MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101501	NC_012125	GCA	2	6	4821264	4821269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586407
101502	NC_012125	GGC	2	6	4821382	4821387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586407
101503	NC_012125	CGCGG	2	10	4821392	4821401	0 %	0 %	60 %	40 %	224586407
101504	NC_012125	CCGC	2	8	4821422	4821429	0 %	0 %	25 %	75 %	224586407
101505	NC_012125	CTG	2	6	4821500	4821505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586407
101506	NC_012125	TGA	2	6	4821559	4821564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586407
101507	NC_012125	GGC	2	6	4821604	4821609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586407
101508	NC_012125	A	6	6	4821610	4821615	100 %	0 %	0 %	0 %	224586407
101509	NC_012125	GTC	2	6	4821650	4821655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586407
101510	NC_012125	GA	3	6	4821759	4821764	50 %	0 %	50 %	0 %	224586407
101511	NC_012125	AGC	2	6	4821869	4821874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586407
101512	NC_012125	GGC	2	6	4821901	4821906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586407
101513	NC_012125	CTC	2	6	4821911	4821916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586407
101514	NC_012125	GGTGA	2	10	4821920	4821929	20 %	20 %	60 %	0 %	224586407
101515	NC_012125	GGC	2	6	4821950	4821955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586407
101516	NC_012125	CTG	2	6	4822026	4822031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101517	NC_012125	C	6	6	4822062	4822067	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101518	NC_012125	TGT	2	6	4822068	4822073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101519	NC_012125	GGC	2	6	4822091	4822096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101520	NC_012125	CTG	2	6	4822106	4822111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101521	NC_012125	TGA	2	6	4822122	4822127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101522	NC_012125	TGG	2	6	4822227	4822232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101523	NC_012125	TGAGC	2	10	4822438	4822447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101524	NC_012125	TCG	2	6	4822479	4822484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101525	NC_012125	GC	3	6	4822499	4822504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101526	NC_012125	AG	3	6	4822583	4822588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101527	NC_012125	CAGT	2	8	4822612	4822619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101528	NC_012125	TTC	2	6	4822755	4822760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101529	NC_012125	CGA	2	6	4822935	4822940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101530	NC_012125	TTG	2	6	4822952	4822957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101531	NC_012125	CTTT	2	8	4822977	4822984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101532	NC_012125	CTG	2	6	4823030	4823035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101533	NC_012125	CTG	2	6	4823063	4823068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101534	NC_012125	CGC	2	6	4823113	4823118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101535	NC_012125	TGG	2	6	4823124	4823129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101536	NC_012125	TGA	2	6	4823136	4823141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101537	NC_012125	GCAG	2	8	4823155	4823162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101538	NC_012125	TGC	2	6	4823235	4823240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101539	NC_012125	GGC	2	6	4823294	4823299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101540	NC_012125	CT	3	6	4823336	4823341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101541	NC_012125	AAAT	2	8	4823396	4823403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101542	NC_012125	GC	4	8	4823411	4823418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101543	NC_012125	GTTA	2	8	4823458	4823465	25 %	50 %	25 %	0 %	224586408
101544	NC_012125	GGC	2	6	4823516	4823521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586408
101545	NC_012125	TAG	2	6	4823529	4823534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586408
101546	NC_012125	CG	3	6	4823535	4823540	0 %	0 %	50 %	50 %	224586408
101547	NC_012125	GGT	2	6	4823552	4823557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586408
101548	NC_012125	CCG	2	6	4823574	4823579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586408
101549	NC_012125	TGG	2	6	4823605	4823610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586408
101550	NC_012125	T	6	6	4823635	4823640	0 %	100 %	0 %	0 %	224586408
101551	NC_012125	GATT	2	8	4823641	4823648	25 %	50 %	25 %	0 %	224586408
101552	NC_012125	GC	3	6	4823725	4823730	0 %	0 %	50 %	50 %	224586408
101553	NC_012125	ATG	2	6	4823794	4823799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586408
101554	NC_012125	CGC	2	6	4823989	4823994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586408
101555	NC_012125	CG	3	6	4824028	4824033	0 %	0 %	50 %	50 %	224586408
101556	NC_012125	GT	3	6	4824122	4824127	0 %	50 %	50 %	0 %	224586408
101557	NC_012125	GGTA	2	8	4824148	4824155	25 %	25 %	50 %	0 %	224586408
101558	NC_012125	GTT	2	6	4824251	4824256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586408
