MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012125	AATG	2	8	93396	93403	50 %	25 %	25 %	0 %	224581928
2002	NC_012125	TGG	2	6	93482	93487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581928
2003	NC_012125	GAT	2	6	93489	93494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581928
2004	NC_012125	GCT	2	6	93498	93503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581928
2005	NC_012125	GCC	2	6	93505	93510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581928
2006	NC_012125	GCG	2	6	93512	93517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581928
2007	NC_012125	CCA	2	6	93521	93526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581928
2008	NC_012125	TGG	2	6	93578	93583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581928
2009	NC_012125	GCGCT	2	10	93613	93622	0 %	20 %	40 %	40 %	224581928
2010	NC_012125	CG	3	6	93627	93632	0 %	0 %	50 %	50 %	224581928
2011	NC_012125	GGCG	2	8	93738	93745	0 %	0 %	75 %	25 %	224581928
2012	NC_012125	CTG	2	6	93748	93753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581928
2013	NC_012125	TGC	2	6	93809	93814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581928
2014	NC_012125	GATT	2	8	93846	93853	25 %	50 %	25 %	0 %	224581928
2015	NC_012125	TGG	2	6	93863	93868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581928
2016	NC_012125	CTG	2	6	93886	93891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581928
2017	NC_012125	TTG	2	6	93892	93897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224581928
2018	NC_012125	TTA	2	6	93988	93993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224581928
2019	NC_012125	GGCGC	2	10	94027	94036	0 %	0 %	60 %	40 %	224581928
2020	NC_012125	GGC	2	6	94101	94106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581928
2021	NC_012125	TGC	2	6	94124	94129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581928
2022	NC_012125	GC	3	6	94162	94167	0 %	0 %	50 %	50 %	224581928
2023	NC_012125	CGA	2	6	94182	94187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581928
2024	NC_012125	TGC	2	6	94247	94252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581928
2025	NC_012125	TGG	2	6	94271	94276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581928
2026	NC_012125	T	6	6	94331	94336	0 %	100 %	0 %	0 %	224581928
2027	NC_012125	GCGAC	2	10	94340	94349	20 %	0 %	40 %	40 %	224581928
2028	NC_012125	GCG	2	6	94378	94383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581928
2029	NC_012125	GCCCGT	2	12	94480	94491	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	224581928
2030	NC_012125	GC	3	6	94559	94564	0 %	0 %	50 %	50 %	224581928
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2032	NC_012125	GCTGGG	2	12	94593	94604	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	224581928
2033	NC_012125	GC	3	6	94623	94628	0 %	0 %	50 %	50 %	224581928
2034	NC_012125	TGG	2	6	94658	94663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581928
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2036	NC_012125	ATT	2	6	94741	94746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224581928
2037	NC_012125	TGA	2	6	94830	94835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581928
2038	NC_012125	A	6	6	94864	94869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_012125	ACT	2	6	94912	94917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2041	NC_012125	CGA	2	6	94998	95003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_012125	GGC	2	6	95026	95031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_012125	T	8	8	95034	95041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_012125	TAAT	2	8	95053	95060	50 %	50 %	0 %	0 %	224581929
2045	NC_012125	GCG	2	6	95074	95079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581929
2046	NC_012125	CCTG	2	8	95127	95134	0 %	25 %	25 %	50 %	224581929
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2054	NC_012125	GGC	2	6	95555	95560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_012125	CTTCGC	2	12	95658	95669	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	224581930
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2057	NC_012125	TCCCTT	2	12	95787	95798	0 %	50 %	0 %	50 %	224581930
2058	NC_012125	GCG	2	6	95874	95879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581930
2059	NC_012125	TAA	2	6	95964	95969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224581930
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2063	NC_012125	TAA	2	6	96433	96438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224581930
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2067	NC_012125	AACGT	2	10	96797	96806	40 %	20 %	20 %	20 %	224581931
2068	NC_012125	AC	3	6	96857	96862	50 %	0 %	0 %	50 %	224581931
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2096	NC_012125	GAC	2	6	98583	98588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581933
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2109	NC_012125	GC	3	6	99065	99070	0 %	0 %	50 %	50 %	224581934
2110	NC_012125	CTG	2	6	99071	99076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581934
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2112	NC_012125	CTG	2	6	99305	99310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581934
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2126	NC_012125	ACG	2	6	99867	99872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581934
2127	NC_012125	ATT	2	6	99875	99880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224581934
2128	NC_012125	GAC	2	6	99881	99886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581934
2129	NC_012125	G	6	6	99910	99915	0 %	0 %	100 %	0 %	224581934
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2133	NC_012125	GTT	2	6	100152	100157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224581935
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2138	NC_012125	GCT	4	12	100462	100473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581935
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2141	NC_012125	TAG	2	6	100634	100639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581935
