MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS223 chromosome

Total Repeats: 90436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011663	TGA	2	6	170684	170689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971359
3002	NC_011663	CAA	2	6	170690	170695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971359
3003	NC_011663	GCG	3	9	170720	170728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971359
3004	NC_011663	GATA	2	8	170804	170811	50 %	25 %	25 %	0 %	217971359
3005	NC_011663	AGAA	2	8	170937	170944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_011663	GA	3	6	170991	170996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011663	ATTGG	2	10	171021	171030	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011663	GTT	2	6	171055	171060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011663	GTGCG	2	10	171236	171245	0 %	20 %	60 %	20 %	217971360
3010	NC_011663	CCA	2	6	171323	171328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971360
3011	NC_011663	AAGA	2	8	171331	171338	75 %	0 %	25 %	0 %	217971360
3012	NC_011663	GAA	2	6	171438	171443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971360
3013	NC_011663	ATA	2	6	171459	171464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971360
3014	NC_011663	GCA	2	6	171503	171508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971360
3015	NC_011663	TTC	2	6	171616	171621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971360
3016	NC_011663	AGA	2	6	171680	171685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971360
3017	NC_011663	AAT	2	6	171807	171812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971360
3018	NC_011663	ATC	2	6	171826	171831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971360
3019	NC_011663	CA	3	6	171832	171837	50 %	0 %	0 %	50 %	217971360
3020	NC_011663	CGA	2	6	171845	171850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971360
3021	NC_011663	GAA	2	6	171915	171920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971360
3022	NC_011663	CCG	2	6	171952	171957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971360
3023	NC_011663	TTGG	2	8	171976	171983	0 %	50 %	50 %	0 %	217971360
3024	NC_011663	GCT	2	6	172056	172061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971360
3025	NC_011663	CAC	2	6	172122	172127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971360
3026	NC_011663	AAG	2	6	172150	172155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971360
3027	NC_011663	CCG	2	6	172181	172186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971360
3028	NC_011663	TGA	2	6	172217	172222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971360
3029	NC_011663	GTG	2	6	172283	172288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971360
3030	NC_011663	GC	3	6	172328	172333	0 %	0 %	50 %	50 %	217971360
3031	NC_011663	TAA	2	6	172374	172379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971360
3032	NC_011663	GCA	2	6	172418	172423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_011663	TG	3	6	172427	172432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011663	T	7	7	172511	172517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011663	TTTA	2	8	172655	172662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011663	TGA	2	6	172687	172692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011663	TA	3	6	172725	172730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011663	CCA	2	6	172747	172752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_011663	ATG	2	6	172770	172775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011663	TCCA	2	8	172796	172803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_011663	GCA	2	6	172841	172846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_011663	T	6	6	172936	172941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011663	CGA	2	6	173210	173215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971361
3044	NC_011663	GTG	2	6	173224	173229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971361
3045	NC_011663	CAG	2	6	173345	173350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971361
3046	NC_011663	GAA	2	6	173358	173363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971361
3047	NC_011663	AAG	2	6	173452	173457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971361
3048	NC_011663	GGT	2	6	173494	173499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971361
3049	NC_011663	TCT	2	6	173560	173565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971361
3050	NC_011663	GCT	2	6	173619	173624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971361
3051	NC_011663	ACG	2	6	173659	173664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971361
3052	NC_011663	TTC	2	6	173713	173718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971361
3053	NC_011663	CGC	2	6	173768	173773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971361
3054	NC_011663	AG	3	6	173826	173831	50 %	0 %	50 %	0 %	217971361
3055	NC_011663	AGC	2	6	173995	174000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971361
3056	NC_011663	CAAA	2	8	174067	174074	75 %	0 %	0 %	25 %	217971361
3057	NC_011663	TGA	2	6	174086	174091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971361
3058	NC_011663	CA	3	6	174097	174102	50 %	0 %	0 %	50 %	217971361
3059	NC_011663	TTC	2	6	174123	174128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971361
3060	NC_011663	CTGG	2	8	174191	174198	0 %	25 %	50 %	25 %	217971361
3061	NC_011663	TTGA	2	8	174309	174316	25 %	50 %	25 %	0 %	217971361
3062	NC_011663	CGC	2	6	174440	174445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971361
3063	NC_011663	ATCC	2	8	174503	174510	25 %	25 %	0 %	50 %	217971361
3064	NC_011663	ATTTG	2	10	174528	174537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011663	ATCG	2	8	174553	174560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_011663	ATTTT	2	10	174568	174577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_011663	TG	3	6	174640	174645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011663	A	6	6	174666	174671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_011663	TGA	2	6	174707	174712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011663	ATT	2	6	174725	174730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971362
