MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_012466	A	6	6	1216368	1216373	100 %	0 %	0 %	0 %	225854816
25003	NC_012466	TCTTT	2	10	1216408	1216417	0 %	80 %	0 %	20 %	225854816
25004	NC_012466	T	6	6	1216415	1216420	0 %	100 %	0 %	0 %	225854816
25005	NC_012466	AG	3	6	1216429	1216434	50 %	0 %	50 %	0 %	225854816
25006	NC_012466	CTCTT	2	10	1216492	1216501	0 %	60 %	0 %	40 %	225854816
25007	NC_012466	CTA	2	6	1216520	1216525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854816
25008	NC_012466	T	7	7	1216571	1216577	0 %	100 %	0 %	0 %	225854816
25009	NC_012466	CT	3	6	1216578	1216583	0 %	50 %	0 %	50 %	225854816
25010	NC_012466	T	6	6	1216601	1216606	0 %	100 %	0 %	0 %	225854816
25011	NC_012466	AAT	2	6	1216611	1216616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854816
25012	NC_012466	ATG	2	6	1216633	1216638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854816
25013	NC_012466	TCT	2	6	1216662	1216667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854816
25014	NC_012466	ATAGG	2	10	1216696	1216705	40 %	20 %	40 %	0 %	225854817
25015	NC_012466	GAC	2	6	1216829	1216834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225854817
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25019	NC_012466	TTTC	2	8	1217178	1217185	0 %	75 %	0 %	25 %	225854817
25020	NC_012466	A	6	6	1217210	1217215	100 %	0 %	0 %	0 %	225854817
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25058	NC_012466	TAC	2	6	1219217	1219222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854819
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25104	NC_012466	TGA	2	6	1221745	1221750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854822
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25114	NC_012466	TCAA	2	8	1222479	1222486	50 %	25 %	0 %	25 %	225854823
25115	NC_012466	TCAA	2	8	1222515	1222522	50 %	25 %	0 %	25 %	225854823
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25131	NC_012466	TCT	2	6	1223106	1223111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854824
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25238	NC_012466	A	6	6	1227922	1227927	100 %	0 %	0 %	0 %	225854827
25239	NC_012466	T	6	6	1227962	1227967	0 %	100 %	0 %	0 %	225854827
25240	NC_012466	CTT	2	6	1227986	1227991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854827
25241	NC_012466	CTT	2	6	1228012	1228017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854827
25242	NC_012466	T	6	6	1228049	1228054	0 %	100 %	0 %	0 %	225854827
25243	NC_012466	CCT	2	6	1228079	1228084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225854828
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25248	NC_012466	CTG	2	6	1228639	1228644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854828
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25252	NC_012466	A	7	7	1228858	1228864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25330	NC_012466	TTCA	2	8	1233714	1233721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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25334	NC_012466	AT	3	6	1233938	1233943	50 %	50 %	0 %	0 %	225854832
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25339	NC_012466	T	7	7	1234137	1234143	0 %	100 %	0 %	0 %	225854832
25340	NC_012466	A	6	6	1234145	1234150	100 %	0 %	0 %	0 %	225854832
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25342	NC_012466	GGCAA	2	10	1234251	1234260	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25343	NC_012466	TAC	2	6	1234294	1234299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25344	NC_012466	GCAA	2	8	1234303	1234310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25345	NC_012466	TAGAA	2	10	1234336	1234345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25346	NC_012466	TCT	2	6	1234407	1234412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25347	NC_012466	T	7	7	1234759	1234765	0 %	100 %	0 %	0 %	225854833
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25351	NC_012466	TTA	2	6	1235104	1235109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225854833
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25353	NC_012466	TCT	2	6	1235326	1235331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854833
25354	NC_012466	T	7	7	1235486	1235492	0 %	100 %	0 %	0 %	225854833
25355	NC_012466	TGCT	2	8	1235495	1235502	0 %	50 %	25 %	25 %	225854833
25356	NC_012466	CCT	2	6	1235503	1235508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225854834
25357	NC_012466	GA	3	6	1235515	1235520	50 %	0 %	50 %	0 %	225854834
25358	NC_012466	TAA	2	6	1235526	1235531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854834
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25381	NC_012466	AGGT	2	8	1236899	1236906	25 %	25 %	50 %	0 %	225854835
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25457	NC_012466	AAT	2	6	1240842	1240847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854839
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25459	NC_012466	AAG	2	6	1240969	1240974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25460	NC_012466	A	8	8	1240976	1240983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25470	NC_012466	CT	3	6	1241415	1241420	0 %	50 %	0 %	50 %	225854840
25471	NC_012466	CAA	2	6	1241459	1241464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225854840
25472	NC_012466	CT	3	6	1241477	1241482	0 %	50 %	0 %	50 %	225854840
25473	NC_012466	AGCCA	2	10	1241498	1241507	40 %	0 %	20 %	40 %	225854840
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25475	NC_012466	ATG	2	6	1241745	1241750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854840
25476	NC_012466	AGA	2	6	1241761	1241766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854840
25477	NC_012466	AAG	2	6	1241792	1241797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854840
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25479	NC_012466	AAG	2	6	1241913	1241918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854840
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25497	NC_012466	CT	3	6	1243147	1243152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25498	NC_012466	T	6	6	1243199	1243204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25499	NC_012466	T	6	6	1243225	1243230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25500	NC_012466	A	7	7	1243236	1243242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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