MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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89002	NC_012125	TAA	2	6	4222145	4222150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585848
89003	NC_012125	AGC	2	6	4222158	4222163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585848
89004	NC_012125	AG	3	6	4222171	4222176	50 %	0 %	50 %	0 %	224585848
89005	NC_012125	GCC	3	9	4222198	4222206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585848
89006	NC_012125	TCG	2	6	4222300	4222305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585848
89007	NC_012125	ATT	2	6	4222353	4222358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585848
89008	NC_012125	CAAT	2	8	4222363	4222370	50 %	25 %	0 %	25 %	224585848
89009	NC_012125	TGA	2	6	4222446	4222451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585848
89010	NC_012125	GTT	2	6	4222472	4222477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585848
89011	NC_012125	T	8	8	4222485	4222492	0 %	100 %	0 %	0 %	224585848
89012	NC_012125	TCA	2	6	4222517	4222522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585848
89013	NC_012125	ATA	2	6	4222531	4222536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585848
89014	NC_012125	TGA	2	6	4222539	4222544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585848
89015	NC_012125	ATA	2	6	4222578	4222583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89016	NC_012125	A	8	8	4222613	4222620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89017	NC_012125	ATT	2	6	4222632	4222637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89018	NC_012125	A	6	6	4222644	4222649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89019	NC_012125	TATCAA	2	12	4222681	4222692	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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89021	NC_012125	TGA	2	6	4222810	4222815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585849
89022	NC_012125	AAT	2	6	4222817	4222822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585849
89023	NC_012125	GCC	2	6	4222844	4222849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585849
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89028	NC_012125	TAA	2	6	4223044	4223049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585849
89029	NC_012125	A	6	6	4223108	4223113	100 %	0 %	0 %	0 %	224585849
89030	NC_012125	AG	3	6	4223128	4223133	50 %	0 %	50 %	0 %	224585849
89031	NC_012125	GCC	2	6	4223204	4223209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585849
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89035	NC_012125	GGC	2	6	4223439	4223444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585849
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89051	NC_012125	TTC	2	6	4223947	4223952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89052	NC_012125	AG	3	6	4223997	4224002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89053	NC_012125	TTA	2	6	4224003	4224008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89054	NC_012125	GGC	2	6	4224145	4224150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89055	NC_012125	TCA	2	6	4224158	4224163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89056	NC_012125	TTAA	2	8	4224200	4224207	50 %	50 %	0 %	0 %	224585850
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89079	NC_012125	GC	3	6	4224934	4224939	0 %	0 %	50 %	50 %	224585851
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89089	NC_012125	TCGT	2	8	4225253	4225260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89090	NC_012125	GCGCG	2	10	4225361	4225370	0 %	0 %	60 %	40 %	224585852
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89111	NC_012125	CCAG	2	8	4226269	4226276	25 %	0 %	25 %	50 %	224585854
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89116	NC_012125	GC	3	6	4226707	4226712	0 %	0 %	50 %	50 %	224585854
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89470	NC_012125	CGT	2	6	4242718	4242723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585872
89471	NC_012125	CCA	2	6	4242727	4242732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585872
89472	NC_012125	GAG	2	6	4242755	4242760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585872
89473	NC_012125	TCA	3	9	4242789	4242797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585872
89474	NC_012125	TCA	2	6	4242848	4242853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89475	NC_012125	GTT	2	6	4242878	4242883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89476	NC_012125	TC	3	6	4242926	4242931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89477	NC_012125	GCT	2	6	4242983	4242988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585873
89478	NC_012125	T	6	6	4243015	4243020	0 %	100 %	0 %	0 %	224585873
89479	NC_012125	GTT	2	6	4243037	4243042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585873
89480	NC_012125	GC	3	6	4243086	4243091	0 %	0 %	50 %	50 %	224585873
89481	NC_012125	CAG	2	6	4243136	4243141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585873
89482	NC_012125	AGGCA	2	10	4243161	4243170	40 %	0 %	40 %	20 %	224585873
89483	NC_012125	CCT	2	6	4243178	4243183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585873
89484	NC_012125	TGA	2	6	4243237	4243242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585873
89485	NC_012125	GC	3	6	4243252	4243257	0 %	0 %	50 %	50 %	224585873
89486	NC_012125	A	6	6	4243266	4243271	100 %	0 %	0 %	0 %	224585873
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89489	NC_012125	A	6	6	4243416	4243421	100 %	0 %	0 %	0 %	224585873
89490	NC_012125	ATT	2	6	4243435	4243440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585873
89491	NC_012125	AGT	2	6	4243442	4243447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585873
89492	NC_012125	AAC	2	6	4243467	4243472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585873
89493	NC_012125	ATG	2	6	4243515	4243520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89494	NC_012125	T	8	8	4243526	4243533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89495	NC_012125	TTA	2	6	4243554	4243559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89496	NC_012125	TAC	2	6	4243585	4243590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89497	NC_012125	AGA	2	6	4243595	4243600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89498	NC_012125	GGC	2	6	4243647	4243652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585874
89499	NC_012125	GTG	2	6	4243704	4243709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585874
89500	NC_012125	GGC	2	6	4243734	4243739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585874

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