MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35619	NC_012466	AGT	2	6	1750535	1750540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855356
35620	NC_012466	AT	3	6	1750555	1750560	50 %	50 %	0 %	0 %	225855356
35621	NC_012466	T	6	6	1750633	1750638	0 %	100 %	0 %	0 %	225855356
35622	NC_012466	GTT	2	6	1750785	1750790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855356
35623	NC_012466	TCC	2	6	1750887	1750892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855356
35624	NC_012466	TTC	2	6	1750911	1750916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855356
35625	NC_012466	GTCT	2	8	1751055	1751062	0 %	50 %	25 %	25 %	225855356
35626	NC_012466	CAG	2	6	1751093	1751098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35627	NC_012466	TCAG	2	8	1751140	1751147	25 %	25 %	25 %	25 %	225855356
35628	NC_012466	CTT	2	6	1751234	1751239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855356
35629	NC_012466	ACA	2	6	1751318	1751323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855356
35630	NC_012466	AAT	2	6	1751427	1751432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855356
35631	NC_012466	GTTTTT	2	12	1751433	1751444	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	225855356
35632	NC_012466	TGCAA	2	10	1751452	1751461	40 %	20 %	20 %	20 %	225855356
35633	NC_012466	AAG	2	6	1751502	1751507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855356
35634	NC_012466	A	7	7	1751565	1751571	100 %	0 %	0 %	0 %	225855356
35635	NC_012466	ATT	2	6	1751622	1751627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855356
35636	NC_012466	AG	3	6	1751766	1751771	50 %	0 %	50 %	0 %	225855356
35637	NC_012466	CTC	2	6	1751772	1751777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855356
35638	NC_012466	GTCT	2	8	1751904	1751911	0 %	50 %	25 %	25 %	225855356
35639	NC_012466	CAG	2	6	1751942	1751947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35640	NC_012466	TGAG	2	8	1751954	1751961	25 %	25 %	50 %	0 %	225855356
35641	NC_012466	TCAG	2	8	1751989	1751996	25 %	25 %	25 %	25 %	225855356
35642	NC_012466	GCT	2	6	1752029	1752034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35643	NC_012466	ACT	2	6	1752049	1752054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855356
35644	NC_012466	TCT	2	6	1752064	1752069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855356
35645	NC_012466	AAT	2	6	1752101	1752106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855356
35646	NC_012466	GAC	2	6	1752135	1752140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35647	NC_012466	CAG	2	6	1752149	1752154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35648	NC_012466	ATT	2	6	1752189	1752194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855356
35649	NC_012466	AGA	2	6	1752210	1752215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855356
35650	NC_012466	TTC	2	6	1752403	1752408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855356
35651	NC_012466	CCT	2	6	1752454	1752459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855356
35652	NC_012466	CCTG	2	8	1752508	1752515	0 %	25 %	25 %	50 %	225855356
35653	NC_012466	CTC	2	6	1752540	1752545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855356
35654	NC_012466	GTC	3	9	1752616	1752624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35655	NC_012466	GCCA	2	8	1752654	1752661	25 %	0 %	25 %	50 %	225855356
35656	NC_012466	CTTG	2	8	1752692	1752699	0 %	50 %	25 %	25 %	225855356
35657	NC_012466	TGCT	2	8	1752720	1752727	0 %	50 %	25 %	25 %	225855356
35658	NC_012466	GCCA	2	8	1752882	1752889	25 %	0 %	25 %	50 %	225855356
35659	NC_012466	CTTG	2	8	1752920	1752927	0 %	50 %	25 %	25 %	225855356
35660	NC_012466	TGCT	2	8	1752948	1752955	0 %	50 %	25 %	25 %	225855356
35661	NC_012466	TTTC	2	8	1753148	1753155	0 %	75 %	0 %	25 %	225855356
35662	NC_012466	TGAT	2	8	1753186	1753193	25 %	50 %	25 %	0 %	225855356
35663	NC_012466	TC	3	6	1753207	1753212	0 %	50 %	0 %	50 %	225855356
35664	NC_012466	CTT	2	6	1753217	1753222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855356
35665	NC_012466	T	6	6	1753263	1753268	0 %	100 %	0 %	0 %	225855356
35666	NC_012466	CTG	2	6	1753301	1753306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35667	NC_012466	TTG	2	6	1753344	1753349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855356
35668	NC_012466	ACC	2	6	1753434	1753439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855356
35669	NC_012466	ACCG	2	8	1753656	1753663	25 %	0 %	25 %	50 %	225855356
35670	NC_012466	CTT	2	6	1753671	1753676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855356
35671	NC_012466	AAG	2	6	1753738	1753743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855356
35672	NC_012466	GAA	2	6	1753812	1753817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855356
35673	NC_012466	ATC	2	6	1753831	1753836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855356
35674	NC_012466	TGA	2	6	1754093	1754098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855356
35675	NC_012466	GGTA	2	8	1754123	1754130	25 %	25 %	50 %	0 %	225855356
35676	NC_012466	CCA	2	6	1754230	1754235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855356
35677	NC_012466	TCCTT	2	10	1754327	1754336	0 %	60 %	0 %	40 %	225855356
