MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS223 chromosome

Total Repeats: 90436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011663	CAAG	2	8	197790	197797	50 %	0 %	25 %	25 %	217971382
3502	NC_011663	AATTG	2	10	197824	197833	40 %	40 %	20 %	0 %	217971382
3503	NC_011663	AAT	2	6	197884	197889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971382
3504	NC_011663	TTC	2	6	197986	197991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971382
3505	NC_011663	ACC	2	6	198025	198030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971382
3506	NC_011663	AAT	2	6	198031	198036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971382
3507	NC_011663	TCA	2	6	198056	198061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971382
3508	NC_011663	TGT	2	6	198087	198092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971382
3509	NC_011663	TTTC	2	8	198095	198102	0 %	75 %	0 %	25 %	217971382
3510	NC_011663	GTA	2	6	198111	198116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971382
3511	NC_011663	TCT	2	6	198143	198148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971382
3512	NC_011663	CGAT	2	8	198167	198174	25 %	25 %	25 %	25 %	217971382
3513	NC_011663	GTT	2	6	198212	198217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971382
3514	NC_011663	TTA	2	6	198218	198223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3515	NC_011663	TGT	2	6	198287	198292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971382
3516	NC_011663	CAA	2	6	198327	198332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971382
3517	NC_011663	GTT	2	6	198351	198356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971382
3518	NC_011663	T	6	6	198367	198372	0 %	100 %	0 %	0 %	217971382
3519	NC_011663	TAA	2	6	198376	198381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971382
3520	NC_011663	ATT	2	6	198419	198424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3521	NC_011663	GCAG	2	8	198500	198507	25 %	0 %	50 %	25 %	217971382
3522	NC_011663	TCA	2	6	198545	198550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971382
3523	NC_011663	TAT	2	6	198646	198651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3524	NC_011663	GTG	2	6	198711	198716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971382
3525	NC_011663	CAT	2	6	198747	198752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971382
3526	NC_011663	GATT	2	8	198798	198805	25 %	50 %	25 %	0 %	217971382
3527	NC_011663	ATC	2	6	198865	198870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971382
3528	NC_011663	T	6	6	198878	198883	0 %	100 %	0 %	0 %	217971382
3529	NC_011663	T	9	9	198885	198893	0 %	100 %	0 %	0 %	217971382
3530	NC_011663	TTA	2	6	198947	198952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3531	NC_011663	CTG	2	6	199025	199030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971382
3532	NC_011663	ATA	2	6	199034	199039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971382
3533	NC_011663	TAAG	2	8	199120	199127	50 %	25 %	25 %	0 %	217971382
3534	NC_011663	TATT	2	8	199142	199149	25 %	75 %	0 %	0 %	217971382
3535	NC_011663	TCA	2	6	199193	199198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971382
3536	NC_011663	CGC	2	6	199242	199247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971382
3537	NC_011663	T	6	6	199258	199263	0 %	100 %	0 %	0 %	217971382
3538	NC_011663	AATT	2	8	199264	199271	50 %	50 %	0 %	0 %	217971382
3539	NC_011663	TTA	2	6	199304	199309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3540	NC_011663	TAT	2	6	199329	199334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3541	NC_011663	AGCTTT	2	12	199388	199399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217971382
3542	NC_011663	GTT	2	6	199411	199416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971382
3543	NC_011663	CTA	2	6	199443	199448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971382
3544	NC_011663	AGCTGC	2	12	199471	199482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	217971382
3545	NC_011663	CAG	2	6	199485	199490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971382
3546	NC_011663	TCA	2	6	199547	199552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971382
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3549	NC_011663	TGA	2	6	199695	199700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971382
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3551	NC_011663	TGTCA	2	10	199846	199855	20 %	40 %	20 %	20 %	217971382
3552	NC_011663	G	6	6	199859	199864	0 %	0 %	100 %	0 %	217971382
3553	NC_011663	TCTT	2	8	199918	199925	0 %	75 %	0 %	25 %	217971382
3554	NC_011663	ATTT	2	8	199936	199943	25 %	75 %	0 %	0 %	217971382
3555	NC_011663	T	6	6	199941	199946	0 %	100 %	0 %	0 %	217971382
3556	NC_011663	TAA	2	6	199969	199974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971382
3557	NC_011663	TGA	2	6	199982	199987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971382
3558	NC_011663	ATT	2	6	200024	200029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3559	NC_011663	ATTTA	2	10	200106	200115	40 %	60 %	0 %	0 %	217971383
3560	NC_011663	TAG	2	6	200118	200123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971383
3561	NC_011663	TTGTT	2	10	200144	200153	0 %	80 %	20 %	0 %	217971383
3562	NC_011663	TAA	2	6	200157	200162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971383
3563	NC_011663	CTG	2	6	200205	200210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971383
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3565	NC_011663	T	6	6	200239	200244	0 %	100 %	0 %	0 %	217971383
