MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012125	CAG	3	9	45890	45898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581879
1002	NC_012125	CAG	2	6	45977	45982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581879
1003	NC_012125	GTA	2	6	46021	46026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581879
1004	NC_012125	ATG	2	6	46033	46038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581879
1005	NC_012125	AAC	2	6	46116	46121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012125	ATT	2	6	46148	46153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012125	AGTA	2	8	46191	46198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012125	AGT	2	6	46213	46218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012125	ATCA	2	8	46231	46238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_012125	ATT	2	6	46239	46244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012125	TTA	2	6	46267	46272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012125	GGT	2	6	46305	46310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012125	T	6	6	46316	46321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012125	GAAA	2	8	46351	46358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012125	AGGG	2	8	46384	46391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012125	A	6	6	46399	46404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012125	A	7	7	46481	46487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012125	TTG	2	6	46544	46549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224581880
1019	NC_012125	AGC	2	6	46609	46614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581880
1020	NC_012125	GCA	2	6	46658	46663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581880
1021	NC_012125	TGA	2	6	46701	46706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581880
1022	NC_012125	CAT	2	6	46714	46719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581880
1023	NC_012125	GC	3	6	46766	46771	0 %	0 %	50 %	50 %	224581880
1024	NC_012125	CTT	2	6	46861	46866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_012125	GCA	2	6	46905	46910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581881
1026	NC_012125	GCG	2	6	46991	46996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581881
1027	NC_012125	TCT	2	6	47036	47041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581881
1028	NC_012125	CATA	2	8	47143	47150	50 %	25 %	0 %	25 %	224581882
1029	NC_012125	TCAG	2	8	47154	47161	25 %	25 %	25 %	25 %	224581882
1030	NC_012125	GT	3	6	47173	47178	0 %	50 %	50 %	0 %	224581882
1031	NC_012125	GAA	2	6	47243	47248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581882
1032	NC_012125	GGT	3	9	47269	47277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581882
1033	NC_012125	GCG	2	6	47376	47381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581882
1034	NC_012125	TGTGC	2	10	47389	47398	0 %	40 %	40 %	20 %	224581882
1035	NC_012125	CGC	2	6	47411	47416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581882
1036	NC_012125	CTG	2	6	47453	47458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581882
1037	NC_012125	GAT	2	6	47495	47500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581882
1038	NC_012125	CG	3	6	47519	47524	0 %	0 %	50 %	50 %	224581882
1039	NC_012125	TTA	2	6	47537	47542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224581882
1040	NC_012125	GGC	2	6	47600	47605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581882
1041	NC_012125	AGT	2	6	47615	47620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581882
1042	NC_012125	CTG	2	6	47672	47677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581882
1043	NC_012125	CGA	2	6	47716	47721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581882
1044	NC_012125	TGGC	2	8	47868	47875	0 %	25 %	50 %	25 %	224581882
1045	NC_012125	CAA	2	6	47882	47887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224581882
1046	NC_012125	CTG	2	6	47900	47905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581882
1047	NC_012125	AGC	2	6	47970	47975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581882
1048	NC_012125	TGA	2	6	47989	47994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581882
1049	NC_012125	T	6	6	48038	48043	0 %	100 %	0 %	0 %	224581882
1050	NC_012125	TGA	2	6	48107	48112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1051	NC_012125	GCG	2	6	48161	48166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581883
1052	NC_012125	GAT	3	9	48208	48216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1053	NC_012125	CAT	2	6	48225	48230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581883
1054	NC_012125	A	6	6	48241	48246	100 %	0 %	0 %	0 %	224581883
1055	NC_012125	A	7	7	48250	48256	100 %	0 %	0 %	0 %	224581883
1056	NC_012125	ATG	2	6	48269	48274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1057	NC_012125	GCA	2	6	48293	48298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1058	NC_012125	CCG	2	6	48461	48466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581883
1059	NC_012125	CAT	2	6	48600	48605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581883
1060	NC_012125	CG	3	6	48607	48612	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
1061	NC_012125	GCGGAA	2	12	48694	48705	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	224581883
1062	NC_012125	ACC	2	6	48829	48834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581883
1063	NC_012125	CTG	2	6	49015	49020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1064	NC_012125	CTG	2	6	49264	49269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1065	NC_012125	GC	3	6	49280	49285	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
1066	NC_012125	A	6	6	49298	49303	100 %	0 %	0 %	0 %	224581883
1067	NC_012125	GCA	2	6	49305	49310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1068	NC_012125	CG	3	6	49354	49359	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
1069	NC_012125	AAG	2	6	49388	49393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581883
1070	NC_012125	GCT	2	6	49560	49565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1071	NC_012125	GGC	2	6	49584	49589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581883
1072	NC_012125	GTG	2	6	49635	49640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581883
1073	NC_012125	GTTTG	2	10	49711	49720	0 %	60 %	40 %	0 %	224581883
1074	NC_012125	CCA	2	6	49730	49735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581883
1075	NC_012125	TCC	2	6	49828	49833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224581883
1076	NC_012125	TGA	2	6	49835	49840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1077	NC_012125	CGC	2	6	49949	49954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581883
