MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96001	NC_012125	ATT	2	6	4557601	4557606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96002	NC_012125	ATC	2	6	4557660	4557665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96003	NC_012125	TTCTG	2	10	4557678	4557687	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96004	NC_012125	A	6	6	4557952	4557957	100 %	0 %	0 %	0 %	224586150
96005	NC_012125	ACC	2	6	4557997	4558002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586150
96006	NC_012125	AAC	2	6	4558009	4558014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586150
96007	NC_012125	TCC	2	6	4558076	4558081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586151
96008	NC_012125	CAGA	2	8	4558192	4558199	50 %	0 %	25 %	25 %	224586151
96009	NC_012125	CAG	2	6	4558211	4558216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586151
96010	NC_012125	TGGT	2	8	4558242	4558249	0 %	50 %	50 %	0 %	224586151
96011	NC_012125	CATC	2	8	4558344	4558351	25 %	25 %	0 %	50 %	224586151
96012	NC_012125	CAG	2	6	4558364	4558369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586151
96013	NC_012125	CCG	2	6	4558377	4558382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586151
96014	NC_012125	TCA	2	6	4558446	4558451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586151
96015	NC_012125	TGA	2	6	4558452	4558457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586151
96016	NC_012125	GGC	2	6	4558535	4558540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586151
96017	NC_012125	TGTT	2	8	4558545	4558552	0 %	75 %	25 %	0 %	224586151
96018	NC_012125	TGA	2	6	4558567	4558572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586151
96019	NC_012125	CATCT	2	10	4558638	4558647	20 %	40 %	0 %	40 %	224586151
96020	NC_012125	GCT	2	6	4558648	4558653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586151
96021	NC_012125	GAA	2	6	4558673	4558678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586151
96022	NC_012125	CTG	2	6	4558871	4558876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586151
96023	NC_012125	AAAATC	2	12	4558882	4558893	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224586151
96024	NC_012125	A	7	7	4558924	4558930	100 %	0 %	0 %	0 %	224586151
96025	NC_012125	AGCGAA	2	12	4558969	4558980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	224586152
96026	NC_012125	AGA	2	6	4559178	4559183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586152
96027	NC_012125	CGG	2	6	4559225	4559230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586152
96028	NC_012125	GGC	2	6	4559290	4559295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586152
96029	NC_012125	AGG	2	6	4559337	4559342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586152
96030	NC_012125	TGG	2	6	4559483	4559488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586152
96031	NC_012125	GGC	2	6	4559529	4559534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586152
96032	NC_012125	GCTG	2	8	4559555	4559562	0 %	25 %	50 %	25 %	224586152
96033	NC_012125	TGA	3	9	4559574	4559582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586152
96034	NC_012125	AC	3	6	4559639	4559644	50 %	0 %	0 %	50 %	224586152
96035	NC_012125	G	6	6	4559723	4559728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96036	NC_012125	AGGG	2	8	4559739	4559746	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96037	NC_012125	AT	3	6	4559835	4559840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96038	NC_012125	TTA	2	6	4559987	4559992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586153
96039	NC_012125	AC	3	6	4560072	4560077	50 %	0 %	0 %	50 %	224586153
96040	NC_012125	GC	3	6	4560295	4560300	0 %	0 %	50 %	50 %	224586153
96041	NC_012125	CCA	2	6	4560310	4560315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586153
96042	NC_012125	CGCTT	2	10	4560365	4560374	0 %	40 %	20 %	40 %	224586153
96043	NC_012125	TCGC	2	8	4560395	4560402	0 %	25 %	25 %	50 %	224586153
96044	NC_012125	ATC	2	6	4560471	4560476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586153
96045	NC_012125	AAT	2	6	4560512	4560517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586153
96046	NC_012125	CT	3	6	4560523	4560528	0 %	50 %	0 %	50 %	224586153
96047	NC_012125	TCA	2	6	4560594	4560599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586153
96048	NC_012125	GAG	2	6	4560629	4560634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586153
96049	NC_012125	TCG	2	6	4560678	4560683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96050	NC_012125	CAG	2	6	4560776	4560781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96051	NC_012125	CGCTT	2	10	4560848	4560857	0 %	40 %	20 %	40 %	224586153
96052	NC_012125	GCC	2	6	4560879	4560884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586153
96053	NC_012125	GCA	2	6	4560951	4560956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96054	NC_012125	CTG	2	6	4561034	4561039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96055	NC_012125	GCTTC	2	10	4561162	4561171	0 %	40 %	20 %	40 %	224586153
