MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_012466	ATA	2	6	1513529	1513534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855124
31003	NC_012466	ACA	2	6	1513613	1513618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855124
31004	NC_012466	GAA	2	6	1513722	1513727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855124
31005	NC_012466	TCCT	2	8	1513747	1513754	0 %	50 %	0 %	50 %	225855124
31006	NC_012466	CTTC	2	8	1513757	1513764	0 %	50 %	0 %	50 %	225855124
31007	NC_012466	ACTTG	2	10	1513782	1513791	20 %	40 %	20 %	20 %	225855124
31008	NC_012466	TCC	2	6	1513811	1513816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855124
31009	NC_012466	TCT	2	6	1513916	1513921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855124
31010	NC_012466	AAGA	2	8	1514003	1514010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_012466	GAT	2	6	1514050	1514055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_012466	AGT	2	6	1514064	1514069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31013	NC_012466	A	6	6	1514080	1514085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_012466	CT	4	8	1514096	1514103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31015	NC_012466	T	6	6	1514118	1514123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_012466	CTTC	2	8	1514125	1514132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31017	NC_012466	TGA	2	6	1514198	1514203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_012466	TTCT	2	8	1514270	1514277	0 %	75 %	0 %	25 %	225855125
31019	NC_012466	TCT	2	6	1514313	1514318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855125
31020	NC_012466	TAGC	2	8	1514343	1514350	25 %	25 %	25 %	25 %	225855125
31021	NC_012466	CTT	2	6	1514362	1514367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855125
31022	NC_012466	ATA	2	6	1514388	1514393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855125
31023	NC_012466	TCC	2	6	1514469	1514474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855125
31024	NC_012466	C	6	6	1514575	1514580	0 %	0 %	0 %	100 %	225855125
31025	NC_012466	CGT	2	6	1514687	1514692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855125
31026	NC_012466	TC	3	6	1514714	1514719	0 %	50 %	0 %	50 %	225855125
31027	NC_012466	AGA	2	6	1514772	1514777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855125
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31029	NC_012466	GTC	2	6	1514805	1514810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855125
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31032	NC_012466	GA	3	6	1514872	1514877	50 %	0 %	50 %	0 %	225855125
31033	NC_012466	CTG	2	6	1514980	1514985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855125
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31039	NC_012466	AG	3	6	1515277	1515282	50 %	0 %	50 %	0 %	225855125
31040	NC_012466	CTG	2	6	1515373	1515378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855125
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31042	NC_012466	ACTT	2	8	1515530	1515537	25 %	50 %	0 %	25 %	225855125
31043	NC_012466	CTG	2	6	1515541	1515546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855125
31044	NC_012466	TCT	2	6	1515768	1515773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855125
31045	NC_012466	TGA	2	6	1515808	1515813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855125
31046	NC_012466	CTGA	2	8	1515830	1515837	25 %	25 %	25 %	25 %	225855125
31047	NC_012466	TCT	2	6	1515873	1515878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855125
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31049	NC_012466	AGAA	2	8	1516094	1516101	75 %	0 %	25 %	0 %	225855125
31050	NC_012466	TCCAGC	2	12	1516119	1516130	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225855125
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31052	NC_012466	CTG	2	6	1516219	1516224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855125
31053	NC_012466	CTTT	2	8	1516283	1516290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31054	NC_012466	TAA	2	6	1516293	1516298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855126
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31056	NC_012466	GAG	2	6	1516322	1516327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855126
31057	NC_012466	ACC	2	6	1516332	1516337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855126
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31060	NC_012466	TCA	2	6	1516884	1516889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855126
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31063	NC_012466	AATC	2	8	1517002	1517009	50 %	25 %	0 %	25 %	225855126
31064	NC_012466	TCCAG	2	10	1517070	1517079	20 %	20 %	20 %	40 %	225855126
31065	NC_012466	CAT	2	6	1517221	1517226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855126
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31068	NC_012466	TCC	2	6	1517401	1517406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855127
31069	NC_012466	CCT	2	6	1517573	1517578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855127
31070	NC_012466	TTC	2	6	1517715	1517720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855127
31071	NC_012466	TCA	2	6	1517750	1517755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31072	NC_012466	TCT	2	6	1517817	1517822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855128
31073	NC_012466	TGGT	2	8	1517885	1517892	0 %	50 %	50 %	0 %	225855128
31074	NC_012466	GAC	2	6	1517896	1517901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855128
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31076	NC_012466	TGGT	2	8	1518030	1518037	0 %	50 %	50 %	0 %	225855128
31077	NC_012466	TAG	2	6	1518108	1518113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855128
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31083	NC_012466	CTGG	2	8	1518508	1518515	0 %	25 %	50 %	25 %	225855128
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31091	NC_012466	ATA	2	6	1519140	1519145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855129
31092	NC_012466	T	6	6	1519159	1519164	0 %	100 %	0 %	0 %	225855129
