MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes NZ131 chromosome

Total Repeats: 38652

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_011375	AAC	2	6	1809563	1809568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560284
38502	NC_011375	A	6	6	1809586	1809591	100 %	0 %	0 %	0 %	209560284
38503	NC_011375	T	7	7	1809601	1809607	0 %	100 %	0 %	0 %	209560284
38504	NC_011375	ATT	2	6	1809657	1809662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560284
38505	NC_011375	TAT	3	9	1809775	1809783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560284
38506	NC_011375	AAAT	2	8	1809829	1809836	75 %	25 %	0 %	0 %	209560284
38507	NC_011375	TAC	2	6	1809868	1809873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209560284
38508	NC_011375	TAG	2	6	1809892	1809897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209560284
38509	NC_011375	AACCA	2	10	1809962	1809971	60 %	0 %	0 %	40 %	209560284
38510	NC_011375	CAGC	2	8	1810019	1810026	25 %	0 %	25 %	50 %	209560284
38511	NC_011375	ATATT	2	10	1810158	1810167	40 %	60 %	0 %	0 %	209560284
38512	NC_011375	CAGA	2	8	1810199	1810206	50 %	0 %	25 %	25 %	209560284
38513	NC_011375	AT	3	6	1810220	1810225	50 %	50 %	0 %	0 %	209560284
38514	NC_011375	T	7	7	1810246	1810252	0 %	100 %	0 %	0 %	209560284
38515	NC_011375	GTTT	2	8	1810294	1810301	0 %	75 %	25 %	0 %	209560284
38516	NC_011375	A	6	6	1810306	1810311	100 %	0 %	0 %	0 %	209560284
38517	NC_011375	A	7	7	1810392	1810398	100 %	0 %	0 %	0 %	209560284
38518	NC_011375	A	6	6	1810529	1810534	100 %	0 %	0 %	0 %	209560284
38519	NC_011375	AGG	2	6	1810540	1810545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209560284
38520	NC_011375	AAAGG	2	10	1810568	1810577	60 %	0 %	40 %	0 %	209560284
38521	NC_011375	A	6	6	1810704	1810709	100 %	0 %	0 %	0 %	209560284
38522	NC_011375	T	7	7	1810715	1810721	0 %	100 %	0 %	0 %	209560284
38523	NC_011375	TAA	2	6	1810810	1810815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38524	NC_011375	ATA	2	6	1810822	1810827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38525	NC_011375	ACT	2	6	1810862	1810867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38526	NC_011375	CT	3	6	1810866	1810871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38527	NC_011375	AAT	2	6	1810890	1810895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38528	NC_011375	AAT	2	6	1810932	1810937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38529	NC_011375	TCA	2	6	1810945	1810950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38530	NC_011375	A	6	6	1810982	1810987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38531	NC_011375	ATC	2	6	1811026	1811031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38532	NC_011375	AGAAC	2	10	1811043	1811052	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38533	NC_011375	TAA	2	6	1811109	1811114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38534	NC_011375	TAAA	2	8	1811153	1811160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38535	NC_011375	A	7	7	1811158	1811164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38536	NC_011375	CAT	2	6	1811223	1811228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38537	NC_011375	CTA	2	6	1811245	1811250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38538	NC_011375	GAAAAA	2	12	1811268	1811279	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38539	NC_011375	A	7	7	1811275	1811281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38540	NC_011375	CCG	2	6	1811332	1811337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38541	NC_011375	GGA	2	6	1811384	1811389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38542	NC_011375	TAT	2	6	1811410	1811415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38543	NC_011375	GATT	2	8	1811420	1811427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38544	NC_011375	T	8	8	1811426	1811433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38545	NC_011375	T	7	7	1811442	1811448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38546	NC_011375	A	7	7	1811449	1811455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38547	NC_011375	T	8	8	1811461	1811468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38548	NC_011375	GTCAA	2	10	1811481	1811490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38549	NC_011375	GAA	2	6	1811574	1811579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38550	NC_011375	GTC	2	6	1811580	1811585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38551	NC_011375	TTC	2	6	1811623	1811628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38552	NC_011375	GAG	2	6	1811674	1811679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38553	