MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011274	GCC	2	6	840675	840680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352056
18002	NC_011274	GC	3	6	840683	840688	0 %	0 %	50 %	50 %	205352056
18003	NC_011274	CGC	2	6	840715	840720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352056
18004	NC_011274	GGC	2	6	840777	840782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352056
18005	NC_011274	GACAG	2	10	840783	840792	40 %	0 %	40 %	20 %	205352056
18006	NC_011274	CTT	2	6	840843	840848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_011274	CTG	2	6	840865	840870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_011274	CCT	2	6	840885	840890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18009	NC_011274	AAT	2	6	840959	840964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_011274	T	8	8	840984	840991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_011274	GGC	2	6	841028	841033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_011274	TA	3	6	841188	841193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_011274	TTG	2	6	841201	841206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_011274	AGGA	2	8	841210	841217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_011274	TCA	2	6	841239	841244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18016	NC_011274	A	6	6	841263	841268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_011274	CTG	2	6	841296	841301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_011274	T	6	6	841387	841392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_011274	T	6	6	841402	841407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_011274	CGT	2	6	841538	841543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18021	NC_011274	GGA	2	6	841558	841563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205352057
18022	NC_011274	GGC	2	6	841681	841686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352057
18023	NC_011274	CTA	2	6	841747	841752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352057
18024	NC_011274	ACT	2	6	841755	841760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352057
18025	NC_011274	GTG	3	9	841883	841891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352057
18026	NC_011274	ATG	2	6	841943	841948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352057
18027	NC_011274	GC	3	6	841981	841986	0 %	0 %	50 %	50 %	205352057
18028	NC_011274	GCG	2	6	842061	842066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352057
18029	NC_011274	GAC	2	6	842096	842101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18030	NC_011274	TGA	2	6	842125	842130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352057
18031	NC_011274	CTAT	2	8	842199	842206	25 %	50 %	0 %	25 %	205352057
18032	NC_011274	CGC	2	6	842226	842231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352057
18033	NC_011274	AAT	2	6	842303	842308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205352057
18034	NC_011274	GCT	2	6	842311	842316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18035	NC_011274	AGC	2	6	842322	842327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18036	NC_011274	GAT	2	6	842359	842364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352057
18037	NC_011274	CGGGC	2	10	842422	842431	0 %	0 %	60 %	40 %	205352057
18038	NC_011274	CCG	2	6	842435	842440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352057
18039	NC_011274	CCG	2	6	842463	842468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352057
18040	NC_011274	CTG	2	6	842474	842479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18041	NC_011274	GTG	2	6	842480	842485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352057
18042	NC_011274	GGC	2	6	842516	842521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352057
18043	NC_011274	GC	3	6	842540	842545	0 %	0 %	50 %	50 %	205352057
18044	NC_011274	GAG	2	6	842612	842617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205352057
18045	NC_011274	CTAT	2	8	842640	842647	25 %	50 %	0 %	25 %	205352057
18046	NC_011274	TGA	2	6	842689	842694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352057
18047	NC_011274	GGT	2	6	842695	842700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352057
18048	NC_011274	CGAC	2	8	842714	842721	25 %	0 %	25 %	50 %	205352057
18049	NC_011274	GCT	2	6	842725	842730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18050	NC_011274	ATT	2	6	842738	842743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352057
18051	NC_011274	CTG	2	6	842777	842782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18052	NC_011274	GCGT	2	8	842889	842896	0 %	25 %	50 %	25 %	205352057
18053	NC_011274	ATC	2	6	842936	842941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352057
18054	NC_011274	TGG	2	6	842973	842978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352057
18055	NC_011274	CTG	2	6	842987	842992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18056	NC_011274	TGG	2	6	843024	843029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352057
18057	NC_011274	GC	3	6	843094	843099	0 %	0 %	50 %	50 %	205352057
18058	NC_011274	AGC	2	6	843195	843200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352057
18059	NC_011274	A	6	6	843245	843250	100 %	0 %	0 %	0 %	205352057
18060	NC_011274	GCA	2	6	843370	843375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352057
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18062	NC_011274	GAA	2	6	843431	843436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205352057
18063	NC_011274	GTT	2	6	843475	843480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352057
18064	NC_011274	AGTC	2	8	843571	843578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18065	NC_011274	GAA	2	6	843665	843670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_011274	CT	3	6	843707	843712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18067	NC_011274	A	8	8	843724	843731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_011274	TAT	2	6	843739	843744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_011274	CAT	2	6	843819	843824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352058
18070	NC_011274	A	6	6	843832	843837	100 %	0 %	0 %	0 %	205352058
18071	NC_011274	GAC	2	6	843906	843911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352058
