855454
37353	NC_012466	ATCTCA	2	12	1832705	1832716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855454
37354	NC_012466	TTC	2	6	1832731	1832736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855454
37355	NC_012466	TCA	2	6	1832762	1832767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855454
37356	NC_012466	CAT	2	6	1832787	1832792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855454
37357	NC_012466	AGC	2	6	1832833	1832838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855454
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37359	NC_012466	GACT	2	8	1832856	1832863	25 %	25 %	25 %	25 %	225855454
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37366	NC_012466	TTC	2	6	1833318	1833323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37367	NC_012466	TAT	2	6	1833347	1833352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37368	NC_012466	ATT	2	6	1833377	1833382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37369	NC_012466	T	6	6	1833381	1833386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37370	NC_012466	TC	4	8	1833416	1833423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37371	NC_012466	AGTT	2	8	1833435	1833442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37372	NC_012466	T	6	6	1833456	1833461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37373	NC_012466	AGTTAC	2	12	1833550	1833561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225855455
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37462	NC_012466	CTT	2	6	1838315	1838320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855462
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37469	NC_012466	TCA	2	6	1838620	1838625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855462
37470	NC_012466	TTC	2	6	1838763	1838768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855462
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37473	NC_012466	AGTG	2	8	1839061	1839068	25 %	25 %	50 %	0 %	225855462
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37475	NC_012466	TCT	2	6	1839247	1839252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855462
37476	NC_012466	TTC	2	6	1839271	1839276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855462
37477	NC_012466	CTC	2	6	1839285	1839290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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37481	NC_012466	A	8	8	1839347	1839354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37482	NC_012466	AGAT	2	8	1839445	1839452	50 %	25 %	25 %	0 %	225855463
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37497	NC_012466	GTT	2	6	1840328	1840333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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