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2247	NC_012125	CGGCAG	2	12	105806	105817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	224581939
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2251	NC_012125	TCG	2	6	106023	106028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581939
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2352	NC_012125	GTTT	2	8	110606	110613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2353	NC_012125	ATA	2	6	110671	110676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2354	NC_012125	TAAA	2	8	110697	110704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2355	NC_012125	TCG	2	6	110724	110729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2370	NC_012125	AT	3	6	111203	111208	50 %	50 %	0 %	0 %	224581942
2371	NC_012125	TCA	2	6	111221	111226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581942
2372	NC_012125	C	6	6	111232	111237	0 %	0 %	0 %	100 %	224581942
2373	NC_012125	CAG	2	6	111311	111316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581943
2374	NC_012125	TGC	2	6	111321	111326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581943
2375	NC_012125	GCG	2	6	111340	111345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581943
2376	NC_012125	GGC	2	6	111352	111357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581943
2377	NC_012125	AGA	2	6	111358	111363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581943
2378	NC_012125	CTT	2	6	111379	111384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581943
2379	NC_012125	GCG	2	6	111474	111479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581943
2380	NC_012125	CAA	2	6	111505	111510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224581943
2381	NC_012125	GGT	2	6	111605	111610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581943
2382	NC_012125	GT	3	6	111669	111674	0 %	50 %	50 %	0 %	224581943
2383	NC_012125	GCC	2	6	111680	111685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581943
2384	NC_012125	ACA	2	6	111706	111711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224581943
2385	NC_012125	GAC	2	6	111732	111737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581943
2386	NC_012125	ACC	3	9	111780	111788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581943
2387	NC_012125	CGC	2	6	111844	111849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581943
2388	NC_012125	TCT	2	6	111945	111950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581943
2389	NC_012125	CAGCG	2	10	112127	112136	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2390	NC_012125	GC	3	6	112254	112259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2391	NC_012125	GCCA	2	8	112261	112268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2392	NC_012125	GCG	2	6	112350	112355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2393	NC_012125	CAG	2	6	112381	112386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2394	NC_012125	CGA	2	6	112419	112424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2395	NC_012125	GCCGG	2	10	112427	112436	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2396	NC_012125	GCC	2	6	112474	112479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2397	NC_012125	GGAC	2	8	112528	112535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2398	NC_012125	AC	3	6	112534	112539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2399	NC_012125	CGAGC	2	10	112552	112561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2400	NC_012125	TCC	2	6	112598	112603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2401	NC_012125	GCC	2	6	112615	112620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2402	NC_012125	GCG	2	6	112661	112666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2403	NC_012125	TGC	2	6	112703	112708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2404	NC_012125	GTA	2	6	112766	112771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2405	NC_012125	GCC	2	6	112786	112791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2406	NC_012125	CGC	2	6	112828	112833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2407	NC_012125	GGCG	2	8	112873	112880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2408	NC_012125	GCT	2	6	112891	112896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2409	NC_012125	TCGCCG	2	12	112925	112936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2410	NC_012125	CAC	2	6	112945	112950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2411	NC_012125	ATTTG	2	10	112995	113004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2412	NC_012125	GTCA	2	8	113023	113030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2413	NC_012125	GAC	2	6	113158	113163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2414	NC_012125	TGC	2	6	113168	113173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2415	NC_012125	CG	3	6	113183	113188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2416	NC_012125	CCG	2	6	113210	113215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2417	NC_012125	GGTTCA	2	12	113226	113237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2418	NC_012125	GCG	2	6	113270	113275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2419	NC_012125	AGT	2	6	113297	113302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2420	NC_012125	ACC	2	6	113366	113371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2421	NC_012125	GCTG	2	8	113550	113557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2422	NC_012125	TGT	2	6	113673	113678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2423	NC_012125	CTG	2	6	113696	113701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2424	NC_012125	GCG	2	6	113705	113710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2425	NC_012125	G	10	10	113742	113751	0 %	0 %	100 %	0 %	224581944
2426	NC_012125	GGC	2	6	113790	113795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581944
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2428	NC_012125	GCG	2	6	113839	113844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581944
2429	NC_012125	CGA	2	6	113870	113875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581944
