MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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90002	NC_012125	TGG	2	6	4267349	4267354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585897
90003	NC_012125	CAG	2	6	4267356	4267361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585897
90004	NC_012125	TCA	2	6	4267397	4267402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585897
90005	NC_012125	AGC	2	6	4267409	4267414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585897
90006	NC_012125	TTCC	2	8	4267439	4267446	0 %	50 %	0 %	50 %	224585897
90007	NC_012125	CTG	2	6	4267476	4267481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585897
90008	NC_012125	GGA	2	6	4267554	4267559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585897
90009	NC_012125	GCA	2	6	4267574	4267579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585897
90010	NC_012125	CG	3	6	4267581	4267586	0 %	0 %	50 %	50 %	224585897
90011	NC_012125	CAG	2	6	4267734	4267739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585897
90012	NC_012125	CG	3	6	4267752	4267757	0 %	0 %	50 %	50 %	224585897
90013	NC_012125	CG	3	6	4267760	4267765	0 %	0 %	50 %	50 %	224585897
90014	NC_012125	CGA	2	6	4267820	4267825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585897
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90032	NC_012125	A	7	7	4269015	4269021	100 %	0 %	0 %	0 %	224585898
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90035	NC_012125	GAG	2	6	4269125	4269130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90036	NC_012125	TG	3	6	4269212	4269217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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90039	NC_012125	TGAAT	2	10	4269281	4269290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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90041	NC_012125	GATG	2	8	4269347	4269354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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90054	NC_012125	ACTT	2	8	4269806	4269813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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90119	NC_012125	CTT	2	6	4272565	4272570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224585902
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90237	NC_012125	GTT	2	6	4278312	4278317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585907
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90354	NC_012125	GC	3	6	4283917	4283922	0 %	0 %	50 %	50 %	224585914
90355	NC_012125	GGCG	2	8	4283925	4283932	0 %	0 %	75 %	25 %	224585914
90356	NC_012125	CGT	2	6	4283940	4283945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585914
90357	NC_012125	GTG	2	6	4284058	4284063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585914
90358	NC_012125	GTG	2	6	4284099	4284104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585914
90359	NC_012125	AAT	2	6	4284109	4284114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585914
90360	NC_012125	CGG	2	6	4284126	4284131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585914
90361	NC_012125	CTG	3	9	4284148	4284156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585914
90362	NC_012125	GCGCA	2	10	4284193	4284202	20 %	0 %	40 %	40 %	224585914
90363	NC_012125	A	6	6	4284247	4284252	100 %	0 %	0 %	0 %	224585914
90364	NC_012125	ATC	2	6	4284257	4284262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585914
90365	NC_012125	CG	3	6	4284297	4284302	0 %	0 %	50 %	50 %	224585914
90366	NC_012125	GAG	2	6	4284352	4284357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585914
90367	NC_012125	CGT	2	6	4284364	4284369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585914
90368	NC_012125	GGGC	2	8	4284375	4284382	0 %	0 %	75 %	25 %	224585914
90369	NC_012125	TC	3	6	4284431	4284436	0 %	50 %	0 %	50 %	224585914
90370	NC_012125	CGC	2	6	4284438	4284443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585914
90371	NC_012125	CGC	2	6	4284467	4284472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585914
90372	NC_012125	CCG	2	6	4284485	4284490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585914
90373	NC_012125	GCAG	2	8	4284608	4284615	25 %	0 %	50 %	25 %	224585915
90374	NC_012125	GTC	2	6	4284625	4284630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90375	NC_012125	GGC	2	6	4284645	4284650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585915
90376	NC_012125	AGT	2	6	4284651	4284656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585915
90377	NC_012125	ATG	2	6	4284723	4284728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585915
90378	NC_012125	CCG	2	6	4284736	4284741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90379	NC_012125	ACC	2	6	4284750	4284755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585915
90380	NC_012125	CGC	2	6	4284828	4284833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90381	NC_012125	GCT	2	6	4284857	4284862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90382	NC_012125	CCG	2	6	4284865	4284870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90383	NC_012125	GCC	2	6	4284921	4284926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90384	NC_012125	CGG	2	6	4284935	4284940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585915
90385	NC_012125	CCG	2	6	4285006	4285011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90386	NC_012125	CAG	2	6	4285020	4285025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90387	NC_012125	GCC	2	6	4285035	4285040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90388	NC_012125	CG	4	8	4285049	4285056	0 %	0 %	50 %	50 %	224585915
90389	NC_012125	CGC	2	6	4285076	4285081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90390	NC_012125	TGA	2	6	4285094	4285099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585915
90391	NC_012125	GCA	2	6	4285136	4285141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90392	NC_012125	GC	3	6	4285246	4285251	0 %	0 %	50 %	50 %	224585915
90393	NC_012125	GGCG	2	8	4285253	4285260	0 %	0 %	75 %	25 %	224585915
90394	NC_012125	TGCC	2	8	4285328	4285335	0 %	25 %	25 %	50 %	224585915
90395	NC_012125	TGC	2	6	4285336	4285341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90396	NC_012125	TGC	2	6	4285345	4285350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90397	NC_012125	GGC	2	6	4285382	4285387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585915