96056	NC_012125	AAGC	2	8	4561195	4561202	50 %	0 %	25 %	25 %	224586153
96057	NC_012125	ACG	2	6	4561211	4561216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96058	NC_012125	TGC	2	6	4561220	4561225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96059	NC_012125	CCG	2	6	4561315	4561320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586153
96060	NC_012125	GAA	2	6	4561340	4561345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586153
96061	NC_012125	TCT	2	6	4561374	4561379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586153
96062	NC_012125	GGC	2	6	4561384	4561389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586153
96063	NC_012125	TTTA	2	8	4561391	4561398	25 %	75 %	0 %	0 %	224586153
96064	NC_012125	AGC	2	6	4561599	4561604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96065	NC_012125	CAG	2	6	4561616	4561621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96066	NC_012125	TCC	2	6	4561626	4561631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586153
96067	NC_012125	CA	3	6	4561638	4561643	50 %	0 %	0 %	50 %	224586153
96068	NC_012125	CAG	2	6	4561652	4561657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96069	NC_012125	TTA	2	6	4561659	4561664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586153
96070	NC_012125	GTA	2	6	4561672	4561677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586153
96071	NC_012125	GAT	2	6	4561692	4561697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586153
96072	NC_012125	CGT	2	6	4561719	4561724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586153
96073	NC_012125	ACA	2	6	4561765	4561770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586153
96074	NC_012125	AAT	2	6	4561823	4561828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586153
96075	NC_012125	CTGA	2	8	4561871	4561878	25 %	25 %	25 %	25 %	224586153
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96077	NC_012125	T	7	7	4561933	4561939	0 %	100 %	0 %	0 %	224586153
96078	NC_012125	GA	3	6	4562010	4562015	50 %	0 %	50 %	0 %	224586154
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96081	NC_012125	TC	3	6	4562130	4562135	0 %	50 %	0 %	50 %	224586154
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96083	NC_012125	AATT	2	8	4562421	4562428	50 %	50 %	0 %	0 %	224586154
96084	NC_012125	CAT	2	6	4562534	4562539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586154
96085	NC_012125	A	6	6	4562625	4562630	100 %	0 %	0 %	0 %	224586154
96086	NC_012125	GCA	2	6	4562669	4562674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586154
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96088	NC_012125	GCG	2	6	4562747	4562752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586154
96089	NC_012125	AAT	2	6	4562767	4562772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586154
96090	NC_012125	A	6	6	4562800	4562805	100 %	0 %	0 %	0 %	224586154
96091	NC_012125	CAT	2	6	4562829	4562834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586154
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96093	NC_012125	CTGG	2	8	4562922	4562929	0 %	25 %	50 %	25 %	224586154
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96096	NC_012125	AAAG	2	8	4563026	4563033	75 %	0 %	25 %	0 %	224586154
96097	NC_012125	GCTTG	2	10	4563050	4563059	0 %	40 %	40 %	20 %	224586154
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96101	NC_012125	TGT	2	6	4563202	4563207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586154
96102	NC_012125	TCT	2	6	4563247	4563252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586154
96103	NC_012125	T	6	6	4563258	4563263	0 %	100 %	0 %	0 %	224586154
96104	NC_012125	TA	3	6	4563308	4563313	50 %	50 %	0 %	0 %	224586155
96105	NC_012125	AAT	2	6	4563321	4563326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586155
96106	NC_012125	TCG	2	6	4563339	4563344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586155
96107	NC_012125	CA	3	6	4563396	4563401	50 %	0 %	0 %	50 %	224586155
96108	NC_012125	GCA	2	6	4563417	4563422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586155
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96111	NC_012125	TG	3	6	4563530	4563535	0 %	50 %	50 %	0 %	224586155
96112	NC_012125	GGC	2	6	4563576	4563581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586155
96113	NC_012125	TCAC	2	8	4563638	4563645	25 %	25 %	0 %	50 %	224586155
96114	NC_012125	CAT	2	6	4563730	4563735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586155
96115	NC_012125	TCA	2	6	4563827	4563832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586155
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96117	NC_012125	CGT	2	6	4563865	4563870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586155
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96473	NC_012125	AGT	2	6	4581269	4581274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586168
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