1078	NC_012125	TGA	2	6	49961	49966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1079	NC_012125	TCG	2	6	50070	50075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1080	NC_012125	CG	3	6	50088	50093	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
1081	NC_012125	CTG	2	6	50098	50103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1082	NC_012125	TGG	2	6	50156	50161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581883
1083	NC_012125	GCA	2	6	50199	50204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1084	NC_012125	GTTC	2	8	50285	50292	0 %	50 %	25 %	25 %	224581883
1085	NC_012125	CAT	2	6	50301	50306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581883
1086	NC_012125	CG	3	6	50343	50348	0 %	0 %	50 %	50 %	224581883
1087	NC_012125	TGA	2	6	50427	50432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1088	NC_012125	ACG	2	6	50489	50494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1089	NC_012125	GTT	2	6	50496	50501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224581883
1090	NC_012125	GAA	2	6	50518	50523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581883
1091	NC_012125	CAA	2	6	50571	50576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224581883
1092	NC_012125	AAG	2	6	50668	50673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581883
1093	NC_012125	G	6	6	50742	50747	0 %	0 %	100 %	0 %	224581883
1094	NC_012125	TGA	3	9	50751	50759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1095	NC_012125	GCT	2	6	50834	50839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581883
1096	NC_012125	CACTA	2	10	50842	50851	40 %	20 %	0 %	40 %	224581883
1097	NC_012125	AAC	2	6	50924	50929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224581883
1098	NC_012125	TGA	2	6	50941	50946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581883
1099	NC_012125	GTA	2	6	50988	50993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581884
1100	NC_012125	GCA	2	6	51016	51021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581884
1101	NC_012125	TCC	2	6	51031	51036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224581884
1102	NC_012125	GCG	2	6	51133	51138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581884
1103	NC_012125	TGA	2	6	51196	51201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581884
1104	NC_012125	ATC	2	6	51252	51257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581884
1105	NC_012125	GGC	2	6	51258	51263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581884
1106	NC_012125	GC	3	6	51262	51267	0 %	0 %	50 %	50 %	224581884
1107	NC_012125	TGT	2	6	51302	51307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224581884
1108	NC_012125	CGGCG	2	10	51380	51389	0 %	0 %	60 %	40 %	224581884
1109	NC_012125	AGCGC	2	10	51488	51497	20 %	0 %	40 %	40 %	224581885
1110	NC_012125	GTG	2	6	51510	51515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581885
1111	NC_012125	TTCAC	2	10	51635	51644	20 %	40 %	0 %	40 %	224581886
1112	NC_012125	GAT	2	6	51655	51660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581886
1113	NC_012125	CGG	2	6	51668	51673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581886
1114	NC_012125	AGCC	2	8	51695	51702	25 %	0 %	25 %	50 %	224581886
1115	NC_012125	AGC	3	9	51743	51751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581886
1116	NC_012125	AAG	2	6	51764	51769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581886
1117	NC_012125	AAAG	2	8	51774	51781	75 %	0 %	25 %	0 %	224581886
1118	NC_012125	CGC	2	6	51801	51806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581886
1119	NC_012125	GGC	2	6	51861	51866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581886
1120	NC_012125	ATGG	2	8	51907	51914	25 %	25 %	50 %	0 %	224581886
1121	NC_012125	TTG	2	6	52111	52116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224581887
1122	NC_012125	GC	3	6	52138	52143	0 %	0 %	50 %	50 %	224581887
1123	NC_012125	TCT	2	6	52258	52263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581887
1124	NC_012125	GC	4	8	52368	52375	0 %	0 %	50 %	50 %	224581887
1125	NC_012125	GAA	2	6	52389	52394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224581887
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1127	NC_012125	TGAT	2	8	52579	52586	25 %	50 %	25 %	0 %	224581887
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1252	NC_012125	GC	3	6	58839	58844	0 %	0 %	50 %	50 %	224581893
1253	NC_012125	CGT	2	6	58881	58886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581893
1254	NC_012125	CAG	2	6	58894	58899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581893
1255	NC_012125	AGC	2	6	58946	58951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581893
1256	NC_012125	CCG	2	6	58952	58957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581893
1257	NC_012125	GCA	4	12	58968	58979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581893
1258	NC_012125	CTT	2	6	58990	58995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581893
1259	NC_012125	GCCA	2	8	59003	59010	25 %	0 %	25 %	50 %	224581893
1260	NC_012125	CAG	4	12	59011	59022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581893
1261	NC_012125	CAG	2	6	59029	59034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581893
1262	NC_012125	ATG	2	6	59036	59041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581893
1263	NC_012125	GCCTG	2	10	59042	59051	0 %	20 %	40 %	40 %	224581893
1264	NC_012125	CTC	2	6	59109	59114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_012125	TCA	2	6	59130	59135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581894
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1270	NC_012125	CGC	2	6	59406	59411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581894
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1351	NC_012125	TAA	2	6	62696	62701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1352	NC_012125	TAAT	2	8	62751	62758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1353	NC_012125	ATT	2	6	62762	62767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1355	NC_012125	TTAA	2	8	62782	62789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1492	NC_012125	AT	3	6	69157	69162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1494	NC_012125	C	6	6	69185	69190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1495	NC_012125	TTC	2	6	69241	69246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581904
1496	NC_012125	T	6	6	69382	69387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1497	NC_012125	AAAGAA	2	12	69434	69445	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1498	NC_012125	TTA	2	6	69475	69480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1499	NC_012125	T	6	6	69499	69504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_012125	ATG	2	6	69514	69519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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