MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_012125	AT	3	6	4748766	4748771	50 %	50 %	0 %	0 %	224586335
100003	NC_012125	AAG	2	6	4748852	4748857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586335
100004	NC_012125	CGT	2	6	4748875	4748880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586335
100005	NC_012125	TGC	2	6	4748894	4748899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586335
100006	NC_012125	TAT	2	6	4748904	4748909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586335
100007	NC_012125	CGG	2	6	4749046	4749051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586335
100008	NC_012125	TAA	2	6	4749242	4749247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100009	NC_012125	T	6	6	4749255	4749260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100010	NC_012125	GT	3	6	4749281	4749286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100011	NC_012125	AC	3	6	4749325	4749330	50 %	0 %	0 %	50 %	224586336
100012	NC_012125	G	7	7	4749343	4749349	0 %	0 %	100 %	0 %	224586336
100013	NC_012125	CGG	2	6	4749366	4749371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586336
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100015	NC_012125	CAA	2	6	4749416	4749421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586336
100016	NC_012125	CGG	2	6	4749484	4749489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586336
100017	NC_012125	ATT	2	6	4749579	4749584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586336
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100019	NC_012125	CTG	2	6	4749680	4749685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586336
100020	NC_012125	AAAG	2	8	4749721	4749728	75 %	0 %	25 %	0 %	224586336
100021	NC_012125	AGA	2	6	4749760	4749765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586336
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100042	NC_012125	GCC	2	6	4750986	4750991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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100054	NC_012125	GCC	2	6	4751680	4751685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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100059	NC_012125	GCG	2	6	4751744	4751749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100060	NC_012125	GGT	2	6	4751754	4751759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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100071	NC_012125	TTA	2	6	4752268	4752273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586338
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100101	NC_012125	GAT	2	6	4753421	4753426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100102	NC_012125	GTTG	2	8	4753429	4753436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100103	NC_012125	GTAT	2	8	4753504	4753511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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100105	NC_012125	A	6	6	4753604	4753609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100106	NC_012125	AAAT	2	8	4753661	4753668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100107	NC_012125	GTT	2	6	4753703	4753708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100108	NC_012125	A	6	6	4753709	4753714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100109	NC_012125	T	6	6	4753720	4753725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100110	NC_012125	GGTCA	2	10	4753780	4753789	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100111	NC_012125	TAA	2	6	4753837	4753842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100112	NC_012125	A	6	6	4753841	4753846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100113	NC_012125	AAT	2	6	4753849	4753854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100114	NC_012125	AATT	2	8	4753857	4753864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100115	NC_012125	ATTT	2	8	4753875	4753882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100116	NC_012125	TGA	2	6	4753890	4753895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100117	NC_012125	ATC	2	6	4753913	4753918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100119	NC_012125	AAT	2	6	4753939	4753944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100122	NC_012125	ATGG	2	8	4754037	4754044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100123	NC_012125	TA	3	6	4754093	4754098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100236	NC_012125	GCT	2	6	4759275	4759280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586344
100237	NC_012125	CTG	2	6	4759315	4759320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586344
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100337	NC_012125	TAAA	2	8	4764231	4764238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100338	NC_012125	ATATT	2	10	4764289	4764298	40 %	60 %	0 %	0 %	224586350
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100344	NC_012125	CA	3	6	4764481	4764486	50 %	0 %	0 %	50 %	224586351
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100349	NC_012125	CTG	2	6	4764645	4764650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586351
100350	NC_012125	CAG	2	6	4764672	4764677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586351
100351	NC_012125	GTT	2	6	4764749	4764754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586351
100352	NC_012125	GCG	2	6	4764778	4764783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586351
100353	NC_012125	CCCA	2	8	4764829	4764836	25 %	0 %	0 %	75 %	224586351
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