3566	NC_011663	TTTAG	2	10	200362	200371	20 %	60 %	20 %	0 %	217971383
3567	NC_011663	TAA	2	6	200549	200554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971383
3568	NC_011663	T	10	10	200666	200675	0 %	100 %	0 %	0 %	217971383
3569	NC_011663	A	6	6	200690	200695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_011663	TATTT	2	10	200696	200705	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_011663	AGAT	2	8	200708	200715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_011663	TC	3	6	200720	200725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_011663	CAT	2	6	200772	200777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_011663	AAT	2	6	200796	200801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011663	ATTT	2	8	200827	200834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_011663	T	7	7	200841	200847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011663	TGT	2	6	200866	200871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011663	TCTA	2	8	200934	200941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_011663	T	6	6	200951	200956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011663	ATTTT	2	10	200994	201003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_011663	T	6	6	201000	201005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011663	TGA	2	6	201034	201039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971384
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3584	NC_011663	CAT	2	6	201156	201161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971384
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3586	NC_011663	GAT	2	6	201305	201310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971384
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3588	NC_011663	TGCT	2	8	201562	201569	0 %	50 %	25 %	25 %	217971384
3589	NC_011663	TGA	2	6	201644	201649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971384
3590	NC_011663	CTCAA	2	10	201745	201754	40 %	20 %	0 %	40 %	217971384
3591	NC_011663	TTA	2	6	201817	201822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971384
3592	NC_011663	TC	3	6	201848	201853	0 %	50 %	0 %	50 %	217971384
3593	NC_011663	TGA	2	6	201917	201922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971384
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3595	NC_011663	AAATT	2	10	201976	201985	60 %	40 %	0 %	0 %	217971384
3596	NC_011663	GTT	2	6	201991	201996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971384
3597	NC_011663	TGCA	2	8	202000	202007	25 %	25 %	25 %	25 %	217971384
3598	NC_011663	CATTG	2	10	202049	202058	20 %	40 %	20 %	20 %	217971384
3599	NC_011663	GAG	2	6	202179	202184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217971384
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3601	NC_011663	CTGC	2	8	202314	202321	0 %	25 %	25 %	50 %	217971385
3602	NC_011663	CATA	2	8	202337	202344	50 %	25 %	0 %	25 %	217971385
3603	NC_011663	TG	3	6	202417	202422	0 %	50 %	50 %	0 %	217971385
3604	NC_011663	GCG	2	6	202448	202453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971385
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3607	NC_011663	CGC	2	6	202557	202562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971385
3608	NC_011663	CTT	2	6	202650	202655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971385
3609	NC_011663	CGC	2	6	202710	202715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971385
3610	NC_011663	CTG	2	6	202772	202777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971385
3611	NC_011663	GCC	3	9	202894	202902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971385
3612	NC_011663	TAC	2	6	202932	202937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971385
3613	NC_011663	TAA	2	6	202948	202953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971385
3614	NC_011663	AG	3	6	202978	202983	50 %	0 %	50 %	0 %	217971385
3615	NC_011663	AAC	2	6	203041	203046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971385
3616	NC_011663	AAT	2	6	203099	203104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971385
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3618	NC_011663	CGGGT	2	10	203244	203253	0 %	20 %	60 %	20 %	217971385
3619	NC_011663	ATC	2	6	203459	203464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971385
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3622	NC_011663	CTG	2	6	203602	203607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971385
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3624	NC_011663	T	6	6	203777	203782	0 %	100 %	0 %	0 %	217971386
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3989	NC_011663	AATTA	2	10	225658	225667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_011663	TAA	3	9	225714	225722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3993	NC_011663	GCCA	2	8	225758	225765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3994	NC_011663	TAA	2	6	225856	225861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_011663	AAT	2	6	225884	225889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_011663	TGTC	2	8	226056	226063	0 %	50 %	25 %	25 %	217971408
3997	NC_011663	TGT	2	6	226076	226081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971408
3998	NC_011663	CGA	2	6	226101	226106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971408
3999	NC_011663	TGAG	2	8	226236	226243	25 %	25 %	50 %	0 %	217971408
4000	NC_011663	ATC	2	6	226261	226266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971408

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