2430	NC_012125	GCA	2	6	113901	113906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581944
2431	NC_012125	GCC	2	6	113940	113945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581944
2432	NC_012125	GC	5	10	114001	114010	0 %	0 %	50 %	50 %	224581944
2433	NC_012125	GCG	2	6	114114	114119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581944
2434	NC_012125	CAC	2	6	114138	114143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581944
2435	NC_012125	GCT	2	6	114200	114205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581944
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2437	NC_012125	TGC	2	6	114241	114246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581944
2438	NC_012125	CAC	2	6	114345	114350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581944
2439	NC_012125	CGC	2	6	114506	114511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581944
2440	NC_012125	CAC	2	6	114519	114524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581944
2441	NC_012125	CGG	2	6	114584	114589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581944
2442	NC_012125	TCA	2	6	114646	114651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581944
2443	NC_012125	AAG	2	6	114652	114657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581944
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2446	NC_012125	GTG	2	6	114745	114750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581944
2447	NC_012125	AGC	2	6	114757	114762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581944
2448	NC_012125	CA	3	6	114776	114781	50 %	0 %	0 %	50 %	224581944
2449	NC_012125	CGG	2	6	114797	114802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581944
2450	NC_012125	GCC	2	6	114873	114878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581944
2451	NC_012125	AGT	2	6	114890	114895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581944
2452	NC_012125	TCG	2	6	114931	114936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581944
2453	NC_012125	CGG	2	6	114947	114952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581944
2454	NC_012125	GCG	2	6	115096	115101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581944
2455	NC_012125	CG	3	6	115154	115159	0 %	0 %	50 %	50 %	224581944
2456	NC_012125	GAT	2	6	115160	115165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581944
2457	NC_012125	GTT	2	6	115176	115181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224581944
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2459	NC_012125	TGG	2	6	115232	115237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581944
2460	NC_012125	TCG	2	6	115243	115248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581944
2461	NC_012125	GC	3	6	115273	115278	0 %	0 %	50 %	50 %	224581944
2462	NC_012125	TCCA	2	8	115328	115335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2463	NC_012125	AG	3	6	115360	115365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2464	NC_012125	CAGG	2	8	115382	115389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2465	NC_012125	AATGCT	2	12	115412	115423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2466	NC_012125	TCA	2	6	115564	115569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2467	NC_012125	GTC	2	6	115600	115605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2468	NC_012125	TCT	2	6	115629	115634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2469	NC_012125	G	6	6	115644	115649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2470	NC_012125	T	7	7	115758	115764	0 %	100 %	0 %	0 %	224581945
2471	NC_012125	ATCG	2	8	115765	115772	25 %	25 %	25 %	25 %	224581945
2472	NC_012125	AT	3	6	115791	115796	50 %	50 %	0 %	0 %	224581945
2473	NC_012125	TAA	3	9	115830	115838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224581945
2474	NC_012125	TGTC	2	8	115851	115858	0 %	50 %	25 %	25 %	224581945
2475	NC_012125	AT	3	6	115868	115873	50 %	50 %	0 %	0 %	224581945
2476	NC_012125	CCG	2	6	115882	115887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581945
2477	NC_012125	TCA	2	6	115896	115901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581945
2478	NC_012125	GC	3	6	116032	116037	0 %	0 %	50 %	50 %	224581945
2479	NC_012125	ATC	2	6	116068	116073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581945
2480	NC_012125	CTG	2	6	116122	116127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581945
2481	NC_012125	AGC	2	6	116129	116134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581945
2482	NC_012125	TAAT	2	8	116156	116163	50 %	50 %	0 %	0 %	224581945
2483	NC_012125	CCG	2	6	116176	116181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581945
2484	NC_012125	TGCC	2	8	116202	116209	0 %	25 %	25 %	50 %	224581945
2485	NC_012125	CAG	2	6	116308	116313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581945
2486	NC_012125	CAC	2	6	116379	116384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581945
2487	NC_012125	A	6	6	116455	116460	100 %	0 %	0 %	0 %	224581945
2488	NC_012125	ATG	2	6	116513	116518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2489	NC_012125	TCA	2	6	116602	116607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2490	NC_012125	AC	3	6	116617	116622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2491	NC_012125	CTG	2	6	116633	116638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581946
2492	NC_012125	CGCTGG	2	12	116706	116717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	224581946
2493	NC_012125	GC	3	6	116760	116765	0 %	0 %	50 %	50 %	224581946
2494	NC_012125	GCG	2	6	116775	116780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581946
2495	NC_012125	CTGG	2	8	116800	116807	0 %	25 %	50 %	25 %	224581946
2496	NC_012125	TAT	2	6	116812	116817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224581946
2497	NC_012125	CTGG	2	8	116848	116855	0 %	25 %	50 %	25 %	224581946
2498	NC_012125	GCT	2	6	116911	116916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581946
2499	NC_012125	CGA	2	6	116985	116990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581946
2500	NC_012125	TGG	2	6	117006	117011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581946

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