MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

Total Repeats: 45632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011900	ATG	2	6	244008	244013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011900	CA	3	6	244091	244096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_011900	CTAA	2	8	244121	244128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_011900	CAA	2	6	244174	244179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_011900	TTA	2	6	244224	244229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011900	AATAG	2	10	244242	244251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011900	AAAT	2	8	244259	244266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011900	AAAC	2	8	244272	244279	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_011900	A	6	6	244305	244310	100 %	0 %	0 %	0 %	221231172
5010	NC_011900	ACA	2	6	244352	244357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231172
5011	NC_011900	ACT	2	6	244358	244363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231172
5012	NC_011900	TAC	2	6	244376	244381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231172
5013	NC_011900	TGGA	2	8	244436	244443	25 %	25 %	50 %	0 %	221231172
5014	NC_011900	GCAAGA	2	12	244444	244455	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	221231172
5015	NC_011900	TATCAC	2	12	244462	244473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231172
5016	NC_011900	CTG	2	6	244476	244481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231172
5017	NC_011900	ACA	2	6	244484	244489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231172
5018	NC_011900	CAT	2	6	244516	244521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231172
5019	NC_011900	AC	3	6	244524	244529	50 %	0 %	0 %	50 %	221231172
5020	NC_011900	CGTAT	2	10	244670	244679	20 %	40 %	20 %	20 %	221231172
5021	NC_011900	CAA	2	6	244684	244689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231172
5022	NC_011900	CCCA	2	8	244758	244765	25 %	0 %	0 %	75 %	221231172
5023	NC_011900	ATC	2	6	244805	244810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231172
5024	NC_011900	ACGA	2	8	244841	244848	50 %	0 %	25 %	25 %	221231172
5025	NC_011900	GAA	2	6	244868	244873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5026	NC_011900	GAA	2	6	244949	244954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5027	NC_011900	TGA	3	9	244956	244964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231172
5028	NC_011900	GAA	2	6	244979	244984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5029	NC_011900	GAA	2	6	244994	244999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5030	NC_011900	TTC	2	6	245039	245044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231172
5031	NC_011900	TG	3	6	245052	245057	0 %	50 %	50 %	0 %	221231172
5032	NC_011900	GAA	3	9	245168	245176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5033	NC_011900	TGAC	2	8	245229	245236	25 %	25 %	25 %	25 %	221231172
5034	NC_011900	TTC	2	6	245258	245263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231172
5035	NC_011900	TTC	2	6	245280	245285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231172
5036	NC_011900	GCT	2	6	245402	245407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231172
5037	NC_011900	TAC	2	6	245425	245430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231172
5038	NC_011900	ATC	2	6	245465	245470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231172
5039	NC_011900	TCAA	2	8	245477	245484	50 %	25 %	0 %	25 %	221231172
5040	NC_011900	CAAGA	2	10	245537	245546	60 %	0 %	20 %	20 %	221231172
5041	NC_011900	GAA	2	6	245573	245578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5042	NC_011900	AAAC	2	8	245598	245605	75 %	0 %	0 %	25 %	221231172
5043	NC_011900	TTG	2	6	245661	245666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231172
5044	NC_011900	CGT	2	6	245675	245680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231172
5045	NC_011900	TTC	2	6	245762	245767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231172
5046	NC_011900	TGG	2	6	245779	245784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221231172
5047	NC_011900	GAA	2	6	245828	245833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5048	NC_011900	ATTCGA	2	12	245842	245853	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221231172
5049	NC_011900	TCG	2	6	245862	245867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231172
5050	NC_011900	GTG	2	6	245868	245873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221231172
5051	NC_011900	AAGCT	2	10	245967	245976	40 %	20 %	20 %	20 %	221231172
5052	NC_011900	GCT	2	6	246053	246058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231172
5053	NC_011900	ATG	2	6	246089	246094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231172
5054	NC_011900	AGA	2	6	246115	246120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5055	NC_011900	TCG	2	6	246154	246159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231172
5056	NC_011900	TCGT	2	8	246201	246208	0 %	50 %	25 %	25 %	221231172
