MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83003	NC_012125	GCG	2	6	3940504	3940509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585600
83004	NC_012125	GCC	2	6	3940538	3940543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585600
83005	NC_012125	CAC	2	6	3940545	3940550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585600
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83008	NC_012125	TTCCG	2	10	3940675	3940684	0 %	40 %	20 %	40 %	224585600
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83118	NC_012125	CTTTGG	2	12	3946002	3946013	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	224585609
83119	NC_012125	CAT	2	6	3946131	3946136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83120	NC_012125	T	8	8	3946239	3946246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83121	NC_012125	TCA	2	6	3946361	3946366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83122	NC_012125	ATGA	2	8	3946389	3946396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83123	NC_012125	TGA	2	6	3946398	3946403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83124	NC_012125	A	6	6	3946405	3946410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83125	NC_012125	ATA	2	6	3946427	3946432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83126	NC_012125	TTA	2	6	3946448	3946453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83127	NC_012125	GTT	2	6	3946458	3946463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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83130	NC_012125	GAT	2	6	3946528	3946533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585610
83131	NC_012125	CCG	2	6	3946593	3946598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585610
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83153	NC_012125	CATCG	2	10	3947625	3947634	20 %	20 %	20 %	40 %	224585611
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83158	NC_012125	GCG	2	6	3947936	3947941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585611
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83160	NC_012125	CCGC	2	8	3948120	3948127	0 %	0 %	25 %	75 %	224585612
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83221	NC_012125	CAG	2	6	3950226	3950231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
83222	NC_012125	GCCATC	2	12	3950232	3950243	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	224585614
83223	NC_012125	CCG	2	6	3950248	3950253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585614
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83226	NC_012125	GTG	2	6	3950310	3950315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585614
83227	NC_012125	CAG	2	6	3950330	3950335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
83228	NC_012125	CAG	3	9	3950390	3950398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
83229	NC_012125	TGC	2	6	3950458	3950463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585614
83230	NC_012125	GCA	2	6	3950491	3950496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
83231	NC_012125	CAG	2	6	3950504	3950509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
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83233	NC_012125	GGC	2	6	3950522	3950527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585614
83234	NC_012125	CAG	2	6	3950531	3950536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
83235	NC_012125	GTT	2	6	3950540	3950545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585614
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83238	NC_012125	GTT	2	6	3950579	3950584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585614
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83242	NC_012125	CAG	2	6	3950741	3950746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
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83244	NC_012125	GC	3	6	3950799	3950804	0 %	0 %	50 %	50 %	224585614
83245	NC_012125	GCA	2	6	3950827	3950832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
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83249	NC_012125	GCC	2	6	3950894	3950899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585614
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83258	NC_012125	CGG	2	6	3951083	3951088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585614
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83260	NC_012125	CGA	2	6	3951241	3951246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
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83262	NC_012125	ACCGCC	2	12	3951273	3951284	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	224585614
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83265	NC_012125	CAG	3	9	3951314	3951322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585614
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83282	NC_012125	CGT	2	6	3951825	3951830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585615
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83294	NC_012125	CAG	2	6	3952188	3952193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585616
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83296	NC_012125	GCCA	2	8	3952222	3952229	25 %	0 %	25 %	50 %	224585616
83297	NC_012125	A	6	6	3952233	3952238	100 %	0 %	0 %	0 %	224585616
83298	NC_012125	A	6	6	3952258	3952263	100 %	0 %	0 %	0 %	224585616
83299	NC_012125	GCG	2	6	3952331	3952336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585617
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83302	NC_012125	CTG	2	6	3952451	3952456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585617
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83310	NC_012125	CACC	2	8	3952655	3952662	25 %	0 %	0 %	75 %	224585617
83311	NC_012125	CGC	2	6	3952688	3952693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585617
83312	NC_012125	CGC	2	6	3952742	3952747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585617
83313	NC_012125	CGC	2	6	3952793	3952798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585617
83314	NC_012125	CGC	2	6	3952808	3952813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585617
83315	NC_012125	GCC	2	6	3952836	3952841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585617
83316	NC_012125	CTG	2	6	3952877	3952882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585617
83317	NC_012125	CCG	2	6	3952888	3952893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585617
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83319	NC_012125	GCCG	2	8	3952940	3952947	0 %	0 %	50 %	50 %	224585617
83320	NC_012125	GCCA	2	8	3952950	3952957	25 %	0 %	25 %	50 %	224585617
83321	NC_012125	GCG	2	6	3952993	3952998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585617
83322	NC_012125	TGA	2	6	3953007	3953012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585617
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83324	NC_012125	CCT	2	6	3953040	3953045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83325	NC_012125	CGT	2	6	3953063	3953068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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83329	NC_012125	GCA	2	6	3953242	3953247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83330	NC_012125	CAG	2	6	3953258	3953263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83331	NC_012125	CGC	3	9	3953266	3953274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585618
83332	NC_012125	GGCC	2	8	3953281	3953288	0 %	0 %	50 %	50 %	224585618
83333	NC_012125	CGGCG	2	10	3953303	3953312	0 %	0 %	60 %	40 %	224585618
83334	NC_012125	AGC	3	9	3953337	3953345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585618
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83336	NC_012125	CCA	2	6	3953395	3953400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585618
83337	NC_012125	CAT	2	6	3953411	3953416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585618
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83339	NC_012125	GCA	3	9	3953485	3953493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83340	NC_012125	GCT	2	6	3953497	3953502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83341	NC_012125	GTC	2	6	3953522	3953527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83342	NC_012125	CAG	2	6	3953549	3953554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83343	NC_012125	CAG	2	6	3953561	3953566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83344	NC_012125	CGC	2	6	3953567	3953572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585618
83345	NC_012125	CAG	2	6	3953603	3953608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585618
83346	NC_012125	CTGCGG	2	12	3953609	3953620	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	224585618
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83348	NC_012125	GAA	2	6	3953657	3953662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585618
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83467	NC_012125	CAC	2	6	3958516	3958521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585622
83468	NC_012125	GCGCC	2	10	3958539	3958548	0 %	0 %	40 %	60 %	224585622
83469	NC_012125	CG	4	8	3958597	3958604	0 %	0 %	50 %	50 %	224585622
83470	NC_012125	T	6	6	3958683	3958688	0 %	100 %	0 %	0 %	224585622
83471	NC_012125	CGC	2	6	3958758	3958763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585622
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83473	NC_012125	CGC	2	6	3958831	3958836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585622
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83487	NC_012125	CGC	2	6	3959420	3959425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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83490	NC_012125	CCGT	2	8	3959529	3959536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83491	NC_012125	GCG	2	6	3959643	3959648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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83493	NC_012125	TCA	2	6	3959718	3959723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83494	NC_012125	GCT	2	6	3959741	3959746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83495	NC_012125	TTTC	2	8	3959800	3959807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83496	NC_012125	GCG	2	6	3959808	3959813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83497	NC_012125	GCCGC	2	10	3959824	3959833	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83498	NC_012125	CATCG	2	10	3959858	3959867	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83499	NC_012125	GC	3	6	3959912	3959917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83500	NC_012125	G	6	6	3960048	3960053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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