MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_012466	CGT	2	6	1243507	1243512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854842
25503	NC_012466	TGC	2	6	1243541	1243546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854842
25504	NC_012466	CAA	2	6	1243549	1243554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225854842
25505	NC_012466	T	7	7	1243576	1243582	0 %	100 %	0 %	0 %	225854842
25506	NC_012466	TTC	2	6	1243586	1243591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854842
25507	NC_012466	TTC	2	6	1243610	1243615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854842
25508	NC_012466	GA	3	6	1243720	1243725	50 %	0 %	50 %	0 %	225854842
25509	NC_012466	GTT	2	6	1243729	1243734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225854842
25510	NC_012466	CAT	2	6	1243795	1243800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854842
25511	NC_012466	CGTAC	2	10	1243848	1243857	20 %	20 %	20 %	40 %	225854842
25512	NC_012466	GATT	2	8	1243858	1243865	25 %	50 %	25 %	0 %	225854842
25513	NC_012466	CTT	2	6	1243876	1243881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854842
25514	NC_012466	TCT	2	6	1243920	1243925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854842
25515	NC_012466	TCAA	2	8	1244036	1244043	50 %	25 %	0 %	25 %	225854843
25516	NC_012466	TGC	2	6	1244090	1244095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854843
25517	NC_012466	GAT	2	6	1244206	1244211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854843
25518	NC_012466	GCT	2	6	1244250	1244255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854843
25519	NC_012466	ACC	2	6	1244260	1244265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854843
25520	NC_012466	ACA	2	6	1244396	1244401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225854843
25521	NC_012466	ATAG	2	8	1244407	1244414	50 %	25 %	25 %	0 %	225854843
25522	NC_012466	GTT	2	6	1244433	1244438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225854843
25523	NC_012466	TGT	2	6	1244496	1244501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225854843
25524	NC_012466	GA	3	6	1244563	1244568	50 %	0 %	50 %	0 %	225854843
25525	NC_012466	GAG	2	6	1244572	1244577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225854843
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25527	NC_012466	TAT	2	6	1244667	1244672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225854843
25528	NC_012466	TGG	2	6	1244757	1244762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225854844
25529	NC_012466	TCAA	2	8	1244807	1244814	50 %	25 %	0 %	25 %	225854844
25530	NC_012466	AAG	2	6	1244828	1244833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854844
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25532	NC_012466	CTG	2	6	1244860	1244865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854844
25533	NC_012466	ATG	3	9	1244882	1244890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854844
25534	NC_012466	TCT	2	6	1244921	1244926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854844
25535	NC_012466	AGGCTG	2	12	1244952	1244963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225854844
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25538	NC_012466	TCAT	2	8	1245320	1245327	25 %	50 %	0 %	25 %	225854844
25539	NC_012466	GTAG	2	8	1245346	1245353	25 %	25 %	50 %	0 %	225854844
25540	NC_012466	TTTC	2	8	1245395	1245402	0 %	75 %	0 %	25 %	225854844
25541	NC_012466	TAG	2	6	1245462	1245467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854844
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25543	NC_012466	CTG	2	6	1245637	1245642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854845
25544	NC_012466	CTG	2	6	1245790	1245795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854845
25545	NC_012466	GAC	2	6	1245842	1245847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225854845
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25550	NC_012466	AAT	2	6	1246202	1246207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854845
25551	NC_012466	CAC	2	6	1246258	1246263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854845
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25553	NC_012466	AAGA	2	8	1246293	1246300	75 %	0 %	25 %	0 %	225854845
25554	NC_012466	ATG	2	6	1246365	1246370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854845
25555	NC_012466	GC	3	6	1246419	1246424	0 %	0 %	50 %	50 %	225854845
25556	NC_012466	CTTT	2	8	1246441	1246448	0 %	75 %	0 %	25 %	225854846
25557	NC_012466	TCA	2	6	1246484	1246489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854846
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25588	NC_012466	AAT	2	6	1248228	1248233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25589	NC_012466	T	6	6	1248249	1248254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25591	NC_012466	ATT	2	6	1248309	1248314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25592	NC_012466	TA	3	6	1248315	1248320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25593	NC_012466	CCT	2	6	1248347	1248352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25594	NC_012466	T	6	6	1248352	1248357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25598	NC_012466	CTT	2	6	1248595	1248600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25599	NC_012466	CTAT	2	8	1248638	1248645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25600	NC_012466	AGT	2	6	1248681	1248686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25601	NC_012466	ATC	2	6	1248721	1248726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25602	NC_012466	CTA	2	6	1248727	1248732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25603	NC_012466	A	7	7	1248732	1248738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25604	NC_012466	AAT	2	6	1248811	1248816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854849