5057	NC_011900	TTC	2	6	246249	246254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231172
5058	NC_011900	ATG	2	6	246284	246289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231172
5059	NC_011900	AAG	2	6	246327	246332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231172
5060	NC_011900	GAAG	2	8	246380	246387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011900	TAG	2	6	246440	246445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011900	AAT	2	6	246449	246454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011900	AATG	2	8	246463	246470	50 %	25 %	25 %	0 %	221231173
5064	NC_011900	TGA	2	6	246490	246495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231173
5065	NC_011900	CTG	2	6	246511	246516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5066	NC_011900	AAG	2	6	246645	246650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5067	NC_011900	GAA	2	6	246660	246665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5068	NC_011900	TAT	2	6	246744	246749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221231173
5069	NC_011900	AG	3	6	246750	246755	50 %	0 %	50 %	0 %	221231173
5070	NC_011900	T	6	6	246757	246762	0 %	100 %	0 %	0 %	221231173
5071	NC_011900	GGA	2	6	246824	246829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221231173
5072	NC_011900	ATC	2	6	246886	246891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231173
5073	NC_011900	AAC	2	6	246907	246912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231173
5074	NC_011900	GAA	2	6	246953	246958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5075	NC_011900	CCT	2	6	247071	247076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231173
5076	NC_011900	A	6	6	247113	247118	100 %	0 %	0 %	0 %	221231173
5077	NC_011900	GAC	2	6	247172	247177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5078	NC_011900	GGA	2	6	247178	247183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221231173
5079	NC_011900	GTT	2	6	247206	247211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231173
5080	NC_011900	GTT	2	6	247434	247439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231173
5081	NC_011900	AGA	2	6	247535	247540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5082	NC_011900	GCT	2	6	247554	247559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5083	NC_011900	GGC	2	6	247628	247633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221231173
5084	NC_011900	TATGG	2	10	247659	247668	20 %	40 %	40 %	0 %	221231173
5085	NC_011900	GGA	2	6	247682	247687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221231173
5086	NC_011900	ACG	2	6	247761	247766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5087	NC_011900	TGA	2	6	247844	247849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231173
5088	NC_011900	TAC	2	6	247883	247888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231173
5089	NC_011900	GAT	2	6	247908	247913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231173
5090	NC_011900	A	6	6	247919	247924	100 %	0 %	0 %	0 %	221231173
5091	NC_011900	CAC	2	6	248166	248171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231173
5092	NC_011900	CTAG	2	8	248256	248263	25 %	25 %	25 %	25 %	221231173
5093	NC_011900	TTGAT	2	10	248272	248281	20 %	60 %	20 %	0 %	221231173
5094	NC_011900	A	6	6	248298	248303	100 %	0 %	0 %	0 %	221231173
5095	NC_011900	A	6	6	248351	248356	100 %	0 %	0 %	0 %	221231173
5096	NC_011900	GCG	2	6	248514	248519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221231173
5097	NC_011900	TAT	2	6	248535	248540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221231173
5098	NC_011900	CTAT	2	8	248566	248573	25 %	50 %	0 %	25 %	221231173
5099	NC_011900	GGA	2	6	248609	248614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221231173
5100	NC_011900	GAA	2	6	248706	248711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5101	NC_011900	GAT	2	6	248756	248761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231173
5102	NC_011900	CTC	2	6	248800	248805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231173
5103	NC_011900	CTT	2	6	248855	248860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231173
5104	NC_011900	GAA	2	6	248976	248981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5105	NC_011900	AAG	2	6	249003	249008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5106	NC_011900	TTGG	2	8	249153	249160	0 %	50 %	50 %	0 %	221231173
5107	NC_011900	CT	4	8	249223	249230	0 %	50 %	0 %	50 %	221231173
5108	NC_011900	GTCAGT	2	12	249247	249258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221231173
5109	NC_011900	CCTT	2	8	249373	249380	0 %	50 %	0 %	50 %	221231173
5110	NC_011900	GAA	2	6	249474	249479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5111	NC_011900	GCT	2	6	249513	249518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5112	NC_011900	ACA	2	6	249632	249637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231173
5113	NC_011900	G	6	6	249641	249646	0 %	0 %	100 %	0 %	221231173
5114	NC_011900	GTT	2	6	249651	249656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231173
