MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS223 chromosome

Total Repeats: 90436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011663	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011663	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011663	GAT	2	6	54	59	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011663	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971217
5	NC_011663	CAG	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971217
6	NC_011663	ATGG	2	8	173	180	25 %	25 %	50 %	0 %	217971217
7	NC_011663	GTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971217
8	NC_011663	ACG	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971217
9	NC_011663	AGCCG	2	10	418	427	20 %	0 %	40 %	40 %	217971217
10	NC_011663	GCG	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971217
11	NC_011663	GGT	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971217
12	NC_011663	ATT	2	6	562	567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971217
13	NC_011663	TTG	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971217
14	NC_011663	AAT	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971217
15	NC_011663	GAA	2	6	719	724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971217
16	NC_011663	TAC	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971217
17	NC_011663	GAT	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971217
18	NC_011663	T	6	6	776	781	0 %	100 %	0 %	0 %	217971217
19	NC_011663	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971217
20	NC_011663	TTC	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971217
21	NC_011663	AAT	2	6	850	855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971217
22	NC_011663	TTGG	2	8	918	925	0 %	50 %	50 %	0 %	217971217
23	NC_011663	CCA	2	6	947	952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971217
24	NC_011663	AG	3	6	994	999	50 %	0 %	50 %	0 %	217971217
25	NC_011663	CTT	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971217
26	NC_011663	CGTG	2	8	1057	1064	0 %	25 %	50 %	25 %	217971217
27	NC_011663	GCC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971217
28	NC_011663	TAC	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971217
29	NC_011663	TGT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971217
30	NC_011663	CG	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	217971217
31	NC_011663	TAAC	2	8	1311	1318	50 %	25 %	0 %	25 %	217971217
32	NC_011663	TGG	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971217
33	NC_011663	CAC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971217
34	NC_011663	AG	3	6	1408	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	217971217
35	NC_011663	AGA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971217
36	NC_011663	TCT	2	6	1457	1462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971217
37	NC_011663	GT	3	6	1533	1538	0 %	50 %	50 %	0 %	217971218
38	NC_011663	CCT	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217971218
39	NC_011663	AAGT	2	8	1591	1598	50 %	25 %	25 %	0 %	217971218
40	NC_011663	TCAC	2	8	1601	1608	25 %	25 %	0 %	50 %	217971218
41	NC_011663	GAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971218
42	NC_011663	TAC	2	6	1685	1690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971218
43	NC_011663	GCT	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971218
44	NC_011663	AAC	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971218
45	NC_011663	ATA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971218
46	NC_011663	TGC	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971218
47	NC_011663	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971218
48	NC_011663	TTA	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971218
49	NC_011663	GC	3	6	1985	1990	0 %	0 %	50 %	50 %	217971218
50	NC_011663	CGAC	2	8	1996	2003	25 %	0 %	25 %	50 %	217971218
51	NC_011663	AAGC	2	8	2274	2281	50 %	0 %	25 %	25 %	217971218
52	NC_011663	GTG	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971218
53	NC_011663	GAA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971218
54	NC_011663	ATC	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971218
55	NC_011663	ACA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971218
56	NC_011663	CAA	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971218
57	NC_011663	GAT	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971218
58	NC_011663	GAA	2	6	2544	2549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971218
59	NC_011663	ATGT	2	8	2556	2563	25 %	50 %	25 %	0 %	217971218
60	NC_011663	TTACC	2	10	2597	2606	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_011663	CGG	2	6	2646	2651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011663	GCA	2	6	2667	2672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011663	TAGCCT	2	12	2700	2711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011663	TATT	2	8	2912	2919	25 %	75 %	0 %	0 %	217971219
65	NC_011663	TAA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971219
66	NC_011663	CGA	3	9	2975	2983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971219
67	NC_011663	GC	3	6	3015	3020	0 %	0 %	50 %	50 %	217971219
68	NC_011663	GTG	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971219
69	NC_011663	CCG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971219
70	NC_011663	CGC	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971219
71	NC_011663	CG	3	6	3448	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	217971219
72	NC_011663	ACT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971219
73	NC_011663	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971219
74	NC_011663	ACA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971219
75	NC_011663	GAT	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971219
76	NC_011663	TCCG	2	8	3698	3705	0 %	25 %	25 %	50 %	217971219
77	NC_011663	CTG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971219
78	NC_011663	AC	3	6	3809	3814	50 %	0 %	0 %	50 %	217971219
79	NC_011663	GA	3	6	3875	3880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011663	ATA	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971220
81	NC_011663	TTC	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971220
82	NC_011663	CGA	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971220
83	NC_011663	CAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971220
84	NC_011663	AGT	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971220
85	NC_011663	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971220
86	NC_011663	GCA	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971220
87	NC_011663	CGG	2	6	4188	4193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971220
88	NC_011663	CGA	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971220
89	NC_011663	TCG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971220
90	NC_011663	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971220
91	NC_011663	ACA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971220
92	NC_011663	GAAT	2	8	4521	4528	50 %	25 %	25 %	0 %	217971220
93	NC_011663	TCG	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971220
94	NC_011663	ATT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971220
95	NC_011663	TAA	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971220