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18073	NC_011274	AATAA	2	10	844079	844088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_011274	AGA	2	6	844171	844176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_011274	ATA	2	6	844230	844235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_011274	TAG	2	6	844243	844248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_011274	AGG	2	6	844249	844254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_011274	GAGG	2	8	844334	844341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_011274	AGTC	2	8	844347	844354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18080	NC_011274	GCA	2	6	844470	844475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18081	NC_011274	GAA	2	6	844482	844487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18082	NC_011274	ATA	2	6	844519	844524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_011274	ACT	2	6	844590	844595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18084	NC_011274	ATA	2	6	844798	844803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_011274	GCC	2	6	844955	844960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18086	NC_011274	ACC	2	6	845018	845023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18087	NC_011274	GTAA	2	8	845043	845050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_011274	AAC	2	6	845093	845098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18089	NC_011274	CGG	2	6	845146	845151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_011274	AAT	2	6	845159	845164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_011274	GTG	2	6	845218	845223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_011274	AAT	2	6	845243	845248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_011274	GAAC	2	8	845271	845278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18094	NC_011274	GAG	2	6	845415	845420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_011274	GGCG	2	8	845437	845444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18096	NC_011274	TAT	2	6	845594	845599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_011274	ACC	2	6	845647	845652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18098	NC_011274	ATG	2	6	845677	845682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_011274	TCGC	2	8	845763	845770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18100	NC_011274	T	6	6	845793	845798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_011274	CGAAGT	2	12	845804	845815	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18102	NC_011274	GTCGCT	2	12	845846	845857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_011274	ACA	2	6	845859	845864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18104	NC_011274	AGA	2	6	846020	846025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18105	NC_011274	ATG	2	6	846036	846041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_011274	ATCA	2	8	846168	846175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18107	NC_011274	AT	3	6	846202	846207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_011274	A	6	6	846213	846218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_011274	GCTC	2	8	846226	846233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18110	NC_011274	AGA	2	6	846271	846276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_011274	GA	3	6	846279	846284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_011274	CGT	2	6	846328	846333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18113	NC_011274	TAA	2	6	846385	846390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205352059
18114	NC_011274	ACT	2	6	846488	846493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352059
18115	NC_011274	T	6	6	846505	846510	0 %	100 %	0 %	0 %	205352059
18116	NC_011274	AT	3	6	846515	846520	50 %	50 %	0 %	0 %	205352059
18117	NC_011274	CAT	2	6	846526	846531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352059
18118	NC_011274	GGC	2	6	846559	846564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352059
18119	NC_011274	CAG	3	9	846646	846654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352059
18120	NC_011274	AATCAG	2	12	846691	846702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	205352059
18121	NC_011274	GCG	3	9	846771	846779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352059
18122	NC_011274	AATTA	2	10	846901	846910	60 %	40 %	0 %	0 %	205352059
18123	NC_011274	GACGC	2	10	847022	847031	20 %	0 %	40 %	40 %	205352059
18124	NC_011274	GCG	2	6	847096	847101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352059
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18126	NC_011274	GAA	2	6	847166	847171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205352059
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18243	NC_011274	T	6	6	853086	853091	0 %	100 %	0 %	0 %	205352068
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18369	NC_011274	CAC	2	6	858878	858883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352074
18370	NC_011274	CAGC	2	8	858890	858897	25 %	0 %	25 %	50 %	205352074
18371	NC_011274	ACGC	3	12	858940	858951	25 %	0 %	25 %	50 %	205352074
18372	NC_011274	GA	4	8	858960	858967	50 %	0 %	50 %	0 %	205352074
18373	NC_011274	TGA	2	6	859001	859006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352075
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18381	NC_011274	GC	3	6	859397	859402	0 %	0 %	50 %	50 %	205352075
18382	NC_011274	A	6	6	859429	859434	100 %	0 %	0 %	0 %	205352075
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18401	NC_011274	CAACGC	2	12	860198	860209	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	205352075
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18441	NC_011274	GCG	2	6	862306	862311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352077
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18445	NC_011274	GATT	2	8	862393	862400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18489	NC_011274	GCC	2	6	864077	864082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18490	NC_011274	A	6	6	864096	864101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18491	NC_011274	CGCTG	2	10	864177	864186	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18492	NC_011274	CGC	2	6	864198	864203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18493	NC_011274	GAT	2	6	864264	864269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18495	NC_011274	A	6	6	864392	864397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18496	NC_011274	TGG	2	6	864401	864406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18497	NC_011274	GCT	2	6	864459	864464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18500	NC_011274	GT	3	6	864520	864525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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