101559	NC_012125	ATTG	2	8	4824269	4824276	25 %	50 %	25 %	0 %	224586408
101560	NC_012125	GC	3	6	4824295	4824300	0 %	0 %	50 %	50 %	224586408
101561	NC_012125	A	6	6	4824315	4824320	100 %	0 %	0 %	0 %	224586408
101562	NC_012125	CCAT	2	8	4824345	4824352	25 %	25 %	0 %	50 %	224586408
101563	NC_012125	CCA	2	6	4824421	4824426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586408
101564	NC_012125	CGG	2	6	4824437	4824442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586408
101565	NC_012125	CAG	2	6	4824512	4824517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586408
101566	NC_012125	GCG	2	6	4824664	4824669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586409
101567	NC_012125	GTT	2	6	4824723	4824728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586409
101568	NC_012125	TGG	2	6	4824917	4824922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586409
101569	NC_012125	AG	4	8	4824970	4824977	50 %	0 %	50 %	0 %	224586409
101570	NC_012125	GGC	2	6	4825110	4825115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586409
101571	NC_012125	GCA	2	6	4825120	4825125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586409
101572	NC_012125	CCA	2	6	4825151	4825156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101573	NC_012125	CTG	3	9	4825240	4825248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586410
101574	NC_012125	TAA	2	6	4825265	4825270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586410
101575	NC_012125	CAA	2	6	4825318	4825323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586410
101576	NC_012125	CTG	2	6	4825326	4825331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586410
101577	NC_012125	AGACG	2	10	4825352	4825361	40 %	0 %	40 %	20 %	224586410
101578	NC_012125	ACC	2	6	4825449	4825454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586410
101579	NC_012125	T	6	6	4825503	4825508	0 %	100 %	0 %	0 %	224586410
101580	NC_012125	CGT	2	6	4825517	4825522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586410
101581	NC_012125	ACG	2	6	4825566	4825571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586410
101582	NC_012125	ATG	2	6	4825650	4825655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586410
101583	NC_012125	GTC	2	6	4825658	4825663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586410
101584	NC_012125	GTA	3	9	4825696	4825704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586410
101585	NC_012125	CGC	2	6	4825705	4825710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586410
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101587	NC_012125	TGG	2	6	4825810	4825815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586410
101588	NC_012125	GA	3	6	4825854	4825859	50 %	0 %	50 %	0 %	224586410
101589	NC_012125	ATTG	2	8	4825982	4825989	25 %	50 %	25 %	0 %	224586410
101590	NC_012125	TCG	2	6	4826019	4826024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586410
101591	NC_012125	TGT	2	6	4826095	4826100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586410
101592	NC_012125	ATG	2	6	4826116	4826121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586410
101593	NC_012125	TA	3	6	4826152	4826157	50 %	50 %	0 %	0 %	224586410
101594	NC_012125	AGTG	2	8	4826159	4826166	25 %	25 %	50 %	0 %	224586410
101595	NC_012125	TAT	2	6	4826236	4826241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586410
101596	NC_012125	GTA	2	6	4826273	4826278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586410
101597	NC_012125	CT	3	6	4826508	4826513	0 %	50 %	0 %	50 %	224586410
101598	NC_012125	GCC	2	6	4826534	4826539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586410
101599	NC_012125	TGT	2	6	4826577	4826582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586410
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101602	NC_012125	CCG	2	6	4826773	4826778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586410
101603	NC_012125	GC	3	6	4826827	4826832	0 %	0 %	50 %	50 %	224586410
101604	NC_012125	TCA	2	6	4826895	4826900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586410
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101606	NC_012125	TCCG	2	8	4827129	4827136	0 %	25 %	25 %	50 %	224586410
101607	NC_012125	TCA	2	6	4827141	4827146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586410
101608	NC_012125	A	6	6	4827186	4827191	100 %	0 %	0 %	0 %	224586410
101609	NC_012125	GCCA	2	8	4827311	4827318	25 %	0 %	25 %	50 %	224586410
101610	NC_012125	GTT	2	6	4827397	4827402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586410
101611	NC_012125	TTA	2	6	4827432	4827437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586410
101612	NC_012125	T	6	6	4827446	4827451	0 %	100 %	0 %	0 %	224586410
101613	NC_012125	T	6	6	4827468	4827473	0 %	100 %	0 %	0 %	224586410
101614	NC_012125	TTA	2	6	4827489	4827494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586410
101615	NC_012125	CTGC	2	8	4827523	4827530	0 %	25 %	25 %	50 %	224586410
101616	NC_012125	C	7	7	4827530	4827536	0 %	0 %	0 %	100 %	224586410
101617	NC_012125	TCA	2	6	4827576	4827581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586410
101618	NC_012125	GTAAAA	2	12	4827716	4827727	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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