96	NC_011663	CAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971220
97	NC_011663	CAA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971220
98	NC_011663	TGG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971220
99	NC_011663	CGA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971220
100	NC_011663	AGTGA	2	10	4915	4924	40 %	20 %	40 %	0 %	217971220
101	NC_011663	CTG	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971220
102	NC_011663	TTG	2	6	5000	5005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971220
103	NC_011663	GCCCGT	2	12	5023	5034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	217971220
104	NC_011663	GCG	2	6	5038	5043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971220
105	NC_011663	CGT	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971220
106	NC_011663	GGT	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971220
107	NC_011663	CTG	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971220
108	NC_011663	TGT	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971220
109	NC_011663	AAG	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971220
110	NC_011663	CGA	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971220
111	NC_011663	CAT	4	12	5364	5375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971220
112	NC_011663	CTT	3	9	5424	5432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971220
113	NC_011663	CCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971220
114	NC_011663	GCAA	2	8	5507	5514	50 %	0 %	25 %	25 %	217971220
115	NC_011663	TTG	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971220
116	NC_011663	ACC	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971220
117	NC_011663	TGG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971220
118	NC_011663	CTG	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971220
119	NC_011663	ACTA	2	8	5905	5912	50 %	25 %	0 %	25 %	217971220
120	NC_011663	CTT	2	6	5928	5933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971220
121	NC_011663	GCG	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971220
122	NC_011663	GAA	2	6	5992	5997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971220
123	NC_011663	GGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971220
124	NC_011663	AAG	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971220
125	NC_011663	TGA	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971220
126	NC_011663	GTT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971220
127	NC_011663	TCG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971220
128	NC_011663	T	6	6	6391	6396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011663	GCA	2	6	6443	6448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971221
130	NC_011663	TGC	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971221
131	NC_011663	CAT	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971221
132	NC_011663	CG	3	6	6730	6735	0 %	0 %	50 %	50 %	217971221
133	NC_011663	AGT	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971221
134	NC_011663	TTGT	2	8	7080	7087	0 %	75 %	25 %	0 %	217971221
135	NC_011663	CTA	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011663	TTCG	2	8	7271	7278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011663	TCG	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011663	TGA	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011663	TAA	2	6	7395	7400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971222
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265	NC_011663	TA	3	6	15134	15139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_011663	TGA	2	6	15171	15176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971230
267	NC_011663	GGC	2	6	15212	15217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971230
268	NC_011663	GAA	2	6	15297	15302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971230
269	NC_011663	ACA	2	6	15303	15308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971230
270	NC_011663	TGA	2	6	15360	15365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971230
271	NC_011663	GGA	2	6	15375	15380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217971230
272	NC_011663	TAT	2	6	15429	15434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971230
273	NC_011663	TTG	2	6	15503	15508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971230
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275	NC_011663	CAA	2	6	15623	15628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971230
276	NC_011663	ACC	2	6	15668	15673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971230
277	NC_011663	TGATG	2	10	15758	15767	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
278	NC_011663	A	6	6	15832	15837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_011663	AAT	2	6	15893	15898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_011663	TCAT	2	8	15996	16003	25 %	50 %	0 %	25 %	217971231
281	NC_011663	TGT	2	6	16134	16139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971231
282	NC_011663	TGG	2	6	16168	16173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971231
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293	NC_011663	T	6	6	16721	16726	0 %	100 %	0 %	0 %	217971231
294	NC_011663	CAT	2	6	16750	16755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971231
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333	NC_011663	AAG	2	6	19229	19234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
334	NC_011663	TGA	2	6	19258	19263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
335	NC_011663	AG	3	6	19297	19302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
336	NC_011663	GAG	2	6	19347	19352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
337	NC_011663	CAT	2	6	19443	19448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971232
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373	NC_011663	TGT	2	6	21545	21550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
374	NC_011663	CAG	2	6	21613	21618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
375	NC_011663	AATATT	2	12	21630	21641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
376	NC_011663	A	6	6	21665	21670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
377	NC_011663	ATT	2	6	21695	21700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_011663	AGC	2	6	21937	21942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971235
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390	NC_011663	GCA	2	6	22340	22345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971235
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393	NC_011663	CCA	2	6	22526	22531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971235
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395	NC_011663	TGA	2	6	22594	22599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971235
396	NC_011663	CAG	2	6	22629	22634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971235
397	NC_011663	CA	3	6	22702	22707	50 %	0 %	0 %	50 %	217971235
398	NC_011663	CAGA	2	8	22782	22789	50 %	0 %	25 %	25 %	217971235
399	NC_011663	GCAC	2	8	22796	22803	25 %	0 %	25 %	50 %	217971235
400	NC_011663	GTA	2	6	22907	22912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971236
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