3071	NC_011663	AAT	2	6	174760	174765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971362
3072	NC_011663	CTT	2	6	174950	174955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971362
3073	NC_011663	TGA	2	6	174958	174963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971362
3074	NC_011663	TCT	2	6	175063	175068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971362
3075	NC_011663	TGCC	2	8	175094	175101	0 %	25 %	25 %	50 %	217971362
3076	NC_011663	GATT	2	8	175150	175157	25 %	50 %	25 %	0 %	217971362
3077	NC_011663	TTC	2	6	175164	175169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971362
3078	NC_011663	TCG	2	6	175228	175233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971362
3079	NC_011663	TGA	2	6	175244	175249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971362
3080	NC_011663	CAT	2	6	175286	175291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971362
3081	NC_011663	CGC	2	6	175319	175324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971362
3082	NC_011663	CGC	2	6	175400	175405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971362
3083	NC_011663	GCC	2	6	175438	175443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971362
3084	NC_011663	CAG	2	6	175455	175460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971362
3085	NC_011663	GTA	2	6	175466	175471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971362
3086	NC_011663	TTG	2	6	175500	175505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971362
3087	NC_011663	CAC	2	6	175532	175537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971362
3088	NC_011663	CGT	2	6	175629	175634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971363
3089	NC_011663	CGT	2	6	175686	175691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971363
3090	NC_011663	TTC	2	6	175733	175738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971363
3091	NC_011663	CAC	2	6	175759	175764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971363
3092	NC_011663	T	7	7	175784	175790	0 %	100 %	0 %	0 %	217971363
3093	NC_011663	CTA	2	6	175854	175859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971363
3094	NC_011663	GC	3	6	175866	175871	0 %	0 %	50 %	50 %	217971363
3095	NC_011663	GCC	2	6	175892	175897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971363
3096	NC_011663	TAT	2	6	176065	176070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971364
3097	NC_011663	TTG	2	6	176160	176165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_011663	ATT	2	6	176206	176211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011663	TTA	2	6	176259	176264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971365
3100	NC_011663	TCT	2	6	176320	176325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971365
3101	NC_011663	TGT	2	6	176347	176352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971365
3102	NC_011663	CTA	2	6	176383	176388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971365
3103	NC_011663	TCA	2	6	176391	176396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971365
3104	NC_011663	GCA	2	6	176468	176473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971365
3105	NC_011663	CT	3	6	176562	176567	0 %	50 %	0 %	50 %	217971365
3106	NC_011663	ATT	2	6	176619	176624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971365
3107	NC_011663	AAG	2	6	176692	176697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971365
3108	NC_011663	CAG	2	6	176790	176795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971365
3109	NC_011663	ACA	2	6	176798	176803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971365
3110	NC_011663	CAA	2	6	176813	176818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971365
3111	NC_011663	ATG	2	6	177090	177095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971365
3112	NC_011663	GAAA	2	8	177195	177202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011663	GAAT	2	8	177205	177212	50 %	25 %	25 %	0 %	217971366
3114	NC_011663	TTG	2	6	177247	177252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971366
3115	NC_011663	TCC	2	6	177270	177275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217971366
3116	NC_011663	CAT	2	6	177368	177373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971366
3117	NC_011663	CGA	2	6	177382	177387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971366
3118	NC_011663	TCG	2	6	177484	177489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971366
3119	NC_011663	TCA	2	6	177514	177519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971366
3120	NC_011663	GCA	2	6	177540	177545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971366
3121	NC_011663	ATG	2	6	177559	177564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971366
3122	NC_011663	TGT	2	6	177712	177717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971366
3123	NC_011663	GCT	2	6	177726	177731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971366
3124	NC_011663	GTG	2	6	177732	177737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971366
3125	NC_011663	AGTT	2	8	177742	177749	25 %	50 %	25 %	0 %	217971366
3126	NC_011663	CGC	2	6	177759	177764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971366
3127	NC_011663	GTG	2	6	177795	177800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971366
3128	NC_011663	CCG	2	6	177817	177822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971366
3129	NC_011663	GTT	2	6	177930	177935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971366
3130	NC_011663	GCG	2	6	177937	177942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971366
3131	NC_011663	GCC	2	6	177952	177957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971366
3132	NC_011663	TCAT	2	8	177973	177980	25 %	50 %	0 %	25 %	217971366
3133	NC_011663	TTAC	2	8	178025	178032	25 %	50 %	0 %	25 %	217971366
3134	NC_011663	AGA	2	6	178046	178051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971366
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3137	NC_011663	GGC	2	6	178319	178324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971366
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3144	NC_011663	ACC	2	6	178617	178622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217971366