90398	NC_012125	GC	3	6	4285513	4285518	0 %	0 %	50 %	50 %	224585915
90399	NC_012125	GAT	2	6	4285536	4285541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585915
90400	NC_012125	TCTG	2	8	4285543	4285550	0 %	50 %	25 %	25 %	224585915
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90405	NC_012125	GCA	2	6	4285829	4285834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90406	NC_012125	GGA	2	6	4285871	4285876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585915
90407	NC_012125	TGG	2	6	4285888	4285893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585915
90408	NC_012125	TGC	2	6	4285897	4285902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90409	NC_012125	CG	3	6	4286048	4286053	0 %	0 %	50 %	50 %	224585915
90410	NC_012125	GGCG	2	8	4286075	4286082	0 %	0 %	75 %	25 %	224585915
90411	NC_012125	TGG	2	6	4286083	4286088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585915
90412	NC_012125	GCC	2	6	4286092	4286097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
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90414	NC_012125	CG	3	6	4286133	4286138	0 %	0 %	50 %	50 %	224585915
90415	NC_012125	TGA	3	9	4286150	4286158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585915
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90417	NC_012125	ATG	2	6	4286212	4286217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585915
90418	NC_012125	GTG	2	6	4286223	4286228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585915
90419	NC_012125	GCCA	2	8	4286277	4286284	25 %	0 %	25 %	50 %	224585915
90420	NC_012125	GGCG	2	8	4286315	4286322	0 %	0 %	75 %	25 %	224585915
90421	NC_012125	A	6	6	4286365	4286370	100 %	0 %	0 %	0 %	224585915
90422	NC_012125	GCG	2	6	4286449	4286454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585915
90423	NC_012125	TC	3	6	4286462	4286467	0 %	50 %	0 %	50 %	224585915
90424	NC_012125	TCT	2	6	4286479	4286484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224585915
90425	NC_012125	TGG	2	6	4286542	4286547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585915
90426	NC_012125	GCA	2	6	4286558	4286563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90427	NC_012125	CG	3	6	4286584	4286589	0 %	0 %	50 %	50 %	224585915
90428	NC_012125	GAA	2	6	4286703	4286708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585915
90429	NC_012125	TGAA	2	8	4286746	4286753	50 %	25 %	25 %	0 %	224585915
90430	NC_012125	GC	3	6	4286835	4286840	0 %	0 %	50 %	50 %	224585915
90431	NC_012125	GGC	2	6	4286876	4286881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585915
90432	NC_012125	GCT	2	6	4286882	4286887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585915
90433	NC_012125	CCG	2	6	4286977	4286982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585915
90434	NC_012125	TAA	2	6	4287024	4287029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585915
90435	NC_012125	TCA	2	6	4287072	4287077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90436	NC_012125	CATC	2	8	4287177	4287184	25 %	25 %	0 %	50 %	224585916
90437	NC_012125	AGA	2	6	4287239	4287244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585916
90438	NC_012125	GTA	2	6	4287247	4287252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585916
90439	NC_012125	GAT	2	6	4287360	4287365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585916
90440	NC_012125	AAT	2	6	4287373	4287378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585916
90441	NC_012125	T	6	6	4287392	4287397	0 %	100 %	0 %	0 %	224585916
90442	NC_012125	AAT	2	6	4287430	4287435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585916
90443	NC_012125	ATA	2	6	4287473	4287478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585916
90444	NC_012125	AAT	2	6	4287487	4287492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585916
90445	NC_012125	CTT	2	6	4287513	4287518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224585916
90446	NC_012125	GTG	2	6	4287539	4287544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585916
90447	NC_012125	CGC	2	6	4287691	4287696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585916
90448	NC_012125	AAT	2	6	4287709	4287714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585916
90449	NC_012125	GAG	2	6	4287716	4287721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585916
90450	NC_012125	GCC	2	6	4287822	4287827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585916
90451	NC_012125	ATG	2	6	4287893	4287898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585916
90452	NC_012125	CAA	2	6	4287903	4287908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585916
90453	NC_012125	CCAT	2	8	4287948	4287955	25 %	25 %	0 %	50 %	224585916
90454	NC_012125	CAG	2	6	4288013	4288018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585917
90455	NC_012125	TAA	2	6	4288037	4288042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585917
90456	NC_012125	CGC	2	6	4288068	4288073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585917
90457	NC_012125	GCA	2	6	4288085	4288090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585917
90458	NC_012125	CAG	2	6	4288149	4288154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585917
90459	NC_012125	GAA	2	6	4288290	4288295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585917
90460	NC_012125	AATA	2	8	4288298	4288305	75 %	25 %	0 %	0 %	224585917
90461	NC_012125	AAT	2	6	4288330	4288335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585917
90462	NC_012125	CGA	2	6	4288337	4288342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585917
90463	NC_012125	TGA	2	6	4288374	4288379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585917
90464	NC_012125	T	6	6	4288413	4288418	0 %	100 %	0 %	0 %	224585917
90465	NC_012125	TAG	2	6	4288428	4288433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585917
90466	NC_012125	ATT	2	6	4288465	4288470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585917
90467	NC_012125	TA	3	6	4288473	4288478	50 %	50 %	0 %	0 %	224585917
90468	NC_012125	TA	3	6	4288489	4288494	50 %	50 %	0 %	0 %	224585917
90469	NC_012125	GAT	2	6	4288515	4288520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585917
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