MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012125	T	7	7	69527	69533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012125	AT	3	6	69543	69548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012125	T	8	8	69561	69568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012125	GTT	2	6	69640	69645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012125	T	6	6	69644	69649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012125	GTT	2	6	69650	69655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012125	GCCA	2	8	69695	69702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_012125	T	6	6	69704	69709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012125	A	6	6	69806	69811	100 %	0 %	0 %	0 %	224581905
1510	NC_012125	GCC	2	6	69854	69859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581905
1511	NC_012125	ACTG	2	8	69903	69910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_012125	AGTG	2	8	69932	69939	25 %	25 %	50 %	0 %	224581906
1513	NC_012125	CGG	2	6	70033	70038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581906
1514	NC_012125	TCCT	2	8	70094	70101	0 %	50 %	0 %	50 %	224581906
1515	NC_012125	CTTA	2	8	70122	70129	25 %	50 %	0 %	25 %	224581906
1516	NC_012125	GAA	2	6	70167	70172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581906
1517	NC_012125	TCT	2	6	70173	70178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581906
1518	NC_012125	CT	3	6	70251	70256	0 %	50 %	0 %	50 %	224581906
1519	NC_012125	CTG	2	6	70320	70325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581906
1520	NC_012125	CAT	2	6	70352	70357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581906
1521	NC_012125	AAG	2	6	70438	70443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581906
1522	NC_012125	ACG	2	6	70449	70454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581906
1523	NC_012125	TGG	2	6	70540	70545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581906
1524	NC_012125	TGG	2	6	70585	70590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581906
1525	NC_012125	GCC	2	6	70600	70605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581906
1526	NC_012125	GGT	2	6	70610	70615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581906
1527	NC_012125	CTG	2	6	70630	70635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581906
1528	NC_012125	TCC	2	6	70732	70737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224581906
1529	NC_012125	GCT	2	6	70778	70783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581906
1530	NC_012125	CGG	2	6	70832	70837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581906
1531	NC_012125	GTG	2	6	70869	70874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581906
1532	NC_012125	GCG	2	6	71046	71051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581906
1533	NC_012125	AAT	2	6	71104	71109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224581906
1534	NC_012125	TAA	2	6	71116	71121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012125	ACT	2	6	71206	71211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581907
1536	NC_012125	CCA	2	6	71281	71286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581907
1537	NC_012125	GACC	2	8	71291	71298	25 %	0 %	25 %	50 %	224581907
1538	NC_012125	GTG	2	6	71343	71348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581907
1539	NC_012125	TGC	2	6	71383	71388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1540	NC_012125	GGC	2	6	71397	71402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1541	NC_012125	GC	3	6	71419	71424	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
1542	NC_012125	TGGAGC	2	12	71425	71436	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	224581907
1543	NC_012125	CCG	2	6	71482	71487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581907
1544	NC_012125	CGT	2	6	71511	71516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1545	NC_012125	GAA	2	6	71534	71539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581907
1546	NC_012125	CG	3	6	71555	71560	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
1547	NC_012125	GAA	2	6	71583	71588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581907
1548	NC_012125	CAT	2	6	71624	71629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581907
1549	NC_012125	TCCT	2	8	71633	71640	0 %	50 %	0 %	50 %	224581907
1550	NC_012125	CGG	3	9	71657	71665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1551	NC_012125	GAA	2	6	71691	71696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581907
1552	NC_012125	TC	3	6	71717	71722	0 %	50 %	0 %	50 %	224581907
1553	NC_012125	CCAA	2	8	71724	71731	50 %	0 %	0 %	50 %	224581907
1554	NC_012125	CTG	2	6	71736	71741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1555	NC_012125	TGA	2	6	71744	71749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581907
1556	NC_012125	GTG	2	6	71784	71789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581907
1557	NC_012125	CAT	2	6	71810	71815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581907
1558	NC_012125	CGG	2	6	71963	71968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1559	NC_012125	CG	3	6	72031	72036	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
1560	NC_012125	CTC	2	6	72044	72049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224581907
1561	NC_012125	GCC	2	6	72093	72098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581907
1562	NC_012125	TGA	2	6	72130	72135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581907