3145	NC_011663	AAG	2	6	178633	178638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971366
3146	NC_011663	TCG	2	6	178648	178653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971366
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3154	NC_011663	TGA	2	6	179023	179028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971366
3155	NC_011663	TCA	2	6	179032	179037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971366
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3162	NC_011663	TGA	2	6	179394	179399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971367
3163	NC_011663	TTCG	2	8	179405	179412	0 %	50 %	25 %	25 %	217971367
3164	NC_011663	GCA	2	6	179637	179642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971367
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3171	NC_011663	CGT	2	6	180036	180041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971367
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3184	NC_011663	GAC	2	6	180724	180729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971367
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3212	NC_011663	T	6	6	182155	182160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_011663	AGT	2	6	182167	182172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3222	NC_011663	GTTT	2	8	182838	182845	0 %	75 %	25 %	0 %	217971370
3223	NC_011663	T	6	6	182843	182848	0 %	100 %	0 %	0 %	217971370
3224	NC_011663	TGA	2	6	182921	182926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971370
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3228	NC_011663	CAG	2	6	183112	183117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971370
3229	NC_011663	GTGG	2	8	183313	183320	0 %	25 %	75 %	0 %	217971371
3230	NC_011663	A	6	6	183374	183379	100 %	0 %	0 %	0 %	217971371
3231	NC_011663	GTG	2	6	183428	183433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971371
3232	NC_011663	GTGA	2	8	183473	183480	25 %	25 %	50 %	0 %	217971371
3233	NC_011663	ACGA	2	8	183483	183490	50 %	0 %	25 %	25 %	217971371
3234	NC_011663	GCA	2	6	183503	183508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971371
3235	NC_011663	CG	3	6	183655	183660	0 %	0 %	50 %	50 %	217971372
3236	NC_011663	GCA	2	6	183686	183691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971372
3237	NC_011663	TGG	2	6	183727	183732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971372
3238	NC_011663	GGTT	2	8	183837	183844	0 %	50 %	50 %	0 %	217971372
3239	NC_011663	TTA	2	6	183858	183863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971372
3240	NC_011663	GCCGA	2	10	183954	183963	20 %	0 %	40 %	40 %	217971372
3241	NC_011663	CTT	2	6	184007	184012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971372
3242	NC_011663	TGC	2	6	184117	184122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971372
3243	NC_011663	TGC	2	6	184130	184135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971372
3244	NC_011663	CAA	2	6	184190	184195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971372
3245	NC_011663	GCG	2	6	184326	184331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971373
3246	NC_011663	TCG	2	6	184341	184346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971373
3247	NC_011663	TGG	2	6	184365	184370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971373
3248	NC_011663	ATC	2	6	184373	184378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971373
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3250	NC_011663	GAA	2	6	184483	184488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971373
3251	NC_011663	CAA	2	6	184535	184540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971373
3252	NC_011663	CTG	2	6	184569	184574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971373
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3263	NC_011663	GCG	2	6	185244	185249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971373
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3268	NC_011663	ATA	2	6	185339	185344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971374
3269	NC_011663	GACTGG	2	12	185370	185381	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	217971374
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3271	NC_011663	CAG	2	6	185428	185433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971375
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3273	NC_011663	CGC	2	6	185567	185572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971375
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3282	NC_011663	TGA	2	6	186118	186123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971375
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3300	NC_011663	TGAG	2	8	186956	186963	25 %	25 %	50 %	0 %	217971376
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3302	NC_011663	A	7	7	187088	187094	100 %	0 %	0 %	0 %	217971377
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3317	NC_011663	ATT	2	6	188311	188316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3318	NC_011663	AAC	2	6	188324	188329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3320	NC_011663	GTTCAG	2	12	188355	188366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3355	NC_011663	GT	3	6	189773	189778	0 %	50 %	50 %	0 %	217971379
3356	NC_011663	GCA	2	6	189866	189871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971379
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3360	NC_011663	A	6	6	190040	190045	100 %	0 %	0 %	0 %	217971379
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3363	NC_011663	AAGTTT	2	12	190190	190201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217971379
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3366	NC_011663	AT	3	6	190326	190331	50 %	50 %	0 %	0 %	217971379
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3496	NC_011663	TAT	2	6	197388	197393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971382
3497	NC_011663	TAAA	2	8	197475	197482	75 %	25 %	0 %	0 %	217971382
3498	NC_011663	TTTTAC	2	12	197521	197532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217971382
3499	NC_011663	TC	3	6	197661	197666	0 %	50 %	0 %	50 %	217971382
3500	NC_011663	GA	3	6	197732	197737	50 %	0 %	50 %	0 %	217971382

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