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25616	NC_012466	AGTTG	2	10	1249764	1249773	20 %	40 %	40 %	0 %	225854849
25617	NC_012466	C	6	6	1249779	1249784	0 %	0 %	0 %	100 %	225854849
25618	NC_012466	GCA	2	6	1249788	1249793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225854849
25619	NC_012466	CCA	2	6	1249840	1249845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854849
25620	NC_012466	AGC	2	6	1249850	1249855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225854849
25621	NC_012466	TAAAC	2	10	1249869	1249878	60 %	20 %	0 %	20 %	225854849
25622	NC_012466	CTT	2	6	1249966	1249971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854849
25623	NC_012466	TCC	2	6	1250004	1250009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225854849
25624	NC_012466	CAA	2	6	1250065	1250070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225854849
25625	NC_012466	TCC	2	6	1250127	1250132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225854850
25626	NC_012466	CAT	2	6	1250150	1250155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854850
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25632	NC_012466	CAT	2	6	1250558	1250563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854850
25633	NC_012466	CTG	2	6	1250579	1250584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854850
25634	NC_012466	ATT	2	6	1250594	1250599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225854850
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25640	NC_012466	CTTG	2	8	1250967	1250974	0 %	50 %	25 %	25 %	225854851
25641	NC_012466	CAT	2	6	1251050	1251055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854851
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25645	NC_012466	CTT	2	6	1251157	1251162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854852
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25648	NC_012466	TCAA	2	8	1251282	1251289	50 %	25 %	0 %	25 %	225854852
25649	NC_012466	CT	3	6	1251315	1251320	0 %	50 %	0 %	50 %	225854852
25650	NC_012466	ATG	2	6	1251363	1251368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854852
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25654	NC_012466	ATA	2	6	1251435	1251440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854852
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25656	NC_012466	ATG	2	6	1251496	1251501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854852
25657	NC_012466	TCT	2	6	1251540	1251545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25658	NC_012466	TAT	2	6	1251566	1251571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25659	NC_012466	A	7	7	1251574	1251580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25660	NC_012466	A	7	7	1251607	1251613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25661	NC_012466	T	6	6	1251619	1251624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25662	NC_012466	AT	4	8	1251701	1251708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25663	NC_012466	TA	3	6	1251712	1251717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25664	NC_012466	TTTCA	2	10	1251735	1251744	20 %	60 %	0 %	20 %	225854853
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25728	NC_012466	GATGGT	2	12	1255077	1255088	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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25734	NC_012466	T	6	6	1255180	1255185	0 %	100 %	0 %	0 %	225854857
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25979	NC_012466	TACT	2	8	1267170	1267177	25 %	50 %	0 %	25 %	225854870
25980	NC_012466	ATAA	2	8	1267207	1267214	75 %	25 %	0 %	0 %	225854870
25981	NC_012466	ATC	2	6	1267256	1267261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854870
25982	NC_012466	TTC	2	6	1267265	1267270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854870
25983	NC_012466	TTTA	2	8	1267273	1267280	25 %	75 %	0 %	0 %	225854870
25984	NC_012466	CCTT	2	8	1267296	1267303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25985	NC_012466	T	6	6	1267342	1267347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25986	NC_012466	ACT	2	6	1267361	1267366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25987	NC_012466	A	6	6	1267384	1267389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25990	NC_012466	TTC	2	6	1267600	1267605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25991	NC_012466	TCT	2	6	1267610	1267615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25992	NC_012466	T	8	8	1267663	1267670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25993	NC_012466	TGA	2	6	1267691	1267696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25994	NC_012466	AT	3	6	1267735	1267740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25997	NC_012466	TCTT	2	8	1267859	1267866	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25998	NC_012466	AAT	2	6	1267932	1267937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25999	NC_012466	TTC	2	6	1267943	1267948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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