MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS223 chromosome

Total Repeats: 90436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011663	AAGTT	2	10	56628	56637	40 %	40 %	20 %	0 %	217971265
1002	NC_011663	ACA	2	6	56746	56751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971265
1003	NC_011663	TCT	2	6	56760	56765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971265
1004	NC_011663	CTGA	2	8	56777	56784	25 %	25 %	25 %	25 %	217971265
1005	NC_011663	CATT	2	8	56798	56805	25 %	50 %	0 %	25 %	217971265
1006	NC_011663	CAA	2	6	56936	56941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971265
1007	NC_011663	GCT	2	6	56948	56953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971265
1008	NC_011663	GCC	2	6	56966	56971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971265
1009	NC_011663	GAA	2	6	56972	56977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971265
1010	NC_011663	GGGC	2	8	57025	57032	0 %	0 %	75 %	25 %	217971266
1011	NC_011663	TAGC	2	8	57061	57068	25 %	25 %	25 %	25 %	217971266
1012	NC_011663	CGCT	2	8	57118	57125	0 %	25 %	25 %	50 %	217971266
1013	NC_011663	GC	3	6	57297	57302	0 %	0 %	50 %	50 %	217971266
1014	NC_011663	TGC	2	6	57346	57351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971266
1015	NC_011663	ACG	2	6	57535	57540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971266
1016	NC_011663	GGC	2	6	57561	57566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971266
1017	NC_011663	CGT	2	6	57771	57776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971266
1018	NC_011663	TGTGA	2	10	57801	57810	20 %	40 %	40 %	0 %	217971266
1019	NC_011663	TGC	2	6	57956	57961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971266
1020	NC_011663	CAG	2	6	57974	57979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971266
1021	NC_011663	AGAAA	2	10	57980	57989	80 %	0 %	20 %	0 %	217971266
1022	NC_011663	TGA	2	6	58022	58027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011663	AAAGG	2	10	58044	58053	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011663	T	6	6	58071	58076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011663	CTTG	2	8	58123	58130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_011663	CAAT	2	8	58175	58182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_011663	TG	3	6	58188	58193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011663	CAT	2	6	58210	58215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971267
1029	NC_011663	ATT	2	6	58222	58227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217971267
1030	NC_011663	TG	3	6	58253	58258	0 %	50 %	50 %	0 %	217971267
1031	NC_011663	GTACTC	2	12	58288	58299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	217971267
1032	NC_011663	CAAG	2	8	58308	58315	50 %	0 %	25 %	25 %	217971267
1033	NC_011663	TCA	2	6	58331	58336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971267
1034	NC_011663	GCG	3	9	58337	58345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971267
1035	NC_011663	CG	3	6	58425	58430	0 %	0 %	50 %	50 %	217971267
1036	NC_011663	GCA	2	6	58440	58445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971267
1037	NC_011663	GGGC	2	8	58562	58569	0 %	0 %	75 %	25 %	217971267
1038	NC_011663	GGC	2	6	58684	58689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971267
1039	NC_011663	GCT	2	6	58887	58892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971267
1040	NC_011663	TCAC	2	8	58895	58902	25 %	25 %	0 %	50 %	217971267
1041	NC_011663	AGC	3	9	59009	59017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971267
1042	NC_011663	TGA	2	6	59094	59099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971267
1043	NC_011663	GC	3	6	59142	59147	0 %	0 %	50 %	50 %	217971267
1044	NC_011663	TGG	2	6	59153	59158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971267
1045	NC_011663	TGA	2	6	59183	59188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971267
1046	NC_011663	ACCGC	2	10	59204	59213	20 %	0 %	20 %	60 %	217971267
1047	NC_011663	TGGT	2	8	59319	59326	0 %	50 %	50 %	0 %	217971267
1048	NC_011663	CGC	2	6	59367	59372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971267
1049	NC_011663	CCG	2	6	59506	59511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971268
1050	NC_011663	AAACAG	2	12	59638	59649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217971268
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1052	NC_011663	ATC	2	6	59828	59833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971268
1053	NC_011663	TTCG	2	8	59840	59847	0 %	50 %	25 %	25 %	217971268
1054	NC_011663	TGT	2	6	59863	59868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971268
1055	NC_011663	TTAT	2	8	59922	59929	25 %	75 %	0 %	0 %	217971268
1056	NC_011663	A	6	6	59947	59952	100 %	0 %	0 %	0 %	217971268
1057	NC_011663	TCTTT	2	10	60002	60011	0 %	80 %	0 %	20 %	217971268
1058	NC_011663	TGCT	2	8	60075	60082	0 %	50 %	25 %	25 %	217971268
1059	NC_011663	TCGT	2	8	60098	60105	0 %	50 %	25 %	25 %	217971268
1060	NC_011663	TGC	2	6	60125	60130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971268
1061	NC_011663	ACA	2	6	60135	60140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971268
1062	NC_011663	ATC	2	6	60141	60146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971268
1063	NC_011663	GGT	2	6	60173	60178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217971268
1064	NC_011663	AAC	2	6	60198	60203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971268
1065	NC_011663	CTT	2	6	60211	60216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971268
1066	NC_011663	TA	3	6	60319	60324	50 %	50 %	0 %	0 %	217971268
1067	NC_011663	ATC	2	6	60363	60368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971268