NC_011375	CT	3	6	1811703	1811708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38554	NC_011375	GAA	2	6	1811714	1811719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38555	NC_011375	TAAAC	2	10	1811764	1811773	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38556	NC_011375	CTG	2	6	1811787	1811792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38557	NC_011375	GATG	2	8	1811794	1811801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38558	NC_011375	ACTG	2	8	1811811	1811818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38559	NC_011375	TCT	2	6	1811861	1811866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38560	NC_011375	AATC	2	8	1811952	1811959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38561	NC_011375	AT	3	6	1811990	1811995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38562	NC_011375	TTC	2	6	1812004	1812009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38563	NC_011375	TCT	2	6	1812027	1812032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38564	NC_011375	AAC	2	6	1812107	1812112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38565	NC_011375	GAC	2	6	1812151	1812156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38566	NC_011375	TTC	2	6	1812157	1812162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38567	NC_011375	AGC	2	6	1812261	1812266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38568	NC_011375	GAA	2	6	1812343	1812348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38569	NC_011375	GTTT	2	8	1812350	1812357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38570	NC_011375	TTTC	2	8	1812454	1812461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38571	NC_011375	AGC	2	6	1812475	1812480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38572	NC_011375	AGG	2	6	1812516	1812521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38573	NC_011375	T	6	6	1812606	1812611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38574	NC_011375	T	6	6	1812656	1812661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38575	NC_011375	AAAT	2	8	1812664	1812671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38576	NC_011375	ATG	2	6	1812701	1812706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38577	NC_011375	CTG	2	6	1812776	1812781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38578	NC_011375	A	6	6	1812793	1812798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38579	NC_011375	T	7	7	1812814	1812820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38580	NC_011375	T	7	7	1812863	1812869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38581	NC_011375	TAT	2	6	1812896	1812901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38582	NC_011375	TAA	2	6	1812903	1812908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38583	NC_011375	AGTT	2	8	1812918	1812925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38584	NC_011375	CT	3	6	1812939	1812944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38585	NC_011375	TGA	2	6	1813020	1813025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209560285
38586	NC_011375	T	7	7	1813066	1813072	0 %	100 %	0 %	0 %	209560285
38587	NC_011375	AAT	2	6	1813073	1813078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209560285
38588	NC_011375	AAT	2	6	1813103	1813108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209560285
38589	NC_011375	T	7	7	1813225	1813231	0 %	100 %	0 %	0 %	209560285
38590	NC_011375	CTT	2	6	1813246	1813251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209560285
38591	NC_011375	TCA	2	6	1813302	1813307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209560285
38592	NC_011375	T	6	6	1813348	1813353	0 %	100 %	0 %	0 %	209560285
38593	NC_011375	TCTT	2	8	1813382	1813389	0 %	75 %	0 %	25 %	209560285
38594	NC_011375	ACT	2	6	1813487	1813492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38595	NC_011375	TTA	2	6	1813518	1813523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38596	NC_011375	AAAAG	2	10	1813527	1813536	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38597	NC_011375	CTTTT	2	10	1813558	1813567	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38598	NC_011375	T	8	8	1813564	1813571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38599	NC_011375	GGA	2	6	1813623	1813628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38600	NC_011375	AGG	2	6	1813691	1813696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209560286
38601	NC_011375	ATT	2	6	1813707	1813712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560286
38602	NC_011375	AAT	2	6	1813719	1813724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209560286