31093	NC_012466	CAC	2	6	1519181	1519186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855129
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31118	NC_012466	TGA	2	6	1520596	1520601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855130
31119	NC_012466	GTT	2	6	1520632	1520637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855130
31120	NC_012466	CAT	2	6	1520647	1520652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855130
31121	NC_012466	GCT	2	6	1520709	1520714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855130
31122	NC_012466	TCA	2	6	1520809	1520814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855130
31123	NC_012466	ATC	2	6	1520816	1520821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855130
31124	NC_012466	GAC	2	6	1520863	1520868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855130
31125	NC_012466	ACG	2	6	1520897	1520902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855130
31126	NC_012466	TCC	2	6	1520936	1520941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855130
31127	NC_012466	GTTG	2	8	1520993	1521000	0 %	50 %	50 %	0 %	225855130
31128	NC_012466	CAC	2	6	1521013	1521018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855130
31129	NC_012466	ATG	2	6	1521033	1521038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855130
31130	NC_012466	ACCA	2	8	1521143	1521150	50 %	0 %	0 %	50 %	225855130
31131	NC_012466	AAG	2	6	1521227	1521232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855130
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31133	NC_012466	TGT	2	6	1521289	1521294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855130
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31137	NC_012466	ACG	2	6	1521464	1521469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855130
31138	NC_012466	CAC	2	6	1521527	1521532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855130
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31142	NC_012466	TCAA	2	8	1521807	1521814	50 %	25 %	0 %	25 %	225855130
31143	NC_012466	TGT	2	6	1521886	1521891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855130
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31146	NC_012466	CTT	2	6	1521952	1521957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855130
31147	NC_012466	T	6	6	1521956	1521961	0 %	100 %	0 %	0 %	225855130
31148	NC_012466	CCAAG	2	10	1522005	1522014	40 %	0 %	20 %	40 %	225855130
31149	NC_012466	TTCCC	2	10	1522134	1522143	0 %	40 %	0 %	60 %	225855130
31150	NC_012466	GAA	2	6	1522174	1522179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855130
31151	NC_012466	C	7	7	1522184	1522190	0 %	0 %	0 %	100 %	225855130
31152	NC_012466	GTC	2	6	1522334	1522339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855130
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31154	NC_012466	GAC	2	6	1522396	1522401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855130
31155	NC_012466	ATT	2	6	1522514	1522519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31156	NC_012466	GAA	2	6	1522526	1522531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31157	NC_012466	ATAA	2	8	1522630	1522637	75 %	25 %	0 %	0 %	225855131
31158	NC_012466	GACT	2	8	1522682	1522689	25 %	25 %	25 %	25 %	225855131
31159	NC_012466	ATG	2	6	1522750	1522755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855131
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31162	NC_012466	TAA	2	6	1522859	1522864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855131
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31164	NC_012466	T	6	6	1523132	1523137	0 %	100 %	0 %	0 %	225855132
31165	NC_012466	T	6	6	1523219	1523224	0 %	100 %	0 %	0 %	225855132
31166	NC_012466	TC	3	6	1523266	1523271	0 %	50 %	0 %	50 %	225855132
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31173	NC_012466	A	6	6	1523676	1523681	100 %	0 %	0 %	0 %	225855133
31174	NC_012466	AGT	2	6	1523725	1523730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855133
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31180	NC_012466	AG	3	6	1523949	1523954	50 %	0 %	50 %	0 %	225855133
31181	NC_012466	A	6	6	1524032	1524037	100 %	0 %	0 %	0 %	225855133
31182	NC_012466	TC	3	6	1524049	1524054	0 %	50 %	0 %	50 %	225855133
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31189	NC_012466	A	6	6	1524410	1524415	100 %	0 %	0 %	0 %	225855134
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31194	NC_012466	CTTT	2	8	1524634	1524641	0 %	75 %	0 %	25 %	225855134
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31198	NC_012466	TGAT	2	8	1524748	1524755	25 %	50 %	25 %	0 %	225855134
31199	NC_012466	TAA	2	6	1524802	1524807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855134
31200	NC_012466	A	6	6	1524862	1524867	100 %	0 %	0 %	0 %	225855134
31201	NC_012466	TCA	2	6	1524876	1524881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855134
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31209	NC_012466	AGT	2	6	1525321	1525326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855135
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31212	NC_012466	T	6	6	1525405	1525410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31213	NC_012466	AAG	2	6	1525415	1525420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31214	NC_012466	TCC	2	6	1525482	1525487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31216	NC_012466	TA	4	8	1525497	1525504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31217	NC_012466	TTC	2	6	1525594	1525599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31218	NC_012466	T	6	6	1525605	1525610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31219	NC_012466	CCT	2	6	1525629	1525634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31220	NC_012466	ATA	3	9	1525642	1525650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31221	NC_012466	T	6	6	1525666	1525671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31222	NC_012466	AGG	2	6	1525701	1525706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31223	NC_012466	CAA	2	6	1525770	1525775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855136
31224	NC_012466	ATGT	2	8	1525777	1525784	25 %	50 %	25 %	0 %	225855136
