MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011274	AGC	2	6	519472	519477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351772
11002	NC_011274	GTG	2	6	519497	519502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351772
11003	NC_011274	CCG	3	9	519507	519515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351772
11004	NC_011274	CTG	2	6	519566	519571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351772
11005	NC_011274	GTTGGC	2	12	519629	519640	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	205351772
11006	NC_011274	GC	3	6	519642	519647	0 %	0 %	50 %	50 %	205351772
11007	NC_011274	GAT	2	6	519719	519724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351772
11008	NC_011274	GCC	2	6	519791	519796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351772
11009	NC_011274	GCG	2	6	519807	519812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351772
11010	NC_011274	GTC	2	6	519881	519886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351772
11011	NC_011274	TTG	2	6	519906	519911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351772
11012	NC_011274	TTG	2	6	519933	519938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351772
11013	NC_011274	GCGCT	2	10	520035	520044	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11014	NC_011274	TCA	2	6	520079	520084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_011274	CGC	2	6	520094	520099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_011274	T	6	6	520111	520116	0 %	100 %	0 %	0 %	205351773
11017	NC_011274	GC	3	6	520162	520167	0 %	0 %	50 %	50 %	205351773
11018	NC_011274	CGC	2	6	520186	520191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351773
11019	NC_011274	CATT	2	8	520245	520252	25 %	50 %	0 %	25 %	205351773
11020	NC_011274	GATC	2	8	520285	520292	25 %	25 %	25 %	25 %	205351773
11021	NC_011274	GGAA	2	8	520350	520357	50 %	0 %	50 %	0 %	205351773
11022	NC_011274	GCG	2	6	520452	520457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351773
11023	NC_011274	TTTC	2	8	520525	520532	0 %	75 %	0 %	25 %	205351773
11024	NC_011274	CGG	2	6	520538	520543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351773
11025	NC_011274	CTG	2	6	520603	520608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351773
11026	NC_011274	T	6	6	520618	520623	0 %	100 %	0 %	0 %	205351773
11027	NC_011274	CGG	2	6	520704	520709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351773
11028	NC_011274	GCA	2	6	520732	520737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351773
11029	NC_011274	GAAT	2	8	520796	520803	50 %	25 %	25 %	0 %	205351773
11030	NC_011274	GGC	2	6	520835	520840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351773
11031	NC_011274	CAC	2	6	520856	520861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351773
11032	NC_011274	CTT	2	6	520918	520923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351773
11033	NC_011274	T	6	6	520927	520932	0 %	100 %	0 %	0 %	205351773
11034	NC_011274	AAT	2	6	520941	520946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351773
11035	NC_011274	ATT	2	6	520955	520960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351773
11036	NC_011274	CATA	2	8	520973	520980	50 %	25 %	0 %	25 %	205351773
11037	NC_011274	CGG	2	6	521143	521148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_011274	G	6	6	521147	521152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_011274	CTG	2	6	521159	521164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_011274	TGA	2	6	521171	521176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_011274	TGAA	2	8	521187	521194	50 %	25 %	25 %	0 %	205351774
11042	NC_011274	GGC	2	6	521237	521242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351774
11043	NC_011274	CTA	2	6	521314	521319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351774
11044	NC_011274	GCC	2	6	521372	521377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351774
11045	NC_011274	GCTG	2	8	521414	521421	0 %	25 %	50 %	25 %	205351774
11046	NC_011274	GTAC	2	8	521454	521461	25 %	25 %	25 %	25 %	205351774
11047	NC_011274	CG	3	6	521525	521530	0 %	0 %	50 %	50 %	205351774
11048	NC_011274	TATT	2	8	521572	521579	25 %	75 %	0 %	0 %	205351774
11049	NC_011274	GGC	2	6	521610	521615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351774
11050	NC_011274	CGG	2	6	521653	521658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351774
11051	NC_011274	GGT	2	6	521676	521681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351774
11052	NC_011274	CGA	3	9	521683	521691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351774
11053	NC_011274	TCT	2	6	521727	521732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351774
11054	NC_011274	CAC	2	6	521921	521926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351775
11055	NC_011274	TGC	2	6	521944	521949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351775
11056	NC_011274	CCG	2	6	521973	521978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351775
11057	NC_011274	CGA	2	6	522058	522063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351775
11058	NC_011274	ATA	2	6	522102	522107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351775
11059	NC_011274	G	6	6	522145	522150	0 %	0 %	100 %	0 %	205351775
11060	NC_011274	CAGGT	2	10	522298	522307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11061	NC_011274	GGAA	2	8	522310	522317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_011274	TAGC	2	8	522351	522358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11063	NC_011274	CCCA	2	8	522365	522372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11064	NC_011274	CTG	2	6	522399	522404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_011274	AAT	2	6	522577	522582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351776