38603	NC_011375	AAAT	2	8	1813747	1813754	75 %	25 %	0 %	0 %	209560286
38604	NC_011375	CAA	2	6	1813765	1813770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560286
38605	NC_011375	AAC	2	6	1813788	1813793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560286
38606	NC_011375	TAC	2	6	1813802	1813807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209560286
38607	NC_011375	TTA	2	6	1813846	1813851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560286
38608	NC_011375	CTT	2	6	1813867	1813872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209560286
38609	NC_011375	GTT	2	6	1814001	1814006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209560286
38610	NC_011375	TAA	2	6	1814009	1814014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209560286
38611	NC_011375	GTT	2	6	1814070	1814075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209560286
38612	NC_011375	TGT	2	6	1814114	1814119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209560286
38613	NC_011375	AGATA	2	10	1814132	1814141	60 %	20 %	20 %	0 %	209560286
38614	NC_011375	TTGCTA	2	12	1814191	1814202	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209560286
38615	NC_011375	A	6	6	1814282	1814287	100 %	0 %	0 %	0 %	209560286
38616	NC_011375	CAA	2	6	1814308	1814313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560286
38617	NC_011375	CAGA	2	8	1814322	1814329	50 %	0 %	25 %	25 %	209560286
38618	NC_011375	TGC	2	6	1814330	1814335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209560286
38619	NC_011375	TGG	2	6	1814354	1814359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209560286
38620	NC_011375	TAAT	2	8	1814365	1814372	50 %	50 %	0 %	0 %	209560286
38621	NC_011375	AATT	2	8	1814393	1814400	50 %	50 %	0 %	0 %	209560286
38622	NC_011375	TCT	2	6	1814412	1814417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209560286
38623	NC_011375	GTG	2	6	1814443	1814448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209560286
38624	NC_011375	TTA	2	6	1814488	1814493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560286
38625	NC_011375	ATT	2	6	1814496	1814501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560286
38626	NC_011375	AAC	2	6	1814503	1814508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560286
38627	NC_011375	TGG	2	6	1814618	1814623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209560286
38628	NC_011375	GTA	2	6	1814628	1814633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209560286
38629	NC_011375	AAGG	2	8	1814643	1814650	50 %	0 %	50 %	0 %	209560286
38630	NC_011375	AGT	2	6	1814736	1814741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209560286
38631	NC_011375	A	6	6	1814802	1814807	100 %	0 %	0 %	0 %	209560286
38632	NC_011375	ACT	2	6	1814829	1814834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209560286
38633	NC_011375	ATT	2	6	1814958	1814963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38634	NC_011375	TAT	2	6	1815081	1815086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560287
38635	NC_011375	AGTT	2	8	1815116	1815123	25 %	50 %	25 %	0 %	209560287
38636	NC_011375	ACG	2	6	1815132	1815137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209560287
38637	NC_011375	A	7	7	1815165	1815171	100 %	0 %	0 %	0 %	209560287
38638	NC_011375	TAT	2	6	1815180	1815185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209560287
38639	NC_011375	AAG	2	6	1815187	1815192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209560287
38640	NC_011375	CAA	2	6	1815214	1815219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560287
38641	NC_011375	GAA	2	6	1815262	1815267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209560287
38642	NC_011375	A	8	8	1815293	1815300	100 %	0 %	0 %	0 %	209560287
38643	NC_011375	AT	3	6	1815327	1815332	50 %	50 %	0 %	0 %	209560287
38644	NC_011375	GAA	2	6	1815406	1815411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209560287
38645	NC_011375	CG	3	6	1815432	1815437	0 %	0 %	50 %	50 %	209560287
38646	NC_011375	TGA	2	6	1815456	1815461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209560287
38647	NC_011375	CAA	2	6	1815466	1815471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560287
38648	NC_011375	A	7	7	1815562	1815568	100 %	0 %	0 %	0 %	209560287
38649	NC_011375	CTT	2	6	1815587	1815592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209560287
38650	NC_011375	CT	3	6	1815622	1815627	0 %	50 %	0 %	50 %	209560287
38651	NC_011375	ATG	3	9	1815683	1815691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209560287
38652	NC_011375	CAA	2	6	1815708	1815713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209560287

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.