MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011274	GAT	2	6	590436	590441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_011274	GC	3	6	590480	590485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_011274	TTA	2	6	590503	590508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_011274	CGT	2	6	590514	590519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_011274	CCG	2	6	590537	590542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_011274	CGC	2	6	590547	590552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_011274	CGGAA	2	10	590631	590640	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12508	NC_011274	CAA	2	6	590662	590667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_011274	CGC	2	6	590670	590675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_011274	CT	4	8	590753	590760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_011274	CATC	2	8	590767	590774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12512	NC_011274	GTG	2	6	590860	590865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_011274	TAA	2	6	590895	590900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_011274	A	6	6	590899	590904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_011274	TCG	2	6	590991	590996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351831
12516	NC_011274	CTGG	2	8	591009	591016	0 %	25 %	50 %	25 %	205351831
12517	NC_011274	CTT	2	6	591029	591034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351831
12518	NC_011274	ATTA	2	8	591036	591043	50 %	50 %	0 %	0 %	205351831
12519	NC_011274	TCAA	2	8	591050	591057	50 %	25 %	0 %	25 %	205351831
12520	NC_011274	CTT	2	6	591067	591072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351831
12521	NC_011274	CCG	2	6	591082	591087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351831
12522	NC_011274	GC	3	6	591173	591178	0 %	0 %	50 %	50 %	205351831
12523	NC_011274	CG	3	6	591307	591312	0 %	0 %	50 %	50 %	205351831
12524	NC_011274	GCG	2	6	591424	591429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351831
12525	NC_011274	CCA	2	6	591501	591506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351831
12526	NC_011274	AGC	2	6	591578	591583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351831
12527	NC_011274	TTC	2	6	591625	591630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351831
12528	NC_011274	GCC	2	6	591658	591663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351831
12529	NC_011274	GC	3	6	591674	591679	0 %	0 %	50 %	50 %	205351831
12530	NC_011274	CGC	2	6	591785	591790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351831
12531	NC_011274	T	6	6	591799	591804	0 %	100 %	0 %	0 %	205351831
12532	NC_011274	GGC	2	6	591874	591879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351831
12533	NC_011274	GAT	2	6	591885	591890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351831
12534	NC_011274	GCG	2	6	591937	591942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351831
12535	NC_011274	CCG	2	6	592044	592049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351831
12536	NC_011274	CGC	2	6	592070	592075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351831
12537	NC_011274	CCGT	2	8	592133	592140	0 %	25 %	25 %	50 %	205351831
12538	NC_011274	AG	3	6	592203	592208	50 %	0 %	50 %	0 %	205351831
12539	NC_011274	ATCC	2	8	592224	592231	25 %	25 %	0 %	50 %	205351832
12540	NC_011274	CGG	2	6	592252	592257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
12541	NC_011274	TTA	2	6	592329	592334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351832
12542	NC_011274	GCG	3	9	592384	592392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
12543	NC_011274	CGC	2	6	592528	592533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351832
12544	NC_011274	GAG	2	6	592563	592568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351832
12545	NC_011274	GCA	2	6	592596	592601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351832
12546	NC_011274	TGC	2	6	592664	592669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351832
12547	NC_011274	GACT	2	8	592670	592677	25 %	25 %	25 %	25 %	205351832
12548	NC_011274	GGC	2	6	592678	592683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
12549	NC_011274	GAC	2	6	592722	592727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351832
12550	NC_011274	GGC	2	6	592748	592753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
12551	NC_011274	T	7	7	592793	592799	0 %	100 %	0 %	0 %	205351832
12552	NC_011274	CGA	2	6	592825	592830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351832
12553	NC_011274	CTG	2	6	592947	592952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351832
12554	NC_011274	GCT	2	6	592982	592987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351832
12555	NC_011274	ACA	2	6	593003	593008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351832
12556	NC_011274	GGC	2	6	593052	593057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
12557	NC_011274	ATT	2	6	593063	593068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351833
12558	NC_011274	GCC	2	6	593321	593326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351833
12559	NC_011274	CGG	2	6	593359	593364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
12560	NC_011274	AGA	2	6	593417	593422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351833
12561	NC_011274	TGGC	2	8	593447	593454	0 %	25 %	50 %	25 %	205351833
12562	NC_011274	GTC	2	6	593487	593492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351833
12563	NC_011274	GCG	2	6	593572	593577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
12564	NC_011274	GGCGAA	2	12	593598	593609	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	205351833
12565	NC_011274	GATA	2	8	593624	593631	50 %	25 %	25 %	0 %	205351833
12566	NC_011274	GGC	3	9	593639	593647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
12567	NC_011274	CGGATG	2	12	593692	593703	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	205351833