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1070	NC_011663	AAAT	2	8	60467	60474	75 %	25 %	0 %	0 %	217971268
1071	NC_011663	ATC	2	6	60572	60577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971268
1072	NC_011663	ACG	2	6	60641	60646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971268
1073	NC_011663	CAA	2	6	60739	60744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971268
1074	NC_011663	AAT	2	6	60745	60750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217971268
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1076	NC_011663	ATC	2	6	60983	60988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971268
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1080	NC_011663	ACG	2	6	61118	61123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971268
1081	NC_011663	TAG	2	6	61145	61150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971268
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1083	NC_011663	TTGT	2	8	61241	61248	0 %	75 %	25 %	0 %	217971268
1084	NC_011663	T	6	6	61292	61297	0 %	100 %	0 %	0 %	217971268
1085	NC_011663	AAC	2	6	61313	61318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971268
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1089	NC_011663	ACC	2	6	61483	61488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_011663	TTA	2	6	61513	61518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011663	TTCA	2	8	61567	61574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_011663	T	6	6	61584	61589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011663	CTA	2	6	61593	61598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011663	T	6	6	61731	61736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011663	AT	3	6	61854	61859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011663	TCG	2	6	61873	61878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011663	AGAA	2	8	61908	61915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011663	ACGG	2	8	62017	62024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_011663	GGC	2	6	62052	62057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011663	TGCC	2	8	62070	62077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_011663	CCAA	2	8	62080	62087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_011663	T	6	6	62129	62134	0 %	100 %	0 %	0 %	217971269
1103	NC_011663	CAT	2	6	62192	62197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971269
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1105	NC_011663	GCCA	2	8	62337	62344	25 %	0 %	25 %	50 %	217971269
1106	NC_011663	AG	3	6	62355	62360	50 %	0 %	50 %	0 %	217971269
1107	NC_011663	ATG	2	6	62361	62366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971269
1108	NC_011663	TCG	2	6	62430	62435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971269
1109	NC_011663	GAC	2	6	62480	62485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971269
1110	NC_011663	GCC	3	9	62513	62521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971269
1111	NC_011663	GTT	2	6	62672	62677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971269
1112	NC_011663	TGA	2	6	62716	62721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971269
1113	NC_011663	ATC	2	6	62736	62741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971269
1114	NC_011663	AAAC	2	8	62825	62832	75 %	0 %	0 %	25 %	217971269
1115	NC_011663	GTT	2	6	62906	62911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217971269
1116	NC_011663	A	6	6	62931	62936	100 %	0 %	0 %	0 %	217971269
1117	NC_011663	CAAC	2	8	63010	63017	50 %	0 %	0 %	50 %	217971269
1118	NC_011663	TCA	2	6	63154	63159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217971269
1119	NC_011663	CGC	2	6	63169	63174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217971269
1120	NC_011663	AGC	2	6	63183	63188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971269
1121	NC_011663	ACA	2	6	63234	63239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971269
1122	NC_011663	CTG	2	6	63259	63264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971269
1123	NC_011663	AGA	2	6	63299	63304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217971269
1124	NC_011663	GAT	2	6	63344	63349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971269
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1126	NC_011663	GGC	2	6	63381	63386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217971269
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1128	NC_011663	AGC	2	6	63508	63513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971270
1129	NC_011663	GCA	2	6	63530	63535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971270
1130	NC_011663	GCA	2	6	63631	63636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971270
1131	NC_011663	GTC	2	6	63642	63647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217971270
1132	NC_011663	CATA	2	8	63716	63723	50 %	25 %	0 %	25 %	217971270
1133	NC_011663	TTC	2	6	63792	63797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217971270
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1141	NC_011663	GTT	2	6	64189	64194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_011663	GAT	2	6	64195	64200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_011663	GCA	2	6	64507	64512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217971271
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1252	NC_011663	CAA	2	6	69967	69972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217971275
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1254	NC_011663	TGA	2	6	70080	70085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217971275
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1256	NC_011663	TC	3	6	70152	70157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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