MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS223 chromosome

Total Repeats: 90436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011663	GAGT	2	8	226305	226312	25 %	25 %	50 %	0 %	217971408
4002	NC_011663	TGCT	2	8	226315	226322	0 %	50 %	25 %	25 %	217971408
4003	NC_011663	CAG	2	6	226371	226376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4004	NC_011663	GTG	2	6	226440	226445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971408
4005	NC_011663	CA	3	6	226504	226509	50 %	0 %	0 %	50 %	217971408
4006	NC_011663	TTC	2	6	226555	226560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971408
4007	NC_011663	ATA	2	6	226588	226593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971408
4008	NC_011663	TG	3	6	226648	226653	0 %	50 %	50 %	0 %	217971408
4009	NC_011663	GCA	2	6	226983	226988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4010	NC_011663	CGA	2	6	227061	227066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4011	NC_011663	GTC	2	6	227255	227260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4012	NC_011663	AAC	2	6	227273	227278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971408
4013	NC_011663	ACT	2	6	227347	227352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971408
4014	NC_011663	TAC	2	6	227370	227375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971408
4015	NC_011663	TCT	2	6	227447	227452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971408
4016	NC_011663	ATG	2	6	227458	227463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971408
4017	NC_011663	CTT	2	6	227465	227470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971408
4018	NC_011663	TAA	2	6	227496	227501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971408
4019	NC_011663	GCT	2	6	227502	227507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4020	NC_011663	TTA	2	6	227540	227545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971408
4021	NC_011663	ATC	2	6	227560	227565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971408
4022	NC_011663	CGT	2	6	227605	227610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4023	NC_011663	TAA	2	6	227649	227654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971408
4024	NC_011663	TGC	2	6	227714	227719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4025	NC_011663	AGC	2	6	227724	227729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971408
4026	NC_011663	ATT	2	6	227797	227802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971408
4027	NC_011663	GAT	2	6	227858	227863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971408
4028	NC_011663	TTGG	2	8	227941	227948	0 %	50 %	50 %	0 %	217971408
4029	NC_011663	TAA	2	6	227952	227957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971408
4030	NC_011663	ATC	2	6	228037	228042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971408
4031	NC_011663	TAAG	2	8	228057	228064	50 %	25 %	25 %	0 %	217971408
4032	NC_011663	T	6	6	228122	228127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011663	CAT	2	6	228161	228166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_011663	TTG	2	6	228193	228198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011663	T	6	6	228253	228258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011663	CTG	2	6	228267	228272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_011663	CATC	2	8	228341	228348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_011663	TGA	2	6	228349	228354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011663	AGG	2	6	228363	228368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011663	GCC	2	6	228459	228464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971409
4041	NC_011663	GC	3	6	228555	228560	0 %	0 %	50 %	50 %	217971409
4042	NC_011663	AG	3	6	228572	228577	50 %	0 %	50 %	0 %	217971409
4043	NC_011663	CAG	2	6	228603	228608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971409
4044	NC_011663	CGA	2	6	228662	228667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971409
4045	NC_011663	AAG	2	6	228706	228711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971409
4046	NC_011663	ATT	2	6	228789	228794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011663	TTG	3	9	228845	228853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971410
4048	NC_011663	ATC	2	6	228894	228899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971410
4049	NC_011663	CCT	2	6	228953	228958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217971410
4050	NC_011663	TC	3	6	228967	228972	0 %	50 %	0 %	50 %	217971410
4051	NC_011663	ACT	2	6	229063	229068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971410
4052	NC_011663	GCG	2	6	229110	229115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971410
4053	NC_011663	TTA	2	6	229177	229182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971410
4054	NC_011663	CAA	2	6	229186	229191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971410
4055	NC_011663	TTGC	2	8	229268	229275	0 %	50 %	25 %	25 %	217971410
4056	NC_011663	TTA	2	6	229289	229294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971410
4057	NC_011663	TGA	2	6	229317	229322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971410
4058	NC_011663	GCA	2	6	229423	229428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971410
4059	NC_011663	TGGC	2	8	229432	229439	0 %	25 %	50 %	25 %	217971410
4060	NC_011663	ATC	2	6	229448	229453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971410
4061	NC_011663	TA	3	6	229473	229478	50 %	50 %	0 %	0 %	217971410
4062	NC_011663	GTT	2	6	229512	229517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011663	GCG	2	6	229631	229636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971411
4064	NC_011663	AGC	2	6	229660	229665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971411
4065	NC_011663	AGC	2	6	229687	229692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971411
4066	NC_011663	GGC	2	6	229755	229760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971411
4067	NC_011663	CTG	2	6	229827	229832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971411
4068	NC_011663	TGTCTG	2	12	229940	229951	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	217971411
4069	NC_011663	GCA	2	6	229964	229969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971411
4070	NC_011663	TG	3	6	230026	230031	0 %	50 %	50 %	0 %	217971411
4071	NC_011663	TCTG	2	8	230122	230129	0 %	50 %	25 %	25 %	217971411
4072	NC_011663	GTT	2	6	230147	230152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971411
4073	NC_011663	AGC	2	6	230188	230193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971411
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4076	NC_011663	AT	3	6	230317	230322	50 %	50 %	0 %	0 %	217971412