1563	NC_012125	CGG	2	6	72146	72151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1564	NC_012125	CCT	2	6	72163	72168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224581907
1565	NC_012125	ACC	2	6	72249	72254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581907
1566	NC_012125	TCGG	2	8	72264	72271	0 %	25 %	50 %	25 %	224581907
1567	NC_012125	CGCA	2	8	72291	72298	25 %	0 %	25 %	50 %	224581907
1568	NC_012125	GAC	2	6	72372	72377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1569	NC_012125	CCG	2	6	72398	72403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581907
1570	NC_012125	CTGG	2	8	72639	72646	0 %	25 %	50 %	25 %	224581907
1571	NC_012125	GCG	2	6	72723	72728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1572	NC_012125	GCGAA	2	10	72778	72787	40 %	0 %	40 %	20 %	224581907
1573	NC_012125	CCGT	2	8	72789	72796	0 %	25 %	25 %	50 %	224581907
1574	NC_012125	CGG	3	9	72821	72829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1575	NC_012125	ACT	2	6	72862	72867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581907
1576	NC_012125	CGG	2	6	73052	73057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1577	NC_012125	GC	5	10	73077	73086	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
1578	NC_012125	CG	3	6	73137	73142	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
1579	NC_012125	CTGAAG	2	12	73179	73190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224581907
1580	NC_012125	TGG	2	6	73261	73266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581907
1581	NC_012125	CTT	2	6	73273	73278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581907
1582	NC_012125	GGC	2	6	73287	73292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1583	NC_012125	TGC	2	6	73375	73380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1584	NC_012125	TGA	2	6	73394	73399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581907
1585	NC_012125	GTGGAC	2	12	73410	73421	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	224581907
1586	NC_012125	GGCG	2	8	73478	73485	0 %	0 %	75 %	25 %	224581907
1587	NC_012125	CAG	2	6	73557	73562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1588	NC_012125	TGA	2	6	73600	73605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581907
1589	NC_012125	GCG	2	6	73662	73667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1590	NC_012125	CGTAC	2	10	73668	73677	20 %	20 %	20 %	40 %	224581907
1591	NC_012125	GGC	2	6	73718	73723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1592	NC_012125	GC	3	6	73722	73727	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
1593	NC_012125	TAC	2	6	73785	73790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581907
1594	NC_012125	GTG	2	6	73803	73808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581907
1595	NC_012125	CAA	2	6	73817	73822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224581907
1596	NC_012125	CCA	2	6	73936	73941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581907
1597	NC_012125	GAA	2	6	73943	73948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581907
1598	NC_012125	GCT	2	6	73961	73966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1599	NC_012125	GTG	2	6	73995	74000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581907
1600	NC_012125	GCT	2	6	74015	74020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1601	NC_012125	GTC	2	6	74116	74121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1602	NC_012125	CAT	2	6	74162	74167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581907
1603	NC_012125	ACC	2	6	74172	74177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581907
1604	NC_012125	CGC	2	6	74184	74189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581907
1605	NC_012125	CGC	2	6	74214	74219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581907
1606	NC_012125	GC	3	6	74221	74226	0 %	0 %	50 %	50 %	224581907
1607	NC_012125	CGG	2	6	74261	74266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581907
1608	NC_012125	ACG	2	6	74274	74279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581907
1609	NC_012125	T	7	7	74428	74434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012125	TAA	2	6	74490	74495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_012125	TTA	2	6	74574	74579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012125	TG	3	6	74629	74634	0 %	50 %	50 %	0 %	224581908
1613	NC_012125	GAT	2	6	74678	74683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581908
1614	NC_012125	TTGT	2	8	74791	74798	0 %	75 %	25 %	0 %	224581908
1615	NC_012125	GAT	2	6	74807	74812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581908
1616	NC_012125	TGCCAG	2	12	74838	74849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	224581908
1617	NC_012125	GAAA	2	8	74913	74920	75 %	0 %	25 %	0 %	224581908
1618	NC_012125	C	6	6	74958	74963	0 %	0 %	0 %	100 %	224581908
1619	NC_012125	GAT	2	6	74993	74998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581908
1620	NC_012125	CGTC	2	8	75124	75131	0 %	25 %	25 %	50 %	224581909
1621	NC_012125	CGGT	2	8	75146	75153	0 %	25 %	50 %	25 %	224581909
1622	NC_012125	TTC	2	6	75155	75160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581909
1623	NC_012125	GTA	2	6	75274	75279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581909
1624	NC_012125	CG	3	6	75280	75285	0 %	0 %	50 %	50 %	224581909
1625	NC_012125	CAG	2	6	75299	75304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581909
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1627	NC_012125	GGC	2	6	75347	75352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581909
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