11066	NC_011274	GCG	2	6	522585	522590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351776
11067	NC_011274	ACATCC	2	12	522641	522652	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	205351776
11068	NC_011274	TCA	2	6	522695	522700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351776
11069	NC_011274	GC	3	6	522744	522749	0 %	0 %	50 %	50 %	205351776
11070	NC_011274	CAG	2	6	522823	522828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351776
11071	NC_011274	GATT	2	8	522879	522886	25 %	50 %	25 %	0 %	205351776
11072	NC_011274	TGT	2	6	522893	522898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351776
11073	NC_011274	GAT	2	6	522946	522951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351776
11074	NC_011274	CAGC	2	8	522987	522994	25 %	0 %	25 %	50 %	205351776
11075	NC_011274	GAAAG	2	10	523013	523022	60 %	0 %	40 %	0 %	205351776
11076	NC_011274	GCT	2	6	523075	523080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351776
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11079	NC_011274	AGCGG	2	10	523259	523268	20 %	0 %	60 %	20 %	205351776
11080	NC_011274	GAA	2	6	523374	523379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351776
11081	NC_011274	GCT	2	6	523399	523404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351776
11082	NC_011274	AAT	2	6	523432	523437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351776
11083	NC_011274	ATC	2	6	523496	523501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351776
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11087	NC_011274	GCG	2	6	523711	523716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351776
11088	NC_011274	GCT	2	6	523735	523740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351776
11089	NC_011274	AGG	2	6	523758	523763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351776
11090	NC_011274	T	6	6	523857	523862	0 %	100 %	0 %	0 %	205351776
11091	NC_011274	GCCA	2	8	523877	523884	25 %	0 %	25 %	50 %	205351776
11092	NC_011274	GACA	2	8	523909	523916	50 %	0 %	25 %	25 %	205351776
11093	NC_011274	TGTTA	2	10	524156	524165	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_011274	GA	3	6	524176	524181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_011274	CGT	2	6	524219	524224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351777
11096	NC_011274	TCA	2	6	524334	524339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351777
11097	NC_011274	AAATG	2	10	524446	524455	60 %	20 %	20 %	0 %	205351777
11098	NC_011274	AAC	2	6	524484	524489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351778
11099	NC_011274	A	7	7	524579	524585	100 %	0 %	0 %	0 %	205351778
11100	NC_011274	A	6	6	524592	524597	100 %	0 %	0 %	0 %	205351778
11101	NC_011274	AGGG	2	8	524627	524634	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_011274	T	6	6	524642	524647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_011274	GGCT	2	8	524654	524661	0 %	25 %	50 %	25 %	205351779
11104	NC_011274	T	6	6	524720	524725	0 %	100 %	0 %	0 %	205351779
11105	NC_011274	GAA	2	6	524765	524770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351779
11106	NC_011274	G	6	6	524787	524792	0 %	0 %	100 %	0 %	205351779
11107	NC_011274	AGA	2	6	524888	524893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351779
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11109	NC_011274	CAC	2	6	524916	524921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351779
11110	NC_011274	CCA	2	6	524939	524944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351779
11111	NC_011274	GCA	2	6	524957	524962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351779
11112	NC_011274	ATAA	2	8	525001	525008	75 %	25 %	0 %	0 %	205351779
11113	NC_011274	TCA	2	6	525079	525084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351779
11114	NC_011274	GTA	2	6	525152	525157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_011274	A	6	6	525188	525193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_011274	T	6	6	525243	525248	0 %	100 %	0 %	0 %	205351780
11117	NC_011274	ACG	2	6	525277	525282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351780
11118	NC_011274	T	6	6	525295	525300	0 %	100 %	0 %	0 %	205351780
11119	NC_011274	CAC	2	6	525303	525308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351780
11120	NC_011274	CGA	3	9	525320	525328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351780
11121	NC_011274	ACG	2	6	525358	525363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351780
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11123	NC_011274	TTAT	2	8	525655	525662	25 %	75 %	0 %	0 %	205351780
11124	NC_011274	TCA	2	6	525664	525669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351780
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11127	NC_011274	TCGG	2	8	525736	525743	0 %	25 %	50 %	25 %	205351780
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11153	NC_011274	T	6	6	526840	526845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11243	NC_011274	GC	3	6	530616	530621	0 %	0 %	50 %	50 %	205351784
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11247	NC_011274	GAC	2	6	530886	530891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351784
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11352	NC_011274	GC	3	6	535753	535758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11353	NC_011274	GC	4	8	535863	535870	0 %	0 %	50 %	50 %	205351787
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11362	NC_011274	GTC	2	6	536223	536228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351787
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