4077	NC_011663	TGT	2	6	230324	230329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971412
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4079	NC_011663	AAAT	2	8	230418	230425	75 %	25 %	0 %	0 %	217971412
4080	NC_011663	CGG	2	6	230457	230462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971412
4081	NC_011663	CAT	2	6	230521	230526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971412
4082	NC_011663	CTTG	2	8	230606	230613	0 %	50 %	25 %	25 %	217971413
4083	NC_011663	TGCCT	2	10	230628	230637	0 %	40 %	20 %	40 %	217971413
4084	NC_011663	CGC	2	6	230756	230761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971413
4085	NC_011663	TG	3	6	230882	230887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011663	CGC	2	6	231012	231017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971414
4087	NC_011663	CAC	2	6	231095	231100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971414
4088	NC_011663	CAG	2	6	231108	231113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971414
4089	NC_011663	GCC	2	6	231191	231196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971414
4090	NC_011663	TGC	2	6	231234	231239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971414
4091	NC_011663	TCAT	2	8	231257	231264	25 %	50 %	0 %	25 %	217971414
4092	NC_011663	GCA	2	6	231400	231405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971414
4093	NC_011663	T	6	6	231415	231420	0 %	100 %	0 %	0 %	217971414
4094	NC_011663	GAT	2	6	231460	231465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971414
4095	NC_011663	GAGC	2	8	231528	231535	25 %	0 %	50 %	25 %	217971414
4096	NC_011663	TGT	2	6	231700	231705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011663	AGG	2	6	231824	231829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_011663	GAT	2	6	231835	231840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971415
4099	NC_011663	TTCT	2	8	231860	231867	0 %	75 %	0 %	25 %	217971415
4100	NC_011663	TCT	2	6	231873	231878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971415
4101	NC_011663	TA	3	6	231935	231940	50 %	50 %	0 %	0 %	217971415
4102	NC_011663	AT	3	6	231944	231949	50 %	50 %	0 %	0 %	217971415
4103	NC_011663	AAT	2	6	231950	231955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971415
4104	NC_011663	AAG	2	6	231963	231968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971415
4105	NC_011663	GGT	2	6	232004	232009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971415
4106	NC_011663	A	6	6	232089	232094	100 %	0 %	0 %	0 %	217971415
4107	NC_011663	ATT	2	6	232115	232120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971415
4108	NC_011663	TAG	2	6	232128	232133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971415
4109	NC_011663	A	6	6	232172	232177	100 %	0 %	0 %	0 %	217971415
4110	NC_011663	ATT	2	6	232206	232211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971415
4111	NC_011663	CATG	2	8	232522	232529	25 %	25 %	25 %	25 %	217971416
4112	NC_011663	TGGAT	2	10	232556	232565	20 %	40 %	40 %	0 %	217971416
4113	NC_011663	GCA	2	6	232689	232694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971416
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4115	NC_011663	CTAT	2	8	232835	232842	25 %	50 %	0 %	25 %	217971416
4116	NC_011663	AGG	2	6	232901	232906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217971416
4117	NC_011663	ATG	2	6	232945	232950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971416
4118	NC_011663	TTC	2	6	232969	232974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971416
4119	NC_011663	GAA	2	6	233122	233127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971416
4120	NC_011663	AGT	2	6	233205	233210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971416
4121	NC_011663	TTAT	2	8	233306	233313	25 %	75 %	0 %	0 %	217971416
4122	NC_011663	CTT	2	6	233481	233486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_011663	ATT	2	6	233507	233512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011663	CAC	2	6	233529	233534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_011663	ATTA	2	8	233600	233607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011663	TGC	2	6	233688	233693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_011663	GAC	2	6	233921	233926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4240	NC_011663	GCG	2	6	240688	240693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_011663	CGT	2	6	240744	240749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_011663	TGG	2	6	241284	241289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971421
4248	NC_011663	GAT	3	9	241321	241329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971421
4249	NC_011663	TAG	2	6	241387	241392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971421
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4251	NC_011663	TGG	2	6	241527	241532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971422
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4368	NC_011663	CGA	2	6	247580	247585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971428
4369	NC_011663	CG	3	6	247593	247598	0 %	0 %	50 %	50 %	217971428
4370	NC_011663	CAT	2	6	247629	247634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971428
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4374	NC_011663	CAC	2	6	247893	247898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971428
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4381	NC_011663	AAGAT	2	10	248354	248363	60 %	20 %	20 %	0 %	217971428
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4423	NC_011663	TCA	2	6	251012	251017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4489	NC_011663	ATG	2	6	254967	254972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971434
4490	NC_011663	CGC	2	6	255103	255108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971434
4491	NC_011663	TATC	2	8	255112	255119	25 %	50 %	0 %	25 %	217971434
4492	NC_011663	TCA	2	6	255133	255138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971434
4493	NC_011663	A	6	6	255155	255160	100 %	0 %	0 %	0 %	217971434
4494	NC_011663	TAT	2	6	255304	255309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971434
4495	NC_011663	GCG	2	6	255410	255415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971434
4496	NC_011663	CTG	2	6	255427	255432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971434
4497	NC_011663	CAT	2	6	255550	255555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971434
4498	NC_011663	ATC	2	6	255590	255595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971434
4499	NC_011663	GGCT	2	8	255627	255634	0 %	25 %	50 %	25 %	217971434
4500	NC_011663	CTG	2	6	255658	255663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971434

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