31225	NC_012466	AAC	2	6	1525802	1525807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855136
31226	NC_012466	TCT	2	6	1525862	1525867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855136
31227	NC_012466	TA	3	6	1525902	1525907	50 %	50 %	0 %	0 %	225855136
31228	NC_012466	ATT	2	6	1525941	1525946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855136
31229	NC_012466	AG	3	6	1525949	1525954	50 %	0 %	50 %	0 %	225855136
31230	NC_012466	AAC	2	6	1526106	1526111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855136
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31232	NC_012466	TTTC	2	8	1526210	1526217	0 %	75 %	0 %	25 %	225855136
31233	NC_012466	CTT	2	6	1526235	1526240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855136
31234	NC_012466	ATC	2	6	1526303	1526308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855136
31235	NC_012466	T	6	6	1526309	1526314	0 %	100 %	0 %	0 %	225855136
31236	NC_012466	TC	3	6	1526321	1526326	0 %	50 %	0 %	50 %	225855136
31237	NC_012466	CAT	2	6	1526343	1526348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855136
31238	NC_012466	AGA	2	6	1526396	1526401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855136
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31240	NC_012466	TAC	2	6	1526449	1526454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855136
31241	NC_012466	TGAT	2	8	1526470	1526477	25 %	50 %	25 %	0 %	225855136
31242	NC_012466	TTA	2	6	1526490	1526495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855136
31243	NC_012466	AGA	2	6	1526507	1526512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855136
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31245	NC_012466	TCA	2	6	1526578	1526583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31246	NC_012466	TAT	2	6	1526587	1526592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31247	NC_012466	TTGTA	2	10	1526673	1526682	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31248	NC_012466	TC	3	6	1526720	1526725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31249	NC_012466	T	6	6	1526792	1526797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31250	NC_012466	CCTT	2	8	1526808	1526815	0 %	50 %	0 %	50 %	225855137
31251	NC_012466	T	7	7	1526861	1526867	0 %	100 %	0 %	0 %	225855137
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31260	NC_012466	T	6	6	1527158	1527163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31261	NC_012466	TTA	2	6	1527197	1527202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31262	NC_012466	TAA	2	6	1527228	1527233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31263	NC_012466	CCT	2	6	1527259	1527264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31271	NC_012466	TAT	2	6	1527655	1527660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31272	NC_012466	TAT	2	6	1527663	1527668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31273	NC_012466	A	7	7	1527672	1527678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31274	NC_012466	T	6	6	1527705	1527710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31350	NC_012466	ATCC	2	8	1531612	1531619	25 %	25 %	0 %	50 %	225855142
31351	NC_012466	GAT	2	6	1531629	1531634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855142
31352	NC_012466	A	6	6	1531647	1531652	100 %	0 %	0 %	0 %	225855142
31353	NC_012466	CCT	2	6	1531710	1531715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855142
31354	NC_012466	ATT	2	6	1531771	1531776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855142
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31356	NC_012466	TTG	2	6	1531846	1531851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855143
31357	NC_012466	CT	3	6	1531859	1531864	0 %	50 %	0 %	50 %	225855143
31358	NC_012466	CTC	2	6	1531939	1531944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855143
31359	NC_012466	TTTCAT	2	12	1531977	1531988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225855143
31360	NC_012466	TCA	2	6	1532036	1532041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855143
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31364	NC_012466	TCGT	2	8	1532155	1532162	0 %	50 %	25 %	25 %	225855143
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31371	NC_012466	T	6	6	1532320	1532325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31372	NC_012466	TTC	2	6	1532344	1532349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31373	NC_012466	T	6	6	1532365	1532370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31374	NC_012466	TGT	2	6	1532375	1532380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31375	NC_012466	ATT	2	6	1532381	1532386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31412	NC_012466	GAACG	2	10	1534436	1534445	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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31453	NC_012466	AGA	2	6	1536789	1536794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31462	NC_012466	AT	3	6	1537369	1537374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31463	NC_012466	TAT	2	6	1537402	1537407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31464	NC_012466	TCAT	2	8	1537446	1537453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31465	NC_012466	AAC	2	6	1537520	1537525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31466	NC_012466	A	6	6	1537532	1537537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31467	NC_012466	AGA	2	6	1537561	1537566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31468	NC_012466	AACTTG	2	12	1537580	1537591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31469	NC_012466	AAT	2	6	1537601	1537606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31470	NC_012466	ATT	2	6	1537634	1537639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31471	NC_012466	TAAC	2	8	1537663	1537670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31472	NC_012466	AG	4	8	1537710	1537717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31473	NC_012466	TAC	2	6	1537723	1537728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31474	NC_012466	ATT	2	6	1537866	1537871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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