5115	NC_011900	CAG	2	6	249703	249708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5116	NC_011900	TGACG	2	10	249710	249719	20 %	20 %	40 %	20 %	221231173
5117	NC_011900	CACT	2	8	249734	249741	25 %	25 %	0 %	50 %	221231173
5118	NC_011900	ATG	2	6	249793	249798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231173
5119	NC_011900	GAT	2	6	249861	249866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231173
5120	NC_011900	CT	3	6	249880	249885	0 %	50 %	0 %	50 %	221231173
5121	NC_011900	CGA	2	6	250003	250008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5122	NC_011900	CAAG	2	8	250085	250092	50 %	0 %	25 %	25 %	221231173
5123	NC_011900	GAC	2	6	250128	250133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231173
5124	NC_011900	CATG	2	8	250148	250155	25 %	25 %	25 %	25 %	221231173
5125	NC_011900	AGA	2	6	250226	250231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5126	NC_011900	ATG	2	6	250347	250352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231173
5127	NC_011900	TAC	2	6	250395	250400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231173
5128	NC_011900	GAA	2	6	250482	250487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5129	NC_011900	GAA	2	6	250502	250507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231173
5130	NC_011900	TCA	2	6	250627	250632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231173
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5132	NC_011900	ATGG	2	8	250668	250675	25 %	25 %	50 %	0 %	221231173
5133	NC_011900	GA	3	6	250681	250686	50 %	0 %	50 %	0 %	221231173
5134	NC_011900	TC	3	6	250730	250735	0 %	50 %	0 %	50 %	221231173
5135	NC_011900	GTG	2	6	250756	250761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221231173
5136	NC_011900	TCA	2	6	250767	250772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231173
5137	NC_011900	GATG	2	8	250787	250794	25 %	25 %	50 %	0 %	221231173
5138	NC_011900	GTTT	2	8	250837	250844	0 %	75 %	25 %	0 %	221231173
5139	NC_011900	GTT	2	6	250850	250855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231173
5140	NC_011900	A	6	6	250858	250863	100 %	0 %	0 %	0 %	221231173
5141	NC_011900	A	7	7	250894	250900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_011900	CTTT	2	8	250930	250937	0 %	75 %	0 %	25 %	221231174
5143	NC_011900	T	6	6	250935	250940	0 %	100 %	0 %	0 %	221231174
5144	NC_011900	T	6	6	250965	250970	0 %	100 %	0 %	0 %	221231174
5145	NC_011900	TGA	2	6	251018	251023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231174
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5152	NC_011900	AGTTGA	2	12	251760	251771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231174
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5154	NC_011900	T	6	6	251831	251836	0 %	100 %	0 %	0 %	221231174
5155	NC_011900	TGA	2	6	251840	251845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231174
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5166	NC_011900	T	7	7	252213	252219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_011900	ATA	2	6	252239	252244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_011900	ATC	2	6	252294	252299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5170	NC_011900	CTT	2	6	252343	252348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5171	NC_011900	T	6	6	252347	252352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_011900	GTA	2	6	252380	252385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231175
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5176	NC_011900	ATT	2	6	252715	252720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5178	NC_011900	ATC	2	6	252776	252781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5227	NC_011900	AGG	2	6	255791	255796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5243	NC_011900	GTTTG	2	10	256741	256750	0 %	60 %	40 %	0 %	221231180
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5372	NC_011900	TAA	3	9	262227	262235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231185
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5374	NC_011900	T	7	7	262269	262275	0 %	100 %	0 %	0 %	221231185
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5383	NC_011900	CAAA	2	8	262462	262469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5384	NC_011900	TAT	2	6	262505	262510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5410	NC_011900	TCATG	2	10	263895	263904	20 %	40 %	20 %	20 %	221231186
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5494	NC_011900	A	6	6	268094	268099	100 %	0 %	0 %	0 %	221231191
5495	NC_011900	CGC	2	6	268151	268156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221231191
5496	NC_011900	AAGC	2	8	268214	268221	50 %	0 %	25 %	25 %	221231191
5497	NC_011900	GTGGA	2	10	268293	268302	20 %	20 %	60 %	0 %	221231191
5498	NC_011900	GA	3	6	268405	268410	50 %	0 %	50 %	0 %	221231191
5499	NC_011900	TGAT	2	8	268431	268438	25 %	50 %	25 %	0 %	221231191
5500	NC_011900	GGA	2	6	268456	268461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221231191

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