12568	NC_011274	CGC	2	6	593725	593730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351833
12569	NC_011274	AGC	2	6	593731	593736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351833
12570	NC_011274	GC	3	6	593735	593740	0 %	0 %	50 %	50 %	205351833
12571	NC_011274	GCG	2	6	593931	593936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_011274	GCC	2	6	593948	593953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12573	NC_011274	TTTA	2	8	593961	593968	25 %	75 %	0 %	0 %	205351834
12574	NC_011274	GA	3	6	594021	594026	50 %	0 %	50 %	0 %	205351834
12575	NC_011274	GACGT	2	10	594048	594057	20 %	20 %	40 %	20 %	205351834
12576	NC_011274	TCAGAT	2	12	594069	594080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	205351834
12577	NC_011274	ATC	2	6	594182	594187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351834
12578	NC_011274	CG	3	6	594235	594240	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
12579	NC_011274	ACTG	2	8	594255	594262	25 %	25 %	25 %	25 %	205351834
12580	NC_011274	CG	3	6	594303	594308	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
12581	NC_011274	CCTGCT	2	12	594414	594425	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	205351834
12582	NC_011274	GC	5	10	594524	594533	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
12583	NC_011274	CAA	2	6	594573	594578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351834
12584	NC_011274	CG	3	6	594622	594627	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
12585	NC_011274	CGT	2	6	594648	594653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351834
12586	NC_011274	GCC	2	6	594655	594660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351834
12587	NC_011274	TAA	2	6	594672	594677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351834
12588	NC_011274	TCG	2	6	594716	594721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351834
12589	NC_011274	CAG	2	6	594730	594735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351834
12590	NC_011274	GAT	2	6	594799	594804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351834
12591	NC_011274	GC	3	6	594838	594843	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
12592	NC_011274	CTG	2	6	594901	594906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351834
12593	NC_011274	CGG	2	6	594915	594920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351834
12594	NC_011274	CGCC	2	8	594969	594976	0 %	0 %	25 %	75 %	205351834
12595	NC_011274	GCA	2	6	594981	594986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351834
12596	NC_011274	CGT	2	6	595112	595117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351835
12597	NC_011274	GCG	2	6	595135	595140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351835
12598	NC_011274	GCG	2	6	595147	595152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351835
12599	NC_011274	CG	3	6	595199	595204	0 %	0 %	50 %	50 %	205351835
12600	NC_011274	CGC	2	6	595235	595240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351835
12601	NC_011274	AGCGC	2	10	595243	595252	20 %	0 %	40 %	40 %	205351835
12602	NC_011274	GCGCC	2	10	595313	595322	0 %	0 %	40 %	60 %	205351835
12603	NC_011274	AAT	2	6	595335	595340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351835
12604	NC_011274	CCG	2	6	595361	595366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351835
12605	NC_011274	CGG	2	6	595454	595459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351835
12606	NC_011274	ATT	2	6	595518	595523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351835
12607	NC_011274	GCT	2	6	595566	595571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_011274	TGCG	2	8	595618	595625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12609	NC_011274	CGA	2	6	595643	595648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_011274	ATG	2	6	595713	595718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351836
12611	NC_011274	CCG	2	6	595775	595780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351836
12612	NC_011274	GGTG	2	8	595784	595791	0 %	25 %	75 %	0 %	205351836
12613	NC_011274	CGA	2	6	595835	595840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351836
12614	NC_011274	ATA	2	6	595861	595866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351836
12615	NC_011274	TGC	2	6	595877	595882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351836
12616	NC_011274	GGC	2	6	595887	595892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351836
12617	NC_011274	GC	3	6	595903	595908	0 %	0 %	50 %	50 %	205351836
12618	NC_011274	GGC	2	6	595914	595919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351836
12619	NC_011274	CGG	3	9	595924	595932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351836
12620	NC_011274	CAT	2	6	596009	596014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351836
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12622	NC_011274	GTC	3	9	596223	596231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351836
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12746	NC_011274	GCTG	2	8	602306	602313	0 %	25 %	50 %	25 %	205351844
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12991	NC_011274	ATTT	2	8	613686	613693	25 %	75 %	0 %	0 %	205351855
12992	NC_011274	GAT	2	6	613775	613780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351855
12993	NC_011274	T	6	6	613810	613815	0 %	100 %	0 %	0 %	205351855
12994	NC_011274	AT	3	6	613828	613833	50 %	50 %	0 %	0 %	205351855
12995	NC_011274	TA	3	6	613843	613848	50 %	50 %	0 %	0 %	205351855
12996	NC_011274	CAA	2	6	613890	613895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351855
12997	NC_011274	AGTT	2	8	613902	613909	25 %	50 %	25 %	0 %	205351855
12998	NC_011274	ATC	2	6	613955	613960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351855
12999	NC_011274	GAC	2	6	613976	613981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351855
13000	NC_011274	GCT	2	6	614033	614038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351855

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