MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS223 chromosome

Total Repeats: 90436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90001	NC_011663	GCT	2	6	5123586	5123591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975443
90002	NC_011663	GCG	2	6	5123687	5123692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217975443
90003	NC_011663	CTA	2	6	5123701	5123706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975443
90004	NC_011663	CTA	2	6	5123740	5123745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975443
90005	NC_011663	CA	3	6	5123749	5123754	50 %	0 %	0 %	50 %	217975443
90006	NC_011663	GTT	2	6	5123783	5123788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90007	NC_011663	CACT	2	8	5123800	5123807	25 %	25 %	0 %	50 %	217975444
90008	NC_011663	GC	4	8	5123862	5123869	0 %	0 %	50 %	50 %	217975444
90009	NC_011663	TCG	2	6	5123870	5123875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975444
90010	NC_011663	TCG	2	6	5123882	5123887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975444
90011	NC_011663	AC	3	6	5123895	5123900	50 %	0 %	0 %	50 %	217975444
90012	NC_011663	CCA	2	6	5123958	5123963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975444
90013	NC_011663	GTG	2	6	5124029	5124034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975444
90014	NC_011663	ACC	2	6	5124148	5124153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975444
90015	NC_011663	TCA	2	6	5124156	5124161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975444
90016	NC_011663	ATGG	2	8	5124187	5124194	25 %	25 %	50 %	0 %	217975444
90017	NC_011663	ACC	2	6	5124224	5124229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975444
90018	NC_011663	TCAA	2	8	5124254	5124261	50 %	25 %	0 %	25 %	217975444
90019	NC_011663	ATA	2	6	5124287	5124292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975444
90020	NC_011663	GCG	2	6	5124320	5124325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217975444
90021	NC_011663	TTA	2	6	5124344	5124349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975444
90022	NC_011663	TCA	2	6	5124497	5124502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975444
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90024	NC_011663	GCT	2	6	5124552	5124557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975444
90025	NC_011663	GT	3	6	5124558	5124563	0 %	50 %	50 %	0 %	217975444
90026	NC_011663	TTCGA	2	10	5124595	5124604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90027	NC_011663	GAAAC	2	10	5124620	5124629	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90028	NC_011663	T	6	6	5124630	5124635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90029	NC_011663	GCG	2	6	5124666	5124671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90030	NC_011663	T	6	6	5124674	5124679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90031	NC_011663	A	6	6	5124716	5124721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90032	NC_011663	TAA	2	6	5124768	5124773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90033	NC_011663	TAT	2	6	5124970	5124975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975445
90034	NC_011663	CAT	2	6	5125154	5125159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975445
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90038	NC_011663	TGC	2	6	5125322	5125327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975445
90039	NC_011663	TCA	2	6	5125344	5125349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975445
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90043	NC_011663	TCTT	2	8	5125554	5125561	0 %	75 %	0 %	25 %	217975445
90044	NC_011663	TCG	2	6	5125566	5125571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975445
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90049	NC_011663	TGC	2	6	5125794	5125799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975445
90050	NC_011663	TGC	2	6	5125848	5125853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975445
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90052	NC_011663	TCAA	2	8	5125917	5125924	50 %	25 %	0 %	25 %	217975445
90053	NC_011663	CTG	2	6	5125958	5125963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975445
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90055	NC_011663	TCG	2	6	5126175	5126180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975445
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90068	NC_011663	TAAA	2	8	5127171	5127178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90088	NC_011663	CGA	2	6	5128103	5128108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975446
90089	NC_011663	TTG	2	6	5128239	5128244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975446
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90093	NC_011663	AAGCG	2	10	5128909	5128918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90094	NC_011663	A	6	6	5128968	5128973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90102	NC_011663	GC	3	6	5129282	5129287	0 %	0 %	50 %	50 %	217975447
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90118	NC_011663	TGT	2	6	5130364	5130369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975448
90119	NC_011663	CAT	2	6	5130380	5130385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975448
90120	NC_011663	CAC	2	6	5130409	5130414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975448
90121	NC_011663	ACAA	2	8	5130449	5130456	75 %	0 %	0 %	25 %	217975448
90122	NC_011663	TTGA	2	8	5130499	5130506	25 %	50 %	25 %	0 %	217975448
90123	NC_011663	ATAAC	2	10	5130534	5130543	60 %	20 %	0 %	20 %	217975448
90124	NC_011663	CTT	2	6	5130547	5130552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975448
90125	NC_011663	TCA	2	6	5130570	5130575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975448
90126	NC_011663	TAC	2	6	5130653	5130658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975448
90127	NC_011663	ACG	2	6	5130668	5130673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975448
90128	NC_011663	AGA	2	6	5130683	5130688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975448
90129	NC_011663	ACC	3	9	5130713	5130721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975448
90130	NC_011663	GTT	2	6	5130724	5130729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975448
90131	NC_011663	ACA	2	6	5130849	5130854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975448
90132	NC_011663	ACCTA	2	10	5130897	5130906	40 %	20 %	0 %	40 %	217975449
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90136	NC_011663	TCA	2	6	5131172	5131177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975449
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90145	NC_011663	GA	3	6	5131582	5131587	50 %	0 %	50 %	0 %	217975449
90146	NC_011663	GCTG	2	8	5131675	5131682	0 %	25 %	50 %	25 %	217975449
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90149	NC_011663	TTGCTT	2	12	5132052	5132063	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	217975450
90150	NC_011663	GCA	2	6	5132143	5132148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975450
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90217	NC_011663	AC	3	6	5135103	5135108	50 %	0 %	0 %	50 %	217975454
90218	NC_011663	AGCTA	2	10	5135113	5135122	40 %	20 %	20 %	20 %	217975454
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90220	NC_011663	TGC	2	6	5135182	5135187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975454
90221	NC_011663	TCA	2	6	5135226	5135231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975454
90222	NC_011663	CTTT	2	8	5135294	5135301	0 %	75 %	0 %	25 %	217975454
90223	NC_011663	ATC	2	6	5135327	5135332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975454
90224	NC_011663	CAA	2	6	5135334	5135339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975454
90225	NC_011663	T	6	6	5135374	5135379	0 %	100 %	0 %	0 %	217975454
90226	NC_011663	GAACA	2	10	5135404	5135413	60 %	0 %	20 %	20 %	217975454
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90228	NC_011663	AACA	2	8	5135607	5135614	75 %	0 %	0 %	25 %	217975455
90229	NC_011663	C	6	6	5135694	5135699	0 %	0 %	0 %	100 %	217975455
90230	NC_011663	ACC	2	6	5135794	5135799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975455
90231	NC_011663	CCG	2	6	5135868	5135873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217975455
90232	NC_011663	CAT	2	6	5135878	5135883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975455
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.