35678	NC_012466	GTC	2	6	1754360	1754365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855356
35679	NC_012466	CT	3	6	1754390	1754395	0 %	50 %	0 %	50 %	225855357
35680	NC_012466	CCAT	2	8	1754495	1754502	25 %	25 %	0 %	50 %	225855357
35681	NC_012466	A	6	6	1754524	1754529	100 %	0 %	0 %	0 %	225855357
35682	NC_012466	GAT	2	6	1754534	1754539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855357
35683	NC_012466	TCA	2	6	1754574	1754579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855357
35684	NC_012466	TC	3	6	1754655	1754660	0 %	50 %	0 %	50 %	225855357
35685	NC_012466	ATTG	2	8	1754716	1754723	25 %	50 %	25 %	0 %	225855357
35686	NC_012466	CCT	2	6	1754741	1754746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35687	NC_012466	GTCGCC	2	12	1754844	1754855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	225855358
35688	NC_012466	TAC	2	6	1754895	1754900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855358
35689	NC_012466	CTG	2	6	1754905	1754910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35690	NC_012466	ACT	2	6	1754911	1754916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855358
35691	NC_012466	TTG	2	6	1754993	1754998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855358
35692	NC_012466	CGA	2	6	1755005	1755010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35693	NC_012466	ACC	2	6	1755012	1755017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855358
35694	NC_012466	GAGG	2	8	1755029	1755036	25 %	0 %	75 %	0 %	225855358
35695	NC_012466	AAG	2	6	1755250	1755255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855358
35696	NC_012466	AT	3	6	1755305	1755310	50 %	50 %	0 %	0 %	225855358
35697	NC_012466	TC	3	6	1755360	1755365	0 %	50 %	0 %	50 %	225855358
35698	NC_012466	TGTT	2	8	1755395	1755402	0 %	75 %	25 %	0 %	225855358
35699	NC_012466	TGCT	2	8	1755600	1755607	0 %	50 %	25 %	25 %	225855358
35700	NC_012466	CAA	2	6	1755749	1755754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855358
35701	NC_012466	TGC	2	6	1755807	1755812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35702	NC_012466	AAT	2	6	1755813	1755818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855358
35703	NC_012466	CTG	2	6	1755887	1755892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35704	NC_012466	CCG	2	6	1755911	1755916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225855358
35705	NC_012466	CAA	2	6	1756130	1756135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855358
35706	NC_012466	TAC	2	6	1756148	1756153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855358
35707	NC_012466	TCC	2	6	1756179	1756184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855358
35708	NC_012466	GTT	2	6	1756225	1756230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855358
35709	NC_012466	A	6	6	1756274	1756279	100 %	0 %	0 %	0 %	225855358
35710	NC_012466	CCT	2	6	1756345	1756350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855358
35711	NC_012466	AAT	2	6	1756440	1756445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855358
35712	NC_012466	TCA	2	6	1756501	1756506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855358
35713	NC_012466	TAA	2	6	1756581	1756586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855358
35714	NC_012466	TGA	2	6	1756599	1756604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855358
35715	NC_012466	AAAC	2	8	1756647	1756654	75 %	0 %	0 %	25 %	225855358
35716	NC_012466	TAC	2	6	1756667	1756672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855358
35717	NC_012466	CAA	2	6	1756679	1756684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855358
35718	NC_012466	CGT	2	6	1756757	1756762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35719	NC_012466	CAAA	2	8	1756826	1756833	75 %	0 %	0 %	25 %	225855358
35720	NC_012466	TGC	2	6	1757082	1757087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35721	NC_012466	AAC	2	6	1757113	1757118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855358
35722	NC_012466	TGT	2	6	1757162	1757167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855358
35723	NC_012466	ACC	2	6	1757235	1757240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855358
35724	NC_012466	CGT	2	6	1757267	1757272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35725	NC_012466	TCA	2	6	1757302	1757307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855358
35726	NC_012466	CTT	2	6	1757340	1757345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855358
35727	NC_012466	TCC	2	6	1757382	1757387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855358
35728	NC_012466	CGT	2	6	1757402	1757407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35729	NC_012466	CCA	2	6	1757479	1757484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855358
35730	NC_012466	TTG	2	6	1757509	1757514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855358
35731	NC_012466	TTC	2	6	1757554	1757559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855358
35732	NC_012466	TGC	2	6	1757634	1757639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855358
35733	NC_012466	TCA	2	6	1757645	1757650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855358
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