MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 99086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
99001	NC_011294	AAATA	2	10	4681624	4681633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99002	NC_011294	CTT	2	6	4681655	4681660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99003	NC_011294	TCTGT	2	10	4681661	4681670	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99004	NC_011294	GGC	2	6	4681680	4681685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99005	NC_011294	TAA	2	6	4681772	4681777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99006	NC_011294	AAG	2	6	4681788	4681793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99007	NC_011294	TGA	2	6	4681800	4681805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99008	NC_011294	T	6	6	4681829	4681834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99009	NC_011294	ATA	2	6	4681836	4681841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99010	NC_011294	TTA	2	6	4681843	4681848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99011	NC_011294	GGA	2	6	4681855	4681860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99012	NC_011294	TTTA	2	8	4681861	4681868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99013	NC_011294	ACG	2	6	4681898	4681903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99014	NC_011294	TA	3	6	4681967	4681972	50 %	50 %	0 %	0 %	207859717
99015	NC_011294	TGT	2	6	4682034	4682039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207859717
99016	NC_011294	ATA	2	6	4682252	4682257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207859717
99017	NC_011294	GGT	2	6	4682264	4682269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207859717
99018	NC_011294	A	6	6	4682279	4682284	100 %	0 %	0 %	0 %	207859717
99019	NC_011294	TCT	2	6	4682298	4682303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207859717
99020	NC_011294	GATT	2	8	4682430	4682437	25 %	50 %	25 %	0 %	207859717
99021	NC_011294	T	7	7	4682532	4682538	0 %	100 %	0 %	0 %	207859717
99022	NC_011294	CCG	2	6	4682565	4682570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207859717
99023	NC_011294	ATT	2	6	4682594	4682599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99024	NC_011294	CAA	2	6	4682684	4682689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99025	NC_011294	TGA	2	6	4682766	4682771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99026	NC_011294	AGCGA	2	10	4682843	4682852	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99027	NC_011294	TGT	2	6	4682863	4682868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99028	NC_011294	GA	3	6	4682880	4682885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99029	NC_011294	GGCG	2	8	4682901	4682908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99030	NC_011294	CGC	2	6	4682928	4682933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99031	NC_011294	CTC	2	6	4682943	4682948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99032	NC_011294	CGG	2	6	4682950	4682955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99033	NC_011294	GAT	2	6	4683004	4683009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207859718
99034	NC_011294	TCA	2	6	4683046	4683051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207859718
99035	NC_011294	ATT	2	6	4683101	4683106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207859718
99036	NC_011294	AGC	2	6	4683212	4683217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207859718
99037	NC_011294	TGA	2	6	4683227	4683232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207859718
99038	NC_011294	AGC	2	6	4683259	4683264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207859718
99039	NC_011294	T	6	6	4683275	4683280	0 %	100 %	0 %	0 %	207859718
99040	NC_011294	T	6	6	4683319	4683324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99041	NC_011294	CAA	2	6	4683331	4683336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99042	NC_011294	AGG	2	6	4683452	4683457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99043	NC_011294	CGC	2	6	4683564	4683569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207859719
99044	NC_011294	TGG	2	6	4683594	4683599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207859719
99045	NC_011294	GAT	2	6	4683601	4683606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207859719
99046	NC_011294	ACG	2	6	4683646	4683651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207859719
99047	NC_011294	TTC	2	6	4683704	4683709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207859719
99048	NC_011294	GC	3	6	4683719	4683724	0 %	0 %	50 %	50 %	207859719
99049	NC_011294	CG	3	6	4683763	4683768	0 %	0 %	50 %	50 %	207859719
99050	NC_011294	ACG	2	6	4683871	4683876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207859719
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99052	NC_011294	ATC	2	6	4683970	4683975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207859719
99053	NC_011294	AG	3	6	4684135	4684140	50 %	0 %	50 %	0 %	207859719
99054	NC_011294	CAT	2	6	4684179	4684184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207859719
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99056	NC_011294	CAA	2	6	4684409	4684414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207859720
99057	NC_011294	CAT	2	6	4684415	4684420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207859720
99058	NC_011294	TAA	2	6	4684526	4684531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99059	NC_011294	AT	3	6	4684549	4684554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99060	NC_011294	TGA	2	6	4684583	4684588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99061	NC_011294	ATC	2	6	4684590	4684595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99062	NC_011294	TCA	2	6	4684614	4684619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99063	NC_011294	TAA	2	6	4684657	4684662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99064	NC_011294	TGA	2	6	4684666	4684671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99065	NC_011294	TAAAT	2	10	4684694	4684703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99066	NC_011294	TAAA	2	8	4684709	4684716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99067	NC_011294	GCC	2	6	4684956	4684961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207859721
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99072	NC_011294	TTA	2	6	4685190	4685195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207859721
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99081	NC_011294	AT	3	6	4685667	4685672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99082	NC_011294	CAG	2	6	4685676	4685681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99083	NC_011294	AGAC	2	8	4685765	4685772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99084	NC_011294	ACA	2	6	4685793	4685798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99085	NC_011294	CAC	3	9	4685816	4685824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99086	NC_011294	ACC